logo

Genes within 1Mb (chr12:100867747:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 9.26e-01 -0.011 0.118 0.12 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 8.43e-01 0.02 0.1 0.12 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0872 0.062 0.12 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0874 0.09 0.12 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 7.09e-01 0.0382 0.102 0.12 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00069 0.0881 0.12 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0258 0.1 0.12 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0968 0.127 0.12 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 4.16e-01 0.0729 0.0894 0.12 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0686 0.0833 0.12 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.72e-01 -0.137 0.124 0.12 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0861 0.0862 0.12 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 3.94e-01 0.0814 0.0954 0.12 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0489 0.0934 0.12 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0544 0.0712 0.12 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 5.02e-01 0.0667 0.0992 0.12 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0047 0.0983 0.12 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0839 0.124 0.12 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0445 0.0815 0.12 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 1.19e-01 0.16 0.102 0.12 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 5.09e-02 -0.221 0.113 0.12 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 8.36e-01 0.0191 0.0921 0.12 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0527 0.129 0.122 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 5.00e-01 0.0841 0.124 0.122 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 8.70e-01 0.0193 0.118 0.122 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.12e-01 0.131 0.129 0.122 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 3.39e-01 -0.133 0.139 0.122 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 4.89e-01 0.0995 0.143 0.122 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 3.36e-01 0.133 0.138 0.122 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 9.43e-01 0.00921 0.128 0.122 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 3.72e-01 0.101 0.113 0.12 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 3.78e-01 0.0824 0.0932 0.12 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 5.81e-01 0.0502 0.0907 0.12 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0107 0.114 0.12 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 5.99e-03 0.346 0.125 0.12 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 3.54e-01 -0.108 0.117 0.12 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 7.51e-03 0.258 0.0957 0.12 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0578 0.091 0.12 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 4.04e-01 0.0884 0.106 0.12 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 9.33e-01 0.00737 0.0872 0.12 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.44e-01 -0.127 0.108 0.12 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0452 0.0788 0.12 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 9.65e-01 0.00554 0.127 0.12 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 4.05e-01 -0.097 0.116 0.12 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 9.64e-01 0.0041 0.0898 0.12 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 7.10e-03 -0.334 0.123 0.12 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 3.22e-01 -0.118 0.118 0.12 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.46e-01 -0.141 0.122 0.12 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0989 0.0877 0.12 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 2.86e-01 0.147 0.137 0.12 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 8.18e-01 0.0231 0.1 0.12 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 8.92e-01 0.0149 0.109 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0303 0.145 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 4.33e-01 -0.122 0.155 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0831 0.101 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0305 0.143 0.14 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 5.96e-01 0.0734 0.138 0.14 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0523 0.143 0.14 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 1.19e-01 0.227 0.145 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 4.28e-02 -0.227 0.111 0.14 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 1.90e-01 -0.172 0.131 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 4.41e-01 -0.108 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0546 0.076 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 6.33e-01 0.0537 0.112 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00506 0.125 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0287 0.141 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 2.71e-01 0.126 0.114 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 9.87e-02 -0.216 0.13 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 3.11e-01 0.142 0.14 0.119 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 2.55e-01 0.154 0.135 0.119 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 9.49e-01 0.00576 0.0903 0.119 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0548 0.124 0.119 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 6.04e-03 0.37 0.133 0.119 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 5.06e-01 0.0899 0.135 0.119 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 3.11e-01 -0.124 0.123 0.119 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 5.38e-01 0.0803 0.13 0.119 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 2.34e-01 0.149 0.125 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 8.45e-01 0.0235 0.12 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0418 0.0689 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0979 0.0973 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 5.36e-01 0.0718 0.116 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 2.85e-01 -0.138 0.129 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0233 0.113 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 7.20e-02 -0.258 0.143 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 2.36e-01 0.167 0.14 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 6.28e-01 0.0653 0.135 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0386 0.0703 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 4.61e-01 0.0804 0.109 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0172 0.126 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0767 0.139 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0741 0.132 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 7.18e-01 0.0455 0.126 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 2.41e-01 0.171 0.145 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0799 0.144 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 4.33e-01 -0.114 0.145 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 7.15e-01 0.0465 0.127 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 3.26e-01 0.138 0.14 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 4.51e-01 -0.112 0.148 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 1.62e-01 -0.199 0.142 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 4.77e-01 0.0729 0.102 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 2.68e-01 -0.107 0.0964 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 3.68e-01 -0.11 0.122 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0207 0.0944 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00739 0.103 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0369 0.111 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 7.39e-01 0.0286 0.0858 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0223 0.11 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0886 0.115 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.11e-01 -0.161 0.128 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 8.76e-01 0.0155 0.0996 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 8.37e-01 0.0257 0.125 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 7.38e-01 0.0391 0.117 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 2.82e-01 -0.105 0.0976 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 1.07e-01 0.204 0.126 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 3.16e-01 0.126 0.125 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 3.84e-01 -0.11 0.126 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 4.50e-01 0.0997 0.132 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0382 0.124 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0386 0.128 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 4.05e-01 0.0954 0.114 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 2.48e-01 -0.135 0.117 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0504 0.125 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 9.53e-01 0.00595 0.0999 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 8.51e-01 0.0255 0.135 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 3.01e-01 -0.138 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.115 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 7.43e-01 0.0376 0.115 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0703 0.123 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00229 0.128 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 2.72e-01 -0.126 0.115 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 4.79e-02 0.241 0.121 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 5.57e-01 -0.078 0.133 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 6.63e-01 0.0477 0.109 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 3.03e-01 -0.136 0.131 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0571 0.14 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0784 0.123 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.35e-01 0.123 0.127 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 2.85e-02 0.302 0.137 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 8.39e-03 -0.356 0.134 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0839 0.139 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 9.15e-01 0.0142 0.133 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 7.12e-02 0.256 0.141 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 9.41e-01 0.00947 0.128 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.33e-01 -0.132 0.136 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 1.82e-01 0.195 0.146 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0891 0.14 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 2.01e-01 -0.186 0.145 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 1.34e-01 -0.213 0.142 0.119 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 1.13e-01 -0.209 0.131 0.119 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.81e-01 -0.145 0.134 0.119 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 5.73e-01 0.0673 0.119 0.119 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 3.63e-01 0.13 0.143 0.119 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 6.57e-01 0.0647 0.146 0.119 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 4.68e-01 0.09 0.124 0.119 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 1.98e-01 -0.173 0.134 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 2.65e-01 0.144 0.129 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0817 0.104 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0953 0.121 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 5.18e-02 0.273 0.14 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 4.66e-01 -0.101 0.138 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 1.84e-01 -0.172 0.129 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 2.05e-01 0.157 0.123 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0776 0.106 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.07e-01 -0.159 0.125 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 7.50e-01 0.0304 0.0952 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 4.27e-01 0.105 0.132 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 1.61e-01 0.179 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 4.74e-01 0.08 0.112 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 6.32e-01 0.0657 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 6.23e-01 0.0678 0.138 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0141 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.30e-01 -0.104 0.107 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0666 0.14 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 1.73e-01 -0.195 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0277 0.141 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 2.13e-01 -0.154 0.123 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0438 0.115 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.73e-01 -0.133 0.121 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 2.64e-01 -0.103 0.092 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 4.01e-01 -0.108 0.128 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 1.91e-01 -0.169 0.129 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0569 0.108 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0241 0.18 0.122 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 8.41e-01 0.0349 0.173 0.122 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0755 0.107 0.122 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0479 0.153 0.122 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 7.10e-01 0.0656 0.176 0.122 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 2.53e-01 0.124 0.108 0.122 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 7.57e-01 0.0571 0.184 0.122 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 1.86e-02 -0.343 0.144 0.122 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0803 0.14 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 5.70e-01 0.0791 0.139 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 1.02e-01 -0.208 0.127 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.77e-01 0.0834 0.0942 0.12 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 4.35e-01 0.105 0.135 0.12 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 6.22e-01 0.0502 0.102 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 2.81e-01 -0.147 0.136 0.12 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 8.30e-01 -0.028 0.13 0.12 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0782 0.133 0.12 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.48e-01 -0.161 0.139 0.12 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.00e-02 -0.263 0.12 0.12 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 3.16e-01 0.133 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 1.78e-01 0.184 0.137 0.12 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 4.19e-01 -0.102 0.126 0.12 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 7.04e-01 0.0527 0.138 0.12 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 8.00e-01 0.0369 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 9.02e-01 0.0156 0.126 0.12 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 4.10e-01 0.134 0.163 0.12 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 2.97e-01 -0.154 0.147 0.12 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0456 0.153 0.12 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 7.12e-01 0.0514 0.139 0.12 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 8.97e-01 0.0178 0.137 0.12 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 4.32e-01 0.0916 0.116 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 6.26e-01 0.0457 0.0936 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 5.83e-01 0.0506 0.092 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 6.88e-01 0.0492 0.122 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 5.34e-03 0.38 0.135 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0888 0.123 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 1.53e-02 0.274 0.112 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 1.04e-01 -0.161 0.0984 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 9.03e-01 0.0158 0.129 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 7.40e-01 0.0401 0.121 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0458 0.1 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 9.12e-02 -0.205 0.121 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 1.38e-01 0.211 0.142 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 6.58e-01 0.0593 0.134 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 3.12e-01 0.124 0.122 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 7.78e-02 0.213 0.12 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 4.16e-01 -0.137 0.168 0.127 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 4.85e-01 -0.119 0.169 0.127 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 8.31e-01 0.0345 0.161 0.127 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 9.52e-02 -0.202 0.12 0.127 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0985 0.16 0.127 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 3.29e-01 -0.164 0.167 0.127 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 3.92e-01 0.147 0.171 0.127 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 8.95e-01 0.0184 0.14 0.118 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 2.93e-01 -0.149 0.142 0.118 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 6.30e-01 0.0593 0.123 0.118 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0858 0.144 0.118 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 9.89e-01 0.00191 0.135 0.118 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000953 0.14 0.118 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 1.16e-01 0.222 0.141 0.118 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 3.18e-01 -0.131 0.13 0.118 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 3.72e-01 -0.117 0.131 0.12 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 6.75e-02 0.236 0.129 0.12 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.64e-01 -0.136 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 4.28e-01 0.116 0.146 0.12 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 4.17e-01 0.104 0.128 0.12 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 9.93e-01 0.00102 0.123 0.12 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 2.92e-01 0.141 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 8.23e-01 0.0255 0.114 0.12 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 3.81e-01 0.125 0.143 0.121 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 6.27e-01 0.0671 0.138 0.121 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 1.79e-01 -0.183 0.136 0.121 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 6.35e-01 0.0686 0.144 0.121 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 4.37e-01 -0.112 0.143 0.121 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 3.33e-01 0.146 0.151 0.121 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 3.65e-01 0.136 0.15 0.121 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 2.72e-01 0.134 0.121 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 4.03e-01 -0.109 0.13 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0601 0.13 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0401 0.0696 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 9.18e-01 0.0113 0.109 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 6.40e-02 0.208 0.112 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0182 0.127 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 7.61e-01 0.0311 0.102 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 1.32e-01 -0.198 0.131 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 6.57e-02 0.229 0.124 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 4.62e-01 0.0834 0.113 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0639 0.0626 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0364 0.0899 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0435 0.11 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 3.83e-01 -0.11 0.125 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0307 0.112 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -871725 sc-eQTL 1.70e-01 -0.195 0.142 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 3.48e-01 0.106 0.113 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 5.50e-01 0.0536 0.0895 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 7.08e-01 0.034 0.0906 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 9.15e-01 0.0124 0.117 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 9.09e-03 0.357 0.136 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0883 0.118 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 8.75e-03 0.262 0.0991 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00747 0.0967 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 8.35e-01 0.028 0.134 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 6.35e-01 0.0597 0.126 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 3.66e-01 -0.103 0.113 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 3.73e-01 -0.122 0.137 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 4.35e-01 0.103 0.132 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 7.64e-01 0.0394 0.131 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 1.43e-01 0.182 0.124 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 294064 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0365 0.12 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 668625 sc-eQTL 1.97e-01 0.141 0.109 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 724873 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0178 0.0915 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -829200 sc-eQTL 2.05e-01 -0.153 0.12 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -963212 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0347 0.0824 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -412358 sc-eQTL 5.02e-01 -0.085 0.126 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -540025 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0979 0.117 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 600607 sc-eQTL 6.64e-01 0.0403 0.0926 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000196091 MYBPC1 -700606 pQTL 0.036 0.0603 0.0287 0.0012 0.0 0.0961

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina