logo

Genes within 1Mb (chr12:101289246:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0541 0.128 0.062 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 9.39e-01 0.00594 0.0775 0.062 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 3.57e-01 -0.103 0.112 0.062 B L1
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0403 0.128 0.062 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 2.78e-01 -0.119 0.109 0.062 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 2.24e-01 -0.107 0.0875 0.062 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00593 0.0995 0.062 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 5.78e-01 0.088 0.158 0.062 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 9.24e-01 0.0145 0.151 0.062 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 5.43e-01 0.086 0.141 0.062 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.84e-02 0.202 0.114 0.062 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 1.19e-01 -0.242 0.154 0.062 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.42e-01 0.00784 0.108 0.062 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0753 0.119 0.062 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 2.57e-01 0.132 0.116 0.062 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 1.50e-01 -0.117 0.0811 0.062 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 8.86e-01 0.0206 0.143 0.062 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 2.89e-01 -0.165 0.155 0.062 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00011 0.102 0.062 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0156 0.129 0.062 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 1.46e-01 -0.206 0.141 0.062 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 4.57e-02 -0.201 0.1 0.062 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0106 0.145 0.062 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0582 0.16 0.061 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 4.75e-01 -0.105 0.146 0.061 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 4.57e-01 0.12 0.161 0.061 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 3.78e-02 -0.357 0.171 0.061 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 1.44e-01 0.261 0.178 0.061 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 5.73e-01 0.0869 0.154 0.061 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000356 0.127 0.061 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 6.16e-01 0.0801 0.16 0.061 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 4.66e-01 -0.122 0.167 0.061 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.05e-01 0.0516 0.136 0.062 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0793 0.115 0.062 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 1.48e-01 0.209 0.144 0.062 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 5.04e-01 -0.108 0.161 0.062 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 5.19e-01 0.0957 0.148 0.062 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 4.42e-01 -0.1 0.13 0.062 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 8.89e-02 0.181 0.106 0.062 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 2.81e-01 0.125 0.115 0.062 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0867 0.145 0.062 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 2.79e-01 -0.146 0.134 0.062 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 8.96e-01 0.0128 0.0976 0.062 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 8.42e-02 -0.271 0.156 0.062 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 7.08e-01 -0.054 0.144 0.062 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 7.33e-01 0.0372 0.109 0.062 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 2.38e-01 -0.183 0.154 0.062 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 9.94e-01 0.00135 0.182 0.062 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 2.29e-01 0.127 0.105 0.062 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 2.89e-01 -0.163 0.154 0.062 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 3.06e-01 0.114 0.111 0.062 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 3.74e-01 -0.155 0.173 0.062 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 1.39e-01 0.187 0.126 0.062 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 8.46e-01 0.0219 0.113 0.062 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.43e-02 -0.225 0.134 0.062 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0855 0.112 0.062 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 3.17e-01 -0.131 0.131 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 8.92e-01 0.0238 0.175 0.066 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 4.77e-01 0.092 0.129 0.066 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 5.18e-01 -0.119 0.184 0.066 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 4.24e-01 -0.142 0.177 0.066 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 1.72e-01 -0.25 0.183 0.066 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 4.04e-01 0.146 0.175 0.066 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 3.70e-01 0.158 0.175 0.066 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 1.38e-01 -0.214 0.143 0.066 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 1.90e-01 -0.19 0.145 0.066 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 3.55e-01 -0.126 0.136 0.066 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0684 0.181 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00514 0.0972 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 2.01e-01 -0.184 0.143 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00523 0.16 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 5.66e-01 0.103 0.18 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 4.65e-01 -0.109 0.148 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00124 0.159 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 8.86e-01 0.0241 0.168 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 4.13e-01 0.144 0.176 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 9.84e-01 0.00344 0.169 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 5.12e-01 -0.115 0.175 0.062 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 6.61e-01 0.0503 0.115 0.062 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 1.03e-01 -0.255 0.156 0.062 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 8.45e-01 0.0338 0.172 0.062 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0792 0.171 0.062 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 8.69e-02 0.262 0.152 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 5.50e-01 0.0961 0.161 0.062 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 1.87e-01 0.218 0.165 0.062 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 8.86e-01 0.0243 0.169 0.062 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 3.70e-01 0.138 0.154 0.062 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 8.70e-01 0.0272 0.166 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 3.98e-01 -0.073 0.0861 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 3.47e-01 0.115 0.122 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 7.22e-01 0.0515 0.145 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 4.27e-02 -0.327 0.16 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 2.36e-01 -0.145 0.122 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 2.87e-01 0.141 0.132 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0447 0.18 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 7.26e-01 0.0616 0.175 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 4.09e-01 -0.136 0.164 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.87e-01 0.0451 0.167 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 9.70e-01 0.0034 0.0892 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 5.40e-01 0.0848 0.138 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 2.92e-01 0.169 0.16 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00404 0.176 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 7.21e-02 -0.275 0.152 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0204 0.152 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0052 0.16 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 3.27e-01 0.181 0.184 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 9.11e-01 0.0178 0.159 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 3.28e-01 0.195 0.199 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 6.48e-01 0.0914 0.2 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 3.27e-01 -0.171 0.174 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 4.32e-01 0.151 0.192 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 6.59e-01 0.09 0.204 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0707 0.195 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 3.77e-01 0.116 0.131 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 1.24e-01 -0.233 0.151 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 1.05e-01 0.189 0.116 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 2.95e-01 -0.133 0.127 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 2.66e-01 0.153 0.137 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 9.98e-02 -0.158 0.0957 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.98e-01 0.0357 0.14 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 5.23e-02 -0.312 0.16 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 4.01e-01 -0.105 0.125 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0467 0.156 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 9.47e-01 0.00975 0.146 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00894 0.0958 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 1.19e-01 0.257 0.164 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 1.00e-01 -0.26 0.158 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 6.28e-01 0.0742 0.153 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 5.12e-02 -0.321 0.164 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 6.14e-01 0.0789 0.156 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 3.03e-01 0.144 0.14 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 5.41e-01 -0.093 0.152 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 7.31e-02 -0.278 0.155 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 7.98e-01 0.0319 0.125 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0962 0.168 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0333 0.167 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 3.61e-01 -0.13 0.142 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 5.39e-01 0.109 0.177 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 8.44e-01 0.0314 0.159 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 2.87e-01 -0.168 0.158 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 8.50e-01 0.0268 0.142 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 7.85e-01 0.0413 0.151 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 1.29e-01 0.249 0.163 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0971 0.108 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 2.10e-01 -0.209 0.166 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.44e-01 0.0568 0.173 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 3.88e-01 0.134 0.155 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 4.03e-01 -0.135 0.161 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 1.74e-01 0.239 0.175 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 9.52e-01 0.0104 0.173 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0285 0.154 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.90e-02 0.277 0.167 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 4.18e-01 -0.139 0.172 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0789 0.163 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 2.18e-02 -0.398 0.172 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 3.33e-01 -0.181 0.187 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 5.10e-01 -0.118 0.179 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 3.78e-01 -0.138 0.156 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 4.39e-01 -0.134 0.172 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 4.01e-02 0.37 0.179 0.063 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0246 0.176 0.063 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 8.02e-01 0.0393 0.156 0.063 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 1.25e-01 -0.287 0.186 0.063 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 3.11e-01 0.194 0.191 0.063 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 3.82e-01 -0.139 0.159 0.063 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 1.89e-01 -0.237 0.18 0.063 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 6.29e-01 0.0854 0.177 0.063 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 3.16e-01 -0.157 0.156 0.063 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 4.87e-01 0.127 0.183 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 2.57e-01 -0.15 0.132 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0193 0.153 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0149 0.179 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 4.43e-01 -0.134 0.174 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 7.55e-03 0.419 0.155 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 1.52e-01 0.238 0.165 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 9.95e-02 0.288 0.174 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00434 0.16 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 1.35e-01 -0.233 0.155 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 6.94e-01 0.0464 0.118 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 2.21e-02 -0.373 0.162 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 3.79e-01 0.139 0.158 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 3.22e-01 -0.135 0.136 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 2.15e-01 -0.204 0.164 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 4.21e-01 0.149 0.185 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0787 0.167 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 4.56e-01 -0.127 0.171 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0106 0.137 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 7.93e-01 0.0472 0.18 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 3.92e-01 0.157 0.183 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 8.64e-01 0.0293 0.17 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 4.28e-01 -0.139 0.175 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 1.50e-01 0.247 0.171 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 4.79e-01 -0.114 0.161 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0105 0.151 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00214 0.115 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 2.93e-01 -0.168 0.159 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 1.38e-01 -0.238 0.16 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 6.09e-01 0.0647 0.126 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.99e-02 -0.271 0.164 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 4.68e-02 -0.353 0.176 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0818 0.156 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 4.65e-01 0.0889 0.121 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.83e-01 0.00367 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0735 0.2 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 2.86e-01 0.132 0.123 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 2.45e-01 0.165 0.141 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0442 0.144 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0487 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0882 0.153 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 1.68e-01 0.195 0.141 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 3.78e-01 -0.114 0.129 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0322 0.172 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 1.47e-01 0.184 0.126 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 4.82e-01 -0.128 0.181 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 3.65e-01 0.124 0.137 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 7.70e-01 0.0437 0.149 0.059 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 4.85e-01 0.0893 0.128 0.059 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0728 0.118 0.059 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 4.10e-01 -0.107 0.129 0.059 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 3.60e-01 0.155 0.169 0.062 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 8.57e-02 -0.302 0.175 0.062 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0414 0.154 0.062 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 6.32e-01 0.0802 0.167 0.062 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0518 0.173 0.062 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 1.14e-01 -0.222 0.14 0.062 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 2.67e-01 0.17 0.153 0.063 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 9.31e-01 -0.013 0.15 0.063 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 2.49e-01 0.223 0.193 0.063 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 4.81e-01 -0.124 0.175 0.063 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 2.30e-01 0.218 0.181 0.063 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 1.88e-01 0.225 0.17 0.063 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.61e-01 0.0065 0.133 0.063 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 9.80e-01 0.00408 0.163 0.063 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0263 0.152 0.063 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 5.12e-01 0.101 0.154 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0625 0.116 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 4.68e-01 0.112 0.154 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 1.18e-01 -0.271 0.173 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0438 0.156 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 2.81e-01 -0.145 0.134 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 5.82e-01 0.0631 0.114 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 8.38e-01 0.0256 0.125 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0713 0.169 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 3.98e-01 -0.109 0.129 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 1.88e-01 0.207 0.157 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0406 0.184 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 6.74e-01 0.073 0.173 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 2.76e-01 -0.174 0.16 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.56e-02 0.208 0.124 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 8.85e-02 0.266 0.155 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 4.15e-01 0.188 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 4.31e-02 -0.436 0.213 0.055 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 2.55e-01 -0.186 0.162 0.055 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 2.12e-01 0.269 0.214 0.055 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 8.21e-01 0.0512 0.226 0.055 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 9.10e-01 0.0238 0.211 0.055 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 1.47e-01 -0.31 0.212 0.055 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 4.67e-01 0.153 0.21 0.055 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 8.78e-01 0.0295 0.192 0.055 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0621 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 2.79e-01 -0.164 0.151 0.062 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000986 0.177 0.062 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 2.29e-01 -0.2 0.166 0.062 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 6.61e-01 0.0755 0.172 0.062 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 3.36e-01 0.16 0.166 0.062 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 7.27e-02 0.26 0.144 0.062 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 4.16e-01 0.131 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0365 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0911 0.157 0.061 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 8.82e-01 0.0281 0.189 0.061 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 6.65e-02 0.302 0.164 0.061 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 5.97e-01 -0.084 0.159 0.061 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 3.65e-01 0.138 0.152 0.061 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 1.29e-02 0.351 0.14 0.061 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 2.21e-01 0.18 0.147 0.061 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 1.06e-02 -0.49 0.189 0.062 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 3.72e-01 -0.15 0.168 0.062 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0552 0.178 0.062 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 4.23e-02 -0.358 0.175 0.062 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 3.30e-01 0.182 0.186 0.062 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 5.03e-01 -0.109 0.163 0.062 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00556 0.126 0.062 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00711 0.15 0.062 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 1.35e-01 -0.25 0.166 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0422 0.169 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 3.86e-01 0.077 0.0887 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 5.79e-02 -0.264 0.139 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0458 0.144 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0447 0.163 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 4.20e-01 0.0981 0.121 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 7.85e-01 0.0397 0.146 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 6.75e-01 0.0704 0.168 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 7.10e-01 0.0654 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 6.40e-01 0.0814 0.174 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 8.68e-01 0.0266 0.16 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0215 0.0788 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 6.10e-01 0.0576 0.113 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 7.20e-01 0.0495 0.138 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 1.31e-01 -0.237 0.157 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 6.15e-02 -0.22 0.117 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 7.81e-01 0.0344 0.124 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -450226 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0799 0.178 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 5.81e-01 0.1 0.182 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -908339 sc-eQTL 4.45e-01 -0.126 0.165 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 7.17e-01 0.0521 0.144 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0488 0.116 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 1.56e-01 0.212 0.149 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 3.40e-01 -0.169 0.176 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 9.90e-01 0.00181 0.151 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 2.12e-01 -0.164 0.131 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 9.83e-02 0.178 0.107 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 2.72e-01 0.136 0.124 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 8.33e-01 0.0346 0.163 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 2.41e-01 -0.168 0.142 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.84e-01 0.00343 0.173 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 8.37e-01 0.0342 0.166 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 7.09e-01 0.0616 0.165 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 2.42e-01 0.168 0.143 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 2.55e-02 0.275 0.122 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 715563 sc-eQTL 3.46e-01 0.142 0.151 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -830874 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0763 0.153 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 sc-eQTL 3.20e-01 -0.148 0.149 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -541713 sc-eQTL 9.47e-01 0.00681 0.102 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 9141 sc-eQTL 3.67e-02 -0.326 0.155 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -118526 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0252 0.145 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -772903 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0241 0.118 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -588334 sc-eQTL 4.46e-02 -0.317 0.157 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -830939 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00935 0.186 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -407701 eQTL 1.14e-03 -0.137 0.042 0.0 0.0 0.0859
ENSG00000120805 ARL1 -118526 eQTL 0.00988 -0.0656 0.0254 0.0011 0.0 0.0859

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120800 \N 9141 4.1e-05 3.58e-05 6.95e-06 1.62e-05 6.91e-06 1.65e-05 4.97e-05 5.44e-06 3.72e-05 1.79e-05 4.51e-05 2.06e-05 5.36e-05 1.57e-05 8.1e-06 2.35e-05 2.05e-05 2.97e-05 9e-06 7.67e-06 1.9e-05 3.99e-05 3.55e-05 1.04e-05 5.03e-05 9.71e-06 1.67e-05 1.55e-05 3.61e-05 2.9e-05 2.38e-05 1.75e-06 3.24e-06 7.73e-06 1.3e-05 6.68e-06 3.65e-06 3.5e-06 5.61e-06 3.6e-06 1.78e-06 4.15e-05 4.31e-06 4.37e-07 2.79e-06 4.74e-06 4.58e-06 1.93e-06 1.54e-06
ENSG00000257202 \N -635473 2.67e-07 1.92e-07 5.93e-08 3.58e-07 1.02e-07 8.37e-08 2.16e-07 5.43e-08 1.85e-07 6.08e-08 2.62e-07 1.19e-07 3.18e-07 8.55e-08 5.97e-08 7.98e-08 5.73e-08 2.21e-07 7.42e-08 4.92e-08 1.33e-07 1.7e-07 1.75e-07 3.42e-08 2.28e-07 1.25e-07 1.13e-07 1.28e-07 1.24e-07 2e-07 1.43e-07 4.78e-08 4.87e-08 9.3e-08 5.16e-08 3.94e-08 5.02e-08 8.71e-08 6.43e-08 5.13e-08 5.42e-08 1.63e-07 5.39e-08 1.08e-08 3.36e-08 6.53e-09 1.11e-07 1.92e-09 4.98e-08