logo

Genes within 1Mb (chr12:100891435:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 3.20e-01 -0.104 0.105 0.16 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 8.28e-01 0.0194 0.0891 0.16 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.58e-01 0.0625 0.0551 0.16 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0437 0.0799 0.16 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 4.78e-02 0.179 0.0901 0.16 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 4.24e-01 0.0626 0.078 0.16 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 1.34e-01 0.133 0.0883 0.16 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 1.07e-01 0.114 0.0705 0.16 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0457 0.113 0.16 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0289 0.0798 0.16 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0316 0.0743 0.16 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 8.00e-02 -0.194 0.11 0.16 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 1.22e-01 0.119 0.0766 0.16 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 8.47e-02 0.146 0.0846 0.16 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 5.16e-01 0.0541 0.0832 0.16 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00481 0.0635 0.16 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0358 0.0893 0.16 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0267 0.0884 0.16 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.33e-01 -0.133 0.111 0.16 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0109 0.0733 0.16 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00211 0.0925 0.16 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0847 0.102 0.16 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 7.64e-01 0.0249 0.0828 0.16 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0697 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 1.39e-01 -0.174 0.117 0.16 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 1.32e-01 -0.171 0.113 0.16 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 8.82e-01 0.0159 0.108 0.16 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 9.80e-01 0.00299 0.118 0.16 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 6.84e-02 0.231 0.126 0.16 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0327 0.131 0.16 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 1.04e-01 0.205 0.125 0.16 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 2.03e-01 0.119 0.0929 0.16 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0726 0.117 0.16 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 4.30e-01 0.0811 0.102 0.16 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 8.42e-01 0.0168 0.0844 0.16 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0364 0.0819 0.16 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0411 0.103 0.16 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 7.15e-01 0.0419 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 2.72e-01 -0.116 0.105 0.16 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 7.12e-01 0.0325 0.088 0.16 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 5.51e-01 0.0451 0.0756 0.16 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 6.44e-02 0.152 0.0816 0.16 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 9.18e-01 0.00986 0.0953 0.161 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 1.38e-01 0.116 0.0782 0.161 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.34e-01 -0.117 0.0976 0.161 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0706 0.0708 0.161 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 8.65e-01 0.0195 0.114 0.161 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00568 0.105 0.161 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.14e-01 0.1 0.0806 0.161 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 6.75e-01 0.0473 0.113 0.161 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0407 0.114 0.16 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0736 0.108 0.16 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 1.70e-01 -0.152 0.11 0.16 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000714 0.0799 0.16 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 7.36e-01 0.0421 0.125 0.16 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 4.90e-01 0.0628 0.0909 0.16 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.36e-01 -0.118 0.0991 0.16 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0296 0.097 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0415 0.137 0.166 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0708 0.147 0.166 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 5.41e-01 0.0584 0.0953 0.166 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 5.39e-01 0.0833 0.135 0.166 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 6.33e-01 0.0627 0.131 0.166 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 1.68e-01 -0.186 0.135 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 8.27e-01 0.0302 0.138 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 8.39e-01 0.0264 0.13 0.166 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 8.00e-01 0.027 0.106 0.166 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 3.10e-01 -0.122 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 9.12e-01 0.0143 0.129 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0208 0.0699 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 5.61e-01 0.0602 0.103 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 2.35e-01 0.136 0.115 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 1.39e-01 0.191 0.129 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 4.81e-01 0.0743 0.105 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 3.83e-01 0.0999 0.114 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00441 0.121 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0969 0.129 0.162 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 8.07e-01 0.0304 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 3.93e-01 0.0708 0.0827 0.162 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0759 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 6.19e-01 0.0619 0.125 0.162 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 5.75e-01 0.0696 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 8.42e-01 0.0226 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 1.66e-01 -0.161 0.116 0.162 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0724 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 2.44e-01 -0.133 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 4.95e-01 0.0746 0.109 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 5.67e-02 0.119 0.0623 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 9.76e-01 0.0027 0.0889 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 6.16e-01 0.053 0.105 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 7.74e-01 0.0339 0.118 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 8.79e-01 0.0157 0.103 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 2.30e-01 0.116 0.0963 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 2.97e-01 -0.137 0.131 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00463 0.129 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 5.42e-01 0.0753 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 7.69e-02 0.114 0.0639 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 2.18e-01 -0.123 0.0994 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 1.40e-02 0.283 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0111 0.127 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.68e-01 0.133 0.12 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 2.48e-01 0.126 0.109 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 8.41e-01 0.0232 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0562 0.128 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 2.12e-01 -0.159 0.127 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0383 0.128 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0652 0.112 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 1.59e-01 0.174 0.123 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 9.87e-02 0.215 0.13 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 1.73e-01 0.171 0.125 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0489 0.0918 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 5.45e-01 0.0525 0.0866 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 6.99e-02 -0.198 0.109 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 4.85e-01 0.0592 0.0845 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 7.80e-02 0.162 0.0915 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 7.95e-01 -0.026 0.0999 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0238 0.0769 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 8.15e-01 -0.023 0.0981 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 9.89e-02 -0.17 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 7.86e-02 -0.202 0.114 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 8.57e-02 0.153 0.0885 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 1.33e-01 0.167 0.111 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 3.89e-01 0.09 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 7.96e-01 0.0227 0.0876 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 3.84e-01 0.0992 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00642 0.113 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.40e-02 -0.255 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 2.08e-01 0.138 0.109 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0997 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00571 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.10e-01 -0.144 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0631 0.103 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 3.28e-01 0.103 0.106 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0762 0.113 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00646 0.0901 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0267 0.122 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 3.68e-01 -0.108 0.12 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.73e-01 0.114 0.104 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0186 0.128 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0757 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0939 0.109 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.05e-01 -0.144 0.113 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0635 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 4.94e-01 0.0744 0.109 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0657 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0806 0.0971 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0195 0.12 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 3.28e-01 0.117 0.119 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 4.17e-01 -0.104 0.127 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 3.62e-01 -0.102 0.111 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 2.73e-01 0.126 0.115 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0452 0.126 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0731 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00356 0.126 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 7.72e-01 0.035 0.121 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 9.84e-01 0.0024 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 5.52e-01 0.0768 0.129 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 1.20e-01 -0.179 0.115 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0687 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000134 0.133 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 4.24e-01 -0.101 0.127 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.59e-01 -0.149 0.131 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 1.49e-01 -0.176 0.122 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0589 0.126 0.16 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 8.26e-01 0.0256 0.117 0.16 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0984 0.119 0.16 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 3.93e-01 0.0902 0.105 0.16 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0197 0.126 0.16 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 7.26e-01 0.0453 0.129 0.16 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 3.02e-01 -0.113 0.109 0.16 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 5.17e-01 0.0789 0.122 0.16 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 2.21e-02 -0.278 0.121 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0793 0.117 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0981 0.0947 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0297 0.11 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0931 0.128 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 1.26e-01 -0.191 0.124 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.117 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0282 0.119 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0849 0.111 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 3.33e-01 0.0917 0.0945 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 3.05e-01 -0.116 0.113 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0199 0.0853 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0347 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 6.65e-01 0.0497 0.114 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.52e-01 0.114 0.0997 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 9.59e-01 0.00606 0.119 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 6.13e-01 0.0635 0.125 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 5.66e-01 0.0727 0.126 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 4.66e-02 -0.242 0.121 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0856 0.0978 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 1.10e-01 0.205 0.127 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 4.50e-01 0.0991 0.131 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.33e-01 0.154 0.129 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 1.26e-01 -0.191 0.124 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 4.07e-01 0.0929 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 5.78e-01 0.0581 0.104 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0272 0.11 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0939 0.0834 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0271 0.117 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0136 0.117 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 9.19e-01 0.00996 0.0982 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 3.77e-01 0.106 0.12 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 3.67e-01 -0.154 0.17 0.137 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 4.73e-01 0.118 0.164 0.137 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 5.86e-01 0.0551 0.101 0.137 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 7.35e-01 0.0493 0.145 0.137 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 9.76e-01 0.00511 0.167 0.137 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 6.09e-01 0.0526 0.102 0.137 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 5.15e-02 0.337 0.171 0.137 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 8.53e-01 0.0223 0.12 0.137 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 4.63e-01 -0.102 0.139 0.137 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 2.18e-01 -0.158 0.128 0.163 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 5.58e-01 0.0749 0.128 0.163 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.82e-01 -0.126 0.117 0.163 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0643 0.0866 0.163 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00647 0.124 0.163 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 1.90e-01 -0.123 0.0933 0.163 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0452 0.125 0.163 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 4.18e-01 0.0708 0.0872 0.163 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 6.39e-01 0.0555 0.118 0.16 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 3.98e-02 -0.248 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.54e-01 -0.145 0.127 0.16 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0289 0.111 0.16 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 6.14e-01 -0.061 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 5.19e-01 0.0807 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 1.11e-01 0.182 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 1.76e-01 -0.173 0.128 0.151 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 1.38e-01 -0.199 0.134 0.151 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.47e-01 -0.135 0.117 0.151 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 5.17e-01 0.0979 0.151 0.151 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 1.48e-01 0.198 0.136 0.151 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 5.36e-01 0.0878 0.142 0.151 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 3.63e-01 -0.117 0.128 0.151 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 2.32e-01 0.124 0.103 0.151 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0788 0.127 0.151 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 8.12e-01 -0.025 0.105 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 6.47e-01 0.0387 0.0843 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.83e-01 -0.089 0.0826 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0248 0.11 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0249 0.124 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 4.58e-01 0.0822 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0878 0.102 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0223 0.0814 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 7.45e-01 0.029 0.0891 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 5.93e-01 0.0629 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0501 0.11 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 4.87e-01 0.0637 0.0914 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0187 0.111 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 7.12e-01 0.0483 0.13 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 2.23e-02 -0.279 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 8.29e-01 0.0242 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 3.20e-01 0.0879 0.0881 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 2.75e-03 0.328 0.108 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0577 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 2.25e-01 -0.169 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0905 0.132 0.188 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 8.53e-02 -0.171 0.0989 0.188 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 3.55e-01 -0.122 0.132 0.188 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0266 0.138 0.188 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 1.13e-01 -0.223 0.14 0.188 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 6.75e-01 -0.055 0.131 0.188 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 1.09e-01 0.207 0.129 0.156 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 6.88e-01 -0.053 0.132 0.156 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0466 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0621 0.134 0.156 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 3.35e-01 0.121 0.125 0.156 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 4.23e-02 -0.262 0.128 0.156 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 4.82e-01 0.0923 0.131 0.156 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 6.95e-01 0.043 0.109 0.156 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 1.86e-01 0.16 0.121 0.156 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 8.58e-01 0.0218 0.121 0.158 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 9.03e-02 0.204 0.12 0.158 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 3.15e-01 -0.114 0.113 0.158 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 1.98e-01 0.175 0.135 0.158 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 2.83e-02 -0.259 0.117 0.158 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0269 0.114 0.158 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 4.37e-01 0.097 0.125 0.158 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 1.06e-01 -0.165 0.102 0.158 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 5.50e-02 -0.203 0.105 0.158 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 1.03e-01 -0.213 0.13 0.167 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 3.72e-01 -0.113 0.126 0.167 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 5.86e-01 0.068 0.125 0.167 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0684 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0188 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 8.29e-01 0.03 0.138 0.167 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 5.60e-02 0.262 0.136 0.167 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 3.64e-01 0.0847 0.0931 0.167 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 8.64e-01 0.0191 0.111 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 3.88e-01 -0.105 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 9.58e-01 0.00639 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 9.52e-01 0.00386 0.0645 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0273 0.101 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 1.58e-01 0.147 0.104 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 1.45e-01 0.172 0.117 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 4.45e-01 0.0723 0.0944 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 3.96e-01 0.0896 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 9.73e-01 0.00407 0.122 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0799 0.113 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 2.77e-01 0.112 0.103 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 4.50e-02 0.114 0.0565 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 9.80e-01 0.00203 0.0816 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 1.12e-01 0.158 0.0993 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 8.59e-01 0.0203 0.114 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 6.41e-01 0.0473 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 9.95e-02 0.147 0.0889 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -848037 sc-eQTL 2.97e-01 -0.135 0.129 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 8.10e-01 0.0245 0.102 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00577 0.0807 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0214 0.0816 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0832 0.105 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 6.06e-01 0.0641 0.124 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0683 0.106 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0365 0.0907 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 5.67e-01 0.0435 0.0758 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 6.53e-02 0.16 0.0864 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 1.93e-01 0.16 0.122 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 1.18e-01 0.179 0.114 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.14e-01 -0.129 0.103 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 9.42e-01 0.00909 0.126 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0533 0.121 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 4.02e-01 -0.101 0.12 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 2.46e-01 0.132 0.113 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0641 0.0897 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 317752 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0525 0.11 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 692313 sc-eQTL 6.09e-01 0.0502 0.0982 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 748561 sc-eQTL 1.06e-01 0.133 0.082 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 sc-eQTL 2.57e-01 -0.123 0.108 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -939524 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0766 0.0742 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -388670 sc-eQTL 9.11e-01 0.0128 0.114 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -516337 sc-eQTL 7.65e-01 0.0316 0.106 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 624295 sc-eQTL 4.32e-01 0.0656 0.0834 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -986145 sc-eQTL 5.22e-01 0.0739 0.115 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -805512 eQTL 4.23e-02 -0.0639 0.0314 0.0 0.0 0.184
ENSG00000196091 MYBPC1 -676918 pQTL 0.043 -0.0446 0.022 0.00124 0.0 0.18

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina