logo

Genes within 1Mb (chr12:101010898:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 1.21e-02 0.32 0.126 0.083 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 7.52e-01 0.0343 0.109 0.083 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 4.11e-01 0.0554 0.0673 0.083 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 4.58e-01 0.0725 0.0975 0.083 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0579 0.111 0.083 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 8.09e-02 0.166 0.0947 0.083 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 8.92e-01 0.0148 0.108 0.083 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0854 0.0864 0.083 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 2.98e-01 -0.143 0.137 0.083 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0404 0.0969 0.083 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 5.13e-01 -0.059 0.0902 0.083 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 7.01e-01 0.0518 0.135 0.083 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 5.09e-01 0.0618 0.0934 0.083 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 1.87e-01 0.136 0.103 0.083 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0976 0.101 0.083 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 8.85e-01 0.0112 0.0771 0.083 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0721 0.107 0.083 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 1.62e-01 -0.148 0.106 0.083 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 5.36e-01 -0.083 0.134 0.083 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 3.35e-01 0.085 0.0879 0.083 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 4.27e-01 0.0883 0.111 0.083 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 8.53e-01 0.0228 0.123 0.083 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 7.01e-02 -0.18 0.0987 0.083 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 1.73e-01 -0.17 0.124 0.083 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 7.93e-02 -0.245 0.139 0.088 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 9.15e-01 0.0145 0.135 0.088 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0319 0.128 0.088 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0512 0.141 0.088 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 6.84e-01 0.0614 0.151 0.088 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 8.30e-01 0.0336 0.156 0.088 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 1.62e-01 0.209 0.149 0.088 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 6.53e-01 0.0499 0.111 0.088 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 4.96e-01 0.0948 0.139 0.088 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 6.50e-01 0.0571 0.126 0.083 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0662 0.103 0.083 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0606 0.1 0.083 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 2.48e-01 0.145 0.125 0.083 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 6.44e-01 0.0649 0.14 0.083 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 6.92e-01 0.0512 0.129 0.083 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 1.58e-01 0.152 0.107 0.083 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 3.97e-02 -0.19 0.0917 0.083 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 4.58e-01 0.0748 0.101 0.083 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 3.71e-01 -0.102 0.114 0.084 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 1.20e-02 -0.234 0.0925 0.084 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 6.59e-01 0.0516 0.117 0.084 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 3.80e-01 0.0745 0.0847 0.084 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 4.92e-02 -0.268 0.135 0.084 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 3.20e-02 0.268 0.124 0.084 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0341 0.0966 0.084 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 3.04e-01 0.138 0.134 0.084 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 6.62e-01 0.0604 0.138 0.083 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 2.48e-01 0.151 0.131 0.083 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 4.98e-01 0.0912 0.134 0.083 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 9.00e-01 0.0122 0.0971 0.083 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 4.80e-01 0.107 0.152 0.083 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 9.24e-01 0.0105 0.111 0.083 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 9.35e-01 0.00983 0.121 0.083 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 8.52e-01 0.022 0.118 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 4.26e-02 0.353 0.173 0.077 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0274 0.187 0.077 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0754 0.121 0.077 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 3.27e-01 0.169 0.172 0.077 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 1.35e-01 -0.249 0.166 0.077 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 5.61e-02 0.328 0.171 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0906 0.176 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 1.99e-02 -0.382 0.162 0.077 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 3.37e-01 -0.13 0.135 0.077 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 3.71e-02 0.308 0.147 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 5.42e-01 0.0963 0.158 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0246 0.0859 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 6.94e-01 0.0501 0.127 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0247 0.141 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 2.32e-01 0.19 0.158 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0915 0.129 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 1.56e-01 -0.2 0.14 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 3.05e-01 -0.152 0.148 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 2.22e-01 0.19 0.155 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0684 0.15 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0447 0.0998 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 2.74e-01 -0.15 0.136 0.084 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0661 0.15 0.084 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 8.02e-01 0.0375 0.149 0.084 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0401 0.136 0.084 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0903 0.14 0.084 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0327 0.144 0.084 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 1.62e-01 0.192 0.137 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 8.50e-02 -0.226 0.131 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 4.89e-01 0.0523 0.0755 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 2.23e-01 0.13 0.107 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0928 0.127 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 6.60e-01 0.0624 0.142 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 3.52e-01 0.116 0.124 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0221 0.116 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 8.65e-01 0.0269 0.158 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 4.91e-01 0.109 0.158 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 1.34e-01 0.226 0.151 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 2.03e-01 0.101 0.0787 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 8.04e-01 0.0305 0.122 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0214 0.142 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 6.62e-01 0.0683 0.156 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0671 0.148 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 5.39e-01 0.0826 0.134 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 9.63e-02 -0.235 0.141 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0821 0.159 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 9.71e-01 0.00579 0.157 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 3.34e-01 -0.153 0.158 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 3.65e-01 0.126 0.138 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 5.29e-01 0.096 0.152 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0584 0.162 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 2.52e-01 -0.178 0.155 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 6.93e-01 0.0438 0.111 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0265 0.105 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 6.63e-01 0.0579 0.133 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.102 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 9.94e-01 0.000859 0.112 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 1.76e-01 -0.163 0.12 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 8.40e-01 0.0187 0.093 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0234 0.119 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 8.66e-01 -0.021 0.125 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0563 0.139 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 5.33e-01 0.0673 0.108 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 8.47e-01 0.0261 0.135 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 3.10e-01 0.128 0.126 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 3.06e-01 0.108 0.106 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 8.61e-02 -0.238 0.138 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 1.02e-01 -0.225 0.137 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 6.50e-01 0.0629 0.138 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0692 0.133 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 4.67e-01 0.105 0.144 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0646 0.136 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0517 0.14 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0159 0.126 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 2.13e-01 -0.16 0.128 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0259 0.137 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 6.36e-01 0.052 0.11 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 3.13e-01 -0.15 0.148 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 6.85e-01 0.0595 0.147 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 1.87e-01 -0.167 0.126 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 9.82e-01 0.00345 0.156 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0553 0.124 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 8.84e-01 0.0196 0.133 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 8.24e-01 0.0309 0.139 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0122 0.125 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 2.80e-01 0.143 0.132 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0075 0.144 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 3.04e-01 -0.122 0.118 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 4.12e-02 -0.298 0.145 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0377 0.147 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 9.37e-01 0.0125 0.157 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 2.00e-01 -0.176 0.137 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 1.34e-02 0.349 0.14 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 5.99e-01 0.0817 0.155 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 2.52e-01 -0.175 0.152 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 4.90e-01 0.108 0.156 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 2.41e-01 -0.174 0.148 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0507 0.145 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 8.61e-01 0.0273 0.156 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 4.58e-01 -0.103 0.139 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 6.26e-01 0.0728 0.149 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 7.96e-02 0.28 0.159 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 3.76e-01 0.135 0.153 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 1.62e-01 0.222 0.158 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 9.71e-01 0.0053 0.148 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 9.19e-01 0.0151 0.149 0.084 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00281 0.138 0.084 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 4.90e-01 0.0976 0.141 0.084 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 5.26e-01 0.0793 0.125 0.084 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 7.59e-01 0.046 0.15 0.084 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 3.87e-01 -0.132 0.153 0.084 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 7.00e-01 0.0501 0.13 0.084 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0322 0.144 0.084 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0775 0.147 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 2.34e-01 -0.168 0.141 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 2.50e-01 0.132 0.114 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 2.79e-01 0.143 0.132 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 2.30e-01 0.185 0.154 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 1.68e-01 0.208 0.15 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 5.85e-02 0.268 0.141 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 1.53e-01 -0.205 0.143 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0975 0.134 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 2.43e-02 -0.256 0.113 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0682 0.136 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 2.73e-01 0.113 0.103 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 2.09e-01 -0.179 0.142 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 1.23e-01 0.213 0.137 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 5.79e-01 -0.067 0.121 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 2.27e-01 0.173 0.143 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0579 0.157 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 1.77e-01 -0.214 0.158 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0234 0.153 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0918 0.123 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 7.24e-01 0.0569 0.161 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 3.89e-01 0.142 0.164 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 7.91e-01 -0.043 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 4.52e-01 -0.118 0.157 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 9.78e-01 0.00372 0.133 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0757 0.123 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 5.89e-01 0.0706 0.13 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 3.42e-01 0.0942 0.0989 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 7.03e-02 -0.249 0.137 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 1.98e-01 0.179 0.139 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 1.18e-01 -0.181 0.116 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 2.67e-01 0.158 0.142 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 8.65e-02 0.335 0.194 0.081 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0177 0.189 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 1.09e-01 -0.186 0.115 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 1.68e-01 -0.23 0.166 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 3.97e-01 0.163 0.192 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 9.46e-01 0.00796 0.118 0.081 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0601 0.201 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 9.25e-01 0.013 0.138 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 6.60e-01 0.0708 0.16 0.081 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0391 0.153 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 2.57e-01 0.173 0.152 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 7.09e-01 0.0522 0.14 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 2.04e-01 -0.131 0.103 0.085 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0301 0.148 0.085 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 9.81e-01 0.00273 0.112 0.085 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 5.63e-01 0.0863 0.149 0.085 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00141 0.104 0.085 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 2.59e-01 -0.16 0.142 0.083 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 1.02e-01 -0.237 0.144 0.083 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 5.37e-01 0.0942 0.152 0.083 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 7.31e-02 0.238 0.132 0.083 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 2.20e-03 0.439 0.142 0.083 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 7.14e-02 -0.27 0.149 0.083 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0601 0.137 0.083 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 8.19e-02 -0.248 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 7.57e-01 0.0466 0.15 0.09 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 6.21e-01 0.0646 0.131 0.09 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 9.23e-02 -0.283 0.167 0.09 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 1.42e-01 0.224 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 7.76e-02 -0.279 0.157 0.09 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 9.58e-02 0.238 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 5.54e-01 0.0687 0.116 0.09 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 7.26e-01 0.0496 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 9.48e-01 0.00835 0.128 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0373 0.103 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 8.86e-01 0.0144 0.101 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 6.98e-01 0.052 0.134 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 2.92e-01 0.159 0.15 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 2.98e-01 -0.14 0.135 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 3.35e-01 0.12 0.124 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 6.26e-03 -0.269 0.0975 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0511 0.109 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 2.81e-01 0.155 0.143 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0521 0.135 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00504 0.112 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 5.64e-01 0.0785 0.136 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 3.83e-01 -0.139 0.159 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 1.84e-01 0.199 0.149 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 6.68e-01 0.0585 0.137 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 1.46e-01 -0.157 0.107 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 8.85e-01 0.0196 0.135 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0309 0.176 0.091 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 3.88e-01 0.153 0.177 0.091 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 5.18e-01 0.109 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 6.38e-01 0.0597 0.127 0.091 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 2.32e-01 0.2 0.167 0.091 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0963 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 5.28e-01 -0.113 0.179 0.091 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 3.86e-01 -0.144 0.166 0.091 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 2.75e-01 -0.164 0.15 0.087 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 8.88e-01 0.0216 0.153 0.087 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0715 0.133 0.087 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 7.43e-01 0.0512 0.156 0.087 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 7.36e-01 0.0493 0.146 0.087 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 2.69e-01 -0.167 0.15 0.087 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 3.77e-02 0.316 0.151 0.087 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0878 0.127 0.087 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 2.08e-01 0.178 0.141 0.087 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 5.82e-01 0.0805 0.146 0.086 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 4.71e-01 0.104 0.145 0.086 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 4.56e-01 -0.102 0.136 0.086 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 6.68e-02 0.298 0.162 0.086 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 1.88e-01 0.188 0.142 0.086 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 8.27e-01 0.03 0.137 0.086 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 4.88e-01 0.104 0.15 0.086 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 3.58e-02 -0.257 0.122 0.086 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 1.31e-01 0.192 0.127 0.086 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0144 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 9.27e-01 0.0145 0.157 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 7.95e-01 0.0402 0.155 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 1.96e-01 0.212 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 8.21e-01 0.0369 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0665 0.172 0.09 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 8.35e-01 0.0357 0.171 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 9.55e-01 0.0065 0.116 0.09 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0858 0.138 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 8.16e-04 0.478 0.141 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 5.13e-01 0.0944 0.144 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0523 0.0769 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00464 0.121 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 8.35e-01 -0.026 0.125 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 5.17e-02 0.273 0.14 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0473 0.113 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 5.64e-02 -0.24 0.125 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 2.03e-01 -0.185 0.145 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 1.29e-01 0.207 0.136 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 3.75e-01 -0.11 0.124 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 3.87e-01 0.0595 0.0687 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 2.63e-01 0.11 0.0983 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 3.51e-01 -0.112 0.12 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 8.04e-01 0.0343 0.138 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00395 0.123 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0184 0.108 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -728574 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0582 0.156 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 5.18e-01 0.0809 0.125 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0707 0.099 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0127 0.1 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 4.78e-01 0.0916 0.129 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 5.89e-01 0.0824 0.152 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00168 0.13 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 4.47e-01 0.0847 0.111 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 1.17e-02 -0.233 0.0917 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 5.44e-01 -0.065 0.107 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0969 0.147 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 4.10e-01 0.114 0.138 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0216 0.124 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 4.77e-02 0.297 0.149 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 2.62e-01 0.162 0.144 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0327 0.144 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 7.88e-02 0.239 0.135 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0855 0.108 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 437215 sc-eQTL 1.03e-01 0.214 0.131 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 811776 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0856 0.118 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 868024 sc-eQTL 4.64e-02 -0.196 0.098 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -686049 sc-eQTL 8.40e-01 0.0264 0.13 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -820061 sc-eQTL 4.57e-01 0.0663 0.089 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -269207 sc-eQTL 3.72e-02 -0.284 0.135 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -396874 sc-eQTL 5.91e-02 0.239 0.126 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 743758 sc-eQTL 1.88e-01 -0.132 0.0997 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -866682 sc-eQTL 1.18e-01 0.215 0.137 0.084 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000280088 AC126474.2 976824 eQTL 0.0475 0.0546 0.0275 0.00129 0.0 0.0628

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000280088 AC126474.2 976824 2.64e-07 1.16e-07 4.47e-08 1.82e-07 9.21e-08 9.65e-08 1.38e-07 5.33e-08 1.4e-07 4.57e-08 1.56e-07 8.59e-08 1.33e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.26e-08 4.48e-08 1.18e-07 5.36e-08 4.07e-08 1.04e-07 1.26e-07 1.26e-07 3.68e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.08e-07 9.15e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.91e-08 2.9e-08 3.26e-08 8.49e-08 8.96e-08 3.65e-08 5.01e-08 9.55e-08 7.52e-08 3.55e-08 4.44e-08 1.35e-07 5.22e-08 1.38e-08 4.7e-08 1.83e-08 1.22e-07 3.81e-09 5.04e-08