Genes within 1Mb (chr12:100955262:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 4.21e-01 -0.07 0.0867 0.286 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0307 0.0736 0.286 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0264 0.0457 0.286 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00666 0.0661 0.286 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 1.09e-01 0.12 0.0747 0.286 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0257 0.0646 0.286 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 6.00e-01 0.0385 0.0733 0.286 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 3.49e-01 0.0549 0.0585 0.286 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0463 0.0931 0.286 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 7.76e-01 0.0188 0.066 0.286 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0179 0.0615 0.286 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 8.42e-02 -0.158 0.0912 0.286 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 1.31e-01 0.0961 0.0634 0.286 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 8.03e-01 0.0176 0.0705 0.286 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 5.75e-01 0.0386 0.0688 0.286 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 8.91e-01 0.00722 0.0526 0.286 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 8.55e-01 0.0136 0.0739 0.286 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 5.66e-01 0.042 0.0731 0.286 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 1.87e-01 -0.122 0.0921 0.286 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 8.60e-01 0.0107 0.0607 0.286 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0177 0.0766 0.286 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 5.07e-02 -0.165 0.0838 0.286 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0218 0.0685 0.286 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0634 0.0859 0.286 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 2.80e-01 -0.104 0.0962 0.286 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 8.78e-01 0.0143 0.093 0.286 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 7.09e-01 0.0329 0.088 0.286 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 8.07e-01 0.0236 0.0968 0.286 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 8.11e-01 0.0248 0.104 0.286 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 3.17e-01 0.107 0.107 0.286 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 9.57e-02 0.171 0.102 0.286 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 5.57e-01 0.0449 0.0762 0.286 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 2.05e-01 -0.121 0.0955 0.286 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00499 0.0845 0.286 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 8.30e-01 0.015 0.0695 0.286 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 9.66e-01 0.0029 0.0675 0.286 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0239 0.0847 0.286 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 3.63e-01 0.0859 0.0943 0.286 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 2.40e-02 -0.195 0.0859 0.286 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 1.65e-01 0.101 0.0722 0.286 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 2.54e-01 0.0711 0.0621 0.286 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 8.16e-01 0.0158 0.0678 0.286 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 1.81e-01 0.105 0.0779 0.285 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 1.74e-01 0.0875 0.0642 0.285 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 8.10e-02 -0.14 0.0798 0.285 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0469 0.0582 0.285 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 3.66e-01 0.0848 0.0936 0.285 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0412 0.0862 0.285 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 8.83e-02 0.113 0.0659 0.285 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 3.46e-01 0.0871 0.0923 0.285 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0679 0.0931 0.286 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0605 0.0883 0.286 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 7.76e-02 -0.16 0.0901 0.286 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0344 0.0655 0.286 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 3.27e-01 0.1 0.102 0.286 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 4.62e-01 -0.055 0.0745 0.286 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0733 0.0813 0.286 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0255 0.0795 0.286 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 4.89e-01 0.0758 0.109 0.304 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0873 0.117 0.304 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 3.79e-01 0.0669 0.0759 0.304 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 1.36e-01 0.161 0.107 0.304 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00792 0.104 0.304 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 1.12e-01 -0.171 0.107 0.304 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 5.42e-01 0.0671 0.11 0.304 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 2.17e-01 -0.128 0.103 0.304 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0377 0.0848 0.304 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 5.44e-02 -0.187 0.0965 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0682 0.104 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0531 0.0564 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 4.19e-01 0.0675 0.0834 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 1.58e-01 0.131 0.0923 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 3.29e-01 0.102 0.104 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 9.90e-01 0.00109 0.0851 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 8.51e-01 0.0175 0.0925 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 5.99e-01 0.0513 0.0973 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 5.30e-01 0.0662 0.105 0.287 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 2.04e-01 0.129 0.101 0.287 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 5.28e-01 0.0428 0.0677 0.287 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0573 0.0926 0.287 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 9.63e-02 0.169 0.101 0.287 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 4.95e-01 0.0691 0.101 0.287 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0602 0.0921 0.287 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0227 0.0949 0.287 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 1.74e-01 -0.133 0.0973 0.287 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.12e-01 0.0104 0.094 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 3.47e-01 0.0846 0.0898 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 4.61e-01 0.0382 0.0517 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0565 0.0731 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 8.90e-01 0.012 0.0869 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 9.67e-01 0.00396 0.097 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 8.75e-01 0.0134 0.0851 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 8.38e-01 0.0163 0.0796 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 1.04e-01 -0.175 0.107 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.17e-01 0.0109 0.105 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0516 0.101 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 6.94e-01 0.0206 0.0525 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 5.35e-01 0.0505 0.0813 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 7.87e-02 0.165 0.0936 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 2.01e-01 -0.132 0.103 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 6.69e-01 0.0421 0.0983 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 5.57e-01 0.0525 0.0892 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 4.93e-01 0.0645 0.094 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 7.04e-01 0.0401 0.106 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 9.27e-02 -0.175 0.104 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 1.36e-01 -0.157 0.105 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0497 0.0922 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 4.77e-01 0.0722 0.101 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 8.74e-01 0.0171 0.107 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 1.06e-01 0.166 0.103 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.80e-01 0.00191 0.0757 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0546 0.0713 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 7.80e-02 -0.159 0.0898 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 1.14e-01 0.11 0.0693 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 6.76e-01 0.0318 0.0759 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 6.70e-01 0.0351 0.0823 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 8.68e-01 0.0106 0.0634 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.65e-01 0.00351 0.0809 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0457 0.085 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 1.56e-01 -0.134 0.0944 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 5.87e-02 0.138 0.0728 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 8.29e-01 0.0199 0.0919 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 8.46e-01 0.0167 0.086 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00609 0.0722 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 4.25e-01 0.075 0.0939 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 5.76e-01 0.0522 0.0931 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 7.20e-02 -0.168 0.0931 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 7.90e-01 0.024 0.0903 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 2.30e-01 -0.117 0.0974 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0166 0.0923 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 1.56e-01 -0.134 0.0942 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 8.23e-01 0.0192 0.0856 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 6.60e-01 0.0386 0.0876 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 1.93e-01 -0.121 0.0929 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0412 0.0746 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0513 0.101 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 2.89e-02 -0.217 0.0987 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0231 0.0863 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0869 0.106 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 6.15e-01 -0.042 0.0835 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 8.17e-01 0.0208 0.0897 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 2.58e-01 -0.106 0.0931 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 7.20e-01 0.0301 0.0838 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 6.17e-01 0.0446 0.0891 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0448 0.0968 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0603 0.0797 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 7.74e-01 0.0283 0.0984 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 7.34e-01 0.0328 0.0965 0.296 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0919 0.103 0.296 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0964 0.0899 0.296 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 2.53e-01 0.107 0.093 0.296 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0246 0.102 0.296 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 2.35e-01 -0.119 0.0996 0.296 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 9.40e-02 -0.171 0.102 0.296 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 8.43e-01 0.0193 0.0975 0.296 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.96e-01 0.000518 0.0988 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 8.55e-02 0.182 0.105 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0224 0.0949 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.101 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 1.77e-01 0.147 0.108 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0551 0.104 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 1.82e-01 -0.144 0.108 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 4.74e-01 -0.072 0.1 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 2.65e-01 -0.115 0.103 0.288 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00205 0.0956 0.288 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 1.68e-01 -0.134 0.097 0.288 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 4.23e-01 0.0693 0.0863 0.288 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 5.73e-01 0.0585 0.104 0.288 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0404 0.106 0.288 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0458 0.0897 0.288 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 1.32e-01 0.15 0.0991 0.288 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 7.48e-02 -0.175 0.0979 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0158 0.0945 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0922 0.0764 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 9.11e-01 0.0099 0.0886 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 9.45e-01 0.00715 0.103 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 8.07e-03 -0.266 0.0993 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 4.88e-01 0.0659 0.0949 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0166 0.0961 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 5.99e-01 0.0482 0.0916 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 6.08e-01 0.0402 0.0782 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 7.08e-02 -0.168 0.0925 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0172 0.0705 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 1.13e-01 0.155 0.0973 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 2.56e-01 0.108 0.0944 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 2.17e-01 0.102 0.0824 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 2.90e-01 0.104 0.0982 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 6.50e-01 0.0463 0.102 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 9.05e-01 0.0123 0.103 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 6.32e-02 -0.184 0.0983 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0706 0.0795 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 7.09e-01 0.039 0.104 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0742 0.106 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 1.18e-01 0.164 0.105 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0204 0.102 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 4.32e-01 0.0721 0.0916 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 5.03e-01 0.0572 0.0853 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 1.21e-01 -0.14 0.0897 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0973 0.0682 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0372 0.0955 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 9.64e-01 0.00429 0.0961 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 4.82e-01 0.0565 0.0803 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 9.37e-01 0.00776 0.0986 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 8.50e-02 -0.233 0.134 0.244 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 6.50e-01 0.0593 0.131 0.244 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0129 0.0805 0.244 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0195 0.116 0.244 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0359 0.133 0.244 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 6.51e-01 -0.037 0.0816 0.244 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 2.62e-01 0.156 0.138 0.244 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0338 0.0956 0.244 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 4.03e-02 -0.226 0.109 0.244 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0825 0.104 0.289 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 8.66e-01 0.0176 0.104 0.289 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 2.26e-01 -0.116 0.0953 0.289 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 8.00e-01 0.018 0.0707 0.289 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 7.57e-01 0.0313 0.101 0.289 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 9.60e-02 -0.127 0.0759 0.289 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0905 0.102 0.289 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 3.71e-01 0.0637 0.071 0.289 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.59e-01 0.00493 0.0959 0.286 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 3.18e-01 -0.098 0.098 0.286 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 2.55e-01 -0.117 0.103 0.286 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 1.43e-01 -0.132 0.0895 0.286 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0519 0.0979 0.286 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.286 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 6.96e-01 0.0363 0.0929 0.286 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 2.91e-01 -0.108 0.102 0.278 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 8.31e-01 0.0231 0.108 0.278 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0821 0.0935 0.278 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 7.16e-01 0.044 0.121 0.278 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0229 0.11 0.278 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 2.54e-01 0.13 0.113 0.278 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0307 0.103 0.278 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 8.05e-01 0.0205 0.0831 0.278 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 2.60e-01 -0.114 0.101 0.278 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0311 0.086 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 6.41e-01 0.0322 0.0691 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0207 0.0679 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 4.17e-01 0.0732 0.0899 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 6.86e-01 0.041 0.101 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 1.00e+00 -5.12e-05 0.0907 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 5.61e-01 0.0488 0.0838 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 5.45e-01 0.0404 0.0666 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0703 0.0729 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000935 0.0962 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0311 0.0903 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 6.99e-01 0.029 0.0748 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 2.22e-01 -0.111 0.0907 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 4.06e-01 0.0887 0.106 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 1.17e-02 -0.251 0.0987 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 5.62e-01 0.0531 0.0913 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 4.35e-01 0.0564 0.0721 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 5.02e-03 0.252 0.0888 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.08e-01 0.0134 0.116 0.321 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 3.67e-02 -0.242 0.115 0.321 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0355 0.111 0.321 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 2.15e-02 -0.191 0.082 0.321 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0947 0.11 0.321 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0437 0.116 0.321 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0696 0.118 0.321 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 1.25e-01 -0.168 0.109 0.321 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.64e-01 0.00475 0.104 0.278 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 3.27e-01 -0.104 0.106 0.278 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 9.03e-01 0.0112 0.0919 0.278 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 3.22e-01 -0.107 0.108 0.278 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0251 0.101 0.278 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 1.01e-02 -0.267 0.103 0.278 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 4.93e-01 0.0727 0.106 0.278 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 7.50e-02 0.157 0.0877 0.278 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 7.92e-01 0.0258 0.0978 0.278 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0623 0.0978 0.283 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 3.03e-02 0.209 0.096 0.283 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 1.16e-01 -0.143 0.0908 0.283 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 1.40e-01 0.161 0.109 0.283 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 1.15e-01 -0.151 0.0951 0.283 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 5.80e-01 0.051 0.0919 0.283 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 5.17e-01 0.0652 0.1 0.283 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 7.89e-02 -0.144 0.0817 0.283 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 1.14e-01 -0.135 0.0851 0.283 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 8.30e-01 -0.023 0.107 0.288 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 7.65e-01 -0.031 0.104 0.288 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 5.55e-01 0.0605 0.102 0.288 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 9.33e-01 0.0091 0.108 0.288 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0719 0.108 0.288 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 2.27e-01 0.137 0.113 0.288 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 5.35e-02 0.217 0.111 0.288 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 1.83e-01 0.102 0.076 0.288 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 7.63e-01 0.0276 0.0912 0.288 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0958 0.0974 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 9.09e-01 0.0111 0.0973 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0194 0.052 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 7.36e-01 0.0276 0.0817 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 3.23e-02 0.179 0.0833 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 3.44e-01 0.0901 0.095 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0198 0.0762 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 9.95e-01 0.000495 0.0852 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0354 0.0981 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 4.30e-01 0.0735 0.093 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 4.84e-01 0.0593 0.0845 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 5.78e-01 0.0261 0.0468 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 8.30e-01 0.0144 0.0671 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 3.41e-01 0.0783 0.082 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 5.15e-01 -0.061 0.0936 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 6.52e-01 0.0377 0.0834 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 3.26e-01 0.0723 0.0734 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -784210 sc-eQTL 1.94e-01 -0.138 0.106 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0169 0.0839 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 8.68e-01 0.0111 0.0665 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 8.95e-01 0.00889 0.0673 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0211 0.0866 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 2.29e-01 0.123 0.102 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 1.32e-01 -0.132 0.0871 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 2.76e-01 0.0814 0.0746 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 3.53e-01 0.058 0.0624 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 4.86e-01 0.05 0.0717 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 9.72e-01 0.00348 0.0994 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 2.34e-01 0.111 0.0928 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 1.68e-01 -0.116 0.0837 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0414 0.102 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0716 0.0978 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0521 0.0972 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 3.09e-01 0.0938 0.0919 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 9.97e-01 0.000305 0.0728 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 381579 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0625 0.0888 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 756140 sc-eQTL 8.83e-02 0.137 0.0802 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 812388 sc-eQTL 2.00e-01 0.0868 0.0675 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 sc-eQTL 4.95e-02 -0.175 0.0884 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -875697 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0492 0.061 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -324843 sc-eQTL 4.69e-01 0.0678 0.0936 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -452510 sc-eQTL 7.40e-01 0.0289 0.087 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 688122 sc-eQTL 1.26e-01 0.105 0.0683 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -922318 sc-eQTL 3.74e-01 0.0842 0.0944 0.287 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -741685 eQTL 4.64e-02 -0.055 0.0276 0.0 0.0 0.29
ENSG00000279148 AC126474.1 927722 eQTL 0.033 0.0637 0.0298 0.0 0.0 0.29


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000279148 AC126474.1 927722 2.74e-07 1.3e-07 3.69e-08 2.22e-07 9.25e-08 1e-07 1.61e-07 5.49e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.57e-07 8.55e-08 2.05e-07 7.13e-08 6.25e-08 7.17e-08 3.87e-08 1.33e-07 5.39e-08 4.3e-08 1.04e-07 1.28e-07 1.39e-07 4.53e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.16e-07 1.07e-07 1.06e-07 3.89e-08 2.92e-08 8.23e-08 7.66e-08 3.76e-08 5.03e-08 9.6e-08 6.54e-08 4.55e-08 3.92e-08 1.68e-07 5.27e-08 1.21e-08 6.92e-08 1.77e-08 1.26e-07 4.2e-09 4.91e-08