Genes within 1Mb (chr12:100828055:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0511 0.113 0.126 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0728 0.0956 0.126 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0218 0.0594 0.126 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0277 0.0977 0.126 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0599 0.0839 0.126 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0726 0.0953 0.126 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 5.81e-01 -0.067 0.121 0.126 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 8.67e-02 0.147 0.0855 0.126 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0715 0.0801 0.126 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00579 0.12 0.126 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 5.29e-01 0.0579 0.0918 0.126 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0886 0.0896 0.126 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0369 0.0685 0.126 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 6.88e-01 0.0383 0.0954 0.126 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0285 0.0944 0.126 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000188 0.119 0.126 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.11e-01 0.0814 0.0987 0.126 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 1.22e-02 -0.272 0.107 0.126 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 1.89e-01 0.116 0.0881 0.126 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 3.40e-01 0.118 0.123 0.128 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 7.49e-01 0.0383 0.119 0.128 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 7.64e-01 0.0338 0.113 0.128 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.51e-01 -0.1 0.133 0.128 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 5.52e-01 0.082 0.137 0.128 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 9.29e-01 0.0117 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0443 0.123 0.128 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 5.87e-01 0.0595 0.109 0.126 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 7.45e-01 0.0293 0.0901 0.126 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 1.71e-01 0.12 0.0871 0.126 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.58e-02 0.244 0.121 0.126 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 1.41e-01 -0.165 0.112 0.126 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 8.39e-02 0.162 0.0933 0.126 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 4.73e-01 -0.063 0.0878 0.126 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 6.11e-01 0.0517 0.102 0.127 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00885 0.0839 0.127 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0626 0.105 0.127 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0551 0.122 0.127 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 2.41e-01 -0.131 0.112 0.127 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00781 0.0864 0.127 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 1.46e-02 -0.296 0.12 0.126 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0929 0.115 0.126 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 6.25e-01 -0.058 0.119 0.126 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.02e-01 0.112 0.133 0.126 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.0975 0.126 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 8.14e-01 0.0251 0.106 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0117 0.144 0.145 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0195 0.154 0.145 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 6.12e-01 -0.051 0.1 0.145 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 3.47e-01 0.13 0.137 0.145 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0181 0.142 0.145 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.81e-01 0.156 0.145 0.145 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 9.25e-02 -0.188 0.111 0.145 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 1.13e-01 -0.202 0.127 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 1.29e-01 -0.207 0.136 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 8.90e-01 0.0103 0.0742 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0346 0.122 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0945 0.137 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 1.66e-01 0.155 0.111 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 6.20e-02 -0.238 0.127 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 3.14e-01 0.139 0.137 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 5.24e-01 0.0846 0.133 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 3.44e-01 0.0836 0.0882 0.125 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.04e-02 0.271 0.132 0.125 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00503 0.132 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.61e-01 -0.135 0.12 0.125 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 5.43e-01 0.0777 0.127 0.125 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 8.46e-01 0.0236 0.121 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0216 0.116 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 9.11e-01 0.00742 0.0666 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 7.25e-01 0.0395 0.112 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 1.84e-01 -0.166 0.124 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0134 0.11 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 1.46e-01 -0.202 0.138 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 1.53e-01 0.193 0.135 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0453 0.13 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00025 0.0676 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0967 0.121 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 4.37e-01 -0.104 0.133 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.25e-01 -0.154 0.126 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 7.46e-01 0.0392 0.121 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 7.08e-01 0.0523 0.139 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 6.49e-01 -0.063 0.138 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0409 0.139 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 6.11e-01 0.0682 0.134 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 2.15e-01 -0.176 0.141 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 3.77e-01 -0.121 0.136 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 1.35e-01 0.148 0.0987 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 2.01e-01 -0.12 0.0933 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00554 0.119 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0597 0.0995 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0796 0.108 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 5.90e-01 0.0449 0.083 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 9.24e-01 -0.01 0.105 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0596 0.111 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0422 0.124 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 9.35e-01 0.00983 0.12 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 8.55e-01 0.0205 0.112 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 4.71e-01 -0.068 0.094 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 5.94e-02 0.233 0.123 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 3.32e-01 0.119 0.123 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0565 0.124 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 7.54e-01 0.0405 0.129 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0326 0.122 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 6.33e-01 0.0598 0.125 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 4.42e-01 0.0855 0.111 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 3.62e-01 -0.104 0.113 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 8.94e-01 0.0162 0.121 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0505 0.131 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 2.38e-02 -0.291 0.128 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0218 0.112 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 8.23e-01 0.0248 0.111 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 2.79e-01 -0.129 0.119 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 3.20e-01 0.123 0.124 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 3.42e-01 0.112 0.118 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 7.50e-01 -0.041 0.128 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 1.89e-01 0.139 0.105 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 3.36e-01 -0.125 0.13 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0848 0.139 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0565 0.121 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.59e-02 0.272 0.136 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 6.60e-03 -0.362 0.132 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0652 0.138 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0719 0.132 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 1.56e-01 0.201 0.141 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00027 0.127 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0034 0.146 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 3.32e-01 -0.135 0.139 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 3.06e-01 -0.148 0.144 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 1.62e-01 -0.194 0.138 0.126 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 3.45e-01 -0.122 0.128 0.126 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 5.68e-01 -0.075 0.131 0.126 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 6.35e-01 0.0662 0.139 0.126 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 3.30e-01 0.139 0.142 0.126 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 5.65e-01 0.0696 0.121 0.126 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 9.76e-02 -0.217 0.13 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 7.86e-01 0.0342 0.125 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0426 0.102 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 2.33e-01 0.164 0.137 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 1.21e-01 -0.208 0.133 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0778 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 2.39e-01 0.14 0.119 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0637 0.102 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0677 0.121 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 6.69e-01 0.0545 0.127 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 2.90e-01 0.13 0.123 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.19e-01 0.132 0.107 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 3.78e-01 0.117 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 3.24e-01 0.132 0.134 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0203 0.129 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.18e-01 -0.11 0.136 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 4.24e-01 -0.111 0.139 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 9.99e-01 0.000253 0.137 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 1.11e-01 -0.189 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0792 0.111 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0187 0.117 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 1.52e-01 -0.177 0.123 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 2.29e-01 -0.15 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.11e-01 -0.13 0.104 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 5.77e-01 0.0957 0.171 0.137 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 2.63e-01 0.185 0.164 0.137 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 8.17e-01 0.0236 0.102 0.137 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.07e-01 0.139 0.168 0.137 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 3.87e-01 0.0893 0.103 0.137 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 6.14e-01 0.0888 0.175 0.137 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 2.89e-02 -0.304 0.137 0.137 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 7.13e-01 0.0499 0.136 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 6.94e-01 0.0533 0.135 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 2.25e-01 -0.151 0.124 0.124 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 1.45e-01 0.191 0.13 0.124 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0355 0.0991 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 7.56e-02 -0.234 0.131 0.124 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 6.59e-01 0.0557 0.126 0.126 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 7.05e-01 -0.049 0.129 0.126 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0546 0.135 0.126 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 2.35e-02 0.291 0.127 0.126 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 6.87e-02 0.242 0.132 0.126 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.04e-01 -0.155 0.122 0.126 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 3.83e-01 0.117 0.134 0.129 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 6.93e-01 0.0558 0.141 0.129 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 6.29e-01 0.0592 0.122 0.129 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.71e-01 -0.103 0.143 0.129 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00913 0.148 0.129 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0503 0.134 0.129 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0878 0.133 0.129 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00688 0.113 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00838 0.0904 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 1.91e-01 0.116 0.0885 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 9.12e-03 0.343 0.13 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 1.51e-01 -0.17 0.118 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.08e-01 0.138 0.109 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0837 0.0954 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 4.59e-01 0.0922 0.124 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 7.93e-01 0.0307 0.117 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 8.19e-01 0.0222 0.0969 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 3.18e-01 0.138 0.138 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 7.01e-01 0.0499 0.13 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.95e-01 0.124 0.118 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 6.76e-01 0.0491 0.117 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0106 0.168 0.13 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0726 0.168 0.13 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0169 0.16 0.13 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.11e-01 -0.131 0.159 0.13 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 4.70e-01 -0.121 0.167 0.13 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 5.49e-01 0.102 0.17 0.13 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 8.70e-01 0.022 0.134 0.124 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 3.86e-01 -0.118 0.136 0.124 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 5.03e-01 0.079 0.118 0.124 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 9.09e-01 0.0149 0.13 0.124 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 3.10e-01 -0.136 0.134 0.124 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 5.72e-01 0.077 0.136 0.124 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 1.37e-01 -0.186 0.125 0.124 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 2.71e-01 -0.139 0.126 0.124 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 1.42e-01 0.184 0.125 0.124 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0927 0.118 0.124 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0197 0.124 0.124 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000344 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 2.37e-01 0.154 0.129 0.124 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 3.86e-01 0.0959 0.11 0.124 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 1.96e-01 0.18 0.139 0.127 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0224 0.135 0.127 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 1.10e-01 -0.212 0.132 0.127 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 1.95e-01 -0.181 0.139 0.127 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 2.54e-01 0.168 0.147 0.127 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 7.16e-01 0.0534 0.146 0.127 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 1.45e-02 0.287 0.116 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 4.00e-01 -0.107 0.127 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 1.94e-01 -0.164 0.126 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 5.64e-01 0.039 0.0676 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 2.53e-01 0.125 0.109 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 3.53e-01 -0.115 0.124 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 6.16e-01 0.0498 0.0991 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 8.02e-02 -0.223 0.127 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 2.69e-01 0.133 0.12 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 9.67e-01 0.00451 0.109 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 8.17e-01 -0.014 0.0606 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 4.75e-01 -0.076 0.106 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 1.95e-01 -0.157 0.121 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0729 0.108 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -911417 sc-eQTL 2.81e-01 -0.148 0.137 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 5.44e-01 0.0662 0.109 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 8.78e-01 0.0133 0.0865 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 2.28e-01 0.105 0.0871 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 5.10e-02 0.259 0.132 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 2.38e-01 -0.134 0.113 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 1.00e-01 0.159 0.0966 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0293 0.0933 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 9.38e-01 0.01 0.129 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 8.76e-01 0.019 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 6.41e-01 -0.051 0.109 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 7.79e-01 0.0358 0.127 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0808 0.126 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 3.98e-01 0.101 0.12 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 254372 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0234 0.115 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 628933 sc-eQTL 3.75e-01 0.0926 0.104 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 685181 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0468 0.0876 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0804 0.115 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -452050 sc-eQTL 2.70e-01 -0.134 0.121 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -579717 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0756 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 560915 sc-eQTL 7.04e-01 0.0338 0.0887 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -868892 eQTL 2.98e-02 0.0819 0.0376 0.0 0.0 0.116
ENSG00000196091 MYBPC1 -740298 pQTL 0.00833 0.072 0.0272 0.00275 0.0 0.111


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina