Genes within 1Mb (chr12:101004903:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0254 0.0868 0.252 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 4.20e-01 0.0594 0.0735 0.252 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 6.58e-01 0.0203 0.0456 0.252 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 8.76e-01 0.0104 0.0661 0.252 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0927 0.0749 0.252 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00908 0.0646 0.252 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 8.81e-01 0.011 0.0733 0.252 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0319 0.0586 0.252 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00606 0.0931 0.252 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 9.99e-01 9.03e-05 0.0663 0.252 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 4.84e-01 0.0432 0.0617 0.252 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00983 0.0922 0.252 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0444 0.0639 0.252 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 4.14e-01 0.0578 0.0706 0.252 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 5.92e-02 0.13 0.0686 0.252 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0467 0.0526 0.252 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 1.30e-01 0.11 0.0727 0.252 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0462 0.0722 0.252 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 2.82e-01 0.0982 0.0911 0.252 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0471 0.0599 0.252 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 2.42e-02 0.17 0.0748 0.252 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 1.55e-02 0.201 0.0824 0.252 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 1.87e-01 0.0893 0.0675 0.252 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0895 0.0848 0.252 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 7.44e-02 0.164 0.0915 0.25 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0398 0.089 0.25 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 4.15e-02 0.171 0.0833 0.25 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 5.55e-01 0.0547 0.0925 0.25 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 8.36e-01 0.0206 0.0993 0.25 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0748 0.103 0.25 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000444 0.0987 0.25 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0412 0.0729 0.25 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0285 0.0917 0.25 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0292 0.0831 0.252 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 7.28e-01 0.0238 0.0683 0.252 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 2.11e-01 0.083 0.0662 0.252 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.88e-01 0.0719 0.0831 0.252 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 1.26e-01 0.142 0.0923 0.252 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 5.82e-01 0.0471 0.0854 0.252 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 8.85e-01 0.0103 0.0713 0.252 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 5.67e-01 0.0351 0.0612 0.252 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0367 0.0666 0.252 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 3.82e-01 0.0675 0.077 0.253 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 1.18e-01 0.0993 0.0633 0.253 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0636 0.0792 0.253 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 4.05e-01 0.0479 0.0574 0.253 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 4.41e-02 0.186 0.0916 0.253 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0333 0.085 0.253 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0772 0.0653 0.253 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0621 0.0911 0.253 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 1.42e-01 -0.135 0.0913 0.252 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 6.35e-01 0.0414 0.087 0.252 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 8.85e-01 -0.013 0.0894 0.252 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 8.39e-01 0.0131 0.0645 0.252 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 3.27e-01 0.0987 0.101 0.252 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0403 0.0734 0.252 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00758 0.0802 0.252 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0285 0.0783 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0674 0.11 0.258 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 5.25e-01 0.0747 0.117 0.258 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 5.05e-01 0.051 0.0763 0.258 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.17e-01 0.109 0.108 0.258 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 7.78e-01 0.0297 0.105 0.258 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 5.74e-01 -0.061 0.108 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 1.00e-01 -0.181 0.11 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 4.98e-01 0.0703 0.104 0.258 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 7.83e-02 0.15 0.0844 0.258 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0494 0.0973 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 9.89e-01 0.00148 0.104 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00615 0.0565 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.86e-01 0.0723 0.0833 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 4.38e-02 -0.186 0.0919 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0712 0.104 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 5.35e-01 0.0528 0.085 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 3.53e-01 0.0859 0.0924 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0245 0.0973 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 9.78e-02 0.176 0.106 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 7.04e-01 0.039 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 9.68e-01 0.00272 0.0685 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.94e-01 0.0801 0.0936 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 6.73e-01 0.0435 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 6.78e-01 0.0426 0.102 0.248 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 2.28e-02 0.211 0.0921 0.248 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 3.01e-01 0.0993 0.0958 0.248 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 6.24e-01 0.0485 0.0988 0.248 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 4.45e-01 0.0711 0.0929 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 2.57e-01 0.101 0.0888 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00754 0.0512 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00446 0.0724 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 1.49e-01 -0.124 0.0856 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0858 0.0958 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0522 0.0841 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0527 0.0787 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00637 0.107 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0547 0.103 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0363 0.099 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 5.54e-01 0.0306 0.0516 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00714 0.0801 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0368 0.0928 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 9.93e-01 0.000842 0.102 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 8.19e-01 0.0222 0.0968 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0847 0.0877 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0609 0.0924 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 6.29e-01 0.0494 0.102 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 4.51e-01 0.0764 0.101 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0494 0.102 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0163 0.0893 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0897 0.098 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 9.18e-02 0.175 0.103 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0577 0.0999 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 7.49e-01 0.0243 0.0757 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 5.98e-01 0.0377 0.0714 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0178 0.0904 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0374 0.0697 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 6.13e-01 0.0385 0.0759 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 8.85e-02 0.14 0.0817 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0223 0.0633 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0649 0.0814 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 3.29e-01 0.0837 0.0855 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 6.02e-01 0.0498 0.0955 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0365 0.074 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 2.78e-01 0.101 0.0923 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 8.16e-01 0.0202 0.0867 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0836 0.0725 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 5.82e-01 0.0524 0.095 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 1.57e-01 0.133 0.0937 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 3.93e-01 0.081 0.0947 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0531 0.0912 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 1.14e-01 0.156 0.0982 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 7.61e-01 0.0284 0.0933 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 7.93e-01 0.0251 0.0957 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 4.06e-01 0.0685 0.0822 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00295 0.0844 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 5.68e-01 0.0513 0.0898 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 9.31e-02 0.12 0.0714 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 8.47e-03 0.254 0.0956 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 4.46e-01 0.0732 0.096 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 9.24e-01 0.00794 0.0831 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 3.94e-01 -0.087 0.102 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 1.09e-01 0.135 0.0839 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 1.00e-01 -0.149 0.09 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 3.60e-01 0.0863 0.0941 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0913 0.0845 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 9.30e-01 0.00791 0.0901 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 7.48e-02 0.174 0.097 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 6.56e-02 0.148 0.0799 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 1.43e-01 0.145 0.0989 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 2.32e-02 0.232 0.101 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.109 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 7.22e-01 0.0341 0.0958 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.33e-01 0.0961 0.0989 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 5.09e-01 0.0715 0.108 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 7.70e-01 0.0311 0.106 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 2.11e-01 0.136 0.108 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000453 0.104 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 8.66e-01 0.0165 0.0978 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 3.90e-01 0.0902 0.105 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000628 0.0938 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 1.66e-01 -0.139 0.1 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 9.01e-01 0.0134 0.108 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 3.73e-01 0.0918 0.103 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 4.65e-02 -0.212 0.106 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0484 0.0993 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0238 0.101 0.253 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0691 0.0938 0.253 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 8.28e-01 0.0209 0.0957 0.253 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0454 0.0848 0.253 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 5.22e-01 0.0651 0.102 0.253 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 6.48e-01 0.0474 0.104 0.253 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 3.00e-01 0.0912 0.0879 0.253 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 1.73e-01 0.133 0.0975 0.253 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 1.13e-01 -0.158 0.0995 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 2.34e-01 0.114 0.0956 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 1.95e-01 -0.101 0.0775 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 1.14e-01 -0.142 0.0894 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 6.70e-01 0.0448 0.105 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 9.52e-01 0.00623 0.103 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0899 0.0963 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 1.64e-01 -0.136 0.0971 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 2.15e-01 0.112 0.0901 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 1.78e-01 0.104 0.0768 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 7.86e-01 0.0249 0.0919 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 9.17e-01 0.00724 0.0695 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 4.46e-01 0.0735 0.0964 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 7.48e-01 0.03 0.0933 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0296 0.0815 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 7.00e-01 0.0375 0.097 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 6.80e-01 0.0415 0.1 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 6.12e-03 0.275 0.0993 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 6.47e-01 0.0447 0.0976 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 2.58e-02 0.174 0.0775 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 6.94e-02 0.186 0.102 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0852 0.105 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 1.79e-02 -0.244 0.102 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00378 0.1 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 1.46e-01 0.13 0.0891 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 4.98e-01 0.0565 0.0833 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 8.66e-01 0.0149 0.0881 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.18e-02 0.143 0.0662 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 8.48e-03 0.244 0.0918 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 9.72e-02 -0.155 0.0932 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0299 0.0785 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 2.65e-01 -0.107 0.096 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 3.31e-01 -0.123 0.126 0.267 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 8.73e-01 0.0194 0.122 0.267 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 1.96e-01 0.0967 0.0743 0.267 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.89e-01 0.0927 0.107 0.267 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 1.64e-01 0.172 0.123 0.267 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 6.92e-01 0.0302 0.0759 0.267 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 4.34e-01 0.101 0.129 0.267 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0175 0.089 0.267 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 3.02e-01 -0.107 0.103 0.267 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 3.14e-01 -0.103 0.102 0.252 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 3.41e-01 0.097 0.102 0.252 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 9.68e-01 0.00371 0.0934 0.252 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 8.69e-01 0.0114 0.0691 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 2.66e-01 0.11 0.0984 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0968 0.0743 0.252 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 5.82e-01 0.0548 0.0995 0.252 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0677 0.0694 0.252 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0663 0.0974 0.252 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 9.61e-01 0.00492 0.0998 0.252 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 7.44e-01 0.0342 0.105 0.252 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 1.44e-01 -0.133 0.091 0.252 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0621 0.0995 0.252 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 3.35e-01 0.0993 0.103 0.252 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 6.27e-01 0.0459 0.0944 0.252 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 2.48e-01 0.112 0.097 0.244 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0189 0.102 0.244 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 4.04e-01 0.0741 0.0887 0.244 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.70e-01 0.103 0.114 0.244 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0263 0.104 0.244 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0103 0.108 0.244 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 3.65e-01 0.0883 0.0973 0.244 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 6.67e-01 0.0339 0.0788 0.244 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 8.34e-01 0.0202 0.0963 0.244 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0716 0.0857 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 9.48e-01 0.00454 0.069 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 3.66e-01 0.0613 0.0676 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 1.21e-01 0.139 0.0894 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 3.03e-01 0.104 0.101 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0107 0.0906 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 5.22e-01 0.0536 0.0836 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 5.17e-01 0.0432 0.0665 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0102 0.0729 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0695 0.0948 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0561 0.089 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 6.31e-01 0.0355 0.0738 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0384 0.0898 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 8.10e-01 0.0254 0.105 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 2.19e-01 0.122 0.0985 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0098 0.0902 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 6.42e-01 0.0332 0.0712 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 5.72e-01 0.0505 0.0892 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00829 0.126 0.233 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 7.19e-01 0.0457 0.127 0.233 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 1.65e-01 -0.167 0.12 0.233 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 6.54e-01 0.0408 0.0908 0.233 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00916 0.12 0.233 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 9.83e-01 0.00276 0.126 0.233 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 4.92e-01 0.0882 0.128 0.233 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0974 0.119 0.233 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0917 0.101 0.256 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00422 0.103 0.256 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 2.73e-01 0.098 0.0892 0.256 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 9.23e-01 0.0102 0.105 0.256 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 2.10e-02 0.226 0.0971 0.256 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 2.32e-02 0.23 0.1 0.256 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 8.51e-01 0.0193 0.103 0.256 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 5.15e-01 0.0561 0.0859 0.256 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0877 0.095 0.256 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 3.32e-01 0.0933 0.096 0.253 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00875 0.0955 0.253 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00106 0.0898 0.253 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 5.12e-01 0.0706 0.107 0.253 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 5.38e-01 -0.058 0.094 0.253 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0315 0.0904 0.253 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 2.72e-01 -0.109 0.0985 0.253 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 3.66e-02 0.169 0.0801 0.253 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00497 0.0841 0.253 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 1.14e-01 0.169 0.106 0.251 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 1.79e-01 0.138 0.103 0.251 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 1.13e-01 0.161 0.101 0.251 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 5.17e-01 0.0699 0.108 0.251 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00643 0.107 0.251 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0675 0.113 0.251 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0345 0.112 0.251 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 6.46e-01 -0.035 0.0761 0.251 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0775 0.0907 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00457 0.0978 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 4.89e-01 0.0676 0.0974 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 5.96e-01 0.0277 0.0521 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 1.46e-01 0.119 0.0815 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 3.10e-02 -0.181 0.0834 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 2.04e-01 -0.121 0.095 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 2.02e-01 0.0974 0.0761 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 1.27e-01 0.13 0.0849 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 6.77e-01 0.041 0.0983 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0151 0.092 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 3.83e-01 0.0729 0.0833 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 7.56e-01 0.0144 0.0462 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00383 0.0662 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 1.48e-01 -0.117 0.0807 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0678 0.0923 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0438 0.0823 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0799 0.0724 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -734569 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0598 0.105 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0617 0.0828 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0313 0.0657 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 2.25e-01 0.0805 0.0662 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 1.45e-01 0.124 0.0851 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 4.25e-01 0.0807 0.101 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 6.52e-01 0.039 0.0865 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 7.86e-01 0.0201 0.0739 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 5.85e-01 0.0337 0.0617 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 5.52e-01 0.0423 0.0709 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 2.21e-01 0.122 0.0994 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 9.76e-01 0.00284 0.0935 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 4.35e-01 0.0658 0.0843 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0983 0.102 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 2.06e-01 0.124 0.0979 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 2.85e-01 0.104 0.0974 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0692 0.0924 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 4.32e-01 0.0575 0.073 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 431220 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0968 0.0889 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 805781 sc-eQTL 7.78e-02 0.141 0.0795 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 sc-eQTL 1.11e-01 0.107 0.0668 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -692044 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0218 0.0885 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -826056 sc-eQTL 3.68e-01 0.0545 0.0605 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -275202 sc-eQTL 3.74e-02 0.193 0.092 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -402869 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0823 0.0861 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 737763 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0804 0.0679 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -872677 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0446 0.0938 0.252 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 eQTL 4.15e-02 -0.0196 0.0096 0.00109 0.0 0.214
ENSG00000279148 AC126474.1 977363 eQTL 0.048 -0.0625 0.0316 0.0 0.0 0.214
ENSG00000280088 AC126474.2 970829 eQTL 0.0691 -0.0285 0.0156 0.00105 0.0 0.214


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 862029 2.8e-07 1.27e-07 5.64e-08 1.82e-07 1.01e-07 9.48e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.52e-07 1.05e-07 1.53e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.23e-08 4.24e-08 1.44e-07 6.32e-08 4.78e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.91e-08 1.55e-07 1.26e-07 1.13e-07 9.74e-08 1.23e-07 1e-07 1.02e-07 2.99e-08 3.73e-08 8.23e-08 5.64e-08 2.99e-08 5.22e-08 8.72e-08 6.63e-08 4.47e-08 5.37e-08 1.4e-07 5.27e-08 1.35e-08 3.4e-08 1.92e-08 1.2e-07 1.89e-09 4.8e-08