Genes within 1Mb (chr12:100985200:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000663 0.0933 0.197 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0411 0.0791 0.197 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0424 0.049 0.197 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0132 0.071 0.197 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 1.15e-02 0.203 0.0795 0.197 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0144 0.0694 0.197 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 5.55e-01 0.0466 0.0788 0.197 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 8.54e-01 0.0116 0.063 0.197 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0679 0.1 0.197 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00929 0.0718 0.197 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 8.69e-01 0.011 0.0669 0.197 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 1.58e-02 -0.24 0.0985 0.197 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 6.69e-03 0.186 0.0681 0.197 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0923 0.0763 0.197 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0214 0.0749 0.197 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 7.48e-01 0.0184 0.0571 0.197 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 6.56e-01 -0.036 0.0809 0.197 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 9.34e-01 0.00667 0.0801 0.197 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 6.06e-02 -0.189 0.1 0.197 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 8.39e-01 0.0135 0.0664 0.197 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 9.15e-02 -0.141 0.0833 0.197 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0569 0.0925 0.197 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0228 0.075 0.197 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 6.12e-01 0.0478 0.0941 0.197 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 1.37e-01 -0.155 0.104 0.196 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 9.50e-01 0.00631 0.101 0.196 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 4.68e-01 -0.069 0.095 0.196 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0403 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 9.03e-02 0.19 0.111 0.196 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0275 0.116 0.196 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 9.01e-02 0.189 0.111 0.196 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0185 0.0824 0.196 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0565 0.104 0.196 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 7.81e-01 0.0253 0.0909 0.197 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 7.65e-01 0.0224 0.0748 0.197 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0658 0.0725 0.197 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 2.87e-01 -0.097 0.0908 0.197 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0691 0.101 0.197 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 4.26e-02 -0.189 0.0926 0.197 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0424 0.0779 0.197 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 1.96e-01 0.0867 0.0668 0.197 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 6.26e-01 0.0356 0.0729 0.197 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0212 0.0849 0.195 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 3.59e-01 0.0643 0.0699 0.195 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 4.59e-02 -0.174 0.0865 0.195 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0559 0.0632 0.195 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 6.88e-01 0.0409 0.102 0.195 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0738 0.0935 0.195 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 1.20e-01 0.112 0.0717 0.195 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 7.32e-01 0.0345 0.1 0.195 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 1.40e-01 0.148 0.1 0.197 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 7.87e-01 0.0258 0.0955 0.197 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.43e-02 -0.188 0.0972 0.197 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0803 0.0705 0.197 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0464 0.11 0.197 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0234 0.0806 0.197 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.088 0.197 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 6.78e-01 0.0356 0.0858 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.73e-01 0.0193 0.121 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 4.29e-01 -0.102 0.129 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.61e-01 0.0488 0.0837 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 2.54e-01 0.136 0.119 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0451 0.115 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 4.40e-02 -0.238 0.118 0.207 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 9.18e-01 0.0126 0.121 0.207 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0634 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0106 0.0935 0.207 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 3.69e-01 -0.096 0.107 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 9.11e-01 0.0127 0.114 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0859 0.0616 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 1.80e-01 0.122 0.0911 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 9.09e-03 0.263 0.1 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 3.30e-01 0.112 0.114 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0235 0.0933 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00593 0.101 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 3.70e-01 0.0957 0.106 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00419 0.113 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 3.51e-01 0.102 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.76e-01 0.0407 0.0728 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 2.37e-01 -0.118 0.0994 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 3.00e-01 0.113 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0531 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 9.80e-01 0.00249 0.0992 0.198 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0349 0.102 0.198 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0878 0.105 0.198 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0719 0.102 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 4.21e-01 0.0788 0.0978 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 8.59e-01 0.01 0.0563 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0662 0.0795 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 4.29e-01 0.0749 0.0944 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 5.64e-01 0.0609 0.105 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0384 0.0925 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 8.36e-01 0.0179 0.0865 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 8.32e-02 -0.203 0.117 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0198 0.115 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0644 0.11 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0254 0.0573 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 6.52e-01 0.0401 0.0888 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 1.37e-02 0.252 0.102 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0777 0.113 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 2.47e-01 0.124 0.107 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 5.39e-01 0.06 0.0975 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 1.96e-01 0.133 0.102 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 6.94e-01 0.0444 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 2.38e-01 -0.132 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 6.05e-02 -0.211 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0527 0.0986 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 6.31e-01 0.0522 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0533 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 1.49e-02 0.267 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0994 0.0821 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0316 0.0777 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 1.25e-02 -0.244 0.097 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 3.38e-02 0.161 0.0751 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0257 0.0827 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0271 0.0896 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00453 0.069 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 3.13e-01 0.0894 0.0883 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 5.57e-01 0.0547 0.093 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 2.84e-02 -0.227 0.103 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 1.67e-01 0.111 0.08 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0319 0.101 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0212 0.0941 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 6.81e-01 0.0325 0.0789 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 1.97e-01 0.133 0.103 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 4.79e-01 0.0721 0.102 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 1.05e-02 -0.261 0.101 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 1.65e-01 0.137 0.0984 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 1.06e-01 -0.172 0.106 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 2.27e-01 -0.122 0.101 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 1.75e-01 -0.14 0.103 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00735 0.0934 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 8.25e-01 0.0212 0.0956 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 1.03e-01 -0.166 0.101 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0899 0.0812 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0999 0.11 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0748 0.109 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 2.51e-01 0.108 0.094 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 8.82e-01 0.0172 0.116 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 1.57e-01 -0.131 0.0921 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 4.68e-01 0.0721 0.0992 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 6.61e-03 -0.279 0.102 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 4.68e-01 0.0674 0.0927 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0838 0.0986 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0665 0.107 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0932 0.0881 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 9.63e-01 0.00511 0.109 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.71e-01 0.0174 0.107 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0628 0.114 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0572 0.0999 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 4.34e-01 0.0809 0.103 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 2.25e-01 -0.137 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 5.91e-01 0.0597 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 1.87e-02 -0.265 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 2.26e-01 0.131 0.108 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0169 0.108 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 7.71e-01 0.0337 0.115 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0122 0.103 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 1.25e-01 0.169 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 8.02e-01 0.0297 0.119 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 7.72e-01 0.0329 0.113 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00253 0.118 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00404 0.109 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 7.88e-01 0.0302 0.113 0.199 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 3.38e-02 0.22 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 1.33e-01 -0.16 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 2.03e-01 -0.12 0.0939 0.199 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0471 0.113 0.199 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0451 0.115 0.199 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 7.52e-01 -0.031 0.0978 0.199 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 4.08e-01 0.09 0.109 0.199 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 1.74e-01 -0.147 0.108 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0815 0.104 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.26e-02 -0.163 0.0835 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 4.42e-01 0.0749 0.0973 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 3.71e-01 -0.102 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 7.48e-02 -0.197 0.11 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 2.07e-01 0.132 0.104 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 9.55e-01 0.00597 0.106 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0676 0.0994 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 4.06e-01 0.0706 0.0849 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 9.14e-02 -0.17 0.101 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0356 0.0765 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 6.49e-01 0.0483 0.106 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0267 0.103 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 4.10e-01 0.0739 0.0896 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 5.51e-01 0.0639 0.107 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.97e-01 0.0143 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0791 0.112 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.68e-03 -0.296 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 1.88e-01 -0.114 0.0863 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0031 0.113 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0809 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 1.64e-01 0.159 0.114 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0738 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0194 0.0993 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 7.80e-01 0.0259 0.0924 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 1.04e-01 -0.159 0.097 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0828 0.0739 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00139 0.103 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 5.05e-01 0.0694 0.104 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 6.53e-01 0.0392 0.087 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0577 0.107 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 1.75e-01 -0.202 0.148 0.178 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 2.75e-01 -0.156 0.143 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.64e-01 -0.051 0.0882 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0752 0.127 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0894 0.146 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0864 0.0892 0.178 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 3.51e-01 0.142 0.152 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0317 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0529 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0304 0.113 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0196 0.113 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0579 0.103 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 6.75e-01 -0.032 0.0763 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 8.55e-01 -0.02 0.109 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0464 0.0824 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0524 0.11 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 2.62e-01 0.0861 0.0766 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 7.02e-01 0.04 0.105 0.197 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0415 0.107 0.197 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.69e-02 -0.213 0.111 0.197 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0541 0.0981 0.197 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 1.47e-01 -0.155 0.106 0.197 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 4.61e-01 0.0815 0.11 0.197 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 4.15e-01 0.0827 0.101 0.197 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 5.70e-02 -0.211 0.11 0.19 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 9.53e-01 0.00694 0.117 0.19 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 1.16e-01 -0.159 0.101 0.19 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0387 0.131 0.19 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 3.81e-01 0.104 0.119 0.19 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 6.29e-01 0.0596 0.123 0.19 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0147 0.112 0.19 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0675 0.09 0.19 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0736 0.11 0.19 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00712 0.0932 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 6.14e-01 0.0378 0.0748 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0724 0.0734 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 5.80e-01 -0.054 0.0975 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 7.75e-02 -0.193 0.109 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 8.57e-01 0.0178 0.0983 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 1.93e-01 -0.118 0.0905 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 1.81e-01 0.0966 0.072 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0231 0.0791 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 3.69e-01 0.093 0.103 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 6.68e-01 0.0418 0.0972 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0277 0.0805 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0641 0.0978 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 4.16e-01 0.0934 0.115 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 1.83e-03 -0.333 0.105 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0816 0.0982 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 4.20e-01 0.0627 0.0776 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 8.04e-02 0.17 0.0967 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 2.18e-01 0.158 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 5.54e-02 -0.246 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 3.37e-01 -0.118 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 1.61e-01 -0.129 0.0918 0.221 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0754 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 4.76e-01 0.0913 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0341 0.13 0.221 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0517 0.121 0.221 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 5.12e-01 0.0734 0.112 0.191 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 9.40e-01 0.00862 0.114 0.191 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0816 0.0983 0.191 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 6.70e-01 0.0493 0.116 0.191 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 6.05e-01 -0.056 0.108 0.191 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 1.53e-02 -0.27 0.11 0.191 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 8.08e-01 0.0276 0.113 0.191 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 6.18e-01 0.0472 0.0946 0.191 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 1.34e-01 0.157 0.104 0.191 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 2.15e-01 -0.13 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 5.07e-01 0.0689 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0584 0.0976 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 1.86e-01 0.155 0.116 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 1.59e-01 -0.144 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 6.51e-01 0.0446 0.0983 0.195 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 4.02e-01 0.09 0.107 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 1.91e-01 -0.115 0.0876 0.195 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 1.72e-01 -0.125 0.091 0.195 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0265 0.119 0.192 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0971 0.115 0.192 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 8.48e-01 0.0219 0.114 0.192 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 3.46e-01 -0.113 0.12 0.192 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 5.92e-01 0.0643 0.12 0.192 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 6.99e-01 0.0488 0.126 0.192 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 2.01e-01 0.16 0.125 0.192 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0115 0.085 0.192 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 9.11e-01 0.0113 0.101 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0515 0.106 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 5.84e-01 0.0579 0.106 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0521 0.0564 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 8.95e-01 0.0117 0.0888 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 2.68e-03 0.272 0.0896 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 6.12e-01 0.0525 0.103 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00837 0.0828 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000554 0.0925 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 8.41e-01 0.0215 0.107 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.52e-01 -0.019 0.102 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 6.78e-01 0.0385 0.0924 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0129 0.0512 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00856 0.0733 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 3.74e-02 0.186 0.0888 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0165 0.102 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 7.51e-01 0.029 0.0911 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 5.72e-01 0.0455 0.0803 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -754272 sc-eQTL 3.48e-01 -0.109 0.116 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 7.06e-01 0.0342 0.0906 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 4.43e-01 0.0552 0.0717 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0676 0.0725 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 8.53e-02 -0.161 0.0928 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0434 0.11 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 1.27e-01 -0.144 0.094 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0977 0.0805 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 1.41e-01 0.0993 0.0671 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 6.75e-01 0.0326 0.0775 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 8.38e-01 -0.022 0.107 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 5.37e-01 0.062 0.1 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 2.13e-01 -0.113 0.0903 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 3.93e-01 0.0938 0.11 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0818 0.105 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0953 0.105 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 4.78e-01 0.0704 0.0992 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0562 0.0784 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 411517 sc-eQTL 9.90e-01 0.00115 0.0957 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 786078 sc-eQTL 9.95e-01 0.000578 0.0879 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 842326 sc-eQTL 3.74e-01 0.0656 0.0736 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 sc-eQTL 3.82e-02 -0.2 0.0961 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -845759 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0712 0.0663 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -294905 sc-eQTL 5.26e-01 0.0647 0.102 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -422572 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0317 0.0946 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 718060 sc-eQTL 2.32e-01 0.0892 0.0744 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -892380 sc-eQTL 7.08e-01 0.0385 0.103 0.196 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -711747 eQTL 3.42e-02 -0.063 0.0297 0.0 0.0 0.222


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -939519 2.74e-07 1.25e-07 4.69e-08 1.84e-07 9.24e-08 9.8e-08 1.49e-07 5.37e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.57e-07 8.68e-08 1.41e-07 6.76e-08 6.04e-08 7.53e-08 3.87e-08 1.26e-07 5.75e-08 4.16e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.34e-07 3.49e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.7e-08 2.99e-08 3.16e-08 8.34e-08 8.38e-08 3.65e-08 5.11e-08 9.36e-08 6.54e-08 3.76e-08 4.36e-08 1.35e-07 5.27e-08 1.18e-08 3.84e-08 1.84e-08 1.21e-07 3.78e-09 4.88e-08