logo

Genes within 1Mb (chr12:100826656:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0244 0.122 0.109 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 9.77e-01 0.00297 0.104 0.109 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0927 0.0641 0.109 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 6.38e-01 0.0499 0.106 0.109 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0275 0.0911 0.109 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0306 0.103 0.109 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0834 0.131 0.109 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 3.04e-01 0.0948 0.0921 0.109 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0915 0.0857 0.109 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 4.04e-01 -0.107 0.128 0.109 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 1.55e-01 0.14 0.098 0.109 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0144 0.0963 0.109 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0662 0.0733 0.109 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 4.97e-01 0.0694 0.102 0.109 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0344 0.101 0.109 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0593 0.128 0.109 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 1.58e-01 0.149 0.105 0.109 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 3.56e-02 -0.244 0.116 0.109 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 3.62e-01 0.0864 0.0945 0.109 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 5.10e-01 0.0873 0.132 0.11 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 6.79e-01 0.0529 0.128 0.11 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 8.82e-01 0.0179 0.121 0.11 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 2.01e-01 -0.182 0.142 0.11 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 5.71e-01 0.0836 0.147 0.11 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 5.93e-01 0.0758 0.141 0.11 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0728 0.131 0.11 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 8.72e-01 0.0189 0.117 0.109 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 5.75e-01 0.0542 0.0964 0.109 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 3.13e-01 0.0946 0.0935 0.109 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 1.57e-02 0.315 0.129 0.109 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 2.96e-01 -0.126 0.12 0.109 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 4.81e-02 0.198 0.0996 0.109 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0447 0.094 0.109 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 7.91e-01 0.0291 0.109 0.109 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0248 0.0903 0.109 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0969 0.112 0.109 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 8.59e-01 0.0234 0.131 0.109 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0954 0.121 0.109 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0164 0.0929 0.109 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 1.88e-02 -0.304 0.128 0.109 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.109 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 3.52e-01 -0.118 0.126 0.109 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 2.69e-01 0.158 0.142 0.109 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 7.85e-01 0.0284 0.104 0.109 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 9.47e-01 0.00753 0.114 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 9.67e-01 0.00628 0.149 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0875 0.16 0.13 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0841 0.104 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 4.82e-01 0.101 0.143 0.13 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0264 0.147 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 2.92e-01 0.158 0.15 0.13 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 5.22e-02 -0.224 0.115 0.13 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 1.11e-01 -0.216 0.135 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 2.64e-01 -0.162 0.144 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0348 0.0787 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 9.03e-01 0.0158 0.129 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.32e-01 -0.115 0.145 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 2.27e-01 0.143 0.118 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 1.30e-01 -0.205 0.135 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 2.60e-01 0.164 0.145 0.108 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 2.83e-01 0.151 0.14 0.108 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 6.36e-01 0.0443 0.0934 0.108 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 9.10e-03 0.364 0.138 0.108 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 7.92e-01 0.0369 0.14 0.108 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 2.36e-01 -0.151 0.127 0.108 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 3.23e-01 0.133 0.134 0.108 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 3.98e-01 0.11 0.13 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 8.82e-01 0.0185 0.124 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0692 0.0714 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 2.82e-01 0.129 0.12 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0962 0.134 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 8.27e-01 0.0258 0.118 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 5.77e-02 -0.283 0.148 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 2.72e-01 0.161 0.146 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 8.38e-01 0.0287 0.14 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0462 0.073 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0677 0.131 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.10e-01 -0.119 0.144 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0743 0.137 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 5.07e-01 0.087 0.131 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 2.35e-01 0.18 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 3.45e-01 -0.142 0.15 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0488 0.152 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 2.16e-01 0.18 0.145 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.40e-01 -0.119 0.154 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 1.12e-01 -0.236 0.147 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 5.73e-01 0.0596 0.106 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 1.68e-01 -0.137 0.0993 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0877 0.126 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 8.09e-01 0.0257 0.106 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 8.78e-01 0.0176 0.115 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 8.22e-01 0.02 0.0885 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 9.70e-01 0.00432 0.113 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0961 0.119 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 3.19e-01 -0.132 0.133 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 5.59e-01 0.0753 0.129 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.78e-01 0.0854 0.12 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 2.33e-01 -0.12 0.101 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 9.75e-02 0.218 0.131 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 1.56e-01 0.185 0.13 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0847 0.131 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 4.52e-01 0.103 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.27e-01 -0.103 0.129 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 7.74e-01 0.038 0.132 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 1.95e-01 0.154 0.118 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 3.68e-01 -0.109 0.121 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 9.70e-01 0.00488 0.129 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0622 0.14 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 1.61e-01 -0.194 0.138 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0499 0.12 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 9.88e-01 0.00174 0.119 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 3.07e-01 -0.13 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 8.46e-01 0.0259 0.133 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 5.56e-02 0.242 0.126 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0811 0.137 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 5.97e-01 0.06 0.113 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 3.64e-01 -0.125 0.137 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0927 0.147 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0779 0.128 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 9.74e-03 0.371 0.142 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.48e-03 -0.4 0.139 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0346 0.145 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0667 0.138 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 1.22e-01 0.228 0.147 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 7.93e-01 0.0347 0.132 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 4.65e-01 0.111 0.152 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.75e-01 -0.104 0.145 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 3.94e-01 -0.128 0.151 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 1.69e-01 -0.204 0.148 0.108 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 1.00e-01 -0.225 0.136 0.108 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 4.51e-01 -0.106 0.14 0.108 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 4.25e-01 0.119 0.149 0.108 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 7.05e-01 0.0575 0.152 0.108 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 7.27e-01 0.0451 0.129 0.108 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 8.25e-02 -0.243 0.139 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 4.34e-01 0.105 0.134 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0614 0.109 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 3.45e-02 0.309 0.145 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 3.74e-01 -0.128 0.143 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 1.34e-01 -0.202 0.134 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 2.28e-01 0.155 0.128 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 3.42e-01 -0.104 0.109 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 3.06e-01 -0.134 0.13 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 4.29e-01 0.108 0.137 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 1.43e-01 0.194 0.132 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 5.54e-01 0.0686 0.116 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 5.49e-01 0.0853 0.142 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 3.12e-01 0.145 0.143 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0245 0.138 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0599 0.145 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 2.80e-01 -0.16 0.148 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0112 0.147 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 3.62e-02 -0.268 0.127 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 3.52e-01 -0.111 0.119 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0903 0.126 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 3.43e-01 -0.127 0.133 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 1.31e-01 -0.203 0.134 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0815 0.112 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 8.79e-01 0.0279 0.182 0.115 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 7.85e-01 0.0481 0.176 0.115 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0885 0.108 0.115 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 5.37e-01 0.111 0.178 0.115 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.01e-01 0.0924 0.109 0.115 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 8.96e-01 0.0244 0.187 0.115 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 1.68e-02 -0.354 0.146 0.115 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0267 0.144 0.109 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 9.00e-01 0.0181 0.144 0.109 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 2.44e-01 -0.154 0.132 0.109 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 2.23e-01 0.17 0.139 0.109 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.75e-01 0.0753 0.105 0.109 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 2.89e-01 -0.149 0.14 0.109 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00416 0.134 0.109 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 4.59e-01 -0.102 0.137 0.109 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 4.12e-01 -0.118 0.144 0.109 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 9.49e-02 0.229 0.136 0.109 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 1.91e-01 0.185 0.141 0.109 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 4.29e-01 -0.103 0.13 0.109 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 2.66e-01 0.16 0.143 0.11 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 9.32e-01 -0.013 0.151 0.11 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 8.90e-01 0.0182 0.131 0.11 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 2.84e-01 -0.165 0.153 0.11 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0521 0.159 0.11 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 9.98e-01 0.00033 0.144 0.11 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0824 0.142 0.11 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 9.48e-01 0.00795 0.121 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0138 0.0969 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 3.99e-01 0.0803 0.0951 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 1.15e-03 0.457 0.139 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 2.72e-01 -0.14 0.127 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 5.28e-02 0.227 0.117 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 2.89e-01 -0.109 0.102 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00771 0.133 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 6.02e-01 0.0651 0.125 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00646 0.103 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 4.04e-01 0.123 0.147 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 5.42e-01 0.0843 0.138 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 4.77e-01 0.0896 0.126 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 2.71e-01 0.137 0.124 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0492 0.179 0.112 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 5.43e-01 -0.11 0.18 0.112 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 9.60e-01 0.00855 0.171 0.112 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0859 0.17 0.112 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 3.64e-01 -0.162 0.178 0.112 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 3.27e-01 0.178 0.182 0.112 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 9.50e-01 0.009 0.144 0.107 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 2.89e-01 -0.155 0.146 0.107 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 5.39e-01 0.0779 0.127 0.107 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 9.80e-01 0.00353 0.139 0.107 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0209 0.144 0.107 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 2.03e-01 0.186 0.145 0.107 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0854 0.135 0.107 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 1.23e-01 -0.208 0.135 0.109 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 7.00e-02 0.243 0.133 0.109 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0846 0.126 0.109 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 7.23e-01 0.047 0.132 0.109 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0277 0.127 0.109 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 3.49e-01 0.13 0.139 0.109 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 5.53e-01 0.0703 0.118 0.109 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 2.23e-01 0.181 0.148 0.11 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 9.55e-01 0.00808 0.143 0.11 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 5.63e-02 -0.269 0.14 0.11 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 1.69e-01 -0.205 0.148 0.11 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 2.83e-01 0.168 0.156 0.11 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 4.29e-01 0.123 0.155 0.11 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 1.85e-01 0.167 0.125 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 4.14e-01 -0.111 0.135 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0701 0.135 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00942 0.0721 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 7.06e-02 0.21 0.116 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.03e-01 -0.11 0.132 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 8.21e-01 0.0239 0.106 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 2.59e-01 -0.154 0.136 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 1.32e-01 0.195 0.129 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 5.67e-01 0.0675 0.118 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0847 0.0649 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0282 0.114 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0881 0.13 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00789 0.116 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -912816 sc-eQTL 1.70e-01 -0.203 0.147 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 7.68e-01 0.0345 0.117 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 8.25e-01 0.0205 0.0926 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 4.23e-01 0.075 0.0935 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 1.87e-02 0.333 0.141 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 3.62e-01 -0.111 0.122 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 5.19e-02 0.202 0.103 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0176 0.0999 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0368 0.139 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 7.08e-01 0.0488 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0471 0.117 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 7.20e-01 0.0491 0.137 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 8.35e-01 0.0284 0.136 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 3.02e-01 0.133 0.128 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 252973 sc-eQTL 7.76e-01 0.0354 0.124 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 627534 sc-eQTL 4.47e-01 0.0857 0.113 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 683782 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0523 0.0945 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 sc-eQTL 2.84e-01 -0.133 0.124 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -453449 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0821 0.131 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -581116 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0906 0.121 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 559516 sc-eQTL 8.05e-01 0.0237 0.0958 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -870291 eQTL 3.84e-02 0.0874 0.0421 0.0 0.0 0.0932
ENSG00000196091 MYBPC1 -741697 pQTL 0.0201 0.0698 0.03 0.00168 0.0 0.09

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136021 \N 559516 5.14e-07 2.56e-07 6.99e-08 2.62e-07 1.03e-07 1.26e-07 3.42e-07 7.65e-08 2.35e-07 1.37e-07 2.98e-07 1.91e-07 4.34e-07 8.55e-08 8.45e-08 1.33e-07 8.64e-08 2.87e-07 8.68e-08 8.87e-08 1.33e-07 2.24e-07 2.2e-07 5.11e-08 3.98e-07 1.9e-07 1.39e-07 1.52e-07 1.76e-07 2.19e-07 1.78e-07 4.71e-08 4.74e-08 1.23e-07 1.27e-07 5.14e-08 6.29e-08 6.98e-08 4.9e-08 8.34e-08 5.09e-08 2.9e-07 3.02e-08 1.14e-08 4.36e-08 1.01e-08 9.1e-08 0.0 4.61e-08