logo

Genes within 1Mb (chr12:100841906:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 4.41e-02 -0.163 0.0806 0.248 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0265 0.069 0.248 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 8.38e-01 0.00874 0.0428 0.248 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 3.04e-01 0.0637 0.0618 0.248 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 1.37e-01 0.104 0.07 0.248 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 3.58e-01 0.0556 0.0604 0.248 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 3.40e-01 0.0656 0.0686 0.248 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 1.35e-01 0.13 0.0868 0.248 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0816 0.0623 0.248 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0109 0.0583 0.248 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0318 0.087 0.248 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 5.64e-01 0.0348 0.0603 0.248 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 9.03e-01 0.00816 0.0668 0.248 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 4.26e-01 0.0519 0.0652 0.248 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 7.22e-02 -0.0893 0.0494 0.248 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0354 0.0693 0.248 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 4.12e-01 0.0564 0.0685 0.248 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 8.16e-01 0.0202 0.0867 0.248 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.00e-01 0.0479 0.0568 0.248 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0103 0.0719 0.248 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0634 0.0792 0.248 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0397 0.0642 0.248 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 3.17e-01 0.0895 0.0892 0.25 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0785 0.0861 0.25 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0856 0.0814 0.25 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 1.36e-01 -0.133 0.0893 0.25 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 2.59e-01 0.109 0.0959 0.25 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0989 0.25 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0144 0.0956 0.25 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 7.01e-02 -0.161 0.0882 0.25 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0396 0.079 0.248 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 8.12e-02 -0.113 0.0646 0.248 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0515 0.0631 0.248 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 9.70e-01 0.00296 0.0792 0.248 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 6.84e-01 0.036 0.0883 0.248 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00144 0.0813 0.248 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0195 0.0678 0.248 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 1.40e-01 0.0936 0.0631 0.248 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 1.74e-01 -0.101 0.0736 0.245 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 9.57e-01 0.0033 0.061 0.245 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 8.66e-01 0.0128 0.0761 0.245 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.07e-01 0.0457 0.0551 0.245 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 1.98e-01 0.114 0.0884 0.245 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0814 0.0814 0.245 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0465 0.0627 0.245 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 7.82e-02 0.152 0.086 0.248 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00555 0.0822 0.248 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0356 0.0844 0.248 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 1.61e-01 0.0852 0.0606 0.248 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 2.48e-01 -0.11 0.0948 0.248 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 7.86e-02 -0.122 0.0689 0.248 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0405 0.0757 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 3.54e-01 -0.1 0.108 0.247 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 8.92e-01 0.0158 0.116 0.247 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 4.83e-01 0.0529 0.0752 0.247 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0705 0.107 0.247 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 2.11e-01 0.129 0.103 0.247 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 2.22e-01 0.13 0.106 0.247 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0927 0.109 0.247 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 6.70e-03 0.226 0.0822 0.247 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 5.52e-01 -0.055 0.0922 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0277 0.0984 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 1.94e-01 0.0694 0.0533 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 1.96e-02 0.184 0.0781 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 5.70e-01 0.05 0.0879 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 3.46e-01 0.0933 0.0987 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0163 0.0806 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 2.24e-02 0.209 0.0911 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 1.03e-01 -0.161 0.0986 0.25 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0874 0.0954 0.25 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 3.50e-01 0.0596 0.0636 0.25 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0243 0.0872 0.25 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 8.65e-01 0.0163 0.0958 0.25 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 1.74e-01 0.129 0.0948 0.25 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 5.51e-01 0.0517 0.0866 0.25 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0281 0.0919 0.25 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 5.18e-03 -0.242 0.0857 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 7.90e-01 0.0223 0.0836 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 3.24e-01 0.0474 0.048 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 2.06e-01 0.0859 0.0678 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 3.41e-01 0.077 0.0806 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0529 0.0901 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 6.37e-01 0.0373 0.079 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 8.05e-01 0.0248 0.1 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 5.44e-01 0.0602 0.0989 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 6.51e-01 -0.043 0.0949 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 4.62e-01 0.0365 0.0494 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0295 0.0767 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 8.08e-01 0.0216 0.089 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 7.98e-01 0.025 0.0976 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0211 0.0928 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0119 0.0887 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 1.45e-01 -0.145 0.0992 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00373 0.0988 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 3.92e-01 0.0854 0.0995 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0527 0.0871 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 9.70e-01 0.00366 0.0958 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 9.28e-01 0.00915 0.102 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 9.11e-02 0.164 0.0968 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0406 0.0718 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0164 0.0678 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0349 0.0858 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 1.86e-01 0.0874 0.0659 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 2.55e-01 0.082 0.0719 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0014 0.0781 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0414 0.0601 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0233 0.0769 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 8.53e-01 -0.015 0.0809 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 9.30e-01 0.00791 0.0903 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0547 0.0698 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 6.08e-01 0.0448 0.0874 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 2.18e-01 0.101 0.0815 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0787 0.0684 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 8.65e-02 -0.152 0.0885 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0124 0.0883 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0963 0.0886 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 7.48e-01 0.0276 0.0856 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 1.35e-01 -0.138 0.0921 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 8.90e-01 0.0121 0.0875 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 1.49e-02 -0.217 0.0884 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0826 0.0806 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 4.21e-01 0.0665 0.0826 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 1.59e-01 -0.124 0.0877 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0382 0.0704 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 5.83e-01 0.0524 0.0952 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0586 0.0941 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 3.79e-01 0.0718 0.0814 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0174 0.0815 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 4.87e-01 0.0608 0.0874 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0159 0.0911 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 6.53e-01 0.0368 0.0817 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 6.24e-01 0.0427 0.0869 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 1.83e-01 -0.126 0.094 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 7.67e-01 -0.023 0.0778 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 7.24e-01 0.0341 0.0967 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 1.17e-01 -0.161 0.103 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0424 0.0902 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 7.39e-01 0.0312 0.0934 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0213 0.102 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0076 0.1 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 2.87e-01 -0.109 0.102 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 2.69e-01 -0.105 0.0947 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 9.18e-01 0.0105 0.102 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0908 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 1.96e-01 0.126 0.0972 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 9.94e-02 -0.172 0.104 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 5.23e-01 -0.064 0.1 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0675 0.104 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0155 0.0985 0.249 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 1.81e-01 0.122 0.0909 0.249 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0755 0.093 0.249 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 7.73e-01 0.0239 0.0825 0.249 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0911 0.0987 0.249 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 7.65e-02 -0.178 0.1 0.249 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 6.84e-01 -0.035 0.0856 0.249 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 9.29e-01 0.00859 0.0957 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 7.48e-01 0.0295 0.0917 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 6.94e-01 0.0293 0.0744 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 1.07e-01 0.138 0.0854 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 5.44e-01 -0.061 0.1 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 6.11e-02 -0.183 0.0973 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 4.34e-01 0.0722 0.0921 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0852 0.0869 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 8.73e-01 0.0119 0.0743 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 8.82e-01 0.0132 0.0885 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 6.26e-01 0.0327 0.0669 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 1.02e-01 0.152 0.0923 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 2.46e-01 -0.104 0.0896 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 4.80e-02 -0.155 0.0778 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 5.64e-02 -0.184 0.0961 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0921 0.0976 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 2.36e-01 0.112 0.094 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0515 0.0757 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 9.01e-01 0.0124 0.0991 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 8.89e-02 -0.172 0.1 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 1.83e-01 0.133 0.0996 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 2.34e-01 -0.102 0.0856 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00303 0.0799 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 6.97e-01 0.033 0.0844 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00585 0.0641 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 8.14e-01 -0.021 0.0894 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 3.14e-01 0.0904 0.0897 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 3.53e-01 0.0699 0.075 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 4.59e-02 -0.251 0.124 0.267 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 2.07e-01 -0.154 0.121 0.267 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0124 0.0752 0.267 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.50e-01 0.0818 0.108 0.267 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0417 0.124 0.267 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 5.36e-02 -0.146 0.075 0.267 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 9.29e-01 0.0116 0.13 0.267 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 3.90e-01 0.0893 0.103 0.267 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 9.86e-01 0.0017 0.0968 0.248 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0264 0.0965 0.248 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0906 0.0882 0.248 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 8.71e-02 0.112 0.0649 0.248 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0246 0.0934 0.248 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0377 0.0706 0.248 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0877 0.094 0.248 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0992 0.0917 0.248 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00222 0.0941 0.248 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 9.34e-01 0.00821 0.0987 0.248 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 8.72e-01 0.0139 0.0862 0.248 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0424 0.0939 0.248 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0674 0.097 0.248 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0298 0.089 0.248 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 8.99e-01 0.0123 0.0971 0.251 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0986 0.102 0.251 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 1.20e-01 -0.137 0.088 0.251 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0881 0.114 0.251 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 1.24e-01 0.159 0.103 0.251 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 2.40e-02 0.241 0.106 0.251 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0427 0.0972 0.251 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 1.33e-01 -0.144 0.0955 0.251 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 6.98e-01 0.0317 0.0815 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0384 0.0654 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0318 0.0643 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00495 0.0854 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0713 0.0959 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 4.66e-02 0.171 0.0852 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 3.36e-01 0.0764 0.0793 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 2.99e-02 0.15 0.0685 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0977 0.0902 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0401 0.085 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0111 0.0704 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.80e-01 0.0605 0.0855 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 1.46e-01 0.146 0.0998 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 7.64e-02 -0.167 0.0936 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 2.90e-01 -0.091 0.0858 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0703 0.085 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0436 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 2.70e-02 -0.261 0.117 0.239 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 7.34e-01 0.0385 0.113 0.239 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 1.56e-01 0.12 0.0844 0.239 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0352 0.112 0.239 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 1.90e-01 0.154 0.117 0.239 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0721 0.12 0.239 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0815 0.0987 0.247 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 8.49e-03 -0.263 0.0989 0.247 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 5.02e-01 0.0584 0.087 0.247 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 6.07e-01 0.0527 0.102 0.247 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0533 0.0956 0.247 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 2.27e-01 -0.12 0.0987 0.247 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0385 0.1 0.247 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 5.05e-02 0.181 0.0917 0.247 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 8.68e-01 0.0155 0.0933 0.244 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 7.56e-01 0.0288 0.0925 0.244 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 6.52e-01 0.0393 0.0871 0.244 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 7.88e-01 0.0281 0.104 0.244 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 8.96e-01 0.0119 0.0912 0.244 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0707 0.0875 0.244 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 1.32e-01 -0.144 0.0952 0.244 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0296 0.0816 0.244 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 4.39e-01 0.078 0.101 0.254 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 4.47e-01 -0.074 0.0971 0.254 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 2.27e-01 -0.116 0.0956 0.254 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 2.52e-01 -0.116 0.101 0.254 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 3.99e-01 0.0854 0.101 0.254 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 3.12e-01 0.108 0.106 0.254 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 6.89e-01 0.0424 0.106 0.254 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0956 0.0854 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0981 0.0918 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00204 0.0918 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 1.96e-01 0.0634 0.0489 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 1.61e-01 0.108 0.0767 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 1.83e-01 0.106 0.0791 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 5.00e-02 0.175 0.089 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 9.08e-01 0.0083 0.0719 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 8.11e-03 0.243 0.091 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 6.09e-02 -0.163 0.0863 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 9.68e-01 0.0032 0.079 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 2.17e-01 0.0541 0.0436 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.67e-01 0.0456 0.0626 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 2.61e-01 0.0862 0.0765 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00987 0.0875 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 7.10e-01 0.029 0.0779 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -897566 sc-eQTL 8.14e-01 0.0233 0.0992 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0502 0.0792 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0377 0.0628 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0285 0.0635 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0178 0.0818 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 6.67e-01 0.0417 0.0966 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 6.34e-01 0.0394 0.0826 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 7.44e-01 0.0231 0.0706 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 2.16e-01 0.0839 0.0675 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 2.69e-01 -0.105 0.0948 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 1.56e-01 -0.126 0.0886 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000293 0.0804 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 4.94e-01 0.0666 0.0973 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0507 0.0936 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 2.49e-01 -0.107 0.0927 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 1.98e-01 -0.113 0.0878 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 268223 sc-eQTL 6.83e-01 0.0347 0.085 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 642784 sc-eQTL 1.07e-01 -0.123 0.0759 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 699032 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0215 0.0641 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 sc-eQTL 8.88e-01 0.0119 0.0844 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -989053 sc-eQTL 5.03e-01 0.0387 0.0577 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -438199 sc-eQTL 1.64e-01 0.123 0.0883 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -565866 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0329 0.0823 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 574766 sc-eQTL 3.40e-01 -0.062 0.0648 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 eQTL 1.31e-02 -0.0658 0.0265 0.0 0.0 0.288

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111647 \N 699032 2.6e-07 1.06e-07 3.35e-08 1.82e-07 9.91e-08 9.36e-08 1.42e-07 5.49e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 8.03e-08 1.27e-07 6.21e-08 5.4e-08 8.01e-08 4.94e-08 1.07e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.06e-07 1.33e-07 1.29e-07 4.67e-08 1.31e-07 1.13e-07 1.1e-07 8.7e-08 9.97e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.98e-08 2.91e-08 8.65e-08 8.96e-08 3.97e-08 5.45e-08 9.49e-08 7.63e-08 3.87e-08 5e-08 1.37e-07 4.12e-08 1.18e-08 8.79e-08 1.7e-08 1.25e-07 3.99e-09 4.77e-08
ENSG00000111666 CHPT1 -855041 2.6e-07 1.08e-07 3.44e-08 1.79e-07 1.02e-07 9.13e-08 1.39e-07 5.21e-08 1.36e-07 4.23e-08 1.61e-07 7.58e-08 1.21e-07 6.21e-08 5.14e-08 7.87e-08 5.12e-08 1.06e-07 5.22e-08 3.89e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 4.98e-08 1.32e-07 1.09e-07 1.13e-07 8.71e-08 1.03e-07 1.09e-07 9.75e-08 3.76e-08 2.74e-08 8.21e-08 9.15e-08 3.93e-08 5.02e-08 9.35e-08 8.19e-08 3.18e-08 3.89e-08 1.4e-07 3.91e-08 2.4e-08 9.88e-08 1.74e-08 1.27e-07 4.2e-09 4.74e-08