logo

Genes within 1Mb (chr12:100984206:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0219 0.13 0.079 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00566 0.11 0.079 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 2.09e-01 0.0857 0.068 0.079 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 5.10e-01 0.0652 0.0987 0.079 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0759 0.112 0.079 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.16e-01 0.119 0.0962 0.079 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0702 0.11 0.079 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0474 0.0876 0.079 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 3.43e-01 -0.132 0.139 0.079 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0259 0.0986 0.079 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 1.14e-01 -0.145 0.0913 0.079 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 4.99e-02 0.268 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 4.37e-01 0.0741 0.095 0.079 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 8.02e-01 0.0264 0.105 0.079 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.31e-01 0.123 0.103 0.079 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 2.82e-03 0.232 0.0768 0.079 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 4.22e-02 -0.223 0.109 0.079 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 2.07e-01 -0.137 0.108 0.079 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 6.14e-01 0.0695 0.137 0.079 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.01e-01 0.0228 0.0903 0.079 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 8.41e-01 0.0228 0.114 0.079 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 7.80e-01 0.0352 0.126 0.079 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0679 0.102 0.079 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0768 0.128 0.079 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 1.74e-03 -0.48 0.151 0.074 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 7.54e-02 -0.265 0.148 0.074 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.82e-01 0.124 0.141 0.074 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 2.24e-01 -0.189 0.155 0.074 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0529 0.167 0.074 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 7.15e-01 -0.063 0.172 0.074 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 7.99e-03 0.436 0.163 0.074 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 5.16e-02 0.238 0.121 0.074 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 8.16e-01 0.0358 0.154 0.074 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 8.80e-01 0.0195 0.129 0.079 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0676 0.106 0.079 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.103 0.079 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 6.80e-01 0.0533 0.129 0.079 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0775 0.144 0.079 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 1.94e-01 0.172 0.132 0.079 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 8.24e-01 0.0246 0.11 0.079 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 9.25e-01 0.00896 0.095 0.079 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 3.67e-01 0.0932 0.103 0.079 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0338 0.116 0.079 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 9.24e-03 -0.247 0.0941 0.079 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 5.67e-03 0.327 0.117 0.079 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.45e-01 0.0169 0.0864 0.079 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 9.44e-03 -0.358 0.137 0.079 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 1.89e-02 0.298 0.126 0.079 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 1.05e-02 -0.25 0.0968 0.079 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 6.67e-01 0.0589 0.137 0.079 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 4.54e-02 -0.277 0.138 0.079 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0585 0.132 0.079 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 1.48e-01 0.196 0.135 0.079 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.17e-01 0.0226 0.0978 0.079 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 2.03e-01 0.194 0.152 0.079 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.71e-01 0.123 0.111 0.079 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 2.33e-01 0.145 0.121 0.079 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 2.26e-01 0.144 0.118 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0189 0.187 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 4.00e-01 -0.168 0.199 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.80e-01 0.114 0.129 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 1.18e-01 -0.288 0.183 0.069 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 5.31e-01 -0.112 0.178 0.069 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00485 0.184 0.069 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0558 0.188 0.069 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 3.03e-02 -0.38 0.174 0.069 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 9.81e-01 0.00352 0.145 0.069 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 7.88e-01 0.0422 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 2.79e-02 -0.365 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0089 0.0908 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 2.54e-01 -0.153 0.134 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 8.08e-01 0.0363 0.149 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 7.33e-01 0.0573 0.168 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 3.50e-01 0.128 0.136 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 3.62e-02 -0.31 0.147 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 7.34e-01 0.0531 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0128 0.165 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 7.60e-01 0.0486 0.159 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 7.73e-01 0.0305 0.106 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0467 0.145 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0632 0.159 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 3.04e-01 -0.163 0.158 0.078 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 8.14e-01 0.0339 0.144 0.078 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 9.42e-01 0.0109 0.148 0.078 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 7.94e-01 0.0399 0.153 0.078 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 6.71e-01 0.0593 0.139 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 2.84e-01 0.143 0.133 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 2.14e-01 0.0953 0.0765 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 1.66e-01 0.15 0.108 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 8.87e-01 0.0183 0.129 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.71e-02 0.316 0.142 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 8.90e-01 0.0175 0.126 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 2.54e-01 0.134 0.118 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 3.67e-01 -0.145 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 4.75e-01 -0.112 0.156 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 4.79e-01 0.106 0.15 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 1.41e-01 0.115 0.0779 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 4.72e-01 0.0873 0.121 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 3.15e-01 0.141 0.14 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.61e-01 0.174 0.154 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 3.45e-01 -0.139 0.146 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 8.03e-01 0.0333 0.133 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 3.14e-01 -0.141 0.14 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00628 0.165 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 2.86e-01 -0.174 0.163 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.80e-01 0.144 0.164 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.26e-01 0.0316 0.144 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 3.01e-01 -0.164 0.158 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 1.64e-01 -0.233 0.167 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0603 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 6.01e-01 0.0592 0.113 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 1.86e-01 -0.141 0.106 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 4.43e-02 0.271 0.134 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.03e-01 0.026 0.104 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 8.43e-01 0.0225 0.113 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 5.05e-01 0.082 0.123 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 4.41e-03 0.267 0.0928 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0109 0.121 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 5.17e-01 0.0827 0.128 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 1.45e-01 0.207 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 2.81e-01 0.119 0.11 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0105 0.138 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.74e-02 0.283 0.128 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 4.55e-01 0.0809 0.108 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 1.77e-02 -0.342 0.143 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0673 0.143 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 5.05e-02 0.282 0.143 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0212 0.139 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 4.02e-01 -0.126 0.15 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 3.80e-02 0.294 0.141 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 7.25e-01 0.0513 0.146 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 1.09e-01 -0.202 0.126 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 9.04e-02 -0.219 0.129 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 4.60e-01 0.102 0.138 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 6.15e-01 0.0556 0.11 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 2.13e-01 -0.185 0.149 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.01e-01 0.189 0.147 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0615 0.128 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 9.00e-01 0.0197 0.156 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 1.16e-01 -0.203 0.129 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 6.43e-01 0.0643 0.139 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 5.20e-01 0.093 0.144 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 3.26e-01 0.128 0.129 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 2.48e-01 0.159 0.137 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0642 0.15 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0736 0.123 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 1.46e-01 -0.221 0.151 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 1.40e-01 -0.225 0.152 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 5.27e-02 -0.315 0.162 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 4.55e-01 0.107 0.142 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 6.94e-02 0.267 0.146 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0498 0.161 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0556 0.158 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0646 0.162 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 4.53e-02 -0.308 0.153 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 6.79e-01 0.0612 0.147 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 2.60e-01 -0.178 0.158 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 8.63e-01 0.0245 0.142 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 7.07e-01 0.057 0.152 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 1.57e-01 0.23 0.162 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 5.20e-01 0.1 0.155 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 8.77e-02 0.275 0.16 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0265 0.15 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0858 0.154 0.08 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 2.33e-01 -0.17 0.142 0.08 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 6.73e-01 0.0616 0.146 0.08 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.53e-01 0.0239 0.129 0.08 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 9.03e-01 0.0189 0.155 0.08 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.83e-01 -0.169 0.157 0.08 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 5.88e-01 0.0727 0.134 0.08 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 1.35e-01 -0.222 0.148 0.08 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 4.92e-01 -0.105 0.153 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 1.03e-01 -0.238 0.146 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 4.58e-02 0.236 0.118 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 7.93e-01 -0.036 0.137 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 3.48e-01 0.15 0.16 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 1.66e-02 0.373 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 4.12e-01 -0.121 0.147 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 6.57e-01 0.0662 0.149 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 3.34e-01 0.131 0.136 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 8.34e-03 -0.304 0.114 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.75e-02 0.286 0.137 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 3.14e-01 0.105 0.104 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 4.77e-02 -0.286 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 1.36e-01 0.209 0.14 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 3.91e-01 -0.105 0.122 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 5.19e-01 0.0941 0.146 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 4.79e-01 0.118 0.166 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 5.73e-01 0.0945 0.168 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.61e-01 0.148 0.161 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00742 0.13 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0584 0.17 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 3.83e-02 0.358 0.172 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 1.23e-01 -0.264 0.171 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0904 0.166 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 5.26e-01 -0.086 0.135 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 1.33e-02 -0.31 0.124 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 1.91e-01 0.174 0.133 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 7.59e-01 0.0311 0.101 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 1.39e-01 -0.209 0.14 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0324 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 2.49e-02 -0.265 0.117 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 7.25e-01 0.0512 0.145 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 7.62e-01 0.0589 0.194 0.081 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 4.08e-01 -0.155 0.186 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0394 0.115 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 3.38e-01 -0.159 0.165 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 7.62e-01 0.0578 0.19 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0205 0.117 0.081 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 3.56e-02 -0.415 0.195 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 1.07e-01 -0.22 0.135 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 4.29e-01 -0.126 0.159 0.081 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 3.70e-01 -0.138 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0178 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.31e-02 0.299 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 9.09e-01 0.0119 0.104 0.08 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 6.78e-02 0.271 0.148 0.08 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.35e-02 0.253 0.111 0.08 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 4.14e-01 0.123 0.15 0.08 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 2.70e-01 -0.116 0.105 0.08 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 5.74e-01 0.085 0.151 0.079 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 3.72e-01 -0.138 0.154 0.079 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 2.96e-02 0.351 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 2.18e-02 0.323 0.14 0.079 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 5.24e-01 0.0983 0.154 0.079 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 8.07e-01 0.039 0.159 0.079 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 6.74e-01 0.0615 0.146 0.079 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 1.28e-02 -0.387 0.154 0.073 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 2.43e-02 -0.368 0.162 0.073 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 7.07e-01 0.0538 0.143 0.073 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.94e-02 -0.312 0.183 0.073 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 1.56e-01 0.237 0.166 0.073 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 7.40e-02 -0.308 0.172 0.073 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 2.37e-01 0.186 0.156 0.073 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 3.06e-01 0.13 0.126 0.073 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 7.56e-01 0.0483 0.155 0.073 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 7.36e-01 0.0437 0.13 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0285 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 1.68e-01 0.141 0.102 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.67e-01 0.0228 0.136 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0159 0.153 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.89e-01 0.145 0.136 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 6.28e-01 0.0613 0.126 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 6.19e-01 0.0501 0.1 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 4.26e-01 0.0876 0.11 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00207 0.145 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 5.38e-01 0.0841 0.136 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.25e-01 0.111 0.113 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 3.22e-01 0.136 0.137 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 3.60e-01 -0.147 0.161 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 2.99e-01 0.157 0.151 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 2.40e-01 -0.162 0.138 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00138 0.109 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0803 0.137 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 1.37e-01 -0.288 0.193 0.073 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 1.51e-01 0.28 0.194 0.073 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.01e-02 0.4 0.182 0.073 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 5.71e-01 0.0793 0.14 0.073 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 1.71e-01 0.252 0.183 0.073 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0496 0.193 0.073 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 8.30e-01 0.0425 0.197 0.073 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 9.77e-02 0.303 0.182 0.073 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 6.29e-01 0.0733 0.151 0.082 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 4.98e-01 0.104 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 6.94e-01 0.0525 0.133 0.082 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0305 0.157 0.082 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 2.33e-01 -0.175 0.146 0.082 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 3.95e-01 0.129 0.151 0.082 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 6.35e-01 0.073 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0328 0.128 0.082 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 6.72e-03 0.382 0.139 0.082 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0138 0.148 0.077 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 4.00e-01 -0.124 0.147 0.077 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 1.26e-01 0.212 0.138 0.077 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 3.99e-01 -0.14 0.166 0.077 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 7.30e-01 0.05 0.145 0.077 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 1.13e-01 -0.22 0.138 0.077 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 4.37e-02 0.306 0.151 0.077 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0383 0.125 0.077 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0516 0.13 0.077 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 3.64e-01 -0.157 0.172 0.071 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 4.08e-01 0.138 0.166 0.071 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 2.52e-02 0.366 0.162 0.071 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.63e-01 0.0302 0.174 0.071 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 2.50e-01 -0.199 0.173 0.071 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 6.79e-01 0.0758 0.182 0.071 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 9.33e-02 0.304 0.18 0.071 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 1.59e-03 0.383 0.119 0.071 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0684 0.147 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0242 0.151 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 1.36e-01 -0.225 0.15 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 7.41e-01 0.0267 0.0805 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0493 0.127 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 2.20e-01 -0.16 0.13 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0751 0.147 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 4.88e-01 0.0819 0.118 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 1.68e-02 -0.314 0.13 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 8.96e-01 0.0198 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00578 0.139 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 3.65e-01 0.114 0.126 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 1.04e-01 0.113 0.0693 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 2.59e-01 0.113 0.0995 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 6.14e-01 0.0617 0.122 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 5.38e-02 0.268 0.138 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0846 0.124 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 7.08e-01 0.041 0.109 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -755266 sc-eQTL 3.07e-01 -0.161 0.158 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 6.76e-01 0.0532 0.127 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0212 0.101 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 2.63e-01 0.114 0.102 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 6.35e-01 0.0623 0.131 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0644 0.155 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 1.42e-01 0.194 0.132 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 6.40e-01 -0.053 0.113 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 8.31e-01 0.0202 0.0947 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 8.34e-01 0.0228 0.109 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 4.95e-01 -0.101 0.148 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 8.78e-01 0.0213 0.139 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 9.44e-02 0.209 0.125 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0235 0.152 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0859 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 8.94e-01 0.0193 0.145 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 7.29e-02 0.246 0.136 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 4.13e-01 0.0889 0.108 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 410523 sc-eQTL 2.13e-02 0.304 0.131 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 785084 sc-eQTL 7.79e-01 0.0337 0.12 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 841332 sc-eQTL 1.28e-02 -0.249 0.099 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -712741 sc-eQTL 3.22e-02 0.282 0.131 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -846753 sc-eQTL 5.71e-01 0.0513 0.0905 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -295899 sc-eQTL 1.05e-02 -0.353 0.137 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -423566 sc-eQTL 3.96e-02 0.264 0.128 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 717066 sc-eQTL 2.37e-02 -0.229 0.1 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -893374 sc-eQTL 7.81e-01 0.039 0.14 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120800 UTP20 -295899 eQTL 0.0408 0.0436 0.0213 0.00114 0.0 0.0721
ENSG00000196091 MYBPC1 -584147 pQTL 0.0359 -0.0683 0.0325 0.00124 0.0 0.0751

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120800 UTP20 -295899 1.39e-06 1.29e-06 2.86e-07 1.26e-06 5.1e-07 6.63e-07 1.37e-06 4.97e-07 1.72e-06 7.41e-07 1.98e-06 1.29e-06 2.73e-06 4.19e-07 3.88e-07 1.06e-06 1.07e-06 1.18e-06 5.54e-07 6.26e-07 6.35e-07 1.95e-06 1.42e-06 8.33e-07 2.43e-06 1.06e-06 1.04e-06 8.86e-07 1.67e-06 1.26e-06 8.65e-07 2.74e-07 3.76e-07 8.83e-07 5.91e-07 6.59e-07 7.83e-07 3.35e-07 4.82e-07 2.26e-07 3.2e-07 1.88e-06 3.37e-07 1.25e-07 3.6e-07 3.21e-07 4.22e-07 2.7e-07 2.31e-07
ENSG00000280088 \N 950132 3.07e-07 1.42e-07 6.55e-08 2.05e-07 9.82e-08 8.37e-08 2.1e-07 6.57e-08 1.75e-07 1.03e-07 1.66e-07 1.31e-07 1.95e-07 8e-08 5.43e-08 9.11e-08 4.25e-08 1.77e-07 7.36e-08 5.46e-08 1.26e-07 1.65e-07 1.64e-07 3.49e-08 1.85e-07 1.56e-07 1.22e-07 1.04e-07 1.32e-07 1.05e-07 1.09e-07 3.66e-08 3.38e-08 9.3e-08 3.4e-08 3.11e-08 3.91e-08 8.51e-08 6.28e-08 4.08e-08 5.42e-08 1.48e-07 4.76e-08 1.29e-08 3.41e-08 1.55e-08 8.67e-08 1.96e-09 4.98e-08