Genes within 1Mb (chr12:101025971:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 1.82e-01 0.177 0.132 0.094 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 3.21e-01 0.112 0.112 0.094 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 8.31e-01 -0.015 0.07 0.094 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0513 0.101 0.094 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0254 0.115 0.094 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0675 0.0988 0.094 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 2.09e-01 0.141 0.112 0.094 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0849 0.0896 0.094 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 3.74e-01 0.127 0.142 0.094 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 9.56e-02 0.17 0.101 0.094 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0948 0.094 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 8.33e-01 0.03 0.142 0.094 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0435 0.0984 0.094 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 1.40e-01 -0.16 0.108 0.094 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 9.94e-02 -0.175 0.106 0.094 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 3.42e-01 0.0771 0.081 0.094 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 1.40e-01 0.167 0.113 0.094 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 4.27e-01 -0.089 0.112 0.094 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 8.23e-01 0.0316 0.141 0.094 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 2.55e-01 0.106 0.0926 0.094 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 5.55e-02 -0.224 0.116 0.094 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 3.01e-01 -0.134 0.129 0.094 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 4.09e-02 0.214 0.104 0.094 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 2.30e-01 0.158 0.131 0.094 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 6.90e-01 0.0585 0.147 0.092 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.23e-01 0.0317 0.142 0.092 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00264 0.134 0.092 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0929 0.147 0.092 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 2.22e-01 -0.193 0.157 0.092 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 4.45e-01 0.125 0.163 0.092 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0515 0.157 0.092 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0178 0.116 0.092 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 6.71e-01 0.0621 0.146 0.092 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0535 0.131 0.094 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0242 0.108 0.094 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 8.39e-01 0.0213 0.105 0.094 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 8.87e-02 -0.223 0.13 0.094 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 7.17e-01 0.0532 0.146 0.094 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0118 0.135 0.094 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0588 0.112 0.094 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 6.19e-01 0.0481 0.0966 0.094 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 2.40e-01 -0.124 0.105 0.094 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 6.38e-01 0.0564 0.12 0.094 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 7.77e-01 -0.028 0.0988 0.094 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 6.29e-01 0.0596 0.123 0.094 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 9.96e-01 0.000485 0.0893 0.094 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 4.37e-03 -0.406 0.141 0.094 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.132 0.094 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 6.45e-02 0.187 0.101 0.094 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0211 0.142 0.094 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 2.83e-01 0.155 0.144 0.094 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 6.73e-02 -0.249 0.136 0.094 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 5.30e-01 0.0881 0.14 0.094 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0536 0.101 0.094 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 6.17e-01 0.0793 0.158 0.094 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 7.19e-01 0.0415 0.115 0.094 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 7.93e-01 0.033 0.126 0.094 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 4.88e-01 0.0853 0.123 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 3.51e-01 -0.164 0.176 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 1.72e-01 0.257 0.187 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 8.08e-01 0.0298 0.122 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 4.69e-01 -0.126 0.174 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00942 0.168 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 6.32e-01 0.0834 0.174 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 4.75e-01 0.127 0.177 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00589 0.166 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 1.92e-02 -0.318 0.134 0.094 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 3.58e-01 0.141 0.153 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 3.35e-02 0.346 0.162 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 7.72e-01 0.0258 0.0889 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 5.33e-01 0.082 0.131 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 5.62e-01 0.0848 0.146 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 1.82e-01 -0.219 0.164 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 1.89e-01 -0.176 0.133 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 9.42e-01 0.0106 0.146 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 3.04e-01 -0.157 0.153 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 5.83e-01 0.0891 0.162 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 5.00e-01 0.105 0.156 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 3.79e-01 0.125 0.142 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 7.84e-01 -0.043 0.156 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0259 0.156 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0688 0.142 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0744 0.146 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 2.40e-01 0.176 0.15 0.095 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 1.16e-01 0.228 0.144 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 4.68e-01 0.101 0.139 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0297 0.08 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 2.84e-02 -0.247 0.112 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0565 0.134 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 2.50e-01 -0.172 0.149 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 8.54e-02 0.226 0.131 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0649 0.123 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0651 0.167 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0344 0.161 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 1.85e-01 -0.204 0.154 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0436 0.0804 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 3.01e-01 0.129 0.124 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0424 0.145 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 9.17e-02 0.267 0.158 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 2.01e-01 0.193 0.15 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0987 0.137 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 2.15e-02 0.33 0.142 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0232 0.167 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 7.49e-01 0.0529 0.165 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 5.44e-01 0.101 0.167 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0593 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0477 0.16 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 1.75e-01 -0.23 0.169 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 1.81e-01 -0.218 0.162 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 4.17e-01 0.0948 0.117 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 5.71e-01 0.0626 0.11 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 8.72e-01 0.0225 0.14 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0336 0.108 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 2.23e-02 -0.267 0.116 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 2.63e-01 -0.142 0.127 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 7.70e-01 0.0287 0.0978 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 2.36e-01 0.148 0.125 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0122 0.132 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 9.28e-01 0.0133 0.147 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0661 0.114 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 3.06e-01 0.146 0.142 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0872 0.133 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 5.71e-01 0.0635 0.112 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 4.83e-02 0.291 0.147 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.49e-01 0.028 0.147 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0775 0.147 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 5.42e-01 0.0867 0.142 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 3.35e-01 0.148 0.153 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0049 0.145 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 6.46e-01 0.0684 0.149 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 6.66e-02 0.239 0.13 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0829 0.134 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 2.19e-01 0.175 0.142 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0187 0.114 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0839 0.154 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 9.92e-01 0.00148 0.152 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 7.67e-01 0.0392 0.132 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 1.27e-01 0.246 0.161 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 6.46e-01 0.0611 0.133 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.42e-02 -0.245 0.141 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 7.60e-01 0.0454 0.148 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 2.33e-01 0.159 0.133 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 4.78e-01 -0.101 0.141 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 8.24e-01 0.0343 0.154 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 2.78e-02 0.278 0.125 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 6.86e-02 0.284 0.155 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 3.59e-01 -0.139 0.151 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0174 0.161 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0262 0.141 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0755 0.146 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 9.65e-01 0.00709 0.159 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0283 0.156 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 8.35e-01 0.0335 0.16 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 2.66e-01 -0.17 0.152 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 2.71e-01 0.17 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0385 0.166 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0275 0.148 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0257 0.159 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 3.65e-03 -0.491 0.167 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0416 0.163 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 7.94e-01 0.0444 0.169 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 3.86e-01 -0.136 0.157 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 8.10e-01 0.0392 0.163 0.093 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 1.46e-01 -0.219 0.15 0.093 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0898 0.154 0.093 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 8.00e-01 0.0345 0.136 0.093 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 6.87e-01 0.0659 0.163 0.093 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 1.10e-01 0.266 0.166 0.093 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 8.24e-01 0.0315 0.141 0.093 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 9.22e-01 0.0154 0.157 0.093 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0205 0.155 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0354 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 1.59e-01 0.17 0.12 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 6.55e-02 0.256 0.138 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0958 0.163 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 5.81e-01 0.0879 0.159 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 6.56e-02 -0.275 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 2.47e-01 0.176 0.151 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 4.70e-01 0.102 0.141 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 2.17e-01 -0.149 0.12 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0156 0.144 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0159 0.109 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 1.17e-01 -0.236 0.15 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0522 0.146 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 1.70e-01 0.175 0.127 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 2.20e-01 -0.186 0.151 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 1.09e-01 0.262 0.163 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 1.86e-01 -0.219 0.165 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 6.12e-01 0.081 0.159 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 7.90e-01 0.0341 0.128 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 3.47e-02 -0.352 0.166 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 5.83e-01 0.094 0.171 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 1.95e-02 0.393 0.167 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 1.15e-01 0.257 0.162 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0986 0.141 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 2.59e-01 0.148 0.131 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 4.36e-01 0.108 0.139 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 6.38e-01 0.0496 0.105 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 3.41e-02 -0.31 0.145 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 3.55e-01 -0.137 0.148 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 1.74e-01 0.168 0.123 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 2.84e-01 0.162 0.151 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 4.11e-02 0.44 0.213 0.089 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 4.25e-01 -0.167 0.208 0.089 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 9.06e-01 0.0153 0.129 0.089 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 1.60e-01 -0.259 0.183 0.089 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 8.82e-01 0.0316 0.213 0.089 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 6.33e-01 0.0625 0.13 0.089 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 2.63e-01 0.249 0.221 0.089 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 7.64e-01 -0.046 0.153 0.089 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 6.08e-01 0.0913 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 1.67e-02 0.39 0.162 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 1.58e-01 -0.231 0.163 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 1.05e-01 0.242 0.149 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 8.87e-01 0.0157 0.111 0.091 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 2.12e-01 -0.197 0.158 0.091 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 9.69e-01 0.00467 0.12 0.091 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 7.08e-01 0.0599 0.16 0.091 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 1.25e-01 0.171 0.111 0.091 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 9.63e-01 0.00711 0.153 0.094 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 1.72e-01 0.214 0.156 0.094 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 1.60e-01 -0.231 0.164 0.094 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 3.15e-01 -0.144 0.143 0.094 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 1.66e-01 -0.216 0.156 0.094 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00859 0.162 0.094 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 8.08e-01 0.036 0.148 0.094 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 4.04e-01 0.129 0.155 0.098 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 6.02e-01 0.085 0.163 0.098 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 6.13e-01 0.0714 0.141 0.098 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00449 0.182 0.098 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 5.08e-02 -0.321 0.164 0.098 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0655 0.171 0.098 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0174 0.155 0.098 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 7.30e-01 0.0433 0.125 0.098 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 1.09e-01 0.245 0.152 0.098 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 6.09e-01 0.0691 0.135 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 2.41e-01 -0.127 0.108 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 6.33e-01 0.0509 0.107 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 3.57e-02 -0.296 0.14 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 6.48e-01 0.0726 0.159 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0704 0.142 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 8.06e-01 0.0324 0.132 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 6.07e-01 0.0539 0.105 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 1.64e-02 -0.274 0.113 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0448 0.151 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.65e-01 0.0243 0.142 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 7.08e-01 0.0441 0.118 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 3.23e-01 -0.142 0.143 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 6.45e-01 0.0774 0.168 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 3.13e-01 0.159 0.157 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 4.03e-01 0.12 0.144 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0905 0.113 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 9.83e-01 0.00303 0.142 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 1.25e-01 0.286 0.186 0.097 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.82e-02 0.32 0.186 0.097 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 3.64e-01 0.162 0.178 0.097 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0289 0.135 0.097 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 1.40e-01 0.262 0.177 0.097 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 3.52e-01 0.174 0.186 0.097 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 8.56e-01 0.0345 0.19 0.097 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 1.05e-01 -0.286 0.175 0.097 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 2.90e-01 -0.171 0.161 0.096 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 2.71e-01 -0.181 0.164 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 2.55e-01 -0.162 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 8.86e-01 0.0241 0.167 0.096 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 8.47e-01 0.0303 0.157 0.096 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 6.48e-01 0.074 0.162 0.096 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 1.17e-01 -0.257 0.163 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 3.93e-01 0.117 0.137 0.096 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 1.47e-01 -0.219 0.151 0.096 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0188 0.15 0.095 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0153 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0721 0.14 0.095 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 9.39e-01 0.0128 0.168 0.095 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 5.78e-01 0.0817 0.147 0.095 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 6.25e-01 0.0692 0.141 0.095 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 4.65e-01 0.113 0.154 0.095 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0615 0.126 0.095 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 1.07e-01 0.211 0.131 0.095 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0366 0.172 0.09 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0592 0.166 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 2.19e-01 -0.202 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 2.13e-01 -0.216 0.173 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 5.28e-01 0.109 0.173 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 3.01e-01 0.188 0.181 0.09 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 1.29e-01 0.274 0.179 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 9.82e-01 0.00284 0.123 0.09 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0971 0.146 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 8.42e-01 0.0305 0.153 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 9.42e-02 0.255 0.152 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00633 0.0816 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 4.19e-01 0.104 0.128 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 6.61e-01 0.058 0.132 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 1.87e-01 -0.197 0.149 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 2.86e-01 -0.128 0.119 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0771 0.133 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 4.47e-01 -0.117 0.154 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 1.62e-01 0.199 0.142 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0454 0.129 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0289 0.0715 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0986 0.102 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0806 0.125 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 5.61e-01 0.0832 0.143 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 5.03e-03 0.355 0.125 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0379 0.112 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -713501 sc-eQTL 2.95e-01 0.17 0.162 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0366 0.131 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0414 0.104 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 6.43e-01 0.0487 0.105 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 5.38e-02 -0.259 0.134 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 8.23e-01 0.0358 0.159 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00251 0.136 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 4.82e-01 0.082 0.116 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 8.89e-01 0.0136 0.0974 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 1.00e-01 -0.184 0.111 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0602 0.154 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0462 0.145 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 3.24e-01 -0.129 0.13 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 7.26e-01 0.0554 0.158 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 8.37e-01 0.0313 0.152 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 7.73e-01 0.0436 0.151 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 1.86e-01 -0.189 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 4.89e-01 0.0784 0.113 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 452288 sc-eQTL 4.89e-01 0.0956 0.138 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 826849 sc-eQTL 6.44e-01 0.0572 0.124 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0184 0.104 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -670976 sc-eQTL 5.79e-01 0.076 0.137 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -804988 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00403 0.0937 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -254134 sc-eQTL 4.41e-03 -0.406 0.141 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -381801 sc-eQTL 3.47e-01 -0.125 0.133 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 758831 sc-eQTL 4.47e-03 0.297 0.103 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -851609 sc-eQTL 7.36e-01 -0.049 0.145 0.095 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 883097 eQTL 4.57e-02 0.0273 0.0136 0.00116 0.0 0.0922
ENSG00000257489 AC010203.1 826188 eQTL 0.039 -0.1 0.0486 0.0 0.0 0.0922


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -898748 2.66e-07 1.1e-07 3.65e-08 1.79e-07 9.02e-08 9.3e-08 1.42e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.62e-07 7.88e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.4e-08 7.89e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.2e-08 4.03e-08 1.04e-07 1.3e-07 1.26e-07 4.26e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.12e-07 8.7e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.96e-08 2.92e-08 8.68e-08 8.99e-08 3.97e-08 4.75e-08 9.68e-08 7.92e-08 3.05e-08 4.18e-08 1.36e-07 4.1e-08 2.49e-08 8.03e-08 1.69e-08 1.24e-07 3.92e-09 4.73e-08