Genes within 1Mb (chr12:101442642:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 1.87e-01 0.0938 0.0708 0.239 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 7.63e-01 0.013 0.0432 0.239 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00603 0.0625 0.239 B L1
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 5.85e-01 0.0388 0.071 0.239 B L1
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 9.66e-01 0.00264 0.0611 0.239 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 5.19e-03 -0.136 0.048 0.239 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0287 0.0554 0.239 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 4.59e-02 -0.175 0.0873 0.239 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0952 0.0842 0.239 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0822 0.0785 0.239 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 2.43e-01 0.0757 0.0646 0.239 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.66e-01 -0.121 0.0871 0.239 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 1.55e-01 0.0862 0.0604 0.239 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 4.12e-01 0.0551 0.067 0.239 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0244 0.0656 0.239 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 8.53e-02 -0.0789 0.0456 0.239 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 6.21e-02 0.149 0.0794 0.239 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 5.77e-02 -0.164 0.086 0.239 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 6.46e-01 0.0261 0.0569 0.239 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 1.24e-01 0.11 0.0715 0.239 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0511 0.0792 0.239 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 2.44e-03 -0.169 0.0551 0.239 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 4.20e-01 0.0651 0.0806 0.239 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 2.82e-02 0.199 0.0899 0.23 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0726 0.083 0.23 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 1.62e-01 0.128 0.091 0.23 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0311 0.098 0.23 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 1.64e-01 0.141 0.101 0.23 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0624 0.0872 0.23 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 6.46e-01 0.0331 0.072 0.23 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0285 0.0906 0.23 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0436 0.095 0.23 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 9.74e-02 0.127 0.0765 0.239 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 7.85e-01 0.0178 0.0652 0.239 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 7.84e-01 0.0224 0.0817 0.239 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 8.00e-01 0.0232 0.0912 0.239 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 6.99e-01 0.0325 0.0839 0.239 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0775 0.0736 0.239 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 5.59e-01 0.0352 0.0601 0.239 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 5.23e-01 0.0419 0.0654 0.239 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 6.64e-01 0.0359 0.0826 0.238 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0909 0.0764 0.238 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0606 0.0554 0.238 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0788 0.0893 0.238 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0388 0.0822 0.238 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 1.24e-02 -0.154 0.061 0.238 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 1.26e-01 0.135 0.0877 0.238 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 6.84e-01 0.0421 0.103 0.238 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 7.91e-01 0.0154 0.0582 0.239 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 4.51e-01 -0.064 0.0849 0.239 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0198 0.0613 0.239 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0686 0.0957 0.239 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 6.98e-01 0.0272 0.0698 0.239 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 7.59e-01 0.0191 0.062 0.239 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0913 0.0742 0.239 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0437 0.0619 0.239 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 5.61e-01 -0.042 0.072 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 9.17e-01 0.0106 0.102 0.25 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 3.46e-02 0.158 0.0741 0.25 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 1.62e-01 -0.149 0.106 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 8.49e-01 0.0197 0.103 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 1.74e-02 -0.252 0.105 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0094 0.102 0.25 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 2.83e-02 -0.222 0.101 0.25 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0839 0.0835 0.25 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 1.43e-01 -0.123 0.0838 0.25 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0713 0.079 0.25 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 2.60e-01 0.114 0.101 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 3.15e-01 0.0545 0.0541 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 4.49e-02 0.16 0.0794 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 5.43e-01 0.0542 0.089 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 2.11e-02 0.23 0.099 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0862 0.0826 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 2.20e-01 -0.109 0.0886 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0824 0.0933 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 9.85e-01 0.00189 0.0981 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00468 0.094 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 5.61e-01 0.0567 0.0974 0.241 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.86e-01 0.0841 0.0634 0.241 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 8.07e-01 0.0214 0.0872 0.241 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 7.90e-01 0.0255 0.0957 0.241 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0155 0.0952 0.241 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 6.13e-02 -0.159 0.0844 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 6.69e-01 0.0382 0.0892 0.241 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 7.74e-01 0.0264 0.0919 0.241 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00547 0.094 0.241 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0202 0.0856 0.241 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 4.54e-01 0.0708 0.0945 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 6.65e-01 0.0213 0.0491 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 8.12e-02 -0.121 0.069 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00861 0.0826 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 2.50e-01 -0.106 0.0919 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 3.36e-02 -0.148 0.069 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0382 0.0756 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 6.56e-02 -0.188 0.102 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0987 0.0997 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 1.94e-01 -0.121 0.0932 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 8.11e-02 0.163 0.0928 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0331 0.05 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0311 0.0775 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 1.56e-01 0.127 0.0895 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 3.09e-01 -0.101 0.0985 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 5.96e-03 -0.235 0.0844 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 4.45e-01 0.0651 0.085 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 3.84e-01 -0.078 0.0895 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00751 0.103 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 1.72e-01 -0.121 0.0887 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 1.20e-01 0.155 0.0995 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.90e-01 -0.131 0.0999 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 3.12e-02 0.188 0.0867 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0202 0.0965 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 6.92e-02 -0.185 0.101 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0684 0.0979 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0313 0.0747 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.96e-01 -0.111 0.0859 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 2.07e-01 0.0839 0.0662 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 4.16e-01 -0.059 0.0723 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00793 0.0785 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0894 0.0545 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 2.73e-02 0.174 0.0785 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.19e-01 -0.142 0.0911 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 3.98e-01 0.0599 0.0708 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 2.25e-01 0.108 0.0884 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 6.49e-01 0.0379 0.083 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 2.05e-01 -0.069 0.0543 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 1.12e-02 0.236 0.0922 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.49e-02 -0.218 0.0889 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0583 0.0867 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 7.00e-02 0.17 0.0932 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0634 0.0886 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0146 0.0795 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0176 0.0866 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 8.01e-02 -0.155 0.0882 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00636 0.0711 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 6.91e-01 0.0382 0.0961 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 8.41e-01 0.019 0.0951 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 2.07e-03 -0.247 0.0793 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 9.84e-01 0.00207 0.101 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 5.55e-02 0.172 0.0895 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0918 0.0895 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 4.59e-01 0.0597 0.0805 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 1.62e-01 0.12 0.0853 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 2.13e-01 -0.116 0.0927 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 8.19e-02 -0.106 0.0609 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 2.48e-01 0.109 0.0943 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 7.64e-01 0.0292 0.0971 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0465 0.087 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 7.06e-01 0.034 0.0901 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 1.22e-01 0.152 0.0977 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 2.81e-01 -0.104 0.0963 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 2.10e-01 -0.108 0.0861 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 5.73e-01 0.0531 0.0942 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 1.13e-01 0.154 0.0971 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0864 0.0922 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0799 0.0988 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 8.36e-01 0.022 0.106 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 3.79e-01 0.0894 0.101 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 3.31e-01 0.0862 0.0886 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 6.94e-01 0.0385 0.0979 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 9.38e-01 0.00744 0.0954 0.238 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 4.12e-01 0.0764 0.0928 0.238 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0563 0.0824 0.238 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 9.25e-02 -0.166 0.0982 0.238 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 8.03e-01 0.0252 0.101 0.238 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 5.08e-01 0.0555 0.0837 0.238 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 3.18e-01 -0.095 0.0949 0.238 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 6.56e-01 0.0415 0.0931 0.238 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 1.88e-01 -0.108 0.0821 0.238 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 4.83e-01 0.071 0.101 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 7.41e-01 0.0242 0.0732 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0603 0.0845 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 6.07e-01 0.0509 0.0987 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0213 0.0965 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 5.89e-01 0.0472 0.0872 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 7.87e-01 0.0248 0.0918 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 2.73e-01 -0.106 0.0966 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00172 0.091 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0942 0.0887 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0615 0.0671 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0582 0.0933 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0488 0.0903 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 4.39e-03 -0.219 0.0759 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 1.68e-01 0.129 0.0935 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 5.92e-01 0.0567 0.106 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 4.33e-01 0.0739 0.094 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 2.03e-01 -0.123 0.0962 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 4.02e-02 -0.159 0.0768 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0526 0.101 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 4.29e-01 -0.082 0.104 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0212 0.0963 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 7.86e-01 0.0269 0.0989 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0221 0.0973 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0438 0.0916 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 2.42e-01 -0.1 0.0854 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 7.13e-01 -0.024 0.0651 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0468 0.0907 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 6.46e-01 0.042 0.0913 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0688 0.0718 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 2.97e-01 0.0977 0.0934 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 4.20e-01 0.0816 0.101 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0647 0.098 0.248 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 2.09e-01 0.0956 0.0756 0.248 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0593 0.109 0.248 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 8.59e-01 0.0223 0.126 0.248 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 2.68e-01 0.0856 0.0768 0.248 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0922 0.0887 0.248 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 4.37e-02 -0.181 0.0888 0.248 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 8.49e-01 -0.02 0.105 0.248 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 1.86e-01 -0.127 0.0955 0.248 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 1.44e-02 0.216 0.0867 0.248 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 7.03e-02 -0.121 0.0664 0.239 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.12e-01 -0.141 0.0882 0.239 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 8.90e-02 0.111 0.0652 0.239 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 3.64e-01 0.0851 0.0935 0.239 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 8.19e-01 0.0163 0.0709 0.239 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 6.30e-01 0.0372 0.077 0.239 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 2.62e-01 0.0741 0.0659 0.239 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0917 0.0609 0.239 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0384 0.0669 0.239 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0102 0.0956 0.239 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.49e-01 -0.143 0.099 0.239 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 6.60e-01 0.0383 0.0869 0.239 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 1.40e-01 0.139 0.0942 0.239 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0383 0.0978 0.239 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 8.86e-01 0.0114 0.0795 0.239 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 4.18e-01 0.0733 0.0903 0.227 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 2.55e-01 -0.1 0.088 0.227 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 3.71e-01 0.102 0.114 0.227 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 3.21e-01 -0.103 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 8.52e-01 0.02 0.107 0.227 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0496 0.1 0.227 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0136 0.0783 0.227 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0299 0.0957 0.227 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0133 0.0893 0.227 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 1.75e-01 0.119 0.0877 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0402 0.0663 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 7.79e-01 0.0247 0.0881 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 8.35e-02 -0.171 0.0984 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 1.17e-01 0.139 0.0882 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 1.39e-01 -0.113 0.0761 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 9.95e-01 0.000422 0.0652 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 7.83e-01 0.0196 0.0714 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 3.44e-01 0.0902 0.095 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 8.49e-01 0.0139 0.073 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 1.83e-01 -0.118 0.0884 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0148 0.104 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 9.36e-01 0.00792 0.0978 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0581 0.0903 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 7.68e-01 0.0208 0.0704 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 1.14e-01 0.139 0.0878 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 6.09e-01 0.0605 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0303 0.111 0.23 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0454 0.0834 0.23 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 7.46e-01 0.0358 0.11 0.23 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0335 0.116 0.23 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 2.20e-01 -0.132 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 7.45e-02 -0.195 0.108 0.23 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 4.72e-01 0.0775 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 8.21e-02 0.171 0.0975 0.23 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0573 0.0968 0.233 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0409 0.0885 0.233 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 7.70e-01 0.0304 0.104 0.233 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 9.61e-01 0.0048 0.0974 0.233 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 3.28e-01 0.0985 0.101 0.233 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 9.60e-01 0.00491 0.0974 0.233 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0101 0.0851 0.233 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 4.20e-01 0.0761 0.0941 0.233 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 4.02e-01 0.0819 0.0975 0.238 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 8.82e-01 0.0134 0.0901 0.238 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 4.03e-02 0.221 0.107 0.238 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 6.81e-05 0.369 0.0907 0.238 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0419 0.0907 0.238 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0827 0.087 0.238 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0092 0.0812 0.238 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 2.88e-01 0.0897 0.0842 0.238 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 4.82e-01 0.0826 0.117 0.212 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.79e-01 -0.137 0.102 0.212 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 7.77e-01 0.0307 0.108 0.212 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 2.87e-01 0.115 0.107 0.212 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 4.72e-01 0.0816 0.113 0.212 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 7.95e-01 0.0257 0.0988 0.212 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0363 0.0763 0.212 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0577 0.0911 0.212 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00119 0.101 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 3.26e-01 0.0929 0.0944 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 2.22e-01 0.0608 0.0496 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 1.43e-01 0.114 0.0778 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 7.11e-01 0.0299 0.0805 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 8.78e-02 0.155 0.0905 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 4.42e-02 -0.136 0.0674 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0496 0.0814 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0323 0.0939 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 8.64e-01 0.0169 0.0983 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00813 0.0975 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0905 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0159 0.0448 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0507 0.0641 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 5.91e-01 0.0423 0.0786 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 1.49e-01 -0.129 0.0892 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 1.79e-03 -0.208 0.0657 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00581 0.0704 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -296830 sc-eQTL 4.65e-02 -0.202 0.101 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 2.17e-01 -0.128 0.103 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -754943 sc-eQTL 1.08e-01 -0.151 0.0937 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 6.87e-02 0.148 0.0809 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0214 0.0659 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 6.29e-01 -0.041 0.0848 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 2.48e-01 -0.116 0.1 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 2.93e-01 0.0901 0.0855 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 1.46e-01 -0.108 0.0743 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 7.59e-01 0.0188 0.0612 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 4.35e-01 0.055 0.0702 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 8.27e-01 0.0206 0.0944 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 8.01e-01 0.0209 0.0825 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 2.39e-01 0.117 0.0995 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 4.70e-04 0.331 0.0933 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 9.36e-01 0.00771 0.0954 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0464 0.0828 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 9.06e-01 0.0084 0.0714 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 868959 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00117 0.0872 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -677478 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00348 0.087 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -254305 sc-eQTL 1.73e-01 -0.116 0.0846 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -388317 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0615 0.058 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 162537 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0984 0.089 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 34870 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0502 0.0827 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -619507 sc-eQTL 6.80e-03 -0.18 0.0659 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -434938 sc-eQTL 8.41e-02 0.155 0.0894 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -677543 sc-eQTL 4.06e-01 0.088 0.106 0.237 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -677478 3.1e-07 1.53e-07 6.04e-08 2.07e-07 9.8e-08 8.21e-08 1.99e-07 5.85e-08 1.44e-07 6.75e-08 1.62e-07 1.2e-07 2.05e-07 8.13e-08 5.69e-08 7.98e-08 4.18e-08 1.72e-07 6.92e-08 4.95e-08 1.25e-07 1.39e-07 1.62e-07 3.22e-08 2.02e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.07e-07 1.09e-07 3.39e-08 3.13e-08 9.3e-08 3.02e-08 3.22e-08 5.58e-08 8.61e-08 6.58e-08 3.99e-08 5.42e-08 1.55e-07 5.08e-08 1.3e-08 3.41e-08 1.65e-08 8.81e-08 1.89e-09 4.8e-08