Genes within 1Mb (chr12:101404566:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0419 0.131 0.058 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 9.09e-01 0.00916 0.0799 0.058 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 4.42e-01 -0.089 0.115 0.058 B L1
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0158 0.131 0.058 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 2.50e-01 -0.13 0.113 0.058 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0823 0.0903 0.058 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0444 0.103 0.058 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 6.18e-01 0.0814 0.163 0.058 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 9.06e-01 0.0185 0.156 0.058 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 5.20e-01 0.0938 0.145 0.058 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.89e-02 0.21 0.119 0.058 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 1.22e-01 -0.249 0.161 0.058 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00225 0.112 0.058 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.124 0.058 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 7.98e-02 0.212 0.12 0.058 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 8.01e-02 -0.148 0.0841 0.058 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00156 0.149 0.058 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 2.91e-01 -0.17 0.161 0.058 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0374 0.106 0.058 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0605 0.133 0.058 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 1.03e-01 -0.239 0.146 0.058 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 2.58e-02 -0.232 0.103 0.058 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 4.73e-01 0.108 0.15 0.058 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0371 0.168 0.054 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 4.77e-01 -0.11 0.154 0.054 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 3.98e-01 0.143 0.169 0.054 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 7.50e-02 -0.323 0.18 0.054 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 2.09e-01 0.236 0.187 0.054 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 5.74e-01 0.0911 0.162 0.054 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0028 0.134 0.054 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0161 0.168 0.054 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0855 0.176 0.054 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 8.59e-01 0.0252 0.141 0.058 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0533 0.12 0.058 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 2.65e-01 0.167 0.15 0.058 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 3.84e-01 -0.146 0.167 0.058 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 5.24e-01 0.0982 0.154 0.058 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 2.59e-01 -0.153 0.135 0.058 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 1.20e-01 0.171 0.11 0.058 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 3.83e-01 0.105 0.12 0.058 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0258 0.15 0.058 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 2.74e-01 -0.152 0.139 0.058 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00927 0.101 0.058 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 5.71e-02 -0.309 0.161 0.058 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 1.73e-01 -0.204 0.149 0.058 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 6.86e-01 0.0457 0.113 0.058 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 9.59e-02 -0.267 0.159 0.058 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0368 0.188 0.058 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 1.95e-01 0.141 0.108 0.058 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 4.46e-01 -0.121 0.158 0.058 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 4.80e-01 0.0808 0.114 0.058 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 2.35e-01 -0.212 0.178 0.058 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 2.13e-01 0.162 0.13 0.058 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 9.53e-01 0.00687 0.116 0.058 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 7.80e-02 -0.244 0.138 0.058 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 7.91e-01 0.0307 0.116 0.058 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 2.48e-01 -0.155 0.134 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0237 0.182 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 1.72e-01 0.183 0.134 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0978 0.191 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 5.24e-01 -0.118 0.184 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 2.55e-01 -0.217 0.19 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 5.73e-01 0.103 0.182 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 2.83e-01 0.196 0.182 0.061 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 1.54e-01 -0.214 0.149 0.061 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 4.58e-01 -0.112 0.151 0.061 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00548 0.142 0.061 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 4.85e-01 -0.13 0.186 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 8.19e-01 0.0229 0.1 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0875 0.148 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 6.81e-01 0.0677 0.164 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 6.49e-01 0.0844 0.185 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0669 0.153 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 5.22e-01 -0.105 0.164 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 9.11e-01 0.0193 0.173 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 8.58e-01 0.0323 0.181 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 9.40e-01 0.0132 0.174 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 4.84e-01 -0.126 0.18 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 4.77e-01 0.0836 0.117 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 1.40e-01 -0.237 0.16 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00973 0.177 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 5.55e-01 -0.104 0.176 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 3.05e-01 0.161 0.157 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 8.38e-01 0.0337 0.165 0.058 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 3.30e-01 0.165 0.169 0.058 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 7.67e-01 0.0515 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 2.44e-01 0.184 0.158 0.058 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 9.32e-01 0.0145 0.171 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0848 0.0885 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 4.17e-01 0.102 0.125 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 8.71e-01 0.0243 0.149 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 1.73e-02 -0.394 0.164 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 4.04e-01 -0.105 0.126 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 4.92e-01 0.0939 0.136 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0632 0.185 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 7.68e-01 0.0533 0.18 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 4.33e-01 -0.133 0.169 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 6.93e-01 0.068 0.172 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 8.56e-01 0.0168 0.0922 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 3.65e-01 0.129 0.143 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 1.51e-01 0.238 0.165 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0124 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 1.45e-01 -0.23 0.158 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 4.35e-01 -0.123 0.157 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0262 0.165 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 1.82e-01 0.254 0.19 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00134 0.164 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.46e-01 0.0666 0.205 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 5.43e-01 0.125 0.205 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 2.01e-01 -0.229 0.179 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 7.66e-01 0.0589 0.197 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 2.47e-01 0.242 0.209 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0174 0.201 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 2.35e-01 0.162 0.136 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 1.29e-01 -0.238 0.156 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 3.18e-01 0.121 0.121 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 1.50e-01 -0.19 0.131 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 7.10e-02 0.258 0.142 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 5.82e-02 -0.189 0.0992 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 9.90e-01 0.00178 0.145 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 3.11e-02 -0.359 0.166 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 7.46e-01 -0.042 0.13 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 9.72e-01 0.00561 0.162 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0378 0.152 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 9.97e-01 0.000398 0.0996 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 1.44e-01 0.249 0.17 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 1.57e-01 -0.232 0.164 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 7.93e-01 0.0416 0.158 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 3.57e-02 -0.358 0.17 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 5.09e-01 0.107 0.162 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 3.34e-01 0.14 0.145 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0857 0.156 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 6.85e-02 -0.291 0.159 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 8.13e-01 0.0303 0.128 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 4.45e-01 -0.132 0.173 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0569 0.171 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 3.47e-01 -0.137 0.146 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 3.44e-01 0.172 0.181 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0384 0.164 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 2.07e-01 -0.206 0.163 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0017 0.147 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0651 0.156 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 1.43e-01 0.248 0.168 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 2.38e-01 -0.132 0.111 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 3.47e-01 -0.162 0.172 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 9.41e-01 0.0133 0.181 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 4.89e-01 0.112 0.162 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 4.01e-01 -0.141 0.168 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 2.56e-01 0.208 0.183 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00721 0.18 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0439 0.161 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 2.16e-01 0.217 0.175 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00967 0.177 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0438 0.168 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 3.02e-02 -0.388 0.178 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0694 0.193 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 2.00e-01 -0.236 0.184 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 5.08e-01 -0.107 0.161 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0967 0.178 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 3.89e-02 0.384 0.185 0.058 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0142 0.182 0.058 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0198 0.161 0.058 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 1.68e-01 -0.266 0.192 0.058 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 5.84e-01 0.108 0.197 0.058 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 4.73e-01 -0.118 0.164 0.058 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 1.06e-01 -0.3 0.185 0.058 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 2.76e-01 0.199 0.182 0.058 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 9.12e-02 -0.272 0.16 0.058 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 5.54e-01 0.112 0.19 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 4.30e-01 -0.108 0.137 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 8.60e-01 -0.028 0.159 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 7.97e-01 0.0476 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 7.69e-02 -0.319 0.18 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 7.64e-03 0.433 0.161 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 4.82e-01 0.121 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 1.86e-01 0.24 0.181 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.68e-01 0.049 0.166 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 1.18e-01 -0.253 0.161 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0077 0.122 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 4.90e-03 -0.474 0.167 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 4.75e-01 0.118 0.164 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 4.38e-01 -0.109 0.141 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 1.68e-01 -0.236 0.17 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 3.89e-01 0.166 0.192 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.87e-01 0.0463 0.171 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 4.67e-01 -0.128 0.175 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 8.67e-01 0.0236 0.141 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0363 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 5.79e-01 -0.105 0.188 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0703 0.175 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 2.36e-01 -0.213 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 2.34e-01 0.211 0.176 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0518 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 8.03e-01 0.0388 0.156 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0412 0.118 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 3.06e-01 -0.169 0.165 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 3.74e-02 -0.344 0.164 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 4.76e-01 0.0932 0.131 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 5.33e-02 -0.328 0.169 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 5.56e-02 -0.351 0.182 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0693 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 3.39e-01 0.117 0.122 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0628 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0723 0.201 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 2.02e-01 0.158 0.123 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 2.68e-01 0.158 0.142 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 4.18e-01 -0.117 0.145 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00806 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0761 0.154 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 1.72e-01 0.195 0.142 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 3.13e-01 -0.135 0.133 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 9.94e-01 0.00126 0.177 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 1.61e-01 0.184 0.131 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 3.29e-01 -0.183 0.187 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 7.50e-01 0.0452 0.142 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 9.05e-01 0.0185 0.154 0.054 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 7.24e-01 0.0466 0.132 0.054 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0359 0.122 0.054 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0985 0.134 0.054 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 5.70e-01 0.0989 0.174 0.058 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 5.73e-02 -0.343 0.18 0.058 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.158 0.058 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00853 0.172 0.058 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 4.95e-01 0.122 0.178 0.058 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 2.64e-02 -0.32 0.143 0.058 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 1.29e-01 0.246 0.161 0.056 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 9.89e-01 0.00223 0.158 0.056 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 2.70e-01 0.225 0.203 0.056 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0188 0.185 0.056 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 2.75e-01 0.209 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 3.80e-01 0.158 0.18 0.056 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00876 0.14 0.056 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0856 0.171 0.056 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0285 0.16 0.056 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.94e-01 0.042 0.161 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 8.44e-01 0.0239 0.121 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 5.91e-01 0.0866 0.161 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 8.19e-02 -0.314 0.18 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0704 0.162 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 1.93e-01 -0.182 0.139 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 6.51e-01 0.054 0.119 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0124 0.131 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000593 0.176 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0683 0.135 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 4.65e-01 0.12 0.164 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0555 0.192 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 7.64e-01 0.0541 0.18 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 2.56e-01 -0.189 0.166 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 1.32e-01 0.195 0.129 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 1.79e-01 0.219 0.162 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 2.85e-01 0.25 0.233 0.052 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 9.25e-02 -0.368 0.217 0.052 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 2.40e-01 -0.194 0.164 0.052 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 3.00e-01 0.226 0.217 0.052 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 7.28e-01 0.0798 0.228 0.052 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 5.12e-01 0.14 0.213 0.052 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 4.27e-01 -0.172 0.216 0.052 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 4.56e-01 0.159 0.212 0.052 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00593 0.195 0.052 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 3.91e-01 -0.147 0.171 0.058 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 1.86e-01 -0.207 0.156 0.058 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 8.01e-01 0.0465 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 1.11e-01 -0.274 0.171 0.058 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 6.92e-01 0.0708 0.178 0.058 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 2.94e-01 0.181 0.172 0.058 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 7.58e-02 0.267 0.15 0.058 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 4.12e-01 0.137 0.167 0.058 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0431 0.178 0.057 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 5.60e-01 -0.096 0.164 0.057 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 6.78e-01 0.0817 0.197 0.057 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 1.60e-01 0.242 0.171 0.057 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 4.51e-01 -0.125 0.165 0.057 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 5.72e-01 0.0901 0.159 0.057 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 1.81e-02 0.348 0.146 0.057 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 1.70e-01 0.211 0.153 0.057 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.74e-03 -0.542 0.201 0.054 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 2.84e-01 -0.192 0.178 0.054 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0554 0.189 0.054 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 3.05e-02 -0.406 0.186 0.054 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 3.54e-01 0.184 0.198 0.054 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0916 0.173 0.054 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 8.96e-01 0.0175 0.134 0.054 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0119 0.16 0.054 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 1.74e-01 -0.241 0.177 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 5.31e-01 -0.109 0.174 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 2.34e-01 0.109 0.0913 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 1.95e-01 -0.186 0.143 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0325 0.148 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0698 0.168 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 6.71e-01 0.0532 0.125 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 8.62e-01 -0.026 0.15 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 8.09e-01 0.0417 0.173 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 7.80e-01 0.0505 0.181 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 4.54e-01 0.134 0.179 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.74e-01 0.0473 0.164 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0142 0.0811 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 5.86e-01 0.0633 0.116 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 5.95e-01 0.0757 0.142 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 9.23e-02 -0.272 0.161 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 1.79e-01 -0.163 0.121 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00119 0.127 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -334906 sc-eQTL 5.29e-01 -0.116 0.184 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 4.73e-01 0.134 0.187 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -793019 sc-eQTL 3.96e-01 -0.145 0.17 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 7.01e-01 0.0574 0.149 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 8.38e-01 0.0247 0.121 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 3.41e-01 0.148 0.155 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 2.46e-01 -0.213 0.183 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0189 0.157 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 1.20e-01 -0.212 0.136 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 1.26e-01 0.171 0.112 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 4.93e-01 0.0884 0.129 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0664 0.17 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 1.49e-01 -0.214 0.148 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 5.50e-01 0.107 0.18 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0249 0.173 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 8.16e-01 0.04 0.172 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 2.62e-01 0.167 0.149 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 3.34e-02 0.272 0.127 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 830883 sc-eQTL 2.32e-01 0.187 0.156 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -715554 sc-eQTL 8.94e-01 0.0211 0.158 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 sc-eQTL 3.33e-01 -0.15 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -426393 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0271 0.106 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 124461 sc-eQTL 1.68e-02 -0.386 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -3206 sc-eQTL 3.09e-01 -0.153 0.15 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -657583 sc-eQTL 9.28e-01 -0.011 0.122 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -473014 sc-eQTL 2.00e-02 -0.379 0.162 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -715619 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0416 0.193 0.058 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -292381 eQTL 3.82e-03 -0.125 0.043 0.0 0.0 0.0829
ENSG00000120800 UTP20 124461 eQTL 0.0261 0.0434 0.0195 0.0013 0.0 0.0829
ENSG00000120805 ARL1 -3206 eQTL 0.00865 -0.0682 0.0259 0.00112 0.0 0.0829


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120800 UTP20 124461 7.78e-06 9.95e-06 1.3e-06 7.37e-06 2.22e-06 4.55e-06 1.08e-05 1.92e-06 8.69e-06 4.99e-06 1.23e-05 5.56e-06 1.3e-05 4.19e-06 2.55e-06 6.6e-06 3.83e-06 6.15e-06 2.61e-06 2.73e-06 4.24e-06 7.92e-06 7.55e-06 3.21e-06 1.71e-05 2.84e-06 5.21e-06 3.97e-06 8.33e-06 7.87e-06 4.94e-06 9.67e-07 8.87e-07 3.12e-06 5.01e-06 2.07e-06 1.72e-06 1.56e-06 1.76e-06 1.26e-06 8.78e-07 1.24e-05 1.38e-06 1.33e-07 7.83e-07 1.8e-06 1.4e-06 7.75e-07 6.14e-07
ENSG00000120860 \N -657583 1.17e-06 8.16e-07 2.7e-07 1.15e-06 1.07e-07 4.76e-07 7.54e-07 1.59e-07 6.71e-07 2.98e-07 1.09e-06 5.22e-07 1.43e-06 2.68e-07 3.72e-07 2.84e-07 6.15e-07 4.25e-07 3.56e-07 6.84e-07 2.43e-07 5.17e-07 5.21e-07 3.09e-07 1.7e-06 2.68e-07 5.24e-07 4.59e-07 5.42e-07 8.63e-07 3.93e-07 1.59e-07 1.49e-07 5.78e-07 5.38e-07 1.8e-07 5.12e-07 1.61e-07 2.9e-07 3.2e-07 2.82e-07 1.02e-06 7.66e-08 3.36e-08 1.61e-07 1.26e-07 2.41e-07 3.8e-08 5.94e-08