logo

Genes within 1Mb (chr12:101375489:AGGATCATCTG:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0419 0.131 0.058 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 9.09e-01 0.00916 0.0799 0.058 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 4.42e-01 -0.089 0.115 0.058 B L1
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0158 0.131 0.058 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 2.50e-01 -0.13 0.113 0.058 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0823 0.0903 0.058 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0444 0.103 0.058 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 6.18e-01 0.0814 0.163 0.058 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 9.06e-01 0.0185 0.156 0.058 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 5.20e-01 0.0938 0.145 0.058 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.89e-02 0.21 0.119 0.058 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 1.22e-01 -0.249 0.161 0.058 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00225 0.112 0.058 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 3.68e-01 -0.111 0.124 0.058 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 7.98e-02 0.212 0.12 0.058 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 8.01e-02 -0.148 0.0841 0.058 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00156 0.149 0.058 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 2.91e-01 -0.17 0.161 0.058 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0374 0.106 0.058 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0605 0.133 0.058 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 1.03e-01 -0.239 0.146 0.058 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 2.58e-02 -0.232 0.103 0.058 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 4.73e-01 0.108 0.15 0.058 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0371 0.168 0.054 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 4.77e-01 -0.11 0.154 0.054 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 3.98e-01 0.143 0.169 0.054 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 7.50e-02 -0.323 0.18 0.054 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 2.09e-01 0.236 0.187 0.054 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 5.74e-01 0.0911 0.162 0.054 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0028 0.134 0.054 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0161 0.168 0.054 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0855 0.176 0.054 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 8.59e-01 0.0252 0.141 0.058 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0533 0.12 0.058 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 2.65e-01 0.167 0.15 0.058 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 3.84e-01 -0.146 0.167 0.058 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 5.24e-01 0.0982 0.154 0.058 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 2.59e-01 -0.153 0.135 0.058 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 1.20e-01 0.171 0.11 0.058 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 3.83e-01 0.105 0.12 0.058 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0258 0.15 0.058 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 2.74e-01 -0.152 0.139 0.058 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00927 0.101 0.058 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 5.71e-02 -0.309 0.161 0.058 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 1.73e-01 -0.204 0.149 0.058 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 6.86e-01 0.0457 0.113 0.058 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 9.59e-02 -0.267 0.159 0.058 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0368 0.188 0.058 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 1.95e-01 0.141 0.108 0.058 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 4.46e-01 -0.121 0.158 0.058 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 4.80e-01 0.0808 0.114 0.058 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 2.35e-01 -0.212 0.178 0.058 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 2.13e-01 0.162 0.13 0.058 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 9.53e-01 0.00687 0.116 0.058 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 7.80e-02 -0.244 0.138 0.058 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 7.91e-01 0.0307 0.116 0.058 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 2.48e-01 -0.155 0.134 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0237 0.182 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 1.72e-01 0.183 0.134 0.061 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0978 0.191 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 5.24e-01 -0.118 0.184 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 2.55e-01 -0.217 0.19 0.061 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 5.73e-01 0.103 0.182 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 2.83e-01 0.196 0.182 0.061 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 1.54e-01 -0.214 0.149 0.061 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 4.58e-01 -0.112 0.151 0.061 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00548 0.142 0.061 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 4.85e-01 -0.13 0.186 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 8.19e-01 0.0229 0.1 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0875 0.148 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 6.81e-01 0.0677 0.164 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 6.49e-01 0.0844 0.185 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0669 0.153 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 5.22e-01 -0.105 0.164 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 9.11e-01 0.0193 0.173 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 8.58e-01 0.0323 0.181 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 9.40e-01 0.0132 0.174 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 4.84e-01 -0.126 0.18 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 4.77e-01 0.0836 0.117 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 1.40e-01 -0.237 0.16 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00973 0.177 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 5.55e-01 -0.104 0.176 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 3.05e-01 0.161 0.157 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 8.38e-01 0.0337 0.165 0.058 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 3.30e-01 0.165 0.169 0.058 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 7.67e-01 0.0515 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 2.44e-01 0.184 0.158 0.058 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 9.32e-01 0.0145 0.171 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0848 0.0885 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 4.17e-01 0.102 0.125 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 8.71e-01 0.0243 0.149 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 1.73e-02 -0.394 0.164 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 4.04e-01 -0.105 0.126 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 4.92e-01 0.0939 0.136 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0632 0.185 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 7.68e-01 0.0533 0.18 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 4.33e-01 -0.133 0.169 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 6.93e-01 0.068 0.172 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 8.56e-01 0.0168 0.0922 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 3.65e-01 0.129 0.143 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 1.51e-01 0.238 0.165 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0124 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 1.45e-01 -0.23 0.158 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 4.35e-01 -0.123 0.157 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0262 0.165 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 1.82e-01 0.254 0.19 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00134 0.164 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.46e-01 0.0666 0.205 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 5.43e-01 0.125 0.205 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 2.01e-01 -0.229 0.179 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 7.66e-01 0.0589 0.197 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 2.47e-01 0.242 0.209 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0174 0.201 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 2.35e-01 0.162 0.136 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 1.29e-01 -0.238 0.156 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 3.18e-01 0.121 0.121 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 1.50e-01 -0.19 0.131 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 7.10e-02 0.258 0.142 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 5.82e-02 -0.189 0.0992 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 9.90e-01 0.00178 0.145 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 3.11e-02 -0.359 0.166 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 7.46e-01 -0.042 0.13 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 9.72e-01 0.00561 0.162 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0378 0.152 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 9.97e-01 0.000398 0.0996 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 1.44e-01 0.249 0.17 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 1.57e-01 -0.232 0.164 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 7.93e-01 0.0416 0.158 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 3.57e-02 -0.358 0.17 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 5.09e-01 0.107 0.162 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 3.34e-01 0.14 0.145 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0857 0.156 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 6.85e-02 -0.291 0.159 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 8.13e-01 0.0303 0.128 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 4.45e-01 -0.132 0.173 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0569 0.171 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 3.47e-01 -0.137 0.146 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 3.44e-01 0.172 0.181 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0384 0.164 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 2.07e-01 -0.206 0.163 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0017 0.147 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0651 0.156 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 1.43e-01 0.248 0.168 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 2.38e-01 -0.132 0.111 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 3.47e-01 -0.162 0.172 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 9.41e-01 0.0133 0.181 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 4.89e-01 0.112 0.162 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 4.01e-01 -0.141 0.168 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 2.56e-01 0.208 0.183 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00721 0.18 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0439 0.161 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 2.16e-01 0.217 0.175 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00967 0.177 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0438 0.168 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 3.02e-02 -0.388 0.178 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0694 0.193 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 2.00e-01 -0.236 0.184 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 5.08e-01 -0.107 0.161 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0967 0.178 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 3.89e-02 0.384 0.185 0.058 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0142 0.182 0.058 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0198 0.161 0.058 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 1.68e-01 -0.266 0.192 0.058 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 5.84e-01 0.108 0.197 0.058 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 4.73e-01 -0.118 0.164 0.058 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 1.06e-01 -0.3 0.185 0.058 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 2.76e-01 0.199 0.182 0.058 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 9.12e-02 -0.272 0.16 0.058 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 5.54e-01 0.112 0.19 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 4.30e-01 -0.108 0.137 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 8.60e-01 -0.028 0.159 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 7.97e-01 0.0476 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 7.69e-02 -0.319 0.18 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 7.64e-03 0.433 0.161 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 4.82e-01 0.121 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 1.86e-01 0.24 0.181 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.68e-01 0.049 0.166 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 1.18e-01 -0.253 0.161 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0077 0.122 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 4.90e-03 -0.474 0.167 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 4.75e-01 0.118 0.164 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 4.38e-01 -0.109 0.141 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 1.68e-01 -0.236 0.17 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 3.89e-01 0.166 0.192 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.87e-01 0.0463 0.171 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 4.67e-01 -0.128 0.175 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 8.67e-01 0.0236 0.141 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0363 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 5.79e-01 -0.105 0.188 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0703 0.175 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 2.36e-01 -0.213 0.179 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 2.34e-01 0.211 0.176 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0518 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 8.03e-01 0.0388 0.156 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0412 0.118 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 3.06e-01 -0.169 0.165 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 3.74e-02 -0.344 0.164 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 4.76e-01 0.0932 0.131 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 5.33e-02 -0.328 0.169 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 5.56e-02 -0.351 0.182 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0693 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 3.39e-01 0.117 0.122 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0628 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0723 0.201 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 2.02e-01 0.158 0.123 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 2.68e-01 0.158 0.142 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 4.18e-01 -0.117 0.145 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00806 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0761 0.154 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 1.72e-01 0.195 0.142 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 3.13e-01 -0.135 0.133 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 9.94e-01 0.00126 0.177 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 1.61e-01 0.184 0.131 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 3.29e-01 -0.183 0.187 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 7.50e-01 0.0452 0.142 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 9.05e-01 0.0185 0.154 0.054 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 7.24e-01 0.0466 0.132 0.054 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0359 0.122 0.054 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0985 0.134 0.054 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 5.70e-01 0.0989 0.174 0.058 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 5.73e-02 -0.343 0.18 0.058 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.158 0.058 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00853 0.172 0.058 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 4.95e-01 0.122 0.178 0.058 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 2.64e-02 -0.32 0.143 0.058 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 1.29e-01 0.246 0.161 0.056 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 9.89e-01 0.00223 0.158 0.056 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 2.70e-01 0.225 0.203 0.056 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0188 0.185 0.056 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 2.75e-01 0.209 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 3.80e-01 0.158 0.18 0.056 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00876 0.14 0.056 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0856 0.171 0.056 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0285 0.16 0.056 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.94e-01 0.042 0.161 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 8.44e-01 0.0239 0.121 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 5.91e-01 0.0866 0.161 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 8.19e-02 -0.314 0.18 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0704 0.162 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 1.93e-01 -0.182 0.139 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 6.51e-01 0.054 0.119 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0124 0.131 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000593 0.176 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0683 0.135 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 4.65e-01 0.12 0.164 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0555 0.192 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 7.64e-01 0.0541 0.18 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 2.56e-01 -0.189 0.166 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 1.32e-01 0.195 0.129 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 1.79e-01 0.219 0.162 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 2.85e-01 0.25 0.233 0.052 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 9.25e-02 -0.368 0.217 0.052 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 2.40e-01 -0.194 0.164 0.052 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 3.00e-01 0.226 0.217 0.052 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 7.28e-01 0.0798 0.228 0.052 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 5.12e-01 0.14 0.213 0.052 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 4.27e-01 -0.172 0.216 0.052 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 4.56e-01 0.159 0.212 0.052 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00593 0.195 0.052 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 3.91e-01 -0.147 0.171 0.058 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 1.86e-01 -0.207 0.156 0.058 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 8.01e-01 0.0465 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 1.11e-01 -0.274 0.171 0.058 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 6.92e-01 0.0708 0.178 0.058 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 2.94e-01 0.181 0.172 0.058 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 7.58e-02 0.267 0.15 0.058 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 4.12e-01 0.137 0.167 0.058 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0431 0.178 0.057 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 5.60e-01 -0.096 0.164 0.057 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 6.78e-01 0.0817 0.197 0.057 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 1.60e-01 0.242 0.171 0.057 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 4.51e-01 -0.125 0.165 0.057 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 5.72e-01 0.0901 0.159 0.057 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 1.81e-02 0.348 0.146 0.057 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 1.70e-01 0.211 0.153 0.057 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.74e-03 -0.542 0.201 0.054 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 2.84e-01 -0.192 0.178 0.054 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0554 0.189 0.054 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 3.05e-02 -0.406 0.186 0.054 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 3.54e-01 0.184 0.198 0.054 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0916 0.173 0.054 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 8.96e-01 0.0175 0.134 0.054 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0119 0.16 0.054 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 1.74e-01 -0.241 0.177 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 5.31e-01 -0.109 0.174 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 2.34e-01 0.109 0.0913 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 1.95e-01 -0.186 0.143 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0325 0.148 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0698 0.168 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 6.71e-01 0.0532 0.125 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 8.62e-01 -0.026 0.15 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 8.09e-01 0.0417 0.173 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 7.80e-01 0.0505 0.181 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 4.54e-01 0.134 0.179 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.74e-01 0.0473 0.164 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0142 0.0811 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 5.86e-01 0.0633 0.116 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 5.95e-01 0.0757 0.142 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 9.23e-02 -0.272 0.161 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 1.79e-01 -0.163 0.121 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00119 0.127 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -363983 sc-eQTL 5.29e-01 -0.116 0.184 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 4.73e-01 0.134 0.187 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -822096 sc-eQTL 3.96e-01 -0.145 0.17 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 7.01e-01 0.0574 0.149 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 8.38e-01 0.0247 0.121 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 3.41e-01 0.148 0.155 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 2.46e-01 -0.213 0.183 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0189 0.157 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 1.20e-01 -0.212 0.136 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 1.26e-01 0.171 0.112 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 4.93e-01 0.0884 0.129 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0664 0.17 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 1.49e-01 -0.214 0.148 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 5.50e-01 0.107 0.18 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0249 0.173 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 8.16e-01 0.04 0.172 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 2.62e-01 0.167 0.149 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 3.34e-02 0.272 0.127 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 801806 sc-eQTL 2.32e-01 0.187 0.156 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -744631 sc-eQTL 8.94e-01 0.0211 0.158 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 sc-eQTL 3.33e-01 -0.15 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -455470 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0271 0.106 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 95384 sc-eQTL 1.68e-02 -0.386 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -32283 sc-eQTL 3.09e-01 -0.153 0.15 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -686660 sc-eQTL 9.28e-01 -0.011 0.122 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -502091 sc-eQTL 2.00e-02 -0.379 0.162 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -744696 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0416 0.193 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -321458 eQTL 8.49e-03 -0.114 0.0433 0.0 0.0 0.0819
ENSG00000120800 UTP20 95384 eQTL 0.0435 0.0396 0.0196 0.00106 0.0 0.0819
ENSG00000120805 ARL1 -32283 eQTL 0.0086 -0.0687 0.0261 0.00117 0.0 0.0819

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120800 UTP20 95384 4.97e-05 4.57e-05 7.19e-06 1.6e-05 7.81e-06 2.03e-05 4.83e-05 5.02e-06 3.53e-05 1.47e-05 4.8e-05 2.29e-05 5.93e-05 1.54e-05 6.69e-06 2.25e-05 2.22e-05 2.97e-05 1e-05 8.89e-06 1.65e-05 3.99e-05 3.77e-05 9.45e-06 5.22e-05 1.32e-05 1.65e-05 1.61e-05 4.02e-05 2.53e-05 2.44e-05 2.5e-06 3.57e-06 8.1e-06 1.25e-05 6.56e-06 4.14e-06 3.54e-06 6.54e-06 3.57e-06 2.08e-06 4.66e-05 4.22e-06 4.09e-07 2.59e-06 5.22e-06 5.62e-06 2.54e-06 1.47e-06
ENSG00000120860 \N -686660 9.29e-06 9.23e-06 3.68e-06 4.92e-06 2.42e-06 4.23e-06 9.62e-06 1.29e-06 7.75e-06 4.12e-06 8.89e-06 5.74e-06 1.14e-05 2.5e-06 1.2e-06 5.94e-06 2.99e-06 7.69e-06 3.04e-06 2.8e-06 6.39e-06 9.58e-06 7.98e-06 1.95e-06 1.25e-05 4.29e-06 4.22e-06 4.49e-06 8.25e-06 6.28e-06 4.3e-06 1.07e-06 8e-07 3.24e-06 3.31e-06 2.68e-06 1.91e-06 2.35e-06 1.99e-06 8.61e-07 1.55e-06 8.98e-06 2.34e-06 3.6e-07 5.77e-07 2.74e-06 1.26e-06 8.56e-07 8.17e-07