logo

Genes within 1Mb (chr12:100997935:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 2.82e-01 0.141 0.13 0.092 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.58e-01 0.0343 0.111 0.092 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.31e-01 0.0147 0.0688 0.092 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0899 0.0994 0.092 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0353 0.113 0.092 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0966 0.0971 0.092 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 2.88e-01 0.118 0.11 0.092 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0332 0.0883 0.092 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 3.35e-01 0.135 0.14 0.092 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 9.41e-02 0.168 0.0997 0.092 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 1.84e-01 0.124 0.0931 0.092 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.08e-01 0.034 0.14 0.092 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0571 0.0967 0.092 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 1.16e-01 -0.168 0.106 0.092 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 9.82e-02 -0.173 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 3.86e-01 0.0693 0.0797 0.092 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 2.59e-01 0.125 0.111 0.092 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0533 0.11 0.092 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 7.52e-01 0.044 0.139 0.092 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.25e-01 0.058 0.0911 0.092 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 2.80e-02 -0.252 0.114 0.092 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 2.27e-01 -0.153 0.127 0.092 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 2.91e-02 0.224 0.102 0.092 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 5.60e-01 0.0753 0.129 0.092 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 9.38e-01 0.0112 0.144 0.09 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 6.34e-01 0.0661 0.139 0.09 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 7.61e-01 0.0399 0.131 0.09 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 2.85e-01 -0.154 0.144 0.09 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 1.79e-01 -0.207 0.154 0.09 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 7.32e-01 0.0548 0.16 0.09 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 4.64e-01 -0.113 0.153 0.09 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 7.12e-01 0.0419 0.114 0.09 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 8.28e-01 0.0311 0.143 0.09 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0669 0.128 0.092 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0306 0.105 0.092 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 5.60e-01 0.0596 0.102 0.092 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 1.86e-01 -0.17 0.128 0.092 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 7.11e-01 0.053 0.143 0.092 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0198 0.132 0.092 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0684 0.11 0.092 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 4.30e-01 0.0746 0.0942 0.092 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 1.45e-01 -0.15 0.102 0.092 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 5.34e-01 0.073 0.117 0.092 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 8.24e-01 0.0216 0.0968 0.092 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 7.18e-01 0.0436 0.121 0.092 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000753 0.0875 0.092 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 1.11e-02 -0.355 0.139 0.092 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 1.57e-01 -0.183 0.129 0.092 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.58e-02 0.239 0.0982 0.092 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 6.92e-01 0.055 0.139 0.092 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 5.58e-01 0.0829 0.141 0.092 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 1.45e-01 -0.195 0.134 0.092 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 5.55e-01 0.0813 0.138 0.092 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0332 0.0994 0.092 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 7.40e-01 0.0515 0.155 0.092 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00068 0.113 0.092 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 7.52e-01 0.0391 0.124 0.092 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 9.74e-01 0.00396 0.121 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 5.11e-01 -0.114 0.174 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 3.50e-01 0.174 0.185 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 6.93e-01 0.0478 0.121 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.18e-01 -0.111 0.172 0.092 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 7.49e-01 0.0533 0.166 0.092 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 3.43e-01 0.163 0.171 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 3.55e-01 0.162 0.174 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 5.12e-01 -0.108 0.164 0.092 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 8.05e-02 -0.235 0.134 0.092 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 4.53e-01 0.113 0.15 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 3.18e-02 0.343 0.159 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 5.87e-01 0.0474 0.0872 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 6.48e-01 0.0589 0.129 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 5.79e-01 0.0797 0.143 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 7.65e-02 -0.285 0.16 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 2.93e-01 -0.138 0.131 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 4.67e-01 0.104 0.143 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 2.15e-01 -0.186 0.15 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 8.16e-01 0.0371 0.159 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 5.63e-01 0.0886 0.153 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0568 0.102 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 4.18e-01 0.113 0.14 0.093 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0376 0.153 0.093 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0788 0.152 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 2.17e-01 -0.172 0.138 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 4.58e-01 -0.106 0.143 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 1.41e-01 0.217 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 7.92e-02 0.25 0.142 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0327 0.137 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.00e-01 0.02 0.0787 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.28e-03 -0.308 0.109 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0752 0.132 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 3.74e-01 -0.131 0.147 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.06e-01 0.209 0.129 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00172 0.121 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0288 0.164 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0344 0.158 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 2.36e-01 -0.179 0.151 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0373 0.0788 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 3.05e-01 0.125 0.122 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0614 0.142 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 1.69e-01 0.214 0.155 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 3.01e-01 0.153 0.147 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0169 0.134 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 6.17e-02 0.263 0.14 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0396 0.163 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 8.15e-01 0.0379 0.162 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.53e-01 0.0303 0.163 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0516 0.142 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 3.31e-01 -0.152 0.156 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0814 0.166 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.02e-01 -0.26 0.158 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 2.72e-01 0.126 0.114 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 3.63e-01 0.0985 0.108 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 7.79e-01 0.0385 0.137 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0668 0.106 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 2.37e-02 -0.259 0.114 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 2.54e-01 -0.142 0.124 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 7.86e-01 0.0262 0.0961 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 2.21e-01 0.151 0.123 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0389 0.13 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 9.15e-01 0.0154 0.145 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0471 0.112 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 2.67e-01 0.156 0.14 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0774 0.131 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 4.12e-01 0.0903 0.11 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 1.72e-01 0.198 0.144 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.23e-01 0.051 0.143 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0367 0.144 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 9.97e-01 0.000607 0.139 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 2.79e-01 0.163 0.15 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 9.64e-01 0.00643 0.142 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0177 0.146 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 8.07e-02 0.223 0.127 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00361 0.131 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 2.80e-01 0.151 0.139 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00848 0.112 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 4.97e-01 -0.103 0.151 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0347 0.149 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 9.88e-01 0.00186 0.129 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 4.76e-01 0.113 0.158 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 8.68e-01 0.0217 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 8.76e-02 -0.238 0.139 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 7.98e-01 0.0373 0.146 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 6.43e-01 0.0607 0.131 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 2.71e-01 -0.153 0.139 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 8.73e-01 0.0241 0.151 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.17e-02 0.312 0.123 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 1.75e-01 0.208 0.153 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 4.14e-01 -0.121 0.148 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 8.57e-01 0.0285 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0357 0.139 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0889 0.143 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00559 0.157 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0601 0.154 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 8.09e-01 0.0381 0.157 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 1.29e-01 -0.227 0.149 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 3.21e-01 0.15 0.151 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 9.95e-01 0.000985 0.162 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0681 0.145 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0964 0.155 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 7.02e-03 -0.446 0.164 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0411 0.159 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 9.30e-01 0.0145 0.166 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0829 0.154 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 9.91e-01 0.00174 0.159 0.091 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 1.88e-01 -0.194 0.147 0.091 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 4.33e-01 -0.118 0.15 0.091 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.16e-01 0.0868 0.133 0.091 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 5.65e-01 0.0921 0.16 0.091 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 2.16e-01 0.202 0.163 0.091 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 9.44e-01 0.00979 0.139 0.091 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0727 0.154 0.091 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 8.24e-01 0.034 0.152 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0377 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 2.35e-01 0.141 0.118 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 7.55e-02 0.243 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0869 0.16 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0618 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.24e-01 -0.226 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 9.27e-02 0.249 0.147 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 3.74e-01 0.123 0.138 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 1.90e-01 -0.155 0.118 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0255 0.141 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0326 0.106 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 2.50e-01 -0.17 0.147 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 4.34e-01 -0.112 0.143 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.34e-01 0.187 0.124 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 4.79e-01 -0.105 0.149 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 3.72e-01 0.143 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 4.18e-01 -0.131 0.161 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.22e-01 0.035 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 7.58e-01 0.0385 0.125 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 1.26e-02 -0.405 0.161 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 5.18e-01 0.108 0.167 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 2.16e-02 0.377 0.163 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 1.08e-01 0.255 0.158 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 4.04e-01 -0.116 0.138 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.83e-02 0.226 0.128 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 5.06e-01 0.0905 0.136 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 5.95e-01 0.055 0.103 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 3.11e-02 -0.309 0.142 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 3.27e-01 -0.142 0.145 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 6.47e-02 0.223 0.12 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 2.40e-01 0.175 0.148 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 9.52e-02 0.381 0.226 0.081 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0678 0.22 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0284 0.136 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 1.87e-01 -0.257 0.194 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 5.82e-01 0.124 0.224 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 5.63e-01 0.0798 0.138 0.081 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.06e-01 0.378 0.232 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00851 0.161 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 7.03e-01 0.0715 0.187 0.081 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 7.94e-02 0.28 0.159 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 1.70e-01 -0.219 0.159 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 5.54e-01 0.0866 0.146 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 7.30e-01 0.0374 0.108 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 1.21e-01 -0.239 0.154 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0456 0.117 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 3.99e-01 0.131 0.156 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 2.53e-01 0.124 0.109 0.089 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 7.46e-01 0.0486 0.15 0.092 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 6.32e-02 0.285 0.152 0.092 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 1.71e-01 -0.221 0.16 0.092 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 1.21e-01 -0.218 0.14 0.092 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 8.81e-02 -0.261 0.152 0.092 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0398 0.159 0.092 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 9.29e-01 -0.013 0.145 0.092 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 2.54e-01 0.173 0.151 0.095 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 5.93e-01 0.0852 0.159 0.095 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 4.82e-01 0.0972 0.138 0.095 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0205 0.178 0.095 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 2.75e-02 -0.354 0.159 0.095 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0691 0.167 0.095 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0477 0.152 0.095 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 6.14e-01 0.0619 0.122 0.095 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 1.75e-01 0.203 0.149 0.095 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 6.06e-01 0.0681 0.132 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 2.10e-01 -0.133 0.106 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 3.59e-01 0.0956 0.104 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 1.17e-01 -0.216 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 8.38e-01 0.0318 0.155 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0182 0.139 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 7.39e-01 0.0429 0.128 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 5.33e-01 0.0638 0.102 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 1.44e-02 -0.272 0.11 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0194 0.147 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.59e-01 0.0425 0.138 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 5.24e-01 0.0729 0.114 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0953 0.139 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 5.41e-01 0.0997 0.163 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 3.62e-01 0.14 0.153 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 6.74e-01 0.0588 0.14 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0707 0.11 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 6.49e-01 -0.063 0.138 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 5.54e-01 0.108 0.182 0.094 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 3.71e-02 0.379 0.18 0.094 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 3.00e-01 0.18 0.173 0.094 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 8.58e-01 0.0234 0.131 0.094 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 4.02e-01 0.145 0.173 0.094 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 5.10e-01 0.12 0.181 0.094 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 9.04e-01 0.0223 0.185 0.094 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 1.57e-01 -0.243 0.171 0.094 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0795 0.158 0.093 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 2.15e-01 -0.2 0.161 0.093 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 2.12e-01 -0.174 0.139 0.093 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0139 0.164 0.093 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 6.66e-01 0.0662 0.153 0.093 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 4.65e-01 -0.116 0.159 0.093 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.37e-01 -0.239 0.16 0.093 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 4.32e-01 0.106 0.134 0.093 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 1.18e-01 -0.232 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 3.43e-01 -0.14 0.147 0.093 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00588 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0874 0.137 0.093 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0569 0.164 0.093 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 9.61e-01 0.00703 0.144 0.093 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.17e-01 0.0692 0.138 0.093 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 6.08e-01 0.0775 0.151 0.093 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0709 0.124 0.093 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 2.87e-01 0.137 0.128 0.093 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 2.69e-01 -0.185 0.167 0.088 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0289 0.162 0.088 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 4.11e-01 -0.131 0.159 0.088 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 1.21e-01 -0.261 0.168 0.088 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 7.11e-01 0.0625 0.168 0.088 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 9.30e-01 0.0156 0.177 0.088 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 3.33e-01 0.17 0.175 0.088 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 4.72e-01 0.0859 0.119 0.088 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0499 0.142 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00647 0.15 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 1.35e-01 0.223 0.149 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 9.32e-01 0.00679 0.08 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 4.30e-01 0.0993 0.126 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 6.17e-01 0.0648 0.129 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.65e-02 -0.268 0.145 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.84e-01 -0.155 0.117 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0506 0.131 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 4.66e-01 -0.11 0.151 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 1.24e-01 0.214 0.139 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 3.23e-01 -0.125 0.127 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 8.58e-01 0.0126 0.0703 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 1.41e-01 -0.148 0.1 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0923 0.123 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 5.48e-01 0.0845 0.14 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 9.48e-03 0.322 0.123 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 6.85e-01 0.0449 0.11 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -741537 sc-eQTL 3.27e-01 0.156 0.159 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0164 0.128 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0461 0.101 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 3.71e-01 0.0916 0.102 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 1.75e-01 -0.178 0.131 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 8.65e-01 0.0265 0.156 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 8.27e-01 0.029 0.133 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 6.16e-01 0.0571 0.114 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 7.50e-01 0.0303 0.095 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 5.86e-02 -0.206 0.108 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 4.19e-01 -0.122 0.151 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0591 0.142 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 2.80e-01 -0.138 0.127 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0214 0.155 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 9.31e-01 0.0129 0.149 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0684 0.148 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.42e-01 -0.205 0.139 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 3.93e-01 0.0946 0.111 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 424252 sc-eQTL 7.15e-01 0.0495 0.135 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 798813 sc-eQTL 6.44e-01 0.0562 0.121 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 855061 sc-eQTL 7.97e-01 0.0263 0.102 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -699012 sc-eQTL 6.45e-01 0.0618 0.134 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -833024 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00548 0.0918 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -282170 sc-eQTL 8.02e-03 -0.371 0.139 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -409837 sc-eQTL 2.84e-01 -0.14 0.13 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 730795 sc-eQTL 1.22e-03 0.33 0.101 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -879645 sc-eQTL 9.28e-01 0.0128 0.142 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000257489 AC010203.1 798152 eQTL 0.0327 -0.106 0.0495 0.0 0.0 0.0903

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -926784 7.74e-07 2.89e-07 3.88e-08 2.54e-07 8.83e-08 1.19e-07 5.9e-07 5.49e-08 1.86e-07 4.94e-08 1.61e-07 8.55e-08 6.77e-07 8e-08 5.44e-08 8.08e-08 3.88e-08 1.21e-07 5.75e-08 4.45e-08 1.22e-07 2.06e-07 2.04e-07 4.13e-08 1.98e-07 1.14e-07 1.17e-07 9.57e-08 1.6e-07 1.17e-07 1.14e-07 3.59e-08 2.74e-08 9.08e-08 5.65e-08 3.93e-08 5.7e-08 9.2e-08 6.54e-08 3.8e-08 5.13e-08 5.09e-07 5.27e-08 7.35e-09 7.79e-08 1.83e-08 1.22e-07 4.82e-09 4.61e-08
ENSG00000280088 \N 963861 7.23e-07 2.5e-07 3.71e-08 2.43e-07 8.92e-08 1.08e-07 5.65e-07 5.49e-08 1.75e-07 4.94e-08 1.62e-07 8.59e-08 6e-07 8.13e-08 5.14e-08 7.89e-08 3.88e-08 1.21e-07 5.75e-08 4.07e-08 1.22e-07 1.9e-07 1.89e-07 4.26e-08 1.72e-07 1.14e-07 1.12e-07 9.36e-08 1.54e-07 1.05e-07 1.09e-07 3.59e-08 2.74e-08 9.81e-08 4.41e-08 3.97e-08 5.45e-08 8.91e-08 6.56e-08 3.71e-08 4.36e-08 4.42e-07 5.08e-08 7.26e-09 7.91e-08 1.99e-08 1.24e-07 4.82e-09 4.61e-08