logo

Genes within 1Mb (chr12:100819118:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 5.92e-01 0.0595 0.111 0.12 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0454 0.0939 0.12 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 2.11e-01 0.0729 0.0581 0.12 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 9.87e-02 0.158 0.0953 0.12 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0578 0.0823 0.12 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 8.26e-01 0.0206 0.0936 0.12 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 9.78e-01 0.00325 0.119 0.12 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0603 0.084 0.12 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 4.16e-01 0.0637 0.0783 0.12 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 7.08e-01 0.0439 0.117 0.12 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00706 0.0898 0.12 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 3.83e-01 0.0767 0.0876 0.12 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 5.23e-01 0.0428 0.0669 0.12 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 6.23e-01 0.0463 0.0939 0.12 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00994 0.093 0.12 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 5.27e-01 0.0744 0.117 0.12 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0357 0.0974 0.12 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.38e-01 0.127 0.107 0.12 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.96e-01 -0.113 0.0868 0.12 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 3.67e-01 -0.111 0.123 0.119 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 6.91e-01 0.0472 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 2.08e-01 0.141 0.112 0.119 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0087 0.132 0.119 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 7.02e-01 0.0523 0.137 0.119 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.47e-01 0.19 0.131 0.119 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 1.42e-01 0.179 0.122 0.119 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 7.80e-01 0.0301 0.108 0.12 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 6.74e-01 0.0374 0.0888 0.12 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0261 0.0862 0.12 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.36e-02 -0.215 0.12 0.12 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0897 0.111 0.12 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 4.26e-01 0.0737 0.0924 0.12 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0657 0.0865 0.12 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 8.86e-03 0.259 0.0981 0.12 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0184 0.0822 0.12 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.55e-01 0.00576 0.102 0.12 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 2.32e-01 0.143 0.119 0.12 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.40e-01 0.129 0.11 0.12 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 2.50e-02 0.189 0.0836 0.12 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 8.73e-01 0.0193 0.12 0.12 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 9.39e-01 0.00873 0.114 0.12 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.86e-01 0.0021 0.117 0.12 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 9.79e-02 0.218 0.131 0.12 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0303 0.0961 0.12 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0497 0.105 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 1.01e-01 0.244 0.148 0.122 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0618 0.159 0.122 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 4.97e-02 0.202 0.102 0.122 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 8.63e-02 -0.243 0.141 0.122 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 1.03e-01 -0.239 0.146 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0717 0.15 0.122 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0752 0.115 0.122 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0694 0.127 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 8.68e-01 0.0225 0.136 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 4.50e-01 0.0558 0.0737 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.09e-01 0.0453 0.121 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.95e-01 0.143 0.136 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.75e-01 -0.151 0.111 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0136 0.127 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 6.86e-01 0.0551 0.136 0.121 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 2.45e-01 0.153 0.131 0.121 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0327 0.0876 0.121 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00509 0.132 0.121 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 3.34e-01 0.127 0.131 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0805 0.119 0.121 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 1.19e-01 -0.197 0.126 0.121 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 3.72e-01 0.107 0.12 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 9.94e-01 -0.0008 0.115 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 2.17e-01 0.0814 0.0658 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.80e-01 0.031 0.111 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0517 0.124 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0428 0.109 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 5.54e-01 0.0817 0.138 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0391 0.135 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 3.90e-01 -0.112 0.13 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 7.94e-02 0.118 0.0672 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 6.82e-02 0.221 0.121 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.50e-01 -0.153 0.133 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 4.33e-02 0.255 0.126 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0446 0.121 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0632 0.136 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 3.15e-01 0.136 0.135 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00355 0.136 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 9.15e-01 -0.014 0.131 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 1.03e-01 0.226 0.138 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 7.38e-01 0.0447 0.133 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 7.33e-01 -0.033 0.0964 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 2.36e-01 0.108 0.0906 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 6.70e-01 0.0492 0.115 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.41e-01 0.032 0.0967 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.60e-01 0.118 0.105 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0214 0.0807 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 4.88e-01 -0.072 0.104 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 7.80e-01 0.0305 0.109 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0217 0.122 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0938 0.118 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.80e-01 -0.119 0.11 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 8.42e-02 0.16 0.092 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 8.68e-01 0.0201 0.12 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 2.35e-01 -0.141 0.119 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 7.73e-01 0.0346 0.12 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0424 0.125 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 7.96e-02 -0.206 0.117 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 9.30e-01 0.0106 0.121 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 9.70e-01 0.00408 0.109 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 7.26e-01 0.0392 0.112 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 2.71e-01 0.131 0.119 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0898 0.129 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 9.84e-01 0.00251 0.127 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.45e-01 -0.16 0.11 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 4.25e-01 0.0867 0.108 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0349 0.116 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.09e-01 0.0139 0.121 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 5.72e-01 0.0655 0.116 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 3.46e-01 0.119 0.125 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.48e-01 -0.15 0.103 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 8.97e-01 -0.016 0.123 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 6.69e-01 0.0564 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 8.69e-01 0.019 0.115 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 2.45e-01 -0.151 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.26e-01 0.155 0.127 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 7.39e-01 0.0436 0.131 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0717 0.133 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 6.30e-01 0.0687 0.142 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0263 0.127 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.07e-01 0.0551 0.146 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 5.58e-01 0.0821 0.14 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 2.50e-01 0.167 0.145 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0636 0.131 0.121 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0821 0.121 0.121 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 5.99e-01 0.0652 0.124 0.121 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.09e-01 0.0493 0.132 0.121 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 3.23e-01 -0.133 0.134 0.121 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 6.40e-01 0.0534 0.114 0.121 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 3.62e-01 -0.117 0.128 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 9.99e-01 0.000146 0.123 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 2.82e-01 0.107 0.0991 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 3.24e-01 0.132 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 9.58e-02 0.218 0.13 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.79e-01 0.165 0.123 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 2.82e-01 0.126 0.117 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 4.41e-01 0.0771 0.0998 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0281 0.119 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0937 0.125 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 7.10e-01 0.0449 0.121 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 3.95e-01 0.0897 0.105 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 3.57e-01 0.127 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 4.22e-02 -0.28 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 5.99e-01 0.0703 0.134 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 4.70e-01 0.101 0.14 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.70e-01 -0.158 0.143 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 2.79e-04 0.507 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 3.04e-02 0.258 0.119 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0897 0.111 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.38e-01 0.00918 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 1.81e-01 0.167 0.124 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 1.68e-01 0.173 0.125 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 5.80e-01 0.0582 0.105 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0711 0.193 0.104 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0705 0.186 0.104 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 7.45e-01 0.0374 0.115 0.104 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.44e-01 0.0619 0.189 0.104 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 3.70e-01 0.104 0.116 0.104 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 5.31e-01 0.124 0.198 0.104 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 6.85e-01 0.0644 0.158 0.104 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 4.48e-01 -0.103 0.136 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 5.58e-01 0.0795 0.135 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00792 0.124 0.12 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 6.05e-01 0.0678 0.131 0.12 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.35e-01 -0.118 0.0988 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 4.76e-01 0.0943 0.132 0.12 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 3.05e-01 -0.129 0.125 0.12 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 1.10e-01 -0.205 0.128 0.12 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0712 0.134 0.12 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 2.77e-01 -0.139 0.128 0.12 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0142 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.83e-01 0.162 0.121 0.12 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0672 0.132 0.117 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 6.29e-01 0.0672 0.139 0.117 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0475 0.121 0.117 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.27e-01 0.0495 0.141 0.117 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 9.02e-01 0.018 0.146 0.117 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 5.57e-01 0.078 0.133 0.117 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 7.72e-02 0.231 0.13 0.117 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 9.02e-01 0.0138 0.112 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 6.57e-01 0.0398 0.0896 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0464 0.088 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.90e-02 -0.23 0.13 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0682 0.118 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.76e-01 -0.147 0.108 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 9.24e-02 -0.159 0.0941 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 5.15e-01 0.081 0.124 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 7.58e-01 -0.036 0.117 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0215 0.0967 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 8.63e-01 0.0238 0.138 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0845 0.129 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 2.19e-01 0.145 0.118 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 1.03e-01 0.191 0.116 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 2.13e-01 0.186 0.149 0.142 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 8.41e-01 0.0303 0.151 0.142 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00539 0.143 0.142 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 8.93e-01 0.0191 0.142 0.142 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 4.08e-01 -0.124 0.149 0.142 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0748 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00204 0.135 0.118 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 2.89e-01 0.145 0.137 0.118 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000349 0.119 0.118 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.69e-02 -0.23 0.129 0.118 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 8.28e-01 0.0294 0.135 0.118 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 9.39e-02 0.228 0.136 0.118 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0222 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0756 0.124 0.12 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 8.97e-01 0.0159 0.123 0.12 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0647 0.116 0.12 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 1.25e-01 -0.186 0.121 0.12 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.89e-01 0.124 0.116 0.12 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 6.73e-01 0.0538 0.127 0.12 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 4.53e-02 -0.217 0.108 0.12 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0465 0.139 0.127 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 7.85e-01 0.0367 0.134 0.127 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 7.13e-02 0.238 0.131 0.127 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0902 0.139 0.127 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 5.82e-01 0.0808 0.146 0.127 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 2.81e-01 0.157 0.145 0.127 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0593 0.118 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 5.99e-01 0.0671 0.128 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 3.02e-01 0.131 0.127 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 8.85e-01 0.00985 0.0681 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 9.48e-01 0.00725 0.11 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 1.80e-01 0.167 0.124 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.09e-01 -0.159 0.0991 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0658 0.128 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 4.84e-01 0.0836 0.119 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0776 0.108 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 1.03e-01 0.0976 0.0597 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 1.27e-01 0.16 0.105 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 2.62e-01 -0.135 0.12 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 6.23e-01 0.0526 0.107 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -920354 sc-eQTL 9.12e-01 0.015 0.136 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 6.77e-01 0.045 0.108 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 9.32e-01 0.00728 0.0855 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0554 0.0864 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 4.80e-01 -0.093 0.131 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0727 0.112 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 9.59e-01 0.00495 0.0961 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0334 0.0923 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0829 0.127 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 2.15e-01 0.148 0.119 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.40e-01 0.00812 0.108 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 7.12e-02 -0.225 0.124 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 1.75e-01 0.169 0.124 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 1.11e-01 0.187 0.117 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 245435 sc-eQTL 2.83e-01 -0.122 0.113 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 619996 sc-eQTL 9.22e-03 0.266 0.101 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 676244 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00442 0.0865 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -877829 sc-eQTL 9.65e-01 -0.005 0.114 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -460987 sc-eQTL 4.99e-01 0.0808 0.119 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -588654 sc-eQTL 5.91e-01 0.0597 0.111 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 551978 sc-eQTL 5.27e-02 0.169 0.0868 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000196091 MYBPC1 -749235 pQTL 0.0334 -0.0553 0.026 0.0014 0.0 0.115

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina