logo

Genes within 1Mb (chr12:100861398:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 9.26e-01 -0.011 0.118 0.12 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 8.43e-01 0.02 0.1 0.12 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0872 0.062 0.12 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0874 0.09 0.12 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 7.09e-01 0.0382 0.102 0.12 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00069 0.0881 0.12 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0258 0.1 0.12 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0968 0.127 0.12 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 4.16e-01 0.0729 0.0894 0.12 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0686 0.0833 0.12 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.72e-01 -0.137 0.124 0.12 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0861 0.0862 0.12 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 3.94e-01 0.0814 0.0954 0.12 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0489 0.0934 0.12 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0544 0.0712 0.12 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 5.02e-01 0.0667 0.0992 0.12 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0047 0.0983 0.12 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0839 0.124 0.12 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0445 0.0815 0.12 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 1.19e-01 0.16 0.102 0.12 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 5.09e-02 -0.221 0.113 0.12 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 8.36e-01 0.0191 0.0921 0.12 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0527 0.129 0.122 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 5.00e-01 0.0841 0.124 0.122 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 8.70e-01 0.0193 0.118 0.122 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.12e-01 0.131 0.129 0.122 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 3.39e-01 -0.133 0.139 0.122 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 4.89e-01 0.0995 0.143 0.122 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 3.36e-01 0.133 0.138 0.122 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 9.43e-01 0.00921 0.128 0.122 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 3.72e-01 0.101 0.113 0.12 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 3.78e-01 0.0824 0.0932 0.12 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 5.81e-01 0.0502 0.0907 0.12 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0107 0.114 0.12 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 5.99e-03 0.346 0.125 0.12 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 3.54e-01 -0.108 0.117 0.12 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 7.51e-03 0.258 0.0957 0.12 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0578 0.091 0.12 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 4.04e-01 0.0884 0.106 0.12 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 9.33e-01 0.00737 0.0872 0.12 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.44e-01 -0.127 0.108 0.12 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0452 0.0788 0.12 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 9.65e-01 0.00554 0.127 0.12 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 4.05e-01 -0.097 0.116 0.12 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 9.64e-01 0.0041 0.0898 0.12 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 7.10e-03 -0.334 0.123 0.12 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 3.22e-01 -0.118 0.118 0.12 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.46e-01 -0.141 0.122 0.12 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0989 0.0877 0.12 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 2.86e-01 0.147 0.137 0.12 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 8.18e-01 0.0231 0.1 0.12 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 8.92e-01 0.0149 0.109 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0303 0.145 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 4.33e-01 -0.122 0.155 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0831 0.101 0.14 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0305 0.143 0.14 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 5.96e-01 0.0734 0.138 0.14 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0523 0.143 0.14 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 1.19e-01 0.227 0.145 0.14 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 4.28e-02 -0.227 0.111 0.14 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 1.90e-01 -0.172 0.131 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 4.41e-01 -0.108 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0546 0.076 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 6.33e-01 0.0537 0.112 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00506 0.125 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0287 0.141 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 2.71e-01 0.126 0.114 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 9.87e-02 -0.216 0.13 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 3.11e-01 0.142 0.14 0.119 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 2.55e-01 0.154 0.135 0.119 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 9.49e-01 0.00576 0.0903 0.119 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0548 0.124 0.119 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 6.04e-03 0.37 0.133 0.119 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 5.06e-01 0.0899 0.135 0.119 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 3.11e-01 -0.124 0.123 0.119 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 5.38e-01 0.0803 0.13 0.119 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 2.34e-01 0.149 0.125 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 8.45e-01 0.0235 0.12 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0418 0.0689 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0979 0.0973 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 5.36e-01 0.0718 0.116 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 2.85e-01 -0.138 0.129 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0233 0.113 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 7.20e-02 -0.258 0.143 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 2.36e-01 0.167 0.14 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 6.28e-01 0.0653 0.135 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0386 0.0703 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 4.61e-01 0.0804 0.109 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0172 0.126 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0767 0.139 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0741 0.132 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 7.18e-01 0.0455 0.126 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 2.41e-01 0.171 0.145 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0799 0.144 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 4.33e-01 -0.114 0.145 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 7.15e-01 0.0465 0.127 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 3.26e-01 0.138 0.14 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 4.51e-01 -0.112 0.148 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 1.62e-01 -0.199 0.142 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 4.77e-01 0.0729 0.102 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 2.68e-01 -0.107 0.0964 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 3.68e-01 -0.11 0.122 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0207 0.0944 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00739 0.103 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0369 0.111 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 7.39e-01 0.0286 0.0858 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0223 0.11 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0886 0.115 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.11e-01 -0.161 0.128 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 8.76e-01 0.0155 0.0996 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 8.37e-01 0.0257 0.125 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 7.38e-01 0.0391 0.117 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 2.82e-01 -0.105 0.0976 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 1.07e-01 0.204 0.126 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 3.16e-01 0.126 0.125 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 3.84e-01 -0.11 0.126 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 4.50e-01 0.0997 0.132 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0382 0.124 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0386 0.128 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 4.05e-01 0.0954 0.114 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 2.48e-01 -0.135 0.117 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0504 0.125 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 9.53e-01 0.00595 0.0999 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 8.51e-01 0.0255 0.135 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 3.01e-01 -0.138 0.133 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 3.37e-01 -0.111 0.115 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 7.43e-01 0.0376 0.115 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0703 0.123 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00229 0.128 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 2.72e-01 -0.126 0.115 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 4.79e-02 0.241 0.121 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 5.57e-01 -0.078 0.133 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 6.63e-01 0.0477 0.109 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 3.03e-01 -0.136 0.131 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0571 0.14 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0784 0.123 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.35e-01 0.123 0.127 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 2.85e-02 0.302 0.137 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 8.39e-03 -0.356 0.134 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0839 0.139 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 9.15e-01 0.0142 0.133 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 7.12e-02 0.256 0.141 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 9.41e-01 0.00947 0.128 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.33e-01 -0.132 0.136 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 1.82e-01 0.195 0.146 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0891 0.14 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 2.01e-01 -0.186 0.145 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 1.34e-01 -0.213 0.142 0.119 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 1.13e-01 -0.209 0.131 0.119 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.81e-01 -0.145 0.134 0.119 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 5.73e-01 0.0673 0.119 0.119 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 3.63e-01 0.13 0.143 0.119 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 6.57e-01 0.0647 0.146 0.119 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 4.68e-01 0.09 0.124 0.119 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 1.98e-01 -0.173 0.134 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 2.65e-01 0.144 0.129 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0817 0.104 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0953 0.121 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 5.18e-02 0.273 0.14 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 4.66e-01 -0.101 0.138 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 1.84e-01 -0.172 0.129 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 2.05e-01 0.157 0.123 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0776 0.106 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.07e-01 -0.159 0.125 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 7.50e-01 0.0304 0.0952 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 4.27e-01 0.105 0.132 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 1.61e-01 0.179 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 4.74e-01 0.08 0.112 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 6.32e-01 0.0657 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 6.23e-01 0.0678 0.138 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0141 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.30e-01 -0.104 0.107 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0666 0.14 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 1.73e-01 -0.195 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0277 0.141 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 2.13e-01 -0.154 0.123 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0438 0.115 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.73e-01 -0.133 0.121 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 2.64e-01 -0.103 0.092 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 4.01e-01 -0.108 0.128 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 1.91e-01 -0.169 0.129 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0569 0.108 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0241 0.18 0.122 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 8.41e-01 0.0349 0.173 0.122 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0755 0.107 0.122 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0479 0.153 0.122 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 7.10e-01 0.0656 0.176 0.122 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 2.53e-01 0.124 0.108 0.122 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 7.57e-01 0.0571 0.184 0.122 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 1.86e-02 -0.343 0.144 0.122 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0803 0.14 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 5.70e-01 0.0791 0.139 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 1.02e-01 -0.208 0.127 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.77e-01 0.0834 0.0942 0.12 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 4.35e-01 0.105 0.135 0.12 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 6.22e-01 0.0502 0.102 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 2.81e-01 -0.147 0.136 0.12 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 8.30e-01 -0.028 0.13 0.12 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0782 0.133 0.12 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.48e-01 -0.161 0.139 0.12 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.00e-02 -0.263 0.12 0.12 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 3.16e-01 0.133 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 1.78e-01 0.184 0.137 0.12 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 4.19e-01 -0.102 0.126 0.12 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 7.04e-01 0.0527 0.138 0.12 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 8.00e-01 0.0369 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 9.02e-01 0.0156 0.126 0.12 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 4.10e-01 0.134 0.163 0.12 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 2.97e-01 -0.154 0.147 0.12 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0456 0.153 0.12 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 7.12e-01 0.0514 0.139 0.12 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 8.97e-01 0.0178 0.137 0.12 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 4.32e-01 0.0916 0.116 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 6.26e-01 0.0457 0.0936 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 5.83e-01 0.0506 0.092 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 6.88e-01 0.0492 0.122 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 5.34e-03 0.38 0.135 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0888 0.123 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 1.53e-02 0.274 0.112 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 1.04e-01 -0.161 0.0984 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 9.03e-01 0.0158 0.129 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 7.40e-01 0.0401 0.121 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0458 0.1 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 9.12e-02 -0.205 0.121 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 1.38e-01 0.211 0.142 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 6.58e-01 0.0593 0.134 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 3.12e-01 0.124 0.122 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 7.78e-02 0.213 0.12 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 4.16e-01 -0.137 0.168 0.127 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 4.85e-01 -0.119 0.169 0.127 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 8.31e-01 0.0345 0.161 0.127 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 9.52e-02 -0.202 0.12 0.127 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0985 0.16 0.127 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 3.29e-01 -0.164 0.167 0.127 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 3.92e-01 0.147 0.171 0.127 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 8.95e-01 0.0184 0.14 0.118 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 2.93e-01 -0.149 0.142 0.118 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 6.30e-01 0.0593 0.123 0.118 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0858 0.144 0.118 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 9.89e-01 0.00191 0.135 0.118 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000953 0.14 0.118 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 1.16e-01 0.222 0.141 0.118 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 3.18e-01 -0.131 0.13 0.118 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 3.72e-01 -0.117 0.131 0.12 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 6.75e-02 0.236 0.129 0.12 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.64e-01 -0.136 0.122 0.12 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 4.28e-01 0.116 0.146 0.12 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 4.17e-01 0.104 0.128 0.12 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 9.93e-01 0.00102 0.123 0.12 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 2.92e-01 0.141 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 8.23e-01 0.0255 0.114 0.12 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 3.81e-01 0.125 0.143 0.121 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 6.27e-01 0.0671 0.138 0.121 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 1.79e-01 -0.183 0.136 0.121 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 6.35e-01 0.0686 0.144 0.121 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 4.37e-01 -0.112 0.143 0.121 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 3.33e-01 0.146 0.151 0.121 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 3.65e-01 0.136 0.15 0.121 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 2.72e-01 0.134 0.121 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 4.03e-01 -0.109 0.13 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0601 0.13 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0401 0.0696 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 9.18e-01 0.0113 0.109 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 6.40e-02 0.208 0.112 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0182 0.127 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 7.61e-01 0.0311 0.102 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 1.32e-01 -0.198 0.131 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 6.57e-02 0.229 0.124 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 4.62e-01 0.0834 0.113 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0639 0.0626 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0364 0.0899 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0435 0.11 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 3.83e-01 -0.11 0.125 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0307 0.112 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -878074 sc-eQTL 1.70e-01 -0.195 0.142 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 3.48e-01 0.106 0.113 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 5.50e-01 0.0536 0.0895 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 7.08e-01 0.034 0.0906 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 9.15e-01 0.0124 0.117 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 9.09e-03 0.357 0.136 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0883 0.118 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 8.75e-03 0.262 0.0991 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00747 0.0967 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 8.35e-01 0.028 0.134 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 6.35e-01 0.0597 0.126 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 3.66e-01 -0.103 0.113 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 3.73e-01 -0.122 0.137 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 4.35e-01 0.103 0.132 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 7.64e-01 0.0394 0.131 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 1.43e-01 0.182 0.124 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 287715 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0365 0.12 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 662276 sc-eQTL 1.97e-01 0.141 0.109 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 718524 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0178 0.0915 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -835549 sc-eQTL 2.05e-01 -0.153 0.12 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -969561 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0347 0.0824 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -418707 sc-eQTL 5.02e-01 -0.085 0.126 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -546374 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0979 0.117 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 594258 sc-eQTL 6.64e-01 0.0403 0.0926 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000196091 MYBPC1 -706955 pQTL 0.0359 0.0604 0.0287 0.0012 0.0 0.0961

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina