logo

Genes within 1Mb (chr12:101032653:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 4.29e-03 0.284 0.0982 0.154 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 2.50e-01 0.0977 0.0847 0.154 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0018 0.0527 0.154 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 7.53e-01 -0.024 0.0762 0.154 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 7.61e-01 0.0264 0.0867 0.154 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 9.53e-02 0.124 0.074 0.154 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 7.65e-01 0.0254 0.0846 0.154 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 1.08e-01 -0.109 0.0672 0.154 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 5.09e-01 -0.071 0.107 0.154 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 5.80e-01 0.0423 0.0763 0.154 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00571 0.0711 0.154 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 7.12e-01 0.0393 0.106 0.154 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0173 0.0736 0.154 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 5.10e-01 0.0537 0.0814 0.154 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 7.11e-02 -0.143 0.079 0.154 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 9.72e-01 0.0021 0.0607 0.154 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 6.94e-01 0.0335 0.0851 0.154 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 2.28e-01 -0.102 0.084 0.154 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0427 0.106 0.154 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 1.81e-01 0.0933 0.0696 0.154 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 8.22e-01 0.0199 0.0882 0.154 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 2.74e-01 -0.106 0.0971 0.154 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0151 0.0789 0.154 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 7.93e-01 0.026 0.099 0.154 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0713 0.11 0.158 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 4.35e-01 0.0827 0.106 0.158 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 9.53e-01 0.0059 0.1 0.158 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0722 0.11 0.158 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0905 0.118 0.158 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 6.87e-01 0.0492 0.122 0.158 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 1.47e-01 0.17 0.117 0.158 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 7.32e-01 0.0298 0.0868 0.158 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 9.42e-01 0.00801 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 7.60e-01 0.0303 0.0989 0.154 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0372 0.0813 0.154 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0639 0.0789 0.154 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 8.38e-01 0.0203 0.0991 0.154 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 4.72e-01 0.0795 0.11 0.154 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 3.87e-01 0.088 0.102 0.154 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 8.21e-01 0.0193 0.0848 0.154 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 1.05e-01 -0.118 0.0725 0.154 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 9.04e-01 0.00955 0.0793 0.154 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 9.31e-01 0.00772 0.0897 0.155 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 1.28e-02 -0.183 0.0729 0.155 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 5.95e-01 0.0491 0.0922 0.155 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 3.41e-01 0.0637 0.0667 0.155 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 4.71e-03 -0.301 0.106 0.155 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 4.17e-01 0.0804 0.0987 0.155 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 9.11e-01 0.00849 0.0761 0.155 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 2.54e-01 0.121 0.106 0.155 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 1.29e-01 0.165 0.108 0.154 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 9.34e-01 0.00856 0.103 0.154 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 4.45e-01 0.0809 0.106 0.154 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 3.73e-01 -0.068 0.0762 0.154 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 3.21e-01 0.118 0.119 0.154 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0113 0.0869 0.154 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0155 0.0949 0.154 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 4.49e-01 0.0702 0.0925 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 5.43e-01 0.0835 0.137 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 6.38e-01 0.0689 0.146 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 5.09e-01 -0.063 0.0951 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 7.10e-01 0.0504 0.135 0.143 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.48e-01 -0.189 0.13 0.143 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 7.38e-02 0.241 0.134 0.143 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0845 0.138 0.143 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 9.79e-02 -0.213 0.128 0.143 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 1.65e-02 -0.253 0.104 0.143 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 3.96e-02 0.239 0.115 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 1.50e-01 0.179 0.124 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0339 0.0676 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 3.78e-01 0.0881 0.0999 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 6.94e-01 0.0438 0.111 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 3.91e-01 0.107 0.125 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 6.45e-02 -0.188 0.101 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 1.68e-01 -0.153 0.11 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 1.78e-01 -0.157 0.116 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 9.55e-02 0.202 0.12 0.155 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 9.40e-01 0.00876 0.117 0.155 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0764 0.0777 0.155 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0815 0.106 0.155 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 3.88e-01 -0.101 0.117 0.155 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000418 0.116 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0709 0.106 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0626 0.109 0.155 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 7.96e-01 0.0291 0.112 0.155 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 3.69e-02 0.224 0.107 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0528 0.103 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00872 0.0595 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0398 0.0841 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 9.98e-01 0.00031 0.0999 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 6.36e-01 0.0528 0.111 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 4.41e-01 0.0754 0.0976 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0331 0.0914 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0533 0.124 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 7.66e-01 0.0362 0.122 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 4.45e-01 0.089 0.116 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 9.18e-01 0.0063 0.0608 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 6.13e-01 0.0477 0.0942 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0586 0.109 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 2.51e-01 0.138 0.12 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 3.77e-01 0.101 0.114 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 9.85e-01 0.00195 0.103 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0567 0.109 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0239 0.124 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 8.71e-01 0.0199 0.122 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0358 0.123 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 4.09e-01 0.0892 0.108 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 7.33e-01 0.0406 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 1.15e-01 -0.198 0.125 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 1.13e-01 -0.191 0.12 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 5.98e-01 0.0464 0.0877 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00302 0.0828 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 5.99e-01 0.0552 0.105 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00889 0.0809 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0529 0.088 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 1.78e-01 -0.128 0.0951 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0344 0.0735 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 4.77e-01 0.0664 0.0932 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0371 0.0981 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0454 0.109 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0208 0.0847 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 5.02e-01 0.0712 0.106 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00234 0.0992 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 1.95e-01 0.108 0.0829 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 7.95e-01 0.0284 0.109 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0516 0.108 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 8.65e-01 0.0186 0.109 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 3.32e-01 -0.102 0.105 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.84e-01 0.151 0.113 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 2.71e-01 -0.118 0.107 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 9.32e-01 0.00945 0.11 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 3.72e-01 0.0874 0.0977 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 2.98e-01 -0.104 0.0999 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 6.69e-01 0.0457 0.107 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 4.16e-01 0.0695 0.0852 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0959 0.115 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0397 0.114 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0672 0.0987 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 6.41e-02 0.224 0.12 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0469 0.0994 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0708 0.107 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 9.23e-01 0.0107 0.111 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0215 0.0997 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 4.61e-01 0.0781 0.106 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0219 0.115 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 9.70e-01 0.00352 0.0949 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0107 0.117 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0247 0.115 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 7.67e-01 0.0366 0.123 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 2.01e-01 -0.138 0.107 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 1.16e-01 0.175 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 4.61e-01 0.0895 0.121 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 1.64e-01 -0.166 0.119 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 5.03e-01 0.0818 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 8.36e-02 -0.201 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 5.34e-01 0.0712 0.114 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0438 0.123 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 3.13e-01 -0.111 0.11 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 4.66e-01 0.0859 0.117 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0174 0.126 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 9.08e-01 0.0139 0.121 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 3.37e-01 0.12 0.125 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0981 0.116 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 6.18e-01 0.0597 0.119 0.156 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0856 0.111 0.156 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 9.23e-01 -0.011 0.113 0.156 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 4.65e-01 0.0731 0.1 0.156 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 4.47e-01 0.0912 0.12 0.156 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0257 0.122 0.156 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 9.37e-01 0.00816 0.104 0.156 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00614 0.115 0.156 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0597 0.116 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 1.58e-01 -0.157 0.111 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 1.44e-01 0.132 0.0898 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 6.03e-02 0.195 0.103 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.89e-01 0.16 0.121 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 1.80e-01 0.159 0.118 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 6.62e-01 0.0489 0.112 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0349 0.113 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 9.09e-01 0.012 0.105 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 2.10e-02 -0.205 0.0884 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 7.28e-01 -0.037 0.107 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 1.85e-01 0.107 0.0802 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.78e-01 -0.151 0.111 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 3.74e-01 0.0963 0.108 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 8.00e-01 0.024 0.0945 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 2.82e-01 0.121 0.112 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 6.57e-01 0.0544 0.122 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 5.11e-02 -0.24 0.122 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 6.78e-01 0.0494 0.119 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0539 0.0955 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 3.40e-01 -0.119 0.125 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 3.45e-01 0.121 0.127 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 1.41e-01 0.185 0.125 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0147 0.122 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 8.61e-01 0.0185 0.105 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0103 0.0982 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 4.91e-01 0.0715 0.104 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 2.55e-01 0.0896 0.0785 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.55e-03 -0.344 0.107 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 8.48e-01 0.0212 0.111 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 9.69e-02 -0.153 0.0918 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 1.46e-01 0.165 0.113 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 3.00e-03 0.477 0.157 0.144 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0656 0.158 0.144 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 4.52e-02 -0.193 0.0954 0.144 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 1.07e-02 -0.352 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.28e-01 0.243 0.159 0.144 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 9.64e-01 0.00443 0.0985 0.144 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 4.83e-01 0.118 0.167 0.144 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 6.48e-01 0.0527 0.115 0.144 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 5.18e-01 0.0867 0.134 0.144 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 6.71e-02 0.225 0.122 0.154 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 7.59e-01 0.0378 0.123 0.154 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 2.57e-01 0.128 0.112 0.154 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 1.77e-01 -0.112 0.0829 0.154 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 3.80e-01 -0.104 0.119 0.154 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 8.66e-01 0.0151 0.0899 0.154 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0157 0.12 0.154 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 4.04e-01 0.07 0.0837 0.154 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 1.90e-01 -0.147 0.112 0.154 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0898 0.115 0.154 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0394 0.121 0.154 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 5.23e-01 0.0674 0.105 0.154 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 5.53e-01 0.0683 0.115 0.154 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.154 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 9.84e-01 0.00224 0.109 0.154 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 2.78e-01 -0.122 0.112 0.163 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 3.00e-01 0.123 0.118 0.163 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 4.21e-01 0.0829 0.103 0.163 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 4.20e-01 -0.107 0.133 0.163 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 7.53e-01 -0.038 0.12 0.163 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 3.12e-02 -0.268 0.123 0.163 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 7.58e-02 0.2 0.112 0.163 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 4.87e-01 0.0635 0.0913 0.163 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 5.77e-01 0.0623 0.112 0.163 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 4.66e-01 0.074 0.101 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0741 0.0813 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 9.62e-01 0.00382 0.0801 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0739 0.106 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 2.28e-01 0.144 0.119 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0601 0.107 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 5.63e-01 0.0572 0.0988 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 1.03e-01 -0.128 0.0782 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0925 0.0859 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 4.48e-01 0.0862 0.113 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 9.00e-01 0.0135 0.107 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0269 0.0884 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 7.90e-01 0.0287 0.108 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0545 0.126 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 7.25e-02 0.212 0.117 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 7.01e-01 0.0415 0.108 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 3.69e-02 -0.177 0.0844 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0412 0.107 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 4.74e-01 0.101 0.141 0.164 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 9.79e-02 0.234 0.14 0.164 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 2.98e-01 0.14 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 8.26e-01 0.0223 0.101 0.164 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.91e-01 0.175 0.133 0.164 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 9.68e-01 0.00564 0.14 0.164 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 4.41e-01 -0.11 0.143 0.164 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 7.12e-02 -0.239 0.132 0.164 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 1.85e-01 -0.161 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0872 0.123 0.158 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0908 0.107 0.158 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 7.44e-01 -0.041 0.125 0.158 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 3.66e-01 0.106 0.117 0.158 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 7.59e-01 0.0373 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 6.61e-01 0.054 0.123 0.158 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00229 0.103 0.158 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 8.84e-01 0.0167 0.114 0.158 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 5.56e-01 0.0673 0.114 0.158 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 7.41e-01 0.0374 0.113 0.158 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 1.67e-01 -0.147 0.106 0.158 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 1.20e-01 0.198 0.127 0.158 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.92e-01 0.145 0.111 0.158 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 6.58e-01 0.0475 0.107 0.158 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 8.05e-01 0.029 0.117 0.158 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 2.55e-02 -0.213 0.0948 0.158 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 5.73e-02 0.189 0.0989 0.158 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 8.06e-01 0.0314 0.127 0.158 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00146 0.123 0.158 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0582 0.121 0.158 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0243 0.128 0.158 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 8.03e-01 0.0319 0.128 0.158 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 7.13e-01 0.0496 0.134 0.158 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 1.64e-01 0.186 0.133 0.158 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0707 0.0905 0.158 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0676 0.108 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 5.21e-03 0.317 0.112 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 2.20e-01 0.14 0.114 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 3.41e-01 -0.058 0.0608 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 6.73e-01 0.0405 0.0957 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 8.17e-01 0.0228 0.0986 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 2.24e-01 0.136 0.111 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 7.96e-02 -0.156 0.0887 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 4.13e-02 -0.203 0.0988 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 1.98e-01 -0.148 0.115 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 3.58e-02 0.224 0.106 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0307 0.0974 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0053 0.054 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0119 0.0773 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0537 0.0945 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 2.09e-01 0.136 0.107 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 1.93e-01 0.125 0.0957 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0222 0.0847 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -706819 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0368 0.122 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 5.78e-01 0.0547 0.0982 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0375 0.0779 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0217 0.0788 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0209 0.101 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 6.35e-01 0.0569 0.12 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 6.30e-01 0.0494 0.103 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 5.55e-01 0.0518 0.0875 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 3.84e-02 -0.151 0.0725 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 2.12e-01 -0.105 0.0838 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0591 0.117 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 8.05e-01 0.0272 0.11 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 3.03e-01 -0.102 0.099 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 1.38e-01 0.178 0.12 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.65e-01 0.16 0.115 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 6.48e-01 0.0525 0.115 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00211 0.109 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0537 0.0859 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 458970 sc-eQTL 1.07e-01 0.169 0.104 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 833531 sc-eQTL 8.94e-01 0.0124 0.0927 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 889779 sc-eQTL 7.64e-02 -0.138 0.0772 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -664294 sc-eQTL 6.16e-01 0.0514 0.102 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -798306 sc-eQTL 4.21e-01 0.0564 0.07 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -247452 sc-eQTL 1.65e-03 -0.335 0.105 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -375119 sc-eQTL 5.67e-01 0.0573 0.0997 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 765513 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0214 0.0788 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -844927 sc-eQTL 1.40e-01 0.16 0.108 0.155 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000280088 AC126474.2 998579 eQTL 0.0253 0.0447 0.0199 0.00178 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139354 \N 458970 4.37e-07 2.56e-07 6.86e-08 3.62e-07 1.07e-07 1.28e-07 2.95e-07 6.72e-08 1.94e-07 1.15e-07 2.38e-07 1.37e-07 3.6e-07 8.42e-08 6.12e-08 1.01e-07 6.17e-08 2.43e-07 9.97e-08 7.83e-08 1.33e-07 1.98e-07 1.89e-07 4.34e-08 3.41e-07 1.94e-07 1.31e-07 1.36e-07 1.48e-07 2.1e-07 1.59e-07 4.58e-08 3.74e-08 1.27e-07 1.56e-07 4.86e-08 1.03e-07 5.92e-08 5.7e-08 5.8e-08 2.78e-08 2.9e-07 3.35e-08 1.93e-08 4.36e-08 1.01e-08 7.83e-08 2.16e-09 4.54e-08