logo

Genes within 1Mb (chr12:101045561:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 3.92e-02 0.204 0.0986 0.139 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 7.17e-01 0.0306 0.0844 0.139 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 2.22e-01 0.0639 0.0522 0.139 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 4.49e-01 0.0574 0.0757 0.139 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0351 0.0861 0.139 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 2.43e-02 0.166 0.0732 0.139 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0561 0.084 0.139 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0701 0.0671 0.139 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 2.28e-01 -0.129 0.106 0.139 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 5.78e-01 0.0421 0.0754 0.139 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0654 0.0702 0.139 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 2.42e-01 0.123 0.105 0.139 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 2.81e-01 0.0785 0.0726 0.139 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 2.28e-01 0.097 0.0803 0.139 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0461 0.0787 0.139 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 1.87e-02 0.14 0.0593 0.139 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 9.48e-02 -0.139 0.0826 0.139 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0901 0.082 0.139 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0755 0.104 0.139 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 1.72e-01 0.0931 0.0679 0.139 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 3.44e-01 0.0815 0.086 0.139 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0287 0.095 0.139 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 6.10e-02 -0.144 0.0764 0.139 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 2.59e-01 -0.109 0.0964 0.139 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 7.19e-03 -0.297 0.109 0.142 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 1.51e-01 -0.154 0.107 0.142 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 9.83e-01 0.00218 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00833 0.112 0.142 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 5.56e-01 0.0706 0.12 0.142 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0844 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 5.55e-02 0.228 0.118 0.142 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 8.14e-01 0.0208 0.0882 0.142 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 6.24e-01 0.0544 0.111 0.142 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 3.78e-01 0.0862 0.0975 0.139 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0137 0.0803 0.139 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0261 0.078 0.139 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 7.89e-01 0.0262 0.0978 0.139 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 5.75e-01 0.0612 0.109 0.139 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 3.12e-01 0.102 0.1 0.139 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 1.58e-01 0.118 0.0833 0.139 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0751 0.0718 0.139 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 2.30e-01 0.0939 0.0781 0.139 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 6.84e-01 0.0362 0.0889 0.139 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 7.54e-04 -0.244 0.0714 0.139 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 1.23e-01 0.141 0.0909 0.139 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 2.18e-01 0.0817 0.0661 0.139 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 6.76e-04 -0.358 0.104 0.139 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 5.64e-04 0.334 0.0953 0.139 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 1.64e-01 -0.105 0.0752 0.139 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 5.51e-01 0.0627 0.105 0.139 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0712 0.109 0.139 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 4.50e-01 0.0779 0.103 0.139 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 2.01e-01 0.135 0.106 0.139 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 6.59e-01 0.0337 0.0764 0.139 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 8.95e-01 0.0158 0.119 0.139 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 1.75e-01 0.118 0.0867 0.139 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 3.33e-01 0.0921 0.0948 0.139 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 2.86e-01 0.0989 0.0925 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 1.12e-01 0.217 0.136 0.122 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0581 0.146 0.122 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 8.39e-01 0.0194 0.095 0.122 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0635 0.135 0.122 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 2.10e-01 -0.164 0.13 0.122 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 1.56e-01 0.191 0.134 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0572 0.137 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 2.12e-02 -0.295 0.127 0.122 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0698 0.106 0.122 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 8.62e-02 0.202 0.117 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0879 0.126 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 8.58e-01 0.0122 0.0685 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0527 0.101 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 7.05e-01 0.0427 0.112 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 6.72e-02 0.231 0.126 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 1.59e-01 0.145 0.103 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 2.43e-02 -0.252 0.111 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0509 0.118 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 7.15e-01 0.0456 0.125 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0134 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0407 0.0801 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0789 0.11 0.14 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 9.33e-01 0.0102 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0261 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0789 0.109 0.14 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0555 0.112 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0503 0.116 0.14 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 1.75e-01 0.145 0.106 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0619 0.102 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 9.87e-02 0.097 0.0585 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 2.85e-01 0.0891 0.0831 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0311 0.0989 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 3.93e-01 0.0944 0.11 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 5.78e-01 0.0539 0.0967 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 4.64e-01 0.0663 0.0904 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0544 0.123 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 5.30e-01 0.0765 0.121 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 8.16e-02 0.202 0.116 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 1.49e-01 0.0875 0.0605 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 5.83e-01 0.0518 0.0941 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 5.41e-01 0.0669 0.109 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 8.80e-02 0.204 0.119 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 2.22e-01 -0.139 0.113 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 8.61e-01 0.0181 0.103 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 2.42e-01 -0.127 0.109 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0687 0.128 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0598 0.127 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 9.94e-01 0.00103 0.128 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 1.56e-01 0.159 0.112 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0155 0.123 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 5.25e-02 -0.253 0.129 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 3.96e-01 -0.107 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 2.84e-01 0.0924 0.0861 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0551 0.0813 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 1.99e-01 0.132 0.103 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 2.92e-01 0.0838 0.0793 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 6.82e-01 0.0355 0.0866 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0945 0.0936 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 4.13e-02 0.147 0.0715 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 4.55e-01 0.0689 0.0922 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000896 0.0971 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 6.95e-01 0.0424 0.108 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 7.25e-01 0.0295 0.0838 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.105 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 1.19e-01 0.153 0.0976 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 2.40e-01 0.0968 0.0821 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 1.11e-01 -0.177 0.11 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 3.49e-01 -0.103 0.11 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 1.63e-01 0.155 0.11 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0612 0.107 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0139 0.115 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 2.61e-01 0.123 0.109 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 5.28e-01 0.0707 0.112 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 2.96e-01 -0.102 0.0971 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 1.45e-01 -0.145 0.0992 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0282 0.106 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 2.27e-01 0.103 0.0847 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 1.79e-01 -0.154 0.114 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 4.66e-01 0.0828 0.113 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 2.28e-01 -0.118 0.098 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0312 0.121 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 2.31e-01 -0.117 0.097 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 2.57e-01 0.118 0.104 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 8.55e-01 0.0199 0.109 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 3.94e-01 0.0833 0.0975 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 6.98e-02 0.188 0.103 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 4.84e-01 -0.079 0.113 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 2.30e-01 -0.112 0.0926 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 1.46e-02 -0.278 0.113 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 3.64e-01 -0.106 0.117 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 1.61e-01 -0.175 0.124 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0862 0.109 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 1.12e-02 0.284 0.111 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0537 0.123 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 7.29e-01 -0.042 0.121 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0489 0.124 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0817 0.118 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 9.66e-01 0.00484 0.112 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0576 0.12 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0821 0.108 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 1.79e-01 0.155 0.115 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 2.42e-02 0.278 0.122 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 7.33e-01 0.0404 0.118 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 8.44e-02 0.212 0.122 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 9.38e-01 0.00893 0.114 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 5.77e-01 0.0653 0.117 0.141 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0733 0.108 0.141 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 2.76e-01 0.12 0.11 0.141 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 7.31e-01 0.0337 0.0979 0.141 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0959 0.117 0.141 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0744 0.12 0.141 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00696 0.102 0.141 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 7.38e-02 -0.201 0.112 0.141 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 6.97e-01 0.0448 0.115 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 4.99e-02 -0.215 0.109 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 3.12e-02 0.191 0.0881 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 2.49e-01 0.119 0.103 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 5.63e-01 0.0697 0.12 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 8.05e-02 0.205 0.117 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 7.95e-01 0.0288 0.111 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0758 0.112 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 7.37e-01 0.0352 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 5.60e-04 -0.305 0.087 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 5.59e-01 0.0623 0.106 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 1.10e-01 0.129 0.0801 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 7.35e-03 -0.298 0.11 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 5.66e-03 0.297 0.106 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0765 0.0943 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 3.94e-01 0.096 0.112 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 7.50e-01 0.0399 0.125 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0468 0.126 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0244 0.121 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 6.94e-01 0.0383 0.0974 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0463 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 1.17e-01 0.204 0.129 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0152 0.129 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0983 0.124 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 6.74e-01 0.0439 0.104 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 1.94e-01 -0.126 0.0965 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 6.76e-01 0.0428 0.102 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 4.38e-01 0.0604 0.0777 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 6.22e-02 -0.202 0.108 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 1.97e-01 0.141 0.109 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 1.70e-02 -0.217 0.09 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 3.18e-01 0.112 0.112 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 2.68e-01 0.174 0.156 0.13 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 8.98e-01 0.0194 0.151 0.13 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0854 0.0928 0.13 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 1.25e-01 -0.205 0.133 0.13 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 6.24e-01 0.0755 0.154 0.13 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 7.94e-01 0.0247 0.0945 0.13 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 1.65e-01 -0.223 0.159 0.13 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0733 0.11 0.13 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0131 0.129 0.13 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 9.17e-01 0.0123 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 2.15e-01 0.146 0.117 0.141 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 2.50e-01 0.124 0.108 0.141 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0412 0.0799 0.141 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 5.15e-01 0.0744 0.114 0.141 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 1.63e-01 0.12 0.0859 0.141 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 6.56e-01 0.0513 0.115 0.141 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 8.99e-01 0.0102 0.0805 0.141 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 5.99e-01 0.0595 0.113 0.139 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000897 0.116 0.139 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 2.01e-01 0.155 0.121 0.139 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 4.97e-03 0.295 0.104 0.139 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 3.20e-02 0.246 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0538 0.119 0.139 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 8.99e-01 0.0139 0.109 0.139 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 4.42e-03 -0.323 0.112 0.144 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 1.46e-01 -0.175 0.12 0.144 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 3.00e-01 0.108 0.104 0.144 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 2.40e-01 -0.158 0.134 0.144 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 1.18e-01 0.191 0.121 0.144 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 9.66e-03 -0.325 0.124 0.144 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 1.56e-01 0.163 0.114 0.144 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 9.11e-01 0.0104 0.0927 0.144 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 7.73e-01 0.0327 0.113 0.144 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 7.35e-01 0.0337 0.0995 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 8.23e-01 0.0179 0.0799 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 5.63e-01 0.0454 0.0784 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 9.32e-01 0.00891 0.104 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 3.95e-01 0.0998 0.117 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 7.70e-01 0.0307 0.105 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 1.90e-01 0.127 0.0966 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 1.69e-01 -0.106 0.0768 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 4.14e-01 0.069 0.0843 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 2.15e-01 0.138 0.111 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 7.69e-01 0.0308 0.105 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 9.24e-01 0.00826 0.0868 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 5.85e-01 0.0577 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 7.53e-01 -0.039 0.124 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 4.39e-01 0.09 0.116 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 6.69e-01 0.0454 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 1.68e-01 -0.116 0.0834 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0441 0.105 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 1.81e-01 -0.187 0.139 0.142 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 1.20e-01 0.218 0.14 0.142 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 6.06e-02 0.25 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 3.34e-01 0.0973 0.1 0.142 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 2.61e-01 0.15 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0671 0.139 0.142 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 9.21e-01 0.014 0.142 0.142 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 3.74e-01 0.117 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 8.25e-01 0.0258 0.116 0.144 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 5.32e-01 0.074 0.118 0.144 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0202 0.102 0.144 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0574 0.12 0.144 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0774 0.112 0.144 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 8.50e-01 0.0221 0.116 0.144 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 3.40e-01 0.113 0.118 0.144 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0291 0.0983 0.144 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 8.54e-02 0.187 0.108 0.144 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 4.91e-01 0.077 0.112 0.143 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 9.57e-01 0.006 0.111 0.143 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 8.86e-01 0.015 0.104 0.143 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 9.86e-01 0.00226 0.125 0.143 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 8.08e-02 0.19 0.108 0.143 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0425 0.105 0.143 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 6.82e-02 0.209 0.114 0.143 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0604 0.0939 0.143 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 3.34e-01 0.0944 0.0975 0.143 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0126 0.131 0.141 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00741 0.127 0.141 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 5.14e-01 0.0816 0.125 0.141 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 1.75e-01 0.179 0.131 0.141 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0886 0.131 0.141 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 6.18e-01 0.0691 0.138 0.141 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 2.71e-01 0.152 0.137 0.141 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 1.54e-01 0.133 0.0927 0.141 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0244 0.111 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 1.54e-02 0.272 0.112 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0325 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0134 0.0603 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0382 0.0947 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0375 0.0975 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 7.58e-02 0.195 0.11 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 6.60e-01 0.0389 0.0883 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 4.32e-03 -0.279 0.0968 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 1.57e-01 -0.161 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 1.47e-01 0.154 0.106 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0062 0.0965 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 9.40e-02 0.0894 0.0531 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 3.03e-01 0.0789 0.0764 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00331 0.0937 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 2.23e-01 0.13 0.107 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0569 0.0951 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 7.97e-01 0.0216 0.0839 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -693911 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0737 0.121 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 3.28e-01 0.0951 0.097 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 9.62e-01 0.00371 0.0771 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 9.70e-01 0.00295 0.0779 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 8.00e-01 0.0254 0.1 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 5.28e-01 0.0749 0.118 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 4.39e-01 0.0785 0.101 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 3.26e-01 0.0852 0.0864 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 1.04e-01 -0.118 0.072 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 8.04e-01 0.0207 0.0832 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 7.11e-01 -0.042 0.113 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 4.65e-01 0.0776 0.106 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 6.90e-01 0.0382 0.0957 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 7.88e-01 0.0313 0.116 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 6.35e-01 0.0529 0.111 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 7.86e-01 0.0301 0.111 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 6.42e-02 0.194 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 5.18e-01 0.0536 0.0829 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 sc-eQTL 5.21e-02 0.196 0.1 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 846439 sc-eQTL 5.92e-01 0.0495 0.0922 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 902687 sc-eQTL 3.39e-03 -0.225 0.0759 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -651386 sc-eQTL 3.96e-01 0.0865 0.102 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 sc-eQTL 2.18e-01 0.0859 0.0695 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -234544 sc-eQTL 5.74e-04 -0.364 0.104 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -362211 sc-eQTL 8.50e-04 0.327 0.0967 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 778421 sc-eQTL 9.30e-02 -0.131 0.0779 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -832019 sc-eQTL 3.44e-01 0.102 0.108 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111670 GNPTAB -785398 eQTL 3.15e-02 -0.043 0.02 0.00117 0.0 0.126
ENSG00000139351 SYCP3 -693908 eQTL 0.0458 0.103 0.0514 0.0 0.0 0.126
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 eQTL 0.0219 -0.0662 0.0288 0.00158 0.0 0.126

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136021 \N 778421 7.76e-07 7.46e-07 1.46e-07 4.26e-07 1.11e-07 1.74e-07 5.28e-07 9.26e-08 4.43e-07 2.26e-07 9.07e-07 3.11e-07 9.97e-07 1.48e-07 3.08e-07 2.08e-07 5.27e-07 3.95e-07 2.12e-07 8.25e-08 1.91e-07 3.8e-07 3.45e-07 1.04e-07 7.01e-07 2.2e-07 2.52e-07 2.44e-07 3.43e-07 7.6e-07 3.66e-07 7.91e-08 4.62e-08 1.21e-07 2.84e-07 7.98e-08 1.12e-07 5.92e-08 4.04e-08 7.55e-08 5.81e-08 6.19e-07 4.47e-08 1.98e-08 5.84e-08 9.86e-09 9.25e-08 0.0 4.74e-08
ENSG00000139354 GAS2L3 471878 1.28e-06 2.12e-06 2.16e-07 1.32e-06 2.58e-07 6.22e-07 1.5e-06 3.54e-07 1.66e-06 5.15e-07 2.05e-06 6.61e-07 2.62e-06 3.07e-07 4.05e-07 9.33e-07 1.07e-06 9.52e-07 8.2e-07 6.33e-07 7.16e-07 1.91e-06 9.66e-07 6.2e-07 2.22e-06 4.36e-07 9.18e-07 7.51e-07 1.47e-06 1.36e-06 8.46e-07 1.18e-07 2.69e-07 5.39e-07 5.49e-07 4.56e-07 7.32e-07 1.24e-07 4.52e-07 1.92e-07 1.01e-07 1.95e-06 2.73e-07 6.55e-08 1.84e-07 7.09e-08 1.7e-07 8.43e-08 9.13e-08