logo

Genes within 1Mb (chr12:100830960:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 9.95e-01 0.000533 0.0899 0.201 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 1.64e-01 0.106 0.0759 0.201 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 8.54e-02 0.0812 0.047 0.201 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0843 0.0682 0.201 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 1.40e-01 -0.115 0.0774 0.201 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 7.94e-01 0.0174 0.0669 0.201 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0177 0.076 0.201 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 6.27e-01 0.0469 0.0965 0.201 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0319 0.0679 0.201 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 3.42e-01 0.0601 0.0631 0.201 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.16e-01 0.148 0.0939 0.201 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 6.92e-01 0.0259 0.0655 0.201 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 3.27e-01 -0.071 0.0723 0.201 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 6.02e-01 0.0369 0.0708 0.201 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 4.88e-01 0.0375 0.054 0.201 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0159 0.0752 0.201 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0121 0.0744 0.201 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.15e-01 0.148 0.0935 0.201 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 5.07e-01 0.041 0.0617 0.201 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 7.84e-03 0.206 0.0766 0.201 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 3.37e-02 0.182 0.085 0.201 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 2.66e-01 0.0775 0.0695 0.201 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 7.64e-01 0.0303 0.101 0.2 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0811 0.0972 0.2 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 3.94e-01 0.0785 0.0919 0.2 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 4.56e-02 0.202 0.1 0.2 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 4.31e-01 0.0854 0.108 0.2 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 9.10e-02 -0.189 0.111 0.2 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 9.93e-01 0.000955 0.108 0.2 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 7.26e-01 0.0351 0.1 0.2 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0149 0.0855 0.201 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 1.91e-01 0.0919 0.0701 0.201 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 3.57e-01 0.063 0.0682 0.201 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0144 0.0857 0.201 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 6.35e-01 0.0454 0.0955 0.201 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 2.08e-01 0.111 0.0876 0.201 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 7.65e-03 -0.194 0.0721 0.201 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0308 0.0686 0.201 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0499 0.0798 0.202 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 5.59e-01 0.0385 0.0658 0.202 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 2.38e-01 0.0969 0.0818 0.202 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 1.57e-01 0.0841 0.0592 0.202 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 8.42e-01 0.0191 0.0958 0.202 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0543 0.088 0.202 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0145 0.0678 0.202 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 8.75e-01 -0.015 0.0953 0.201 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0771 0.0903 0.201 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.90e-01 0.122 0.0925 0.201 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 8.08e-01 0.0163 0.067 0.201 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 2.64e-01 -0.117 0.104 0.201 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 1.20e-01 0.118 0.0759 0.201 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 3.52e-01 0.0776 0.0832 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 1.76e-01 -0.165 0.122 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 2.98e-01 -0.136 0.13 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00589 0.0849 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 4.77e-01 0.0859 0.12 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 3.00e-01 -0.121 0.116 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 4.21e-01 0.0971 0.12 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 2.90e-01 -0.13 0.122 0.191 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 1.91e-01 0.124 0.0943 0.191 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.51e-01 0.0629 0.105 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 3.58e-01 0.103 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 6.87e-01 0.0247 0.0612 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.0902 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0708 0.1 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0565 0.113 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 1.44e-01 0.135 0.0917 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0949 0.105 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.69e-01 0.0638 0.112 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 9.54e-01 0.00617 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 7.15e-01 0.0263 0.0718 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0277 0.0983 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 8.66e-01 0.0182 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0933 0.107 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 4.10e-01 0.0805 0.0976 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 4.14e-01 0.0847 0.103 0.203 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0129 0.097 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 5.96e-01 0.0493 0.0929 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 4.05e-01 0.0445 0.0533 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0923 0.0753 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0605 0.0896 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 2.27e-01 0.121 0.0998 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 9.59e-01 0.0045 0.0878 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 1.37e-01 0.166 0.111 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 2.07e-01 -0.139 0.11 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 3.58e-01 0.0973 0.106 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 5.44e-01 0.0335 0.0552 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 6.00e-01 0.045 0.0855 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0867 0.099 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 7.94e-01 0.0284 0.109 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 9.72e-01 0.00364 0.103 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0318 0.0989 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 7.76e-01 0.0317 0.111 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 1.95e-01 0.143 0.11 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0399 0.111 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 9.47e-02 -0.162 0.0966 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0353 0.107 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 4.46e-01 0.0864 0.113 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 2.07e-01 -0.137 0.108 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0425 0.0775 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 5.43e-01 0.0445 0.0731 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.68e-01 0.128 0.0923 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 8.68e-01 0.0119 0.0715 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0391 0.0778 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 7.27e-01 0.0294 0.0844 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 7.83e-01 0.0179 0.0649 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0153 0.083 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 3.57e-01 0.0804 0.0871 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 7.31e-02 0.174 0.0966 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 8.54e-01 0.0139 0.0753 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0774 0.0941 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 9.59e-01 0.00449 0.0882 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0567 0.0739 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0166 0.0978 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00834 0.0968 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.01e-01 0.16 0.0969 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 3.75e-01 0.0834 0.0937 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0954 0.101 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 1.00e-01 0.158 0.0954 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 1.02e-01 0.161 0.0978 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0585 0.0885 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 9.10e-01 0.0103 0.0907 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 5.55e-01 0.0571 0.0965 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 1.09e-02 0.195 0.076 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 6.49e-02 0.192 0.104 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 9.29e-03 0.267 0.102 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0443 0.0893 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0269 0.0873 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 9.19e-01 0.00955 0.0937 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.30e-01 0.147 0.0971 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0465 0.0876 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 1.74e-01 0.126 0.0928 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 6.41e-01 0.0473 0.101 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 5.20e-01 0.0536 0.0833 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 1.50e-01 0.148 0.103 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 5.15e-01 0.0718 0.11 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.95e-01 0.125 0.0959 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 7.67e-01 0.0295 0.0996 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 2.36e-02 0.245 0.107 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 7.67e-01 0.0317 0.107 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 7.52e-02 0.194 0.108 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0521 0.106 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 8.39e-01 0.0231 0.114 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 7.48e-01 0.0327 0.102 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0578 0.109 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0436 0.117 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 4.02e-01 0.094 0.112 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 4.89e-01 0.0806 0.116 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 9.68e-01 0.0043 0.107 0.199 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 2.03e-01 -0.127 0.0992 0.199 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 2.20e-01 0.125 0.101 0.199 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0809 0.0898 0.199 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 2.91e-01 -0.114 0.108 0.199 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 2.40e-01 0.129 0.11 0.199 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 6.35e-01 0.0443 0.0934 0.199 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 8.22e-01 0.0234 0.104 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 1.72e-01 0.136 0.0994 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0834 0.0808 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 8.31e-01 -0.02 0.0936 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 9.26e-01 0.0101 0.109 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 7.22e-01 0.038 0.107 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 5.78e-01 -0.056 0.1 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0342 0.0931 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 6.49e-01 0.0363 0.0795 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 8.23e-02 0.164 0.094 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 2.64e-01 0.08 0.0714 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 5.81e-02 -0.188 0.0986 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0543 0.0961 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 5.96e-01 0.0446 0.0839 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0328 0.108 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 7.92e-02 0.19 0.108 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 2.18e-01 0.129 0.104 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 5.15e-03 0.234 0.0825 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 7.42e-01 0.0363 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 1.60e-01 0.158 0.112 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 4.47e-03 -0.313 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.29e-01 0.0594 0.0942 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 6.33e-01 -0.042 0.0877 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 3.17e-01 0.0928 0.0925 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 4.53e-01 0.0528 0.0703 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 1.74e-02 0.232 0.0969 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 2.58e-01 -0.112 0.0985 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 8.44e-01 0.0163 0.0826 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.02e-01 0.0909 0.135 0.219 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 7.13e-01 0.048 0.13 0.219 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.81e-01 0.107 0.0795 0.219 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 6.09e-01 0.059 0.115 0.219 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0776 0.132 0.219 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 6.80e-02 0.148 0.0801 0.219 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0797 0.138 0.219 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 6.09e-01 0.0566 0.111 0.219 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 7.62e-01 0.0324 0.107 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0535 0.106 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 2.11e-01 0.122 0.0972 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 6.53e-01 0.0325 0.0722 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 2.82e-01 -0.111 0.103 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0249 0.078 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 4.97e-01 0.0707 0.104 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 1.83e-02 0.239 0.101 0.201 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 4.56e-01 0.0778 0.104 0.201 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 7.40e-02 0.195 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 3.47e-01 0.0899 0.0954 0.201 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0847 0.104 0.201 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 5.41e-01 0.0658 0.108 0.201 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00712 0.0988 0.201 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 7.78e-01 0.0294 0.104 0.198 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 9.67e-01 -0.0045 0.11 0.198 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 5.16e-02 0.184 0.0941 0.198 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 1.95e-02 0.285 0.121 0.198 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 9.01e-01 0.0139 0.111 0.198 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0724 0.115 0.198 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 2.65e-01 0.116 0.104 0.198 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 9.32e-01 0.00886 0.103 0.198 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0557 0.0884 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 6.19e-01 0.0353 0.071 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 4.03e-01 0.0584 0.0697 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 9.25e-01 0.00871 0.0926 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 3.55e-01 0.0964 0.104 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 6.60e-01 0.041 0.0932 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 3.31e-02 -0.183 0.0853 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 7.30e-01 0.0259 0.0751 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 2.18e-01 0.121 0.0981 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 9.71e-02 0.153 0.0919 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0475 0.0766 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0166 0.0932 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 8.48e-01 -0.021 0.109 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 7.18e-01 0.0371 0.103 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 2.83e-01 -0.1 0.0934 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0402 0.0926 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00434 0.138 0.176 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 8.14e-01 0.0327 0.139 0.176 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 4.42e-01 -0.101 0.131 0.176 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 5.57e-01 0.0583 0.0991 0.176 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 2.45e-01 0.152 0.13 0.176 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 6.79e-01 0.0569 0.137 0.176 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 3.45e-01 0.132 0.14 0.176 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0413 0.105 0.202 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 3.08e-01 0.109 0.106 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 3.96e-01 0.0783 0.0921 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 5.36e-01 -0.067 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 4.87e-01 0.0705 0.101 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 1.14e-02 0.264 0.103 0.202 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 4.75e-01 0.0761 0.106 0.202 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 7.14e-01 -0.036 0.0981 0.202 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 1.84e-01 -0.135 0.101 0.204 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0687 0.1 0.204 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 6.83e-01 0.0387 0.0946 0.204 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 9.32e-02 -0.19 0.113 0.204 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00328 0.0991 0.204 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 4.96e-01 0.065 0.0952 0.204 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 1.26e-01 -0.159 0.103 0.204 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0174 0.0887 0.204 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00967 0.118 0.201 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0889 0.113 0.201 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 2.60e-01 0.126 0.112 0.201 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 7.75e-01 0.0339 0.119 0.201 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 5.65e-01 0.068 0.118 0.201 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 1.01e-01 -0.203 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 3.89e-01 -0.106 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0223 0.1 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.75e-01 0.0591 0.105 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 4.86e-01 0.0733 0.105 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 4.82e-01 0.0395 0.0561 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0978 0.088 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 6.87e-02 -0.165 0.0902 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0991 0.103 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 7.40e-02 0.147 0.0817 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0994 0.106 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 2.72e-01 -0.106 0.0961 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 4.61e-01 0.0646 0.0874 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 2.35e-01 0.0576 0.0483 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0468 0.0693 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0724 0.0848 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 3.26e-01 0.0952 0.0967 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0399 0.0863 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -908512 sc-eQTL 2.36e-01 0.13 0.109 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 7.11e-01 0.0317 0.0855 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 3.96e-01 0.0576 0.0677 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 7.21e-01 0.0245 0.0686 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 6.68e-01 0.0379 0.0882 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 7.82e-01 0.0289 0.104 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 7.19e-01 0.0322 0.0892 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 1.20e-02 -0.19 0.0751 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 7.08e-01 0.0275 0.0732 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0595 0.102 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 9.55e-01 0.00536 0.0959 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 2.44e-01 0.101 0.0863 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 9.00e-02 -0.177 0.104 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 7.05e-01 0.0382 0.101 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 1.52e-01 0.143 0.0996 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0661 0.0947 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 257277 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0572 0.0914 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 631838 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0492 0.0821 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 688086 sc-eQTL 8.70e-01 0.0113 0.069 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -865987 sc-eQTL 1.57e-01 0.128 0.0904 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 sc-eQTL 1.51e-01 0.0892 0.0619 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -449145 sc-eQTL 8.36e-01 0.0198 0.0954 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -576812 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0209 0.0886 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 563820 sc-eQTL 9.81e-01 0.00169 0.0699 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111670 GNPTAB -999999 eQTL 3.50e-02 0.0353 0.0167 0.0 0.0 0.193

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina