logo

Genes within 1Mb (chr12:101449810:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 1.90e-01 0.0936 0.0711 0.244 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 7.34e-01 0.0148 0.0434 0.244 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0223 0.0628 0.244 B L1
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 5.10e-01 0.0471 0.0713 0.244 B L1
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 9.44e-01 0.00435 0.0614 0.244 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 7.00e-03 -0.132 0.0483 0.244 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0435 0.0557 0.244 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 6.65e-02 -0.162 0.0878 0.244 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0929 0.0846 0.244 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 2.66e-01 -0.088 0.0789 0.244 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 2.72e-01 0.0717 0.0651 0.244 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.86e-01 -0.116 0.0878 0.244 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 2.16e-01 0.0755 0.0609 0.244 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 3.20e-01 0.0672 0.0674 0.244 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0317 0.066 0.244 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 8.10e-02 -0.0805 0.0459 0.244 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 4.62e-02 0.16 0.0797 0.244 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 7.72e-02 -0.154 0.0866 0.244 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 5.44e-01 0.0348 0.0572 0.244 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 1.08e-01 0.116 0.0718 0.244 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 5.23e-01 -0.051 0.0796 0.244 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 4.40e-03 -0.16 0.0555 0.244 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 5.07e-01 0.0539 0.081 0.244 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 2.70e-02 0.201 0.0902 0.234 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0786 0.0833 0.234 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 3.04e-01 0.0944 0.0916 0.234 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0232 0.0984 0.234 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 2.00e-01 0.13 0.101 0.234 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0403 0.0876 0.234 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 5.69e-01 0.0413 0.0723 0.234 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 7.50e-01 -0.029 0.0909 0.234 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0155 0.0954 0.234 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 1.41e-01 0.114 0.0769 0.244 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 8.72e-01 0.0105 0.0654 0.244 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 7.97e-01 0.0211 0.082 0.244 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 7.94e-01 0.0239 0.0914 0.244 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 7.51e-01 0.0268 0.0841 0.244 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0719 0.0739 0.244 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 5.69e-01 0.0344 0.0603 0.244 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 4.93e-01 0.0451 0.0656 0.244 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 6.37e-01 0.0393 0.0831 0.242 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.90e-01 -0.101 0.0768 0.242 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 2.30e-01 -0.067 0.0557 0.242 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0736 0.0898 0.242 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0557 0.0826 0.242 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 1.41e-02 -0.152 0.0614 0.242 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 1.43e-01 0.13 0.0882 0.242 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 6.10e-01 0.0532 0.104 0.242 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 8.57e-01 0.0105 0.0583 0.244 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0637 0.0851 0.244 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00622 0.0615 0.244 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0481 0.0959 0.244 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 6.51e-01 0.0317 0.07 0.244 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000295 0.0622 0.244 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 1.66e-01 -0.103 0.0743 0.244 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0391 0.0621 0.244 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0301 0.0722 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 1.00e+00 -2.26e-05 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 3.57e-02 0.157 0.074 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 1.63e-01 -0.148 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 8.21e-01 0.0234 0.103 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 1.69e-02 -0.252 0.105 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 9.55e-01 0.00579 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 2.62e-02 -0.225 0.1 0.253 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0877 0.0834 0.253 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 1.88e-01 -0.111 0.0838 0.253 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 5.03e-01 -0.053 0.079 0.253 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 2.42e-01 0.118 0.101 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 2.93e-01 0.0572 0.0542 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 5.05e-02 0.157 0.0797 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 5.71e-01 0.0506 0.0893 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 3.71e-02 0.209 0.0995 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.07e-01 -0.105 0.0827 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 2.18e-01 -0.11 0.0888 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0754 0.0936 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 8.15e-01 0.023 0.0983 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 9.87e-01 0.00155 0.0943 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 5.23e-01 0.0624 0.0977 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.07e-01 0.103 0.0634 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 9.52e-01 0.00529 0.0874 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 6.13e-01 0.0485 0.0959 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 9.36e-01 0.00772 0.0954 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 9.13e-02 -0.144 0.0848 0.246 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 6.59e-01 0.0395 0.0895 0.246 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 7.11e-01 0.0342 0.0921 0.246 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00735 0.0943 0.246 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0187 0.0858 0.246 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 4.33e-01 0.0744 0.0948 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 7.25e-01 0.0174 0.0493 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 4.43e-02 -0.14 0.0691 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 9.70e-01 0.00307 0.0828 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0871 0.0923 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 3.14e-02 -0.15 0.0692 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0445 0.0758 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 8.71e-02 -0.176 0.102 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.1 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 1.84e-01 -0.125 0.0935 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 8.99e-02 0.159 0.0931 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0361 0.0501 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0366 0.0777 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 1.40e-01 0.133 0.0897 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 1.89e-01 -0.13 0.0986 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 1.10e-02 -0.218 0.0849 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 4.15e-01 0.0697 0.0852 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0702 0.0898 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 9.83e-01 0.00216 0.104 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 1.79e-01 -0.12 0.089 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 1.29e-01 0.152 0.0994 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0997 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 2.32e-02 0.198 0.0864 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0129 0.0963 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 5.35e-02 -0.196 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0557 0.0978 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0258 0.0753 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 2.32e-01 -0.104 0.0865 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 3.10e-01 0.0679 0.0668 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0506 0.0728 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0145 0.079 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 8.92e-02 -0.0936 0.0548 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 4.76e-02 0.158 0.0792 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.52e-01 -0.132 0.0917 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 4.75e-01 0.051 0.0713 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 2.06e-01 0.113 0.089 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 5.52e-01 0.0498 0.0835 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0705 0.0546 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 1.28e-02 0.234 0.093 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.05e-02 -0.231 0.0894 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0406 0.0874 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 1.25e-01 0.145 0.0941 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0616 0.0893 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000752 0.0801 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0134 0.0869 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 7.59e-02 -0.158 0.0885 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 8.66e-01 -0.012 0.0713 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 7.62e-01 0.0292 0.0964 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 8.94e-01 0.0128 0.0953 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.54e-03 -0.243 0.0796 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0136 0.101 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 5.09e-02 0.177 0.09 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0864 0.09 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 5.11e-01 0.0532 0.0809 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 8.33e-02 0.149 0.0855 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 1.51e-01 -0.134 0.0931 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 8.08e-02 -0.107 0.0612 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 2.60e-01 0.107 0.0948 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 7.77e-01 0.0276 0.0974 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0539 0.0873 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 7.05e-01 0.0343 0.0903 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0979 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0965 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.13e-01 -0.108 0.0864 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 6.49e-01 0.0431 0.0945 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 6.27e-02 0.181 0.0968 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0617 0.0923 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0798 0.0988 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 3.77e-01 0.0897 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0884 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 7.07e-01 0.0368 0.0978 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 8.49e-01 0.0182 0.0956 0.242 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 5.92e-01 0.05 0.0931 0.242 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0326 0.0826 0.242 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0986 0.242 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 5.06e-01 0.0673 0.101 0.242 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 5.33e-01 0.0524 0.0839 0.242 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 2.59e-01 -0.108 0.095 0.242 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 6.41e-01 0.0436 0.0933 0.242 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0934 0.0824 0.242 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 3.58e-01 0.0931 0.101 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 8.37e-01 0.0151 0.0733 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0666 0.0846 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 7.08e-01 0.0371 0.0989 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0243 0.0966 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 5.42e-01 0.0533 0.0873 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 8.29e-01 0.0199 0.0919 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 1.95e-01 -0.126 0.0967 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00626 0.0916 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 2.44e-01 -0.104 0.0892 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0638 0.0675 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0337 0.0939 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0614 0.0907 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 5.21e-03 -0.216 0.0764 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 1.67e-01 0.131 0.0941 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 5.43e-01 0.0647 0.106 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 4.33e-01 0.0739 0.0941 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.86e-01 -0.128 0.0962 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 4.85e-02 -0.153 0.0769 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0388 0.102 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0805 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0317 0.0964 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 7.46e-01 0.0322 0.099 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 8.78e-01 -0.015 0.0974 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0327 0.0919 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0991 0.0858 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0387 0.0653 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0676 0.091 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 7.01e-01 0.0352 0.0916 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0617 0.0721 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 3.39e-01 0.0899 0.0938 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 3.24e-01 0.1 0.101 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0391 0.0976 0.256 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.84e-01 0.1 0.0751 0.256 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0737 0.109 0.256 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 9.05e-01 0.015 0.125 0.256 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 3.43e-01 0.0729 0.0765 0.256 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0831 0.0883 0.256 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 2.47e-02 -0.2 0.088 0.256 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0188 0.104 0.256 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 1.59e-01 -0.135 0.0949 0.256 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 9.39e-03 0.227 0.086 0.256 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 9.77e-02 -0.111 0.0665 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 9.51e-02 -0.148 0.0881 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 7.50e-02 0.117 0.0651 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 2.58e-01 0.106 0.0934 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 7.89e-01 0.019 0.0709 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 8.49e-01 0.0147 0.077 0.243 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 3.15e-01 0.0664 0.0659 0.243 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0816 0.061 0.243 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0294 0.0669 0.243 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 6.16e-01 -0.048 0.0957 0.244 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.71e-01 -0.136 0.0992 0.244 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 7.39e-01 0.0291 0.087 0.244 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 1.01e-01 0.155 0.0942 0.244 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0636 0.0979 0.244 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 8.28e-01 0.0173 0.0796 0.244 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 3.26e-01 0.0888 0.0902 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0994 0.0879 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 4.71e-01 0.0821 0.114 0.229 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 2.98e-01 -0.107 0.103 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 9.86e-01 0.00184 0.107 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0459 0.1 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0119 0.0783 0.229 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0459 0.0956 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00698 0.0892 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 2.53e-01 0.101 0.0881 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0426 0.0666 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 7.05e-01 0.0335 0.0884 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 9.58e-02 -0.165 0.0988 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 1.27e-01 0.136 0.0886 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0972 0.0765 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000495 0.0655 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 7.11e-01 0.0266 0.0717 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 3.81e-01 0.0838 0.0954 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00387 0.0733 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 1.30e-01 -0.135 0.0886 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 8.48e-01 -0.02 0.104 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 9.27e-01 0.00894 0.0981 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0427 0.0907 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 7.49e-01 0.0227 0.0707 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 8.18e-02 0.154 0.088 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 6.90e-01 0.0473 0.118 0.233 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0403 0.111 0.233 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0516 0.0836 0.233 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 7.91e-01 0.0294 0.111 0.233 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0325 0.116 0.233 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.03e-01 -0.137 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 6.99e-02 -0.198 0.109 0.233 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 3.27e-01 0.106 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 9.96e-02 0.162 0.0979 0.233 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 6.88e-01 -0.039 0.0971 0.238 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 6.21e-01 -0.044 0.0888 0.238 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 6.89e-01 0.0417 0.104 0.238 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00715 0.0977 0.238 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 2.71e-01 0.111 0.101 0.238 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0194 0.0977 0.238 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0189 0.0854 0.238 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 5.86e-01 0.0516 0.0944 0.238 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 4.29e-01 0.0773 0.0976 0.242 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 9.52e-01 0.00541 0.0902 0.242 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 8.12e-02 0.188 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 6.54e-05 0.37 0.0907 0.242 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0548 0.0907 0.242 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0937 0.0871 0.242 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 9.13e-01 0.00893 0.0813 0.242 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 2.28e-01 0.102 0.0842 0.242 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 4.74e-01 0.0836 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.80e-01 -0.136 0.101 0.215 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 8.46e-01 0.0209 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 2.82e-01 0.115 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 4.43e-01 0.0865 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 7.09e-01 0.0367 0.0982 0.215 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0397 0.0759 0.215 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0484 0.0906 0.215 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00316 0.101 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 3.10e-01 0.0963 0.0946 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.71e-01 0.0683 0.0497 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 1.58e-01 0.111 0.0781 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 6.38e-01 0.038 0.0807 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 7.78e-02 0.161 0.0907 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 4.56e-02 -0.136 0.0676 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0533 0.0816 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0201 0.0941 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 7.27e-01 0.0344 0.0985 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00432 0.0977 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0909 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0209 0.045 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0673 0.0643 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 4.91e-01 0.0545 0.0789 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 1.70e-01 -0.124 0.0897 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.52e-03 -0.202 0.066 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0137 0.0707 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -289662 sc-eQTL 6.30e-02 -0.189 0.101 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 2.02e-01 -0.133 0.104 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -747775 sc-eQTL 9.81e-02 -0.156 0.094 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 1.09e-01 0.131 0.0813 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0314 0.0661 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0449 0.0851 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 2.78e-01 -0.109 0.1 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 3.03e-01 0.0886 0.0859 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0913 0.0747 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 7.75e-01 0.0176 0.0615 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 3.51e-01 0.0659 0.0705 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 7.52e-01 0.0299 0.0947 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 8.10e-01 0.0199 0.0828 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 2.28e-01 0.121 0.0999 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 7.44e-04 0.321 0.0938 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0041 0.0957 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0683 0.083 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 7.53e-01 0.0226 0.0717 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 876127 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0187 0.0875 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -670310 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000949 0.0875 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247137 sc-eQTL 1.50e-01 -0.123 0.085 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381149 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0666 0.0583 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 169705 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0917 0.0895 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 42038 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0669 0.0831 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -612339 sc-eQTL 8.50e-03 -0.176 0.0663 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -427770 sc-eQTL 9.65e-02 0.15 0.09 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -670375 sc-eQTL 3.38e-01 0.102 0.106 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -670310 2.77e-07 1.33e-07 4.48e-08 2.05e-07 9.25e-08 9.91e-08 1.67e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.52e-07 8.68e-08 1.79e-07 7.64e-08 6.12e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.33e-07 6.07e-08 4.3e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.44e-07 2.79e-08 1.63e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.2e-07 1.05e-07 1.02e-07 3.26e-08 4.02e-08 8.89e-08 3.46e-08 3.53e-08 5.42e-08 9.3e-08 6.76e-08 3.67e-08 5.44e-08 1.48e-07 5.27e-08 1.32e-08 4.7e-08 1.89e-08 1.22e-07 3.78e-09 4.9e-08