logo

Genes within 1Mb (chr12:100804372:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 2.70e-01 -0.108 0.0973 0.167 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 7.43e-01 0.0272 0.0827 0.167 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0559 0.0512 0.167 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 1.51e-01 0.121 0.0841 0.167 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 4.57e-01 0.0541 0.0725 0.167 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 7.46e-01 0.0267 0.0825 0.167 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 3.60e-01 -0.096 0.105 0.167 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0355 0.0747 0.167 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0429 0.0695 0.167 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 7.75e-01 0.0298 0.104 0.167 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 1.52e-01 0.114 0.0793 0.167 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 3.20e-01 0.0775 0.0778 0.167 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0145 0.0595 0.167 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0582 0.0819 0.167 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0623 0.081 0.167 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00361 0.103 0.167 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 4.07e-01 0.0705 0.0848 0.167 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 2.85e-01 -0.1 0.0935 0.167 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 3.92e-01 0.0651 0.0759 0.167 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 6.07e-01 0.0562 0.109 0.169 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 7.89e-01 0.0281 0.105 0.169 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0524 0.0995 0.169 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 9.61e-01 0.00576 0.117 0.169 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 7.05e-01 0.046 0.121 0.169 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 2.83e-01 0.125 0.116 0.169 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0164 0.108 0.169 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 5.16e-01 0.0617 0.0948 0.167 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0223 0.0781 0.167 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 6.86e-01 0.0306 0.0758 0.167 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 6.62e-01 0.0464 0.106 0.167 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0156 0.0976 0.167 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 1.00e-01 0.134 0.0809 0.167 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 7.76e-01 0.0217 0.0761 0.167 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0681 0.0885 0.167 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0061 0.0731 0.167 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 9.49e-01 0.0058 0.0911 0.167 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 5.32e-01 0.0665 0.106 0.167 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 1.14e-01 -0.154 0.0971 0.167 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 1.76e-01 -0.102 0.0749 0.167 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.75e-02 -0.217 0.104 0.167 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 6.89e-01 0.0399 0.0995 0.167 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0572 0.102 0.167 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 3.47e-01 0.108 0.115 0.167 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 8.26e-01 0.0185 0.084 0.167 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 7.33e-01 0.0313 0.0917 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 7.85e-01 0.035 0.128 0.184 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 2.88e-01 -0.145 0.136 0.184 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0486 0.0888 0.184 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 1.73e-01 0.166 0.122 0.184 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 2.92e-01 0.133 0.126 0.184 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 4.70e-01 0.093 0.128 0.184 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 2.35e-01 -0.118 0.0988 0.184 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 5.45e-02 -0.214 0.111 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 3.05e-02 -0.256 0.118 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0298 0.0647 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 3.74e-01 0.0947 0.106 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 7.41e-02 -0.213 0.119 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 9.81e-02 0.161 0.097 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 7.35e-01 0.0379 0.112 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 8.87e-01 0.017 0.119 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0195 0.115 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 4.25e-01 0.061 0.0762 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 2.22e-01 0.14 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 6.07e-01 0.0588 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0158 0.104 0.166 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 7.43e-01 0.0362 0.11 0.166 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0892 0.104 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 3.18e-01 0.0997 0.0997 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0353 0.0574 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 4.54e-02 0.192 0.0956 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 7.59e-01 -0.033 0.108 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 4.16e-01 0.0768 0.0943 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 3.60e-01 -0.11 0.12 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 1.68e-01 0.162 0.117 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00951 0.113 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0709 0.0586 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 6.24e-01 0.0518 0.106 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000728 0.116 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 1.06e-01 -0.178 0.11 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0482 0.105 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 8.20e-01 0.0279 0.122 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 7.80e-01 0.0339 0.121 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 2.98e-01 0.127 0.122 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 3.45e-01 0.111 0.117 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 3.60e-01 -0.114 0.124 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 5.37e-01 -0.074 0.12 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0227 0.085 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0563 0.0802 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 6.50e-01 0.0461 0.102 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 7.14e-01 0.0314 0.0853 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 5.48e-01 0.0556 0.0924 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 9.59e-01 0.00366 0.0712 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0802 0.0919 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 9.11e-02 -0.163 0.0962 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 9.67e-01 0.00448 0.108 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 6.47e-01 0.048 0.105 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 4.69e-01 0.0709 0.0978 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 8.56e-01 -0.015 0.0821 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 8.39e-01 0.0218 0.107 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 5.68e-01 0.0607 0.106 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0252 0.107 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 8.53e-01 0.0207 0.111 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0475 0.105 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0445 0.108 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0601 0.0956 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00491 0.098 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 2.84e-01 0.112 0.104 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 5.45e-01 0.0684 0.113 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 3.05e-02 -0.24 0.11 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 7.13e-01 0.0356 0.0965 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00745 0.0953 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 1.18e-01 -0.159 0.102 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 7.71e-01 0.031 0.106 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 4.72e-01 0.0733 0.102 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0207 0.11 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 4.23e-01 0.0729 0.0908 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 7.57e-02 -0.2 0.112 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 1.11e-01 -0.192 0.12 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0402 0.105 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 6.74e-02 0.217 0.118 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 1.28e-01 -0.177 0.116 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 2.45e-01 -0.139 0.119 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0552 0.114 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 6.18e-01 0.0612 0.123 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 8.23e-01 0.0246 0.11 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 4.12e-01 0.104 0.126 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 5.20e-01 0.0777 0.121 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 1.49e-01 -0.181 0.125 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0687 0.119 0.167 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 5.23e-01 0.0705 0.11 0.167 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 5.34e-01 -0.07 0.112 0.167 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0535 0.119 0.167 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 2.39e-01 0.144 0.122 0.167 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0872 0.103 0.167 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0807 0.115 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 3.97e-01 0.0931 0.11 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 7.39e-01 0.0298 0.0891 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 2.66e-01 0.134 0.12 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 4.44e-01 -0.09 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 1.71e-01 -0.151 0.11 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0134 0.103 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0677 0.0881 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00295 0.105 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 2.81e-01 0.119 0.11 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 7.91e-01 0.0283 0.107 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 7.08e-01 -0.035 0.0931 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.16e-01 -0.12 0.119 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 2.94e-01 0.126 0.12 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0761 0.116 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 9.34e-01 0.01 0.122 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 1.02e-01 -0.204 0.124 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0299 0.123 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.13e-01 -0.104 0.103 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0381 0.0958 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0493 0.101 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 6.48e-01 -0.049 0.107 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 1.09e-01 -0.172 0.107 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0441 0.0902 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.62e-01 0.141 0.154 0.167 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 1.03e-01 0.241 0.147 0.167 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0293 0.0916 0.167 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 8.64e-01 0.026 0.151 0.167 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00596 0.093 0.167 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 6.78e-01 0.0658 0.158 0.167 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 5.23e-02 -0.244 0.124 0.167 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 8.60e-01 0.0208 0.118 0.167 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 2.46e-01 0.137 0.118 0.167 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 4.15e-02 -0.22 0.107 0.167 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 9.97e-04 0.372 0.111 0.167 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0138 0.0864 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 9.70e-01 0.00438 0.115 0.167 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.34e-01 -0.107 0.111 0.167 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 4.39e-01 0.0879 0.113 0.167 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 5.55e-01 0.0702 0.119 0.167 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 4.49e-02 0.226 0.112 0.167 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 1.47e-02 0.284 0.115 0.167 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0776 0.107 0.167 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 5.73e-01 0.0647 0.115 0.173 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0327 0.121 0.173 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 7.90e-01 0.0279 0.105 0.173 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00871 0.122 0.173 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 8.18e-01 0.0293 0.127 0.173 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 9.97e-01 0.000388 0.115 0.173 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0704 0.113 0.173 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 1.52e-01 0.143 0.0992 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0021 0.0801 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 2.33e-01 0.0939 0.0784 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 1.92e-01 0.153 0.117 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 4.02e-01 0.0881 0.105 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 1.62e-01 0.136 0.0967 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 6.49e-01 0.0386 0.0846 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0326 0.11 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0672 0.103 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0181 0.0854 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0314 0.122 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 7.65e-01 0.0342 0.114 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 1.10e-01 0.166 0.104 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 6.67e-01 0.0444 0.103 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0585 0.145 0.173 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 2.63e-01 -0.163 0.145 0.173 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 1.29e-01 0.209 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 1.68e-01 -0.189 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 2.16e-01 -0.178 0.143 0.173 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 6.41e-02 0.271 0.145 0.173 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 7.24e-02 0.212 0.117 0.162 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 3.38e-01 -0.115 0.12 0.162 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0565 0.104 0.162 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0387 0.114 0.162 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0162 0.119 0.162 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0536 0.12 0.162 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0397 0.111 0.162 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0943 0.11 0.167 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 2.74e-01 0.119 0.109 0.167 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 1.96e-01 -0.132 0.102 0.167 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 8.70e-01 0.0176 0.107 0.167 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 2.00e-01 -0.132 0.103 0.167 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 3.57e-01 0.104 0.112 0.167 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 6.39e-01 0.045 0.096 0.167 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 5.85e-01 0.0685 0.125 0.172 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 3.52e-01 0.113 0.121 0.172 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 2.66e-01 -0.133 0.119 0.172 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0783 0.126 0.172 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 1.11e-01 0.211 0.131 0.172 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 7.13e-01 0.0484 0.132 0.172 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 6.13e-02 0.199 0.105 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 1.82e-01 -0.148 0.11 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 5.74e-02 -0.209 0.11 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 7.72e-01 0.0171 0.059 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 1.48e-01 0.138 0.095 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 7.54e-01 -0.034 0.108 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 5.24e-01 0.0552 0.0864 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0298 0.111 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 8.77e-01 0.0161 0.104 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 3.46e-01 0.0893 0.0945 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0591 0.0523 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 1.50e-01 0.132 0.0915 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0203 0.105 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0317 0.0934 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -935100 sc-eQTL 2.51e-01 -0.136 0.119 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 3.87e-01 0.0826 0.0953 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0308 0.0756 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 3.55e-01 0.0707 0.0763 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 8.42e-01 0.0232 0.116 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 6.05e-01 0.0515 0.0995 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 5.50e-02 0.163 0.0843 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 3.78e-01 0.072 0.0815 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 9.14e-01 0.0124 0.114 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 9.24e-01 0.0103 0.107 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 1.45e-01 -0.141 0.0962 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0246 0.113 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 2.20e-01 -0.137 0.111 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 9.70e-01 0.00403 0.106 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 230689 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0564 0.102 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 605250 sc-eQTL 4.61e-01 -0.067 0.0907 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 661498 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0361 0.0762 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0358 0.1 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -475733 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00594 0.105 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -603400 sc-eQTL 9.93e-02 -0.161 0.0972 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 537232 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0483 0.0772 0.168 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -892575 eQTL 9.65e-03 0.0872 0.0336 0.0 0.0 0.158

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina