logo

Genes within 1Mb (chr12:100859677:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0973 0.125 0.111 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 7.30e-01 0.0367 0.106 0.111 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 2.31e-01 -0.079 0.0657 0.111 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0927 0.0952 0.111 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 1.00e+00 5.18e-05 0.109 0.111 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 1.00e+00 2.27e-05 0.0933 0.111 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00229 0.106 0.111 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0502 0.135 0.111 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 5.25e-01 0.0603 0.0946 0.111 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 2.45e-01 -0.103 0.0879 0.111 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 2.25e-01 -0.16 0.131 0.111 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 6.78e-01 -0.038 0.0913 0.111 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 4.57e-01 0.0752 0.101 0.111 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0555 0.0987 0.111 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 6.53e-01 -0.034 0.0753 0.111 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 5.94e-01 0.0563 0.105 0.111 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00496 0.104 0.111 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0915 0.132 0.111 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0523 0.0865 0.111 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 1.15e-01 0.172 0.109 0.111 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 1.33e-01 -0.181 0.12 0.111 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 9.38e-01 0.00758 0.0978 0.111 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0747 0.138 0.113 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 3.09e-01 0.135 0.133 0.113 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 6.70e-01 0.0536 0.126 0.113 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 3.74e-01 0.123 0.138 0.113 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 2.21e-01 -0.181 0.148 0.113 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 6.19e-01 0.0763 0.153 0.113 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 5.94e-01 0.0786 0.147 0.113 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0214 0.137 0.113 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 7.04e-01 0.0458 0.12 0.111 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 7.56e-01 0.0308 0.0991 0.111 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 4.62e-01 0.0709 0.0961 0.111 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00311 0.121 0.111 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 1.66e-02 0.321 0.133 0.111 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 3.92e-01 -0.106 0.124 0.111 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 1.41e-02 0.252 0.102 0.111 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0802 0.0965 0.111 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 2.63e-01 0.125 0.112 0.112 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 8.11e-01 0.0221 0.0923 0.112 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 1.71e-01 -0.157 0.115 0.112 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0435 0.0834 0.112 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 9.42e-01 0.00971 0.134 0.112 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0798 0.123 0.112 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 7.60e-01 0.029 0.095 0.112 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 9.02e-03 -0.346 0.131 0.111 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 4.09e-01 -0.105 0.127 0.111 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 2.24e-01 -0.158 0.13 0.111 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0614 0.0939 0.111 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 2.67e-01 0.163 0.146 0.111 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 9.12e-01 0.0118 0.107 0.111 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 7.67e-01 0.0346 0.117 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0672 0.154 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0763 0.164 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 6.94e-01 -0.042 0.107 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0815 0.152 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 7.59e-01 0.045 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 4.97e-01 -0.103 0.152 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 7.02e-02 0.279 0.153 0.13 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 9.62e-02 -0.198 0.118 0.13 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 1.16e-01 -0.219 0.139 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0987 0.149 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0399 0.081 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 7.44e-01 0.0391 0.12 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 9.53e-01 0.00791 0.133 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0653 0.15 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 2.63e-01 0.137 0.122 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 1.28e-01 -0.212 0.139 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 4.45e-01 0.114 0.149 0.11 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 2.87e-01 0.153 0.144 0.11 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 9.88e-01 0.00142 0.0961 0.11 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 9.94e-01 0.00102 0.132 0.11 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 5.21e-03 0.4 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 4.45e-01 0.11 0.143 0.11 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0771 0.131 0.11 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 3.58e-01 0.128 0.138 0.11 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 4.83e-01 0.0937 0.133 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 8.25e-01 0.0283 0.128 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0549 0.0733 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 2.80e-01 -0.112 0.104 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 8.56e-01 0.0224 0.123 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0923 0.137 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0178 0.121 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 2.15e-01 -0.19 0.153 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 5.58e-01 0.0879 0.15 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 4.54e-01 0.108 0.144 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0531 0.0749 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 5.33e-01 0.0725 0.116 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0943 0.135 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0758 0.148 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0777 0.14 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 5.88e-01 0.0729 0.134 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 2.35e-01 0.179 0.15 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0496 0.149 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 3.61e-01 -0.138 0.15 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 6.44e-01 0.0609 0.132 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 4.00e-01 0.122 0.145 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 5.89e-01 -0.083 0.153 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 3.30e-01 -0.143 0.147 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 6.02e-01 0.0566 0.108 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 2.42e-01 -0.12 0.102 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 3.06e-01 -0.133 0.129 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 1.00e+00 -1.31e-05 0.0999 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 8.53e-01 0.0202 0.109 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0323 0.118 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 5.46e-01 0.0549 0.0907 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0493 0.116 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0578 0.122 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 2.21e-01 -0.167 0.136 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 7.13e-01 0.0389 0.106 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0261 0.132 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 8.56e-01 0.0225 0.124 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0946 0.104 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 1.48e-01 0.195 0.135 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 8.58e-01 0.024 0.134 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 3.54e-01 -0.125 0.135 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0539 0.13 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.08e-01 0.143 0.14 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0228 0.133 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0689 0.136 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 5.92e-01 0.0649 0.121 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 2.43e-01 -0.145 0.124 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0449 0.132 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0218 0.106 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 7.64e-01 0.0429 0.143 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 5.24e-01 -0.09 0.141 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 4.09e-01 -0.101 0.122 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0027 0.122 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0772 0.131 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0265 0.136 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 3.58e-01 -0.113 0.122 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 8.91e-02 0.221 0.129 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0826 0.141 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 6.02e-01 0.0608 0.116 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 3.87e-01 -0.123 0.141 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0482 0.151 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0802 0.132 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 4.73e-01 0.0982 0.137 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 7.01e-02 0.27 0.148 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 2.71e-02 -0.322 0.145 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 1.51e-01 -0.215 0.149 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 7.65e-01 0.0426 0.142 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 8.28e-02 0.264 0.152 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 8.17e-01 0.0316 0.137 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 3.42e-01 -0.139 0.146 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 1.71e-01 0.215 0.156 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0516 0.15 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 4.08e-01 -0.129 0.156 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 1.43e-01 -0.216 0.147 0.11 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 2.89e-01 -0.145 0.137 0.11 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 3.45e-01 -0.132 0.139 0.11 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.124 0.11 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.23e-01 0.147 0.148 0.11 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 5.25e-01 0.0963 0.151 0.11 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 3.92e-01 0.11 0.128 0.11 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 2.35e-01 -0.17 0.143 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 2.76e-01 0.15 0.137 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 1.65e-01 -0.155 0.111 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 3.01e-01 -0.133 0.129 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 1.21e-01 0.233 0.15 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 4.14e-01 -0.12 0.147 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 7.82e-02 -0.243 0.137 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 1.46e-01 0.191 0.131 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0312 0.112 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 3.00e-01 -0.138 0.133 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 7.17e-01 0.0366 0.101 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.78e-01 0.123 0.14 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 1.76e-01 0.183 0.135 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 2.35e-01 0.141 0.118 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 7.10e-01 0.0543 0.146 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 6.23e-01 0.0724 0.147 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0404 0.142 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0659 0.114 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.16e-01 -0.15 0.149 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 1.08e-01 -0.244 0.151 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0586 0.15 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 2.75e-01 -0.143 0.13 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0688 0.122 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 1.67e-01 -0.178 0.128 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 2.84e-01 -0.105 0.0974 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0616 0.136 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 3.63e-01 -0.125 0.137 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 7.41e-01 -0.038 0.115 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0998 0.189 0.115 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0268 0.182 0.115 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00703 0.112 0.115 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0335 0.161 0.115 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0318 0.185 0.115 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 2.47e-01 0.132 0.113 0.115 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 8.73e-01 0.0311 0.194 0.115 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 2.43e-02 -0.346 0.151 0.115 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0786 0.15 0.111 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 9.73e-01 0.00504 0.149 0.111 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 3.35e-02 -0.29 0.135 0.111 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 2.83e-01 0.109 0.101 0.111 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.38e-01 0.138 0.144 0.111 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 6.30e-01 0.0527 0.109 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 1.20e-01 -0.226 0.145 0.111 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0362 0.139 0.111 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 4.12e-01 -0.116 0.142 0.111 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 2.16e-01 -0.184 0.148 0.111 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 3.33e-02 -0.275 0.129 0.111 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 2.39e-01 0.167 0.141 0.111 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 1.57e-01 0.207 0.146 0.111 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0752 0.134 0.111 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 8.42e-01 0.0296 0.148 0.11 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 4.88e-01 0.108 0.155 0.11 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 7.72e-01 0.0391 0.135 0.11 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 4.85e-01 0.122 0.174 0.11 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 1.27e-01 -0.24 0.157 0.11 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00459 0.164 0.11 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 9.23e-01 0.0143 0.148 0.11 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0482 0.146 0.11 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 6.50e-01 0.0563 0.124 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 9.84e-01 0.00198 0.0996 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 5.05e-01 0.0652 0.0977 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 6.38e-01 0.0612 0.13 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 1.46e-02 0.355 0.144 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0581 0.131 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 4.96e-02 0.236 0.12 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 8.68e-02 -0.18 0.105 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 7.42e-01 -0.045 0.137 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0099 0.128 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00828 0.106 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 1.17e-01 -0.203 0.129 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.49e-01 0.142 0.151 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 6.16e-01 0.0715 0.142 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 4.61e-01 0.0958 0.13 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 9.44e-02 0.214 0.128 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 4.08e-01 -0.146 0.175 0.118 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 5.65e-01 -0.102 0.176 0.118 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000933 0.168 0.118 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 1.84e-01 -0.168 0.126 0.118 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.75e-01 -0.148 0.167 0.118 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 1.32e-01 -0.263 0.174 0.118 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 3.90e-01 0.154 0.178 0.118 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 9.18e-01 0.0152 0.148 0.109 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 1.74e-01 -0.205 0.15 0.109 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 5.08e-01 0.0865 0.131 0.109 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0928 0.153 0.109 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 9.71e-01 0.00525 0.144 0.109 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 4.87e-01 -0.103 0.149 0.109 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 1.01e-01 0.246 0.15 0.109 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0993 0.139 0.109 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 3.32e-01 -0.136 0.139 0.111 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 1.65e-01 0.192 0.138 0.111 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 2.77e-01 -0.142 0.13 0.111 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 2.81e-01 0.169 0.156 0.111 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 4.45e-01 0.104 0.136 0.111 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 9.63e-01 0.00604 0.131 0.111 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 2.35e-01 0.17 0.143 0.111 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00804 0.122 0.111 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 5.41e-01 0.0945 0.154 0.11 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 5.35e-01 0.0924 0.149 0.11 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 1.38e-01 -0.218 0.146 0.11 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 7.85e-01 0.0424 0.155 0.11 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.15e-01 -0.156 0.154 0.11 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 6.49e-01 0.0744 0.163 0.11 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 8.05e-01 0.0401 0.162 0.11 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 1.35e-01 0.196 0.13 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 2.14e-01 -0.173 0.139 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0661 0.139 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0273 0.0741 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 8.92e-01 0.0158 0.117 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 5.93e-02 0.226 0.119 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0342 0.136 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 4.97e-01 0.0739 0.109 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 2.41e-01 -0.164 0.139 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 3.00e-01 0.138 0.132 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 3.48e-01 0.113 0.12 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0771 0.0666 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0567 0.0955 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.90e-01 -0.101 0.117 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0913 0.133 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0121 0.119 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -879795 sc-eQTL 3.90e-01 -0.13 0.151 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 6.64e-01 0.0521 0.12 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 9.06e-01 0.0112 0.095 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 5.37e-01 0.0593 0.096 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 8.43e-01 0.0245 0.124 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.65e-02 0.304 0.145 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0642 0.125 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 3.03e-02 0.23 0.106 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 8.76e-01 -0.016 0.103 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 9.21e-01 0.0142 0.143 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 9.23e-01 0.013 0.134 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0942 0.121 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 4.09e-01 -0.121 0.146 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 3.51e-01 0.132 0.141 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0159 0.14 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 6.46e-02 0.245 0.132 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 285994 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0538 0.128 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 660555 sc-eQTL 1.27e-01 0.176 0.115 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 716803 sc-eQTL 9.99e-01 -7.96e-05 0.0967 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -837270 sc-eQTL 1.87e-01 -0.168 0.127 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -971282 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0287 0.0871 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -420428 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0645 0.134 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -548095 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0747 0.124 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 592537 sc-eQTL 3.66e-01 0.0886 0.0977 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000196091 MYBPC1 -708676 pQTL 0.0341 0.0623 0.0294 0.00123 0.0 0.0925

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina