logo

Genes within 1Mb (chr12:100994493:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 5.07e-02 0.238 0.121 0.09 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 5.90e-01 0.0558 0.103 0.09 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0032 0.0642 0.09 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 6.24e-01 0.0456 0.0929 0.09 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 4.49e-01 -0.08 0.106 0.09 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 5.47e-02 0.174 0.09 0.09 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 9.51e-01 0.00635 0.103 0.09 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.65e-01 -0.114 0.0821 0.09 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 2.37e-01 -0.155 0.131 0.09 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0396 0.0928 0.09 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0439 0.0864 0.09 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00908 0.129 0.09 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 6.40e-01 0.0419 0.0895 0.09 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 1.64e-01 0.138 0.0986 0.09 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 2.98e-01 -0.101 0.0966 0.09 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 9.58e-01 0.00392 0.0739 0.09 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0431 0.103 0.09 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 2.13e-01 -0.127 0.101 0.09 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 3.59e-01 -0.118 0.128 0.09 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.92e-01 0.0722 0.0842 0.09 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 4.60e-01 0.0787 0.106 0.09 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0351 0.117 0.09 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 1.44e-01 -0.139 0.0948 0.09 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.53e-01 -0.171 0.119 0.09 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 1.83e-01 -0.179 0.134 0.092 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 9.59e-01 0.00671 0.129 0.092 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0642 0.122 0.092 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0216 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 5.26e-01 0.0916 0.144 0.092 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 8.97e-01 0.0193 0.149 0.092 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 2.50e-01 0.165 0.143 0.092 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 7.73e-01 0.0307 0.106 0.092 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 3.94e-01 0.114 0.133 0.092 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 5.55e-01 0.0708 0.12 0.09 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 9.12e-01 0.0109 0.0985 0.09 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 2.59e-01 -0.108 0.0954 0.09 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 1.55e-01 0.17 0.119 0.09 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 6.66e-01 0.0577 0.134 0.09 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 6.81e-01 0.0506 0.123 0.09 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 1.78e-01 0.138 0.102 0.09 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 6.13e-02 -0.165 0.0876 0.09 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 4.76e-01 0.0685 0.0959 0.09 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 3.11e-01 -0.11 0.108 0.09 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 7.23e-03 -0.239 0.088 0.09 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 8.63e-01 0.0193 0.112 0.09 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 2.94e-01 0.0848 0.0807 0.09 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 4.17e-02 -0.264 0.129 0.09 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 2.43e-02 0.268 0.118 0.09 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0246 0.0921 0.09 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 2.85e-01 0.137 0.128 0.09 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 5.56e-01 0.0779 0.132 0.09 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 5.02e-01 0.0841 0.125 0.09 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.02e-01 0.0159 0.129 0.09 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 5.45e-01 0.0562 0.0928 0.09 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 5.19e-01 0.0936 0.145 0.09 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0777 0.106 0.09 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 6.29e-01 0.0559 0.115 0.09 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0151 0.113 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 1.43e-01 0.243 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0601 0.178 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 2.83e-01 -0.124 0.115 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.39e-01 0.157 0.164 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 6.77e-02 -0.289 0.157 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 6.29e-02 0.304 0.162 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0813 0.167 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.85e-02 -0.367 0.154 0.082 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 2.49e-01 -0.149 0.128 0.082 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 4.66e-02 0.281 0.14 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 5.72e-01 0.0855 0.151 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 5.68e-01 -0.047 0.0821 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 7.33e-01 0.0416 0.122 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 9.57e-01 0.00727 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 3.15e-01 0.153 0.152 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0696 0.124 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.28e-01 -0.205 0.134 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 1.32e-01 -0.213 0.141 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 1.68e-01 0.206 0.148 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0834 0.144 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0743 0.0957 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.25e-01 -0.129 0.131 0.088 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0428 0.144 0.088 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0072 0.143 0.088 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0313 0.13 0.088 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0911 0.134 0.088 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0513 0.138 0.088 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 2.34e-01 0.156 0.131 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 1.26e-01 -0.192 0.125 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0176 0.0722 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 2.27e-01 0.123 0.102 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 4.89e-01 -0.084 0.121 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 6.27e-01 0.0659 0.135 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 5.54e-01 0.0703 0.119 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 6.99e-01 -0.043 0.111 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 9.16e-01 0.0159 0.151 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 8.69e-01 0.0248 0.151 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 8.26e-02 0.25 0.143 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 5.23e-01 0.0481 0.0752 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0112 0.117 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0833 0.135 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 3.82e-01 0.13 0.148 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0163 0.141 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 6.72e-01 0.0542 0.128 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 1.18e-01 -0.211 0.134 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 5.00e-01 -0.102 0.151 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 8.33e-01 0.0315 0.149 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 2.74e-01 -0.165 0.15 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 4.70e-01 0.0951 0.132 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 6.07e-01 0.0745 0.145 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0878 0.153 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 2.09e-01 -0.185 0.147 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 7.40e-01 0.0354 0.106 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 1.00e+00 -3.73e-05 0.1 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000547 0.127 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 5.89e-01 0.0531 0.0981 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 9.26e-01 0.00991 0.107 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 1.80e-01 -0.155 0.115 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 9.06e-01 0.0105 0.0891 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00917 0.114 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0251 0.12 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 3.95e-01 -0.113 0.133 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 6.62e-01 0.0452 0.103 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 7.82e-01 0.0359 0.129 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 4.66e-01 0.0883 0.121 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 3.18e-01 0.101 0.101 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 1.54e-01 -0.189 0.132 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 7.30e-02 -0.235 0.131 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 8.43e-01 0.0263 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0583 0.128 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 4.02e-01 0.116 0.138 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0574 0.13 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 7.48e-01 -0.043 0.134 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 7.46e-01 0.0388 0.12 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0906 0.123 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0445 0.131 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 8.99e-01 0.0133 0.105 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 2.35e-01 -0.168 0.141 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 7.03e-01 0.0535 0.14 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 1.44e-01 -0.177 0.12 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00152 0.148 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0532 0.119 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0194 0.128 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0188 0.133 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 9.85e-01 0.00228 0.119 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 2.95e-01 0.133 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0555 0.138 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0718 0.113 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 5.37e-02 -0.27 0.139 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 9.15e-01 -0.015 0.14 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0745 0.149 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 1.88e-01 -0.172 0.13 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 2.95e-02 0.293 0.133 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 5.04e-01 0.0984 0.147 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 2.38e-01 -0.171 0.144 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 3.12e-01 0.15 0.148 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.69e-01 -0.194 0.141 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0247 0.139 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 6.89e-01 0.0598 0.149 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 3.16e-01 -0.134 0.133 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 5.79e-01 0.0792 0.143 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 1.80e-01 0.205 0.152 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 4.91e-01 0.101 0.146 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 1.32e-01 0.229 0.151 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 9.23e-01 0.0137 0.141 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 8.83e-01 0.0211 0.143 0.091 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0373 0.132 0.091 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.83e-01 0.0028 0.135 0.091 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.22e-01 0.118 0.119 0.091 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 7.24e-01 0.0507 0.143 0.091 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 1.89e-01 -0.192 0.146 0.091 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 5.77e-01 0.0693 0.124 0.091 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0933 0.138 0.091 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0452 0.141 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 1.19e-01 -0.21 0.134 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 3.17e-01 0.11 0.109 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.69e-01 0.114 0.126 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 1.35e-01 0.22 0.147 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 1.33e-01 0.217 0.143 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 4.38e-02 0.272 0.134 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.64e-01 -0.191 0.137 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 3.51e-01 -0.119 0.127 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 1.33e-02 -0.268 0.107 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 4.00e-01 -0.109 0.13 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 2.28e-01 0.118 0.0977 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 1.23e-01 -0.21 0.135 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 6.74e-02 0.24 0.131 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 6.52e-01 -0.052 0.115 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 2.77e-01 0.149 0.137 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 7.69e-01 -0.044 0.15 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 2.03e-01 -0.192 0.15 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.05e-01 0.0173 0.145 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0992 0.117 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0219 0.153 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 5.55e-01 0.0923 0.156 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 4.99e-01 -0.104 0.154 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 4.53e-01 -0.112 0.149 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0269 0.127 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0846 0.118 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 8.52e-01 0.0233 0.125 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 2.54e-01 0.108 0.0943 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 1.23e-01 -0.203 0.131 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 3.54e-01 0.123 0.132 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 2.01e-01 -0.142 0.111 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 2.66e-01 0.151 0.136 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 1.15e-01 0.289 0.182 0.089 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0843 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 1.34e-01 -0.164 0.108 0.089 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 1.36e-01 -0.234 0.156 0.089 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 3.42e-01 0.172 0.18 0.089 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00283 0.111 0.089 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0225 0.189 0.089 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 5.94e-01 0.0694 0.13 0.089 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 5.24e-01 0.0962 0.151 0.089 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0136 0.146 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 4.18e-01 0.118 0.145 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.30e-01 0.0117 0.133 0.091 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0861 0.0985 0.091 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0269 0.141 0.091 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 9.87e-01 0.00179 0.107 0.091 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 4.23e-01 0.114 0.142 0.091 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 7.56e-01 0.0309 0.0993 0.091 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 2.25e-01 -0.165 0.136 0.09 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 2.74e-01 -0.153 0.139 0.09 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.17e-01 0.0153 0.146 0.09 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 7.78e-02 0.225 0.127 0.09 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 1.75e-03 0.431 0.136 0.09 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 1.03e-01 -0.234 0.143 0.09 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0205 0.132 0.09 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 2.03e-01 -0.174 0.137 0.095 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 7.26e-01 0.0506 0.144 0.095 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 7.20e-01 0.0449 0.125 0.095 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 1.45e-01 -0.235 0.161 0.095 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 1.87e-01 0.193 0.146 0.095 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 9.69e-02 -0.251 0.151 0.095 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 1.35e-01 0.205 0.137 0.095 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 6.56e-01 0.0495 0.111 0.095 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 6.18e-01 0.0677 0.136 0.095 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 9.39e-01 0.0094 0.122 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 6.58e-01 0.0434 0.098 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0357 0.0963 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 4.95e-01 0.0872 0.128 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 2.58e-01 0.163 0.143 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 2.02e-01 -0.164 0.128 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 2.29e-01 0.143 0.119 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.32e-02 -0.233 0.0933 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0618 0.103 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 3.79e-01 0.121 0.137 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00788 0.129 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0383 0.107 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 5.18e-01 0.084 0.13 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 2.84e-01 -0.163 0.152 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 8.29e-02 0.247 0.142 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 6.90e-01 0.052 0.13 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.60e-01 -0.145 0.102 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 5.34e-01 0.0802 0.129 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 9.04e-01 0.0203 0.168 0.097 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 5.45e-01 0.102 0.169 0.097 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 4.02e-01 0.135 0.16 0.097 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 6.36e-01 0.0572 0.121 0.097 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 3.42e-01 0.152 0.159 0.097 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 3.64e-01 -0.152 0.167 0.097 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 4.60e-01 -0.126 0.17 0.097 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 4.76e-01 -0.113 0.158 0.097 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 3.06e-01 -0.147 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0764 0.146 0.093 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 3.35e-01 -0.122 0.126 0.093 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 4.81e-01 0.105 0.149 0.093 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 5.37e-01 0.0862 0.139 0.093 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 1.98e-01 -0.185 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 4.94e-02 0.286 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 5.49e-01 -0.073 0.122 0.093 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 2.51e-01 0.155 0.134 0.093 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 4.23e-01 0.112 0.139 0.093 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 3.12e-01 0.139 0.138 0.093 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 4.32e-01 -0.102 0.13 0.093 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 5.10e-02 0.302 0.154 0.093 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 3.51e-01 0.127 0.136 0.093 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 7.27e-01 0.0457 0.131 0.093 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 7.20e-01 0.0512 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 3.80e-02 -0.242 0.116 0.093 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 2.06e-01 0.154 0.121 0.093 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 9.80e-01 0.00391 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 1.00e+00 4.37e-05 0.149 0.096 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0128 0.147 0.096 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 1.35e-01 0.232 0.154 0.096 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 6.21e-01 0.0766 0.155 0.096 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 5.15e-01 -0.106 0.163 0.096 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 7.99e-01 0.0413 0.162 0.096 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0169 0.11 0.096 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 7.38e-01 -0.044 0.131 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 5.68e-03 0.381 0.136 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 6.39e-01 0.065 0.138 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0806 0.0737 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00129 0.116 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0322 0.12 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 1.98e-01 0.174 0.135 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0276 0.108 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 4.37e-02 -0.243 0.12 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 1.63e-01 -0.194 0.139 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 2.88e-01 0.138 0.13 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0682 0.118 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000825 0.0655 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 4.32e-01 0.0738 0.0937 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 2.07e-01 -0.145 0.114 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 5.64e-01 0.0757 0.131 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00531 0.117 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0539 0.103 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -744979 sc-eQTL 6.72e-01 -0.063 0.148 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 5.44e-01 0.0723 0.119 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 8.21e-01 0.0214 0.0944 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0593 0.0954 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.50e-01 0.115 0.123 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 6.38e-01 0.0684 0.145 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 9.79e-01 0.0033 0.124 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 3.71e-01 0.095 0.106 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 2.34e-02 -0.2 0.0876 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0542 0.102 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0535 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 5.55e-01 0.0777 0.132 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0574 0.119 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 2.67e-02 0.317 0.142 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 3.14e-01 0.139 0.138 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0441 0.137 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 1.57e-01 0.184 0.13 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 4.09e-01 -0.085 0.103 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 420810 sc-eQTL 1.33e-01 0.188 0.125 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 795371 sc-eQTL 3.46e-01 -0.106 0.112 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 851619 sc-eQTL 3.41e-02 -0.199 0.0931 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -702454 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00942 0.124 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -836466 sc-eQTL 3.38e-01 0.0813 0.0846 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -285612 sc-eQTL 2.25e-02 -0.295 0.128 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -413279 sc-eQTL 4.89e-02 0.237 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 727353 sc-eQTL 2.21e-01 -0.117 0.0949 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -883087 sc-eQTL 1.15e-01 0.207 0.131 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000280088 AC126474.2 960419 eQTL 0.0465 0.0551 0.0276 0.0013 0.0 0.0623

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000280088 AC126474.2 960419 2.95e-07 1.33e-07 6.15e-08 2.01e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.9e-07 5.82e-08 1.66e-07 8.53e-08 1.63e-07 1.22e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.94e-08 8.08e-08 4.31e-08 1.72e-07 7.09e-08 5.07e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.62e-07 3.07e-08 1.72e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.34e-07 1.07e-07 1.09e-07 3.39e-08 3.68e-08 9.78e-08 3.52e-08 2.74e-08 5.42e-08 8.76e-08 6.42e-08 3.99e-08 5.28e-08 1.48e-07 5.12e-08 1.2e-08 3.41e-08 1.8e-08 9.29e-08 1.89e-09 4.82e-08