Genes within 1Mb (chr12:101449095:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 1.77e-01 0.0961 0.0709 0.241 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 7.02e-01 0.0166 0.0433 0.241 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0233 0.0626 0.241 B L1
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 5.99e-01 0.0375 0.0712 0.241 B L1
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 9.09e-01 0.00698 0.0612 0.241 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 7.82e-03 -0.129 0.0482 0.241 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0445 0.0555 0.241 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 5.07e-02 -0.172 0.0875 0.241 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0954 0.0843 0.241 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0896 0.0786 0.241 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 2.10e-01 0.0815 0.0648 0.241 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.82e-01 -0.117 0.0875 0.241 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 2.12e-01 0.076 0.0607 0.241 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 3.77e-01 0.0595 0.0672 0.241 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0241 0.0658 0.241 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 8.67e-02 -0.0788 0.0458 0.241 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 5.84e-02 0.151 0.0795 0.241 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 6.05e-02 -0.163 0.0862 0.241 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 7.65e-01 0.0171 0.057 0.241 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 1.13e-01 0.114 0.0716 0.241 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0533 0.0794 0.241 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 2.71e-03 -0.168 0.0552 0.241 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 4.85e-01 0.0565 0.0808 0.241 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 2.21e-02 0.207 0.0897 0.232 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0702 0.0829 0.232 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 2.18e-01 0.112 0.091 0.232 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0339 0.0979 0.232 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 1.69e-01 0.139 0.101 0.232 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0531 0.0871 0.232 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 6.69e-01 0.0308 0.072 0.232 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0405 0.0904 0.232 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0414 0.0949 0.232 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 8.91e-02 0.131 0.0765 0.241 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 8.23e-01 0.0146 0.0652 0.241 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 7.78e-01 0.023 0.0818 0.241 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 7.79e-01 0.0256 0.0912 0.241 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 7.57e-01 0.0261 0.0839 0.241 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0773 0.0737 0.241 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 6.52e-01 0.0272 0.0602 0.241 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 4.78e-01 0.0465 0.0654 0.241 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 6.24e-01 0.0407 0.0828 0.24 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0906 0.0767 0.24 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0589 0.0556 0.24 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0744 0.0896 0.24 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 6.11e-01 -0.042 0.0824 0.24 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 1.12e-02 -0.157 0.0612 0.24 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 1.14e-01 0.139 0.0879 0.24 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 6.35e-01 0.0493 0.104 0.24 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 8.74e-01 0.00928 0.0583 0.241 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0624 0.085 0.241 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00845 0.0614 0.241 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0574 0.0959 0.241 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 6.78e-01 0.0291 0.0699 0.241 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 9.68e-01 0.00253 0.0622 0.241 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 1.72e-01 -0.102 0.0742 0.241 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0373 0.0621 0.241 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 6.78e-01 -0.03 0.0722 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 1.00e+00 -2.26e-05 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 3.57e-02 0.157 0.074 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 1.63e-01 -0.148 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 8.21e-01 0.0234 0.103 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 1.69e-02 -0.252 0.105 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 9.55e-01 0.00579 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 2.62e-02 -0.225 0.1 0.253 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0877 0.0834 0.253 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 1.88e-01 -0.111 0.0838 0.253 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 5.03e-01 -0.053 0.079 0.253 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 2.81e-01 0.109 0.101 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 2.94e-01 0.057 0.0541 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 6.52e-02 0.147 0.0795 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 5.69e-01 0.0507 0.089 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 2.48e-02 0.224 0.0991 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0876 0.0826 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 2.08e-01 -0.112 0.0885 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0735 0.0933 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 9.56e-01 0.00544 0.0981 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0113 0.094 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 5.32e-01 0.061 0.0975 0.244 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.66e-01 0.0881 0.0634 0.244 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 9.58e-01 0.00462 0.0872 0.244 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 7.53e-01 0.0302 0.0957 0.244 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0116 0.0952 0.244 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 7.05e-02 -0.154 0.0845 0.244 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 7.40e-01 0.0297 0.0893 0.244 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 6.98e-01 0.0357 0.0919 0.244 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00601 0.094 0.244 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0255 0.0856 0.244 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 4.48e-01 0.072 0.0946 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 6.50e-01 0.0223 0.0492 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 4.26e-02 -0.141 0.069 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00559 0.0827 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0927 0.0921 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 4.09e-02 -0.142 0.0692 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 4.92e-01 -0.052 0.0756 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 6.74e-02 -0.188 0.102 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.0998 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 1.86e-01 -0.124 0.0934 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 6.70e-02 0.171 0.0928 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 5.22e-01 -0.032 0.05 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0314 0.0775 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 1.40e-01 0.133 0.0895 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.0984 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 9.06e-03 -0.223 0.0846 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 4.78e-01 0.0604 0.085 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0747 0.0895 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 9.92e-01 0.00101 0.103 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 1.34e-01 -0.133 0.0886 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 1.29e-01 0.152 0.0994 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0997 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 2.32e-02 0.198 0.0864 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0129 0.0963 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 5.35e-02 -0.196 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0557 0.0978 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0218 0.075 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 2.18e-01 -0.107 0.0862 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 2.84e-01 0.0715 0.0666 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0535 0.0726 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00447 0.0788 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0898 0.0547 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 3.52e-02 0.167 0.0788 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.42e-01 -0.135 0.0914 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 4.39e-01 0.0551 0.071 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 2.69e-01 0.0984 0.0888 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 6.24e-01 0.0409 0.0833 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0688 0.0545 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 9.46e-03 0.242 0.0925 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.43e-02 -0.22 0.0892 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 6.88e-01 -0.035 0.087 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 8.65e-02 0.161 0.0936 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0668 0.0889 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00966 0.0797 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0123 0.0868 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 8.10e-02 -0.155 0.0884 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0132 0.0712 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 7.63e-01 0.029 0.0963 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 8.94e-01 0.0127 0.0952 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 2.72e-03 -0.241 0.0795 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0103 0.101 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 4.92e-02 0.177 0.0896 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 3.22e-01 -0.089 0.0897 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 5.31e-01 0.0506 0.0806 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 1.53e-01 0.123 0.0854 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 2.22e-01 -0.114 0.0929 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 8.32e-02 -0.106 0.0609 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 2.46e-01 0.11 0.0944 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 7.77e-01 0.0276 0.0974 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0539 0.0873 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 7.05e-01 0.0343 0.0903 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0979 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0965 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 2.13e-01 -0.108 0.0864 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 6.49e-01 0.0431 0.0945 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 9.50e-02 0.163 0.0971 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 4.12e-01 -0.076 0.0924 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0933 0.0989 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 8.33e-01 0.0225 0.106 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 3.96e-01 0.0863 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 3.54e-01 0.0824 0.0887 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 7.13e-01 0.0361 0.098 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00526 0.0956 0.24 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 4.18e-01 0.0754 0.093 0.24 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0466 0.0825 0.24 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 1.18e-01 -0.154 0.0984 0.24 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 7.35e-01 0.0342 0.101 0.24 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 5.73e-01 0.0474 0.0839 0.24 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0993 0.095 0.24 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 6.03e-01 0.0485 0.0933 0.24 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0902 0.0824 0.24 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 4.24e-01 0.0809 0.101 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 7.30e-01 0.0253 0.0732 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0573 0.0846 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 6.03e-01 0.0515 0.0988 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0172 0.0966 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 5.87e-01 0.0474 0.0872 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 7.68e-01 0.0271 0.0918 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 2.25e-01 -0.118 0.0966 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00889 0.0913 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0961 0.089 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0539 0.0673 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0449 0.0936 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0462 0.0905 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 4.99e-03 -0.216 0.0761 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 1.51e-01 0.135 0.0937 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 5.52e-01 0.0632 0.106 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 4.66e-01 0.0688 0.0941 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 2.25e-01 -0.117 0.0963 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 4.10e-02 -0.158 0.0768 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0562 0.102 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0749 0.104 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0337 0.0963 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 7.34e-01 0.0337 0.099 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00593 0.0974 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0368 0.0917 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0905 0.0857 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0318 0.0652 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0557 0.0909 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 7.00e-01 0.0352 0.0915 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0714 0.0719 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 3.03e-01 0.0967 0.0936 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 3.90e-01 0.0871 0.101 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0371 0.0974 0.252 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 2.25e-01 0.0917 0.0751 0.252 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0695 0.108 0.252 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 9.57e-01 0.00678 0.125 0.252 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 2.78e-01 0.0831 0.0763 0.252 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0743 0.0882 0.252 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 2.80e-02 -0.196 0.0879 0.252 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0201 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 1.53e-01 -0.136 0.0947 0.252 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 1.09e-02 0.222 0.0859 0.252 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 8.68e-02 -0.114 0.0664 0.241 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 9.01e-02 -0.15 0.088 0.241 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 6.21e-02 0.122 0.065 0.241 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 2.90e-01 0.0991 0.0934 0.241 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 7.76e-01 0.0202 0.0708 0.241 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 7.97e-01 0.0198 0.077 0.241 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 3.06e-01 0.0675 0.0658 0.241 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0833 0.0609 0.241 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 6.76e-01 -0.028 0.0669 0.241 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0149 0.0957 0.241 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.75e-01 -0.135 0.0991 0.241 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 8.08e-01 0.0211 0.0869 0.241 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 1.18e-01 0.148 0.0942 0.241 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0425 0.0979 0.241 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 9.03e-01 0.00971 0.0796 0.241 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 3.26e-01 0.0888 0.0902 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0994 0.0879 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 4.71e-01 0.0821 0.114 0.229 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 2.98e-01 -0.107 0.103 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 9.86e-01 0.00184 0.107 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0459 0.1 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0119 0.0783 0.229 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0459 0.0956 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00698 0.0892 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 1.93e-01 0.114 0.0877 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0409 0.0664 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 7.80e-01 0.0247 0.0881 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 1.09e-01 -0.159 0.0985 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 1.35e-01 0.133 0.0883 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 1.44e-01 -0.112 0.0762 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00328 0.0653 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 7.38e-01 0.0239 0.0714 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 3.00e-01 0.0988 0.095 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 9.54e-01 0.00419 0.073 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 1.91e-01 -0.116 0.0885 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0315 0.104 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 9.72e-01 0.00347 0.0978 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0459 0.0903 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 8.91e-01 0.00964 0.0705 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 9.35e-02 0.148 0.0877 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 6.09e-01 0.0605 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0303 0.111 0.23 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0454 0.0834 0.23 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 7.46e-01 0.0358 0.11 0.23 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0335 0.116 0.23 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 2.20e-01 -0.132 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 7.45e-02 -0.195 0.108 0.23 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 4.72e-01 0.0775 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 8.21e-02 0.171 0.0975 0.23 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0452 0.0967 0.236 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0395 0.0885 0.236 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 8.00e-01 0.0264 0.104 0.236 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00197 0.0973 0.236 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 2.83e-01 0.108 0.1 0.236 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00423 0.0974 0.236 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0126 0.0851 0.236 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 4.71e-01 0.0679 0.0941 0.236 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 3.72e-01 0.087 0.0972 0.24 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 9.82e-01 0.00202 0.0899 0.24 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 4.85e-02 0.212 0.107 0.24 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 3.31e-05 0.383 0.0901 0.24 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0516 0.0904 0.24 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0938 0.0868 0.24 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00729 0.081 0.24 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 2.44e-01 0.098 0.0839 0.24 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 4.74e-01 0.0836 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.80e-01 -0.136 0.101 0.215 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 8.46e-01 0.0209 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 2.82e-01 0.115 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 4.43e-01 0.0865 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 7.09e-01 0.0367 0.0982 0.215 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0397 0.0759 0.215 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0484 0.0906 0.215 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00316 0.101 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 3.26e-01 0.0929 0.0945 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.91e-01 0.065 0.0496 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 1.92e-01 0.102 0.078 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 7.22e-01 0.0287 0.0806 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 9.09e-02 0.154 0.0905 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 4.99e-02 -0.133 0.0675 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0561 0.0814 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0219 0.0939 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 8.18e-01 0.0226 0.0983 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0146 0.0975 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 2.02e-01 0.116 0.0907 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0149 0.0449 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0683 0.0642 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 5.49e-01 0.0472 0.0787 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 1.82e-01 -0.12 0.0895 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 3.13e-03 -0.197 0.0659 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0207 0.0705 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -290377 sc-eQTL 4.99e-02 -0.199 0.101 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 2.02e-01 -0.132 0.103 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -748490 sc-eQTL 8.74e-02 -0.161 0.0937 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 6.83e-02 0.148 0.0809 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0263 0.0659 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0406 0.0848 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 2.61e-01 -0.113 0.1 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 3.33e-01 0.0831 0.0856 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 1.73e-01 -0.102 0.0744 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 8.59e-01 0.0109 0.0613 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 3.75e-01 0.0624 0.0702 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 7.29e-01 0.0327 0.0943 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 8.55e-01 0.0151 0.0824 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 2.59e-01 0.113 0.0995 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 3.95e-04 0.335 0.0931 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 9.42e-01 0.00691 0.0953 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0583 0.0827 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 8.73e-01 0.0115 0.0714 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 875412 sc-eQTL 9.89e-01 0.00123 0.0871 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -671025 sc-eQTL 9.98e-01 0.000252 0.0873 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -247852 sc-eQTL 1.90e-01 -0.112 0.0848 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -381864 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0606 0.0582 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 168990 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0941 0.0893 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 41323 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0533 0.083 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -613054 sc-eQTL 6.66e-03 -0.181 0.0661 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -428485 sc-eQTL 7.70e-02 0.159 0.0897 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -671090 sc-eQTL 3.48e-01 0.0997 0.106 0.239 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -671025 3.1e-07 1.53e-07 5.14e-08 2.05e-07 9.87e-08 8.45e-08 1.99e-07 5.66e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.62e-07 1.15e-07 1.95e-07 7.95e-08 5.72e-08 7.89e-08 4.18e-08 1.56e-07 6.32e-08 4.3e-08 1.26e-07 1.31e-07 1.62e-07 2.68e-08 1.85e-07 1.22e-07 1.18e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.03e-07 1.06e-07 2.9e-08 3.96e-08 8.7e-08 3.63e-08 3.28e-08 5.45e-08 9.3e-08 6.71e-08 4.19e-08 5.34e-08 1.59e-07 5.08e-08 1.28e-08 3.81e-08 1.92e-08 1.21e-07 3.79e-09 5.04e-08