logo

Genes within 1Mb (chr12:100869873:TCTC:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0256 0.118 0.118 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.32e-01 0.0345 0.1 0.118 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0777 0.0621 0.118 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0998 0.0899 0.118 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 8.77e-01 0.0159 0.103 0.118 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 9.33e-01 0.00739 0.0881 0.118 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00754 0.1 0.118 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 5.09e-01 -0.084 0.127 0.118 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 3.97e-01 0.0757 0.0893 0.118 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0855 0.0831 0.118 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 2.76e-01 -0.136 0.124 0.118 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0921 0.0861 0.118 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 3.11e-01 0.0966 0.0952 0.118 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0324 0.0933 0.118 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0452 0.0711 0.118 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 5.84e-01 0.0548 0.0998 0.118 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 9.62e-01 0.00474 0.0988 0.118 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0768 0.125 0.118 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0557 0.0819 0.118 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 1.28e-01 0.157 0.103 0.118 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 4.06e-02 -0.233 0.113 0.118 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 8.83e-01 0.0136 0.0925 0.118 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0553 0.13 0.119 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 4.76e-01 0.0895 0.125 0.119 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 7.84e-01 0.0326 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.77e-01 0.115 0.13 0.119 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 2.91e-01 -0.148 0.139 0.119 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 4.84e-01 0.101 0.144 0.119 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 3.15e-01 0.14 0.139 0.119 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0195 0.129 0.119 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 4.60e-01 0.0841 0.114 0.118 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 4.44e-01 0.0718 0.0935 0.118 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 4.12e-01 0.0747 0.0908 0.118 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 9.73e-01 0.00389 0.114 0.118 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 8.25e-03 0.334 0.125 0.118 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 3.42e-01 -0.111 0.117 0.118 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 9.81e-03 0.25 0.0961 0.118 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0603 0.0912 0.118 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 3.06e-01 0.108 0.106 0.118 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 8.47e-01 0.0168 0.0873 0.118 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 2.32e-01 -0.13 0.108 0.118 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0342 0.0788 0.118 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00508 0.127 0.118 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 2.96e-01 -0.122 0.116 0.118 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 8.13e-01 0.0212 0.0898 0.118 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 6.60e-03 -0.339 0.124 0.118 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 3.52e-01 -0.111 0.119 0.118 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 3.36e-01 -0.118 0.122 0.118 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0779 0.0883 0.118 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 3.49e-01 0.129 0.138 0.118 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 8.56e-01 0.0182 0.101 0.118 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 8.92e-01 0.015 0.11 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 8.59e-01 -0.026 0.146 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0837 0.156 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0616 0.101 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0653 0.144 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 6.97e-01 0.0542 0.139 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0444 0.144 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 1.32e-01 0.22 0.145 0.138 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 4.69e-02 -0.223 0.112 0.138 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 1.88e-01 -0.173 0.131 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0947 0.14 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0438 0.0764 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 6.56e-01 0.0503 0.113 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0164 0.126 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0408 0.141 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 2.44e-01 0.134 0.115 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 1.34e-01 -0.197 0.131 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 3.09e-01 0.143 0.141 0.116 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 2.09e-01 0.171 0.135 0.116 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 8.30e-01 0.0195 0.0906 0.116 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0506 0.124 0.116 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 8.60e-03 0.355 0.134 0.116 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 5.23e-01 0.0866 0.135 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0999 0.123 0.116 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 5.62e-01 0.0758 0.131 0.116 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 2.47e-01 0.146 0.126 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 8.65e-01 0.0206 0.121 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0328 0.0693 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0966 0.0978 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 7.50e-01 0.0371 0.116 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 3.55e-01 -0.12 0.13 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 7.79e-01 -0.032 0.114 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 1.12e-01 -0.23 0.144 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 3.11e-01 0.143 0.141 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 4.81e-01 0.0954 0.135 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0398 0.0706 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 5.29e-01 0.0689 0.109 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0298 0.127 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0643 0.139 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 6.18e-01 -0.066 0.132 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 8.11e-01 0.0303 0.127 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 3.18e-01 0.146 0.146 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 5.17e-01 -0.094 0.145 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0921 0.146 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 6.84e-01 0.0521 0.128 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 3.60e-01 0.129 0.14 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0773 0.149 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 2.48e-01 -0.165 0.142 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 4.94e-01 0.0701 0.102 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 2.53e-01 -0.11 0.0963 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 3.35e-01 -0.118 0.122 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0293 0.0943 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 7.58e-01 0.0318 0.103 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 9.66e-01 0.00469 0.111 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 7.72e-01 0.0249 0.0857 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 8.49e-01 -0.021 0.11 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0868 0.115 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 2.77e-01 -0.14 0.128 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 9.10e-01 0.0113 0.0997 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 8.54e-01 0.023 0.125 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 8.45e-01 0.0229 0.117 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 3.05e-01 -0.101 0.0977 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 9.21e-02 0.214 0.127 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 4.47e-01 0.0961 0.126 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0857 0.127 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.29e-01 -0.119 0.122 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 6.02e-01 0.0692 0.132 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0334 0.125 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0438 0.128 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 4.66e-01 0.0842 0.115 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 2.55e-01 -0.134 0.118 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0437 0.126 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 9.62e-01 0.00486 0.101 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 8.55e-01 0.0248 0.136 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 2.82e-01 -0.145 0.134 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 3.24e-01 -0.115 0.116 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 8.96e-01 0.015 0.115 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0458 0.123 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0127 0.128 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 2.31e-01 -0.138 0.115 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 1.14e-01 0.193 0.122 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0709 0.133 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 7.62e-01 0.0332 0.109 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 3.34e-01 -0.128 0.132 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0638 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0764 0.123 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 4.99e-01 0.0864 0.128 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 5.06e-02 0.271 0.138 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 1.08e-02 -0.346 0.135 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 4.64e-01 -0.103 0.14 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 9.23e-01 0.013 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.63e-02 0.253 0.142 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 7.61e-01 0.039 0.128 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.45e-01 -0.13 0.137 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 1.57e-01 0.208 0.146 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0962 0.141 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 2.24e-01 -0.178 0.146 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 1.39e-01 -0.211 0.142 0.117 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 1.55e-01 -0.188 0.132 0.117 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 3.50e-01 -0.126 0.135 0.117 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 4.24e-01 0.0958 0.12 0.117 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 4.64e-01 0.105 0.143 0.117 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 6.77e-01 0.061 0.146 0.117 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 5.10e-01 0.0821 0.124 0.117 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 1.93e-01 -0.176 0.135 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 2.15e-01 0.16 0.129 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 3.00e-01 -0.109 0.105 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.25e-01 -0.12 0.121 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 9.96e-02 0.233 0.141 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 4.46e-01 -0.106 0.138 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 1.11e-01 -0.207 0.129 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 1.69e-01 0.17 0.123 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0708 0.106 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 2.25e-01 -0.153 0.126 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 6.26e-01 0.0465 0.0953 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 4.08e-01 0.11 0.132 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 2.23e-01 0.156 0.128 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 3.43e-01 0.106 0.112 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 4.65e-01 0.1 0.137 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.00e-01 0.0535 0.138 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0107 0.134 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0936 0.107 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0992 0.14 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 1.75e-01 -0.194 0.143 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0584 0.142 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 2.16e-01 -0.153 0.123 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.94e-01 -0.03 0.115 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 3.08e-01 -0.124 0.121 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0786 0.0922 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 4.26e-01 -0.102 0.129 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 1.60e-01 -0.182 0.129 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00678 0.108 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0771 0.179 0.119 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 9.76e-01 0.00531 0.173 0.119 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0148 0.107 0.119 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0514 0.153 0.119 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 9.61e-01 0.00865 0.176 0.119 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 2.54e-01 0.123 0.107 0.119 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 7.76e-01 0.0523 0.184 0.119 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 1.77e-02 -0.345 0.143 0.119 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0414 0.14 0.117 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.32e-01 0.048 0.14 0.117 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 1.17e-01 -0.201 0.128 0.117 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 3.18e-01 0.0948 0.0947 0.117 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 5.68e-01 0.0775 0.135 0.117 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 6.20e-01 0.0509 0.102 0.117 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 2.19e-01 -0.168 0.136 0.117 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0299 0.131 0.118 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 3.84e-01 -0.116 0.133 0.118 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 3.05e-01 -0.144 0.14 0.118 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 1.46e-02 -0.297 0.121 0.118 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 2.98e-01 0.139 0.133 0.118 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 1.67e-01 0.19 0.137 0.118 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0845 0.126 0.118 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 6.64e-01 0.0604 0.139 0.117 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.89e-01 0.0392 0.146 0.117 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 8.23e-01 0.0284 0.127 0.117 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 4.30e-01 0.129 0.163 0.117 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 2.48e-01 -0.171 0.148 0.117 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0415 0.154 0.117 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 6.74e-01 0.0586 0.139 0.117 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00697 0.138 0.117 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 5.04e-01 0.0783 0.117 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.23e-01 0.0334 0.094 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 4.31e-01 0.0728 0.0923 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 5.80e-01 0.0679 0.123 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 9.61e-03 0.355 0.136 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0886 0.123 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 1.66e-02 0.272 0.113 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 1.09e-01 -0.159 0.0988 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00255 0.129 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.65e-01 0.0363 0.121 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0292 0.1 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 1.12e-01 -0.194 0.121 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 1.78e-01 0.193 0.143 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 6.75e-01 0.0564 0.135 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 3.45e-01 0.116 0.122 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 8.94e-02 0.206 0.121 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 3.17e-01 -0.17 0.169 0.124 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 5.03e-01 -0.114 0.17 0.124 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 7.32e-01 0.0556 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 1.41e-01 -0.179 0.121 0.124 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 4.94e-01 -0.11 0.161 0.124 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 2.92e-01 -0.178 0.168 0.124 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 4.11e-01 0.142 0.172 0.124 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 8.98e-01 0.018 0.14 0.116 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 2.47e-01 -0.165 0.142 0.116 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 4.94e-01 0.0845 0.123 0.116 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0572 0.145 0.116 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 9.85e-01 0.00255 0.136 0.116 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0193 0.14 0.116 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 1.19e-01 0.222 0.141 0.116 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 4.08e-01 -0.109 0.131 0.116 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 3.07e-01 -0.134 0.131 0.118 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 8.20e-02 0.226 0.129 0.118 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 3.33e-01 -0.119 0.122 0.118 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 4.13e-01 0.12 0.147 0.118 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 4.05e-01 0.107 0.128 0.118 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00171 0.123 0.118 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 3.22e-01 0.133 0.134 0.118 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 9.10e-01 0.013 0.115 0.118 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 6.02e-01 0.0749 0.143 0.119 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 5.38e-01 0.0855 0.138 0.119 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 1.72e-01 -0.187 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 8.76e-01 0.0226 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 3.11e-01 -0.146 0.144 0.119 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 3.47e-01 0.143 0.151 0.119 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 3.67e-01 0.136 0.15 0.119 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 2.80e-01 0.132 0.122 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 4.30e-01 -0.104 0.131 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0469 0.131 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0261 0.0699 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 9.61e-01 0.00542 0.11 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 8.01e-02 0.197 0.112 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0198 0.128 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 6.38e-01 0.0482 0.102 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 1.70e-01 -0.181 0.131 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 9.51e-02 0.208 0.124 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 3.81e-01 0.0995 0.113 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0575 0.0628 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0445 0.0901 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0617 0.11 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 4.84e-01 -0.088 0.126 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0187 0.112 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -869599 sc-eQTL 1.88e-01 -0.187 0.142 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 4.37e-01 0.0881 0.113 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 6.08e-01 0.0461 0.0898 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 5.21e-01 0.0584 0.0908 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 8.15e-01 0.0274 0.117 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 1.52e-02 0.334 0.136 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0896 0.118 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 1.03e-02 0.257 0.0994 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00844 0.097 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 9.02e-01 0.0167 0.135 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 7.35e-01 0.0427 0.126 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0786 0.114 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 4.35e-01 -0.108 0.138 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 4.28e-01 0.105 0.132 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 8.13e-01 0.0311 0.132 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 1.65e-01 0.173 0.124 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 296190 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0358 0.12 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 670751 sc-eQTL 1.37e-01 0.162 0.108 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 726999 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0105 0.0916 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -827074 sc-eQTL 2.32e-01 -0.144 0.12 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -961086 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0169 0.0825 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -410232 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0907 0.126 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -537899 sc-eQTL 3.15e-01 -0.118 0.117 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 602733 sc-eQTL 4.55e-01 0.0693 0.0926 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000196091 MYBPC1 -698480 pQTL 0.0317 0.0618 0.0288 0.00128 0.0 0.0954

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina