logo

Genes within 1Mb (chr12:100855448:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 5.51e-02 -0.155 0.0806 0.246 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0208 0.0689 0.246 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 9.63e-01 0.00199 0.0428 0.246 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 2.66e-01 0.0688 0.0617 0.246 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 1.56e-01 0.0996 0.07 0.246 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 3.75e-01 0.0536 0.0604 0.246 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 3.10e-01 0.0697 0.0685 0.246 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 1.70e-01 0.119 0.0868 0.246 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0843 0.0623 0.246 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0137 0.0583 0.246 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0416 0.087 0.246 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 4.09e-01 0.0499 0.0603 0.246 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 8.36e-01 0.0139 0.0668 0.246 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 4.69e-01 0.0474 0.0652 0.246 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 5.78e-02 -0.0942 0.0494 0.246 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 5.94e-01 -0.037 0.0694 0.246 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 4.94e-01 0.047 0.0686 0.246 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 8.76e-01 0.0135 0.0868 0.246 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 3.61e-01 0.0521 0.0569 0.246 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00896 0.0719 0.246 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0718 0.0792 0.246 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 5.86e-01 -0.035 0.0643 0.246 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 3.45e-01 0.0845 0.0893 0.248 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0801 0.0862 0.248 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0967 0.0814 0.248 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 1.14e-01 -0.142 0.0893 0.248 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 2.67e-01 0.107 0.096 0.248 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 1.22e-01 0.154 0.099 0.248 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0126 0.0957 0.248 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 5.90e-02 -0.167 0.0882 0.248 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0342 0.0793 0.246 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 8.01e-02 -0.114 0.0648 0.246 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0609 0.0633 0.246 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 8.78e-01 0.0122 0.0795 0.246 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 6.61e-01 0.0389 0.0886 0.246 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0103 0.0816 0.246 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0144 0.068 0.246 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 1.26e-01 0.0974 0.0633 0.246 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0995 0.0737 0.242 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00384 0.061 0.242 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 9.94e-01 0.000561 0.0761 0.242 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 3.89e-01 0.0475 0.0551 0.242 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 1.63e-01 0.124 0.0883 0.242 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 3.21e-01 -0.081 0.0814 0.242 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0396 0.0627 0.242 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 8.13e-02 0.151 0.086 0.246 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00898 0.0823 0.246 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0423 0.0844 0.246 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 1.75e-01 0.0827 0.0607 0.246 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 2.49e-01 -0.11 0.0949 0.246 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 6.37e-02 -0.128 0.0688 0.246 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0445 0.0757 0.246 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 3.35e-01 -0.105 0.108 0.245 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 8.36e-01 0.0241 0.116 0.245 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 5.00e-01 0.0509 0.0753 0.245 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0688 0.107 0.245 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 1.36e-01 0.154 0.103 0.245 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 2.23e-01 0.13 0.107 0.245 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 2.95e-01 -0.114 0.109 0.245 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 5.42e-03 0.232 0.0823 0.245 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0606 0.0922 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0319 0.0985 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 2.37e-01 0.0634 0.0534 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 1.97e-02 0.184 0.0782 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 5.94e-01 0.047 0.0879 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 3.26e-01 0.0972 0.0988 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00333 0.0807 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 2.37e-02 0.208 0.0912 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 1.12e-01 -0.157 0.0986 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0816 0.0954 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 4.94e-01 0.0436 0.0636 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0254 0.0872 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 8.29e-01 0.0207 0.0958 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 1.57e-01 0.134 0.0948 0.248 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 5.29e-01 0.0546 0.0866 0.248 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0262 0.0919 0.248 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 7.47e-03 -0.232 0.0859 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 7.95e-01 0.0218 0.0836 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 3.73e-01 0.0428 0.048 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 2.02e-01 0.0866 0.0677 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 3.49e-01 0.0757 0.0806 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0603 0.09 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 5.88e-01 0.0428 0.079 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 9.64e-01 0.00453 0.1 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 5.43e-01 0.0604 0.099 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 7.60e-01 -0.029 0.0949 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 4.99e-01 0.0335 0.0495 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0139 0.0768 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 8.80e-01 0.0135 0.089 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 7.55e-01 0.0305 0.0977 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0417 0.0928 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0142 0.0887 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 2.14e-01 -0.124 0.0993 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0297 0.0987 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 4.63e-01 0.0731 0.0995 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0428 0.087 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 8.87e-01 0.0137 0.0958 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 9.37e-01 -0.008 0.101 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 1.16e-01 0.153 0.0968 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0417 0.0718 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0133 0.0678 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0425 0.0858 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 1.36e-01 0.0986 0.0659 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 2.45e-01 0.0837 0.0719 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00637 0.0782 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0479 0.0601 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0288 0.0769 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 8.92e-01 -0.011 0.0809 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00266 0.0903 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0486 0.0698 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 5.86e-01 0.0477 0.0874 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 2.67e-01 0.0909 0.0816 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0755 0.0685 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 8.17e-02 -0.155 0.0885 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 8.65e-01 -0.015 0.0883 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 2.14e-01 -0.11 0.0886 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 6.11e-01 0.0436 0.0856 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 1.72e-01 -0.126 0.0922 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 7.32e-01 0.0301 0.0875 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 1.84e-02 -0.21 0.0886 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0821 0.0806 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 5.14e-01 0.054 0.0827 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 1.45e-01 -0.128 0.0877 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0389 0.0704 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 5.99e-01 0.0502 0.0953 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0651 0.0942 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 3.16e-01 0.0817 0.0814 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0217 0.0815 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 5.40e-01 0.0537 0.0874 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0205 0.0911 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 5.45e-01 0.0495 0.0817 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 6.54e-01 0.0391 0.0869 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 1.64e-01 -0.131 0.094 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 7.29e-01 -0.027 0.0778 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 6.68e-01 0.0416 0.0966 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 1.46e-01 -0.15 0.103 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0501 0.0902 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 6.13e-01 0.0473 0.0933 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 8.37e-01 -0.021 0.102 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 8.73e-01 -0.016 0.1 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 3.17e-01 -0.103 0.102 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 2.25e-01 -0.115 0.0946 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 9.17e-01 0.0107 0.102 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 2.50e-01 0.105 0.0909 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 1.78e-01 0.131 0.0972 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 1.32e-01 -0.157 0.104 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0672 0.1 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0634 0.104 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0142 0.0985 0.247 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 1.88e-01 0.12 0.0909 0.247 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0837 0.0929 0.247 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 8.22e-01 0.0186 0.0825 0.247 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0874 0.0987 0.247 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 6.21e-02 -0.188 0.1 0.247 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0361 0.0856 0.247 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 8.37e-01 0.0197 0.0959 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 7.60e-01 0.0281 0.0919 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 7.53e-01 0.0235 0.0746 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 9.14e-02 0.145 0.0856 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0525 0.101 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 6.20e-02 -0.183 0.0975 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 2.92e-01 0.0975 0.0922 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0877 0.0869 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 9.39e-01 0.00566 0.0744 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00194 0.0886 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 6.09e-01 0.0343 0.0669 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 8.42e-02 0.16 0.0923 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 2.37e-01 -0.106 0.0896 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 6.69e-02 -0.144 0.0779 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 5.06e-02 -0.189 0.0961 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0997 0.0976 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 2.82e-01 0.102 0.0941 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0437 0.0757 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 8.72e-01 0.016 0.0991 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 9.18e-02 -0.17 0.101 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 1.97e-01 0.129 0.0996 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0981 0.0857 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00619 0.08 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 7.89e-01 0.0227 0.0845 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00809 0.0642 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0147 0.0895 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 2.96e-01 0.0941 0.0898 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 3.95e-01 0.0641 0.0752 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 4.59e-02 -0.251 0.124 0.267 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 2.07e-01 -0.154 0.121 0.267 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0124 0.0752 0.267 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 4.50e-01 0.0818 0.108 0.267 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0417 0.124 0.267 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 5.36e-02 -0.146 0.075 0.267 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 9.29e-01 0.0116 0.13 0.267 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 3.90e-01 0.0893 0.103 0.267 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0106 0.0968 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0282 0.0965 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 2.73e-01 -0.097 0.0882 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 8.18e-02 0.114 0.0649 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0411 0.0934 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0436 0.0706 0.246 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 2.37e-01 -0.111 0.0939 0.246 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0945 0.0918 0.246 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0146 0.0942 0.246 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000838 0.0988 0.246 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 6.87e-01 0.0348 0.0863 0.246 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0346 0.094 0.246 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0599 0.0971 0.246 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0302 0.0891 0.246 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 9.58e-01 0.00518 0.0973 0.249 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0979 0.102 0.249 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 9.14e-02 -0.15 0.0881 0.249 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 3.73e-01 -0.102 0.114 0.249 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 1.45e-01 0.151 0.103 0.249 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 2.41e-02 0.242 0.106 0.249 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 6.97e-01 -0.038 0.0975 0.249 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 1.11e-01 -0.153 0.0957 0.249 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 7.74e-01 0.0235 0.0817 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0344 0.0656 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0422 0.0644 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 9.10e-01 0.00965 0.0856 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0693 0.0962 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 4.51e-02 0.172 0.0854 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 2.82e-01 0.0857 0.0795 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 3.08e-02 0.149 0.0686 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0929 0.0904 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0436 0.0851 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0077 0.0706 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 5.48e-01 0.0516 0.0857 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 2.05e-01 0.127 0.1 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 6.59e-02 -0.173 0.0937 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0959 0.0859 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0566 0.0852 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0427 0.118 0.236 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 2.32e-02 -0.268 0.117 0.236 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 8.29e-01 0.0244 0.113 0.236 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 1.39e-01 0.125 0.0843 0.236 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0303 0.112 0.236 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 1.55e-01 0.167 0.117 0.236 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0616 0.12 0.236 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 5.32e-01 -0.062 0.0991 0.244 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 7.09e-03 -0.27 0.0991 0.244 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 5.67e-01 0.0501 0.0873 0.244 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 6.65e-01 0.0445 0.103 0.244 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0318 0.096 0.244 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 1.45e-01 -0.145 0.0989 0.244 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0412 0.101 0.244 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 3.18e-02 0.199 0.0919 0.244 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 7.70e-01 0.0274 0.0935 0.242 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 8.42e-01 0.0185 0.0927 0.242 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 8.19e-01 0.02 0.0873 0.242 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 6.84e-01 0.0426 0.105 0.242 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 7.82e-01 0.0253 0.0914 0.242 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0763 0.0877 0.242 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 1.61e-01 -0.134 0.0955 0.242 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0258 0.0817 0.242 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 4.20e-01 0.0816 0.101 0.251 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0871 0.0972 0.251 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 1.84e-01 -0.128 0.0956 0.251 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 2.87e-01 -0.108 0.101 0.251 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 3.53e-01 0.0941 0.101 0.251 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 3.37e-01 0.102 0.106 0.251 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 7.06e-01 0.04 0.106 0.251 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0922 0.0855 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0966 0.0918 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000658 0.0918 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 2.70e-01 0.0541 0.0489 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 1.63e-01 0.108 0.0768 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 1.70e-01 0.109 0.0791 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 4.27e-02 0.181 0.0889 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 8.02e-01 0.018 0.0719 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 7.55e-03 0.245 0.091 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 8.29e-02 -0.151 0.0865 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 9.24e-01 0.00753 0.079 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 2.63e-01 0.049 0.0437 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 3.93e-01 0.0536 0.0626 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 2.86e-01 0.0818 0.0765 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0149 0.0875 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 7.27e-01 0.0273 0.0779 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -884024 sc-eQTL 9.52e-01 0.00593 0.0992 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0536 0.0793 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0373 0.0629 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0349 0.0636 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0104 0.0819 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 7.16e-01 0.0353 0.0968 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 6.59e-01 0.0366 0.0828 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 6.89e-01 0.0283 0.0707 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 2.01e-01 0.0868 0.0677 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 3.73e-01 -0.085 0.0952 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 1.25e-01 -0.137 0.0888 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0182 0.0806 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 4.73e-01 0.0701 0.0975 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0292 0.0939 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 1.77e-01 -0.126 0.0929 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 2.31e-01 -0.106 0.0881 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 281765 sc-eQTL 5.80e-01 0.0472 0.0852 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 656326 sc-eQTL 1.08e-01 -0.122 0.0759 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 712574 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0284 0.0641 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0016 0.0844 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -975511 sc-eQTL 4.99e-01 0.0391 0.0577 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -424657 sc-eQTL 1.35e-01 0.132 0.0882 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -552324 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0326 0.0823 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 588308 sc-eQTL 3.56e-01 -0.06 0.0648 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 eQTL 2.00e-02 -0.0617 0.0265 0.0 0.0 0.291

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111647 \N 712574 3.07e-07 1.56e-07 5.49e-08 2.24e-07 1.03e-07 8.75e-08 2.1e-07 5.56e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.63e-07 1.23e-07 2.29e-07 8e-08 5.94e-08 7.89e-08 4.18e-08 1.64e-07 7.18e-08 5.87e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.62e-07 3.49e-08 2.09e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.1e-07 1.34e-07 1.05e-07 1.14e-07 3.72e-08 3.21e-08 9.81e-08 4.78e-08 2.95e-08 3.7e-08 8.17e-08 6.62e-08 5.35e-08 5.04e-08 1.59e-07 4.87e-08 1.09e-08 3.2e-08 1.71e-08 8.46e-08 1.92e-09 4.99e-08
ENSG00000111666 CHPT1 -841499 2.76e-07 1.35e-07 4.08e-08 1.97e-07 9.24e-08 8.45e-08 1.6e-07 5.53e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.05e-07 1.69e-07 7.37e-08 5.91e-08 7.36e-08 4.09e-08 1.33e-07 5.97e-08 4.89e-08 1.19e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.64e-08 1.63e-07 1.25e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.16e-07 1.05e-07 1.02e-07 3.1e-08 3.96e-08 8.56e-08 3.52e-08 3.49e-08 5.7e-08 8.63e-08 6.57e-08 4.55e-08 5.44e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.86e-08 4.7e-08 1.86e-08 1.2e-07 3.79e-09 4.94e-08