logo

Genes within 1Mb (chr12:100993415:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 4.52e-02 0.255 0.126 0.085 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 7.29e-01 0.0375 0.108 0.085 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.31e-01 0.042 0.067 0.085 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 4.02e-01 0.0813 0.0969 0.085 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 4.69e-01 -0.08 0.11 0.085 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 8.24e-02 0.164 0.0942 0.085 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0169 0.108 0.085 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0777 0.086 0.085 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 3.15e-01 -0.138 0.137 0.085 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0471 0.0965 0.085 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0492 0.0899 0.085 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 7.06e-01 0.0508 0.134 0.085 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 5.86e-01 0.0508 0.0931 0.085 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 1.96e-01 0.133 0.103 0.085 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0674 0.101 0.085 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.61e-01 0.0234 0.0768 0.085 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0647 0.107 0.085 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 1.68e-01 -0.146 0.105 0.085 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0771 0.134 0.085 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 4.17e-01 0.0713 0.0877 0.085 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 5.65e-01 0.0638 0.111 0.085 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0235 0.122 0.085 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.79e-02 -0.174 0.0984 0.085 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 1.85e-01 -0.165 0.124 0.085 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 7.93e-02 -0.245 0.139 0.088 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 9.15e-01 0.0145 0.135 0.088 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0319 0.128 0.088 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0512 0.141 0.088 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 6.84e-01 0.0614 0.151 0.088 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 8.30e-01 0.0336 0.156 0.088 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 1.62e-01 0.209 0.149 0.088 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 6.53e-01 0.0499 0.111 0.088 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 4.96e-01 0.0948 0.139 0.088 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 6.02e-01 0.0652 0.125 0.085 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 7.63e-01 -0.031 0.103 0.085 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0683 0.0996 0.085 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 1.60e-01 0.175 0.124 0.085 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 6.98e-01 0.0541 0.139 0.085 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 7.84e-01 0.0352 0.128 0.085 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 1.25e-01 0.164 0.106 0.085 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 3.89e-02 -0.189 0.0911 0.085 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 4.91e-01 0.0689 0.1 0.085 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0972 0.113 0.086 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 1.43e-02 -0.227 0.0919 0.086 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.60e-01 0.0512 0.116 0.086 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 3.77e-01 0.0745 0.0841 0.086 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 5.78e-02 -0.256 0.134 0.086 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 4.13e-02 0.253 0.123 0.086 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0394 0.0959 0.086 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 3.11e-01 0.135 0.133 0.086 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 7.10e-01 0.0512 0.137 0.085 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 3.98e-01 0.11 0.13 0.085 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.44e-01 0.062 0.134 0.085 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 6.72e-01 0.041 0.0966 0.085 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 6.66e-01 0.0652 0.151 0.085 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0472 0.11 0.085 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.99e-01 0.0632 0.12 0.085 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0074 0.117 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 7.99e-02 0.304 0.173 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0524 0.186 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0868 0.121 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 3.05e-01 0.176 0.171 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 1.20e-01 -0.258 0.165 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 7.06e-02 0.31 0.17 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0887 0.175 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 2.08e-02 -0.378 0.162 0.079 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 2.95e-01 -0.141 0.135 0.079 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 4.18e-02 0.3 0.146 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 5.75e-01 0.0884 0.157 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0296 0.0857 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 6.94e-01 0.0499 0.127 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0372 0.141 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 2.50e-01 0.182 0.158 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0793 0.129 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 1.50e-01 -0.202 0.14 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 2.51e-01 -0.169 0.147 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 2.22e-01 0.19 0.155 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0684 0.15 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0447 0.0998 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 2.74e-01 -0.15 0.136 0.084 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0661 0.15 0.084 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 8.02e-01 0.0375 0.149 0.084 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0401 0.136 0.084 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0903 0.14 0.084 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0327 0.144 0.084 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 2.98e-01 0.142 0.136 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 9.55e-02 -0.218 0.13 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.95e-01 0.0295 0.0752 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 1.81e-01 0.142 0.106 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0917 0.126 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 6.56e-01 0.0628 0.141 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.49e-01 0.0742 0.124 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00703 0.116 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 8.27e-01 0.0344 0.157 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 7.28e-01 0.0546 0.157 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 1.07e-01 0.242 0.15 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 2.48e-01 0.0908 0.0783 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 8.81e-01 0.0182 0.122 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0404 0.141 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 5.98e-01 0.0819 0.155 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0928 0.147 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 4.90e-01 0.0924 0.134 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 7.97e-02 -0.246 0.14 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 3.66e-01 -0.142 0.157 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 9.66e-01 0.00663 0.156 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0947 0.157 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 3.25e-01 0.135 0.137 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 5.68e-01 0.0862 0.151 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0177 0.16 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 2.33e-01 -0.183 0.153 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 5.94e-01 0.0591 0.111 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0217 0.104 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.91e-01 0.0527 0.132 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 4.23e-01 0.0818 0.102 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0199 0.111 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 2.84e-01 -0.129 0.12 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 6.74e-01 0.039 0.0926 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0331 0.118 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 8.41e-01 -0.025 0.125 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0666 0.139 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 5.63e-01 0.0622 0.107 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 6.50e-01 0.0611 0.134 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 3.48e-01 0.118 0.126 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 3.61e-01 0.0965 0.105 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 8.32e-02 -0.239 0.137 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 1.13e-01 -0.217 0.136 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.38e-01 0.0849 0.138 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0827 0.133 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 4.14e-01 0.118 0.143 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 6.22e-01 -0.067 0.136 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0496 0.139 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00775 0.125 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 2.79e-01 -0.139 0.128 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0241 0.137 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 7.92e-01 0.0289 0.109 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 3.25e-01 -0.145 0.147 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 8.62e-01 0.0255 0.146 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 1.38e-01 -0.187 0.126 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00113 0.155 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0463 0.124 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00549 0.133 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 7.98e-01 0.0354 0.138 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0157 0.124 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 4.20e-01 0.107 0.132 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0425 0.143 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0788 0.118 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 3.84e-02 -0.301 0.144 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0311 0.146 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0308 0.156 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 3.23e-01 -0.135 0.136 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 1.47e-02 0.342 0.139 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 6.85e-01 0.0624 0.154 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 2.73e-01 -0.165 0.151 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.19e-01 0.0998 0.154 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 1.58e-01 -0.208 0.147 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0509 0.145 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 8.57e-01 0.028 0.155 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.13e-01 -0.091 0.139 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 6.13e-01 0.0753 0.149 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 1.25e-01 0.244 0.159 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 4.79e-01 0.108 0.152 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 1.41e-01 0.233 0.158 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 9.17e-01 0.0153 0.147 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 8.47e-01 0.0288 0.149 0.087 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 7.77e-01 -0.039 0.138 0.087 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.47e-01 0.0642 0.14 0.087 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 4.49e-01 0.0942 0.124 0.087 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 9.09e-01 0.0171 0.149 0.087 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 2.42e-01 -0.178 0.152 0.087 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.82e-01 0.0711 0.129 0.087 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0752 0.143 0.087 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 4.91e-01 -0.101 0.146 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 1.80e-01 -0.188 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 2.68e-01 0.126 0.114 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 3.73e-01 0.117 0.131 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 1.05e-01 0.248 0.153 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 1.90e-01 0.197 0.149 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 4.74e-02 0.279 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 1.15e-01 -0.225 0.142 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0802 0.133 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 3.17e-02 -0.243 0.112 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0651 0.135 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 2.94e-01 0.107 0.102 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 1.64e-01 -0.197 0.141 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 1.15e-01 0.216 0.136 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0717 0.12 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 2.42e-01 0.167 0.142 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0387 0.156 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 2.52e-01 -0.18 0.157 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 9.86e-01 0.00271 0.152 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 3.74e-01 -0.108 0.122 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 8.54e-01 0.0295 0.159 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 4.94e-01 0.112 0.163 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0599 0.161 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0923 0.155 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 8.73e-01 -0.021 0.132 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0997 0.122 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.33e-01 0.062 0.13 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 3.33e-01 0.0954 0.0982 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 1.11e-01 -0.219 0.136 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 2.57e-01 0.156 0.138 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 1.22e-01 -0.178 0.115 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 3.75e-01 0.126 0.141 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 1.26e-01 0.297 0.193 0.085 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0617 0.188 0.085 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 1.25e-01 -0.177 0.114 0.085 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 1.85e-01 -0.22 0.165 0.085 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 4.30e-01 0.151 0.191 0.085 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0262 0.117 0.085 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.49e-01 -0.064 0.2 0.085 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 7.42e-01 0.0454 0.137 0.085 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 8.20e-01 0.0364 0.16 0.085 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0996 0.152 0.087 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 3.48e-01 0.142 0.151 0.087 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 7.31e-01 0.0479 0.139 0.087 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 2.75e-01 -0.112 0.103 0.087 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0506 0.147 0.087 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0219 0.111 0.087 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 3.82e-01 0.13 0.148 0.087 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 9.28e-01 0.00937 0.103 0.087 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 2.47e-01 -0.164 0.141 0.085 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 1.42e-01 -0.213 0.144 0.085 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.28e-01 0.0963 0.152 0.085 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 7.09e-02 0.24 0.132 0.085 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 1.91e-03 0.445 0.142 0.085 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 9.59e-02 -0.249 0.149 0.085 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0252 0.137 0.085 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 8.19e-02 -0.248 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 7.57e-01 0.0466 0.15 0.09 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.21e-01 0.0646 0.131 0.09 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 9.23e-02 -0.283 0.167 0.09 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 1.42e-01 0.224 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 7.76e-02 -0.279 0.157 0.09 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 9.58e-02 0.238 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 5.54e-01 0.0687 0.116 0.09 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 7.26e-01 0.0496 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0101 0.127 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0186 0.102 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 9.21e-01 0.00997 0.1 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 5.62e-01 0.0772 0.133 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 3.17e-01 0.15 0.149 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 2.17e-01 -0.165 0.134 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 1.85e-01 0.164 0.123 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 8.13e-03 -0.259 0.0969 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0596 0.108 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 2.36e-01 0.169 0.142 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00481 0.134 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00793 0.111 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 3.60e-01 0.124 0.135 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 3.49e-01 -0.148 0.158 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 1.60e-01 0.209 0.148 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.53e-01 0.0427 0.136 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 1.41e-01 -0.157 0.107 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 8.22e-01 0.0303 0.134 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0309 0.176 0.091 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 3.88e-01 0.153 0.177 0.091 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.18e-01 0.109 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 6.38e-01 0.0597 0.127 0.091 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 2.32e-01 0.2 0.167 0.091 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0963 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.28e-01 -0.113 0.179 0.091 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 3.86e-01 -0.144 0.166 0.091 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 2.48e-01 -0.173 0.149 0.089 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0125 0.153 0.089 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0942 0.132 0.089 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 5.86e-01 0.0846 0.155 0.089 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 7.22e-01 0.0517 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 1.90e-01 -0.197 0.15 0.089 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 4.57e-02 0.303 0.151 0.089 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 5.29e-01 -0.08 0.127 0.089 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 2.33e-01 0.167 0.14 0.089 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 5.17e-01 0.0941 0.145 0.088 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 3.25e-01 0.142 0.144 0.088 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0699 0.135 0.088 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 4.95e-02 0.318 0.161 0.088 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 2.62e-01 0.159 0.141 0.088 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 8.37e-01 0.0281 0.136 0.088 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 5.81e-01 0.0824 0.149 0.088 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 2.49e-02 -0.273 0.121 0.088 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 2.05e-01 0.161 0.126 0.088 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0144 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 9.27e-01 0.0145 0.157 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 7.95e-01 0.0402 0.155 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 1.96e-01 0.212 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 8.21e-01 0.0369 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0665 0.172 0.09 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 8.35e-01 0.0357 0.171 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 9.55e-01 0.0065 0.116 0.09 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0858 0.138 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 4.15e-03 0.411 0.142 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 5.85e-01 0.0788 0.144 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0511 0.077 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 9.63e-01 0.00558 0.121 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0609 0.125 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 1.04e-01 0.229 0.14 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0347 0.113 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 6.48e-02 -0.232 0.125 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 2.97e-01 -0.151 0.145 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 2.64e-01 0.152 0.136 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0993 0.123 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 5.40e-01 0.0419 0.0683 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 2.58e-01 0.111 0.0977 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 3.14e-01 -0.121 0.12 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 7.78e-01 0.0386 0.137 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0441 0.122 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00686 0.107 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -746057 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0551 0.155 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 4.81e-01 0.0874 0.124 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0353 0.0983 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0183 0.0995 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 3.37e-01 0.123 0.128 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 6.43e-01 0.0703 0.151 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0146 0.129 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 3.34e-01 0.107 0.11 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 1.37e-02 -0.226 0.0911 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0665 0.106 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0908 0.146 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 4.30e-01 0.108 0.137 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0142 0.124 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 2.89e-02 0.326 0.148 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 3.03e-01 0.148 0.144 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0599 0.143 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 1.08e-01 0.218 0.135 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0908 0.107 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 419732 sc-eQTL 1.23e-01 0.202 0.13 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 794293 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0826 0.117 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 850541 sc-eQTL 5.11e-02 -0.191 0.0973 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -703532 sc-eQTL 8.30e-01 0.0277 0.129 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -837544 sc-eQTL 4.51e-01 0.0668 0.0883 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -286690 sc-eQTL 3.42e-02 -0.286 0.134 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -414357 sc-eQTL 7.04e-02 0.227 0.125 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 726275 sc-eQTL 1.80e-01 -0.133 0.099 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -884165 sc-eQTL 1.27e-01 0.209 0.136 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000280088 AC126474.2 959341 eQTL 0.0465 0.0551 0.0276 0.0013 0.0 0.0623

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000280088 AC126474.2 959341 2.67e-07 1.3e-07 5.14e-08 1.82e-07 9.24e-08 9.76e-08 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9.19e-08 1.52e-07 6.76e-08 5.91e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.31e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.03e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.12e-07 1.07e-07 9.7e-08 3.68e-08 3.61e-08 8e-08 7.02e-08 3.49e-08 4.95e-08 8.93e-08 6.37e-08 3.8e-08 5.43e-08 1.35e-07 5.2e-08 1.86e-08 4.67e-08 1.84e-08 1.19e-07 3.79e-09 4.88e-08