Genes within 1Mb (chr12:100757206:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0395 0.0968 0.162 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0452 0.082 0.162 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 9.69e-01 -0.002 0.0509 0.162 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 2.74e-01 0.0916 0.0836 0.162 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 1.04e-01 -0.117 0.0716 0.162 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 8.67e-01 0.0137 0.0818 0.162 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0963 0.104 0.162 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 5.80e-01 0.0406 0.0733 0.162 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 5.39e-01 -0.042 0.0683 0.162 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0471 0.102 0.162 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 7.82e-01 0.0217 0.0783 0.162 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 6.84e-01 0.0312 0.0765 0.162 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0585 0.0583 0.162 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 1.67e-01 0.113 0.0814 0.162 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 8.39e-02 0.14 0.0803 0.162 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0674 0.102 0.162 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0603 0.0846 0.162 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 9.25e-01 0.00877 0.0935 0.162 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 2.79e-01 0.0821 0.0756 0.162 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 3.99e-01 0.0904 0.107 0.153 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 3.46e-01 0.0974 0.103 0.153 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.10e-01 -0.05 0.0977 0.153 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0576 0.115 0.153 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 3.77e-01 -0.105 0.119 0.153 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 3.11e-02 -0.246 0.113 0.153 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 5.47e-01 0.0643 0.106 0.153 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0172 0.0947 0.162 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 5.75e-01 0.0437 0.0778 0.162 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0246 0.0756 0.162 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 3.32e-01 -0.103 0.106 0.162 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 1.53e-01 -0.139 0.0969 0.162 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 3.50e-01 0.0759 0.081 0.162 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 6.86e-02 -0.138 0.0754 0.162 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 4.49e-01 0.0658 0.0868 0.161 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 2.48e-01 0.0828 0.0715 0.161 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0934 0.0891 0.161 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.91e-02 0.196 0.103 0.161 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 2.03e-01 0.122 0.0954 0.161 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 4.07e-01 0.0611 0.0736 0.161 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0834 0.106 0.162 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00185 0.1 0.162 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 5.88e-01 0.0559 0.103 0.162 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.03e-01 0.078 0.116 0.162 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 3.67e-01 0.0764 0.0846 0.162 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 4.83e-01 -0.065 0.0925 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 4.41e-01 0.101 0.131 0.161 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 7.13e-01 0.0516 0.14 0.161 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0322 0.0909 0.161 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 6.90e-01 0.0499 0.125 0.161 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 1.77e-02 -0.304 0.127 0.161 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0825 0.131 0.161 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 2.76e-01 -0.11 0.101 0.161 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 1.05e-01 -0.184 0.113 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0237 0.121 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 9.22e-01 0.00649 0.0659 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 3.21e-01 0.107 0.108 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0217 0.122 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00865 0.0993 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0809 0.113 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 9.18e-01 0.0123 0.119 0.164 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0283 0.115 0.164 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00279 0.0765 0.164 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.32e-01 -0.072 0.115 0.164 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 7.81e-01 0.0318 0.114 0.164 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00767 0.104 0.164 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0821 0.11 0.164 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 4.47e-01 0.0796 0.105 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0354 0.1 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 8.72e-01 0.00929 0.0577 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.40e-01 0.0593 0.0968 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 8.49e-01 0.0206 0.108 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0726 0.0947 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 3.00e-01 -0.125 0.12 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 8.11e-01 0.0289 0.121 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00291 0.116 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 9.68e-01 0.0024 0.0605 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 7.72e-01 0.0315 0.109 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0336 0.119 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 8.05e-02 0.198 0.112 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 1.73e-01 0.147 0.108 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0472 0.117 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 2.51e-01 -0.133 0.116 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0576 0.117 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0759 0.112 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 3.22e-01 0.118 0.119 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 7.14e-01 0.042 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 7.43e-01 0.0276 0.0841 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0162 0.0793 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0155 0.1 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.35e-01 0.0524 0.0843 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 8.58e-01 0.0164 0.0914 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0813 0.0702 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00673 0.0903 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 2.07e-01 -0.12 0.0946 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0472 0.106 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 2.59e-01 -0.116 0.102 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 6.97e-01 0.0375 0.096 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 2.26e-01 0.0975 0.0803 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 6.16e-01 0.0528 0.105 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 6.85e-02 0.189 0.103 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0504 0.105 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 3.55e-01 0.101 0.109 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 8.06e-01 0.0254 0.103 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0127 0.106 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 8.04e-01 0.0234 0.094 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 4.49e-01 0.0729 0.0961 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0577 0.102 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 2.18e-01 -0.137 0.11 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 9.44e-01 0.00764 0.11 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 3.42e-01 0.0901 0.0946 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 9.05e-03 0.247 0.0937 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 5.38e-02 0.196 0.101 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0201 0.106 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 1.85e-01 -0.134 0.101 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 2.51e-01 0.127 0.11 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0407 0.0908 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 8.12e-01 0.0259 0.108 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 1.50e-01 0.166 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 3.15e-01 0.102 0.101 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 2.16e-01 -0.141 0.114 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 9.96e-01 0.00063 0.112 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 7.27e-02 0.206 0.114 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00204 0.113 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 1.17e-01 -0.189 0.12 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 2.84e-01 -0.116 0.108 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0561 0.124 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 3.92e-01 -0.102 0.119 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 8.09e-01 0.0299 0.123 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0408 0.116 0.165 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 8.04e-01 0.0267 0.108 0.165 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.45e-01 0.0506 0.11 0.165 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.85e-01 0.0637 0.117 0.165 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 6.03e-01 0.0619 0.119 0.165 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 2.68e-01 -0.112 0.101 0.165 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 7.75e-01 0.0326 0.114 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 5.79e-01 0.0606 0.109 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 1.79e-01 -0.119 0.0881 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.13e-01 0.0781 0.119 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0257 0.117 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 7.98e-01 -0.028 0.11 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0115 0.103 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 6.29e-01 0.0426 0.088 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 3.19e-01 -0.104 0.105 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 5.47e-01 0.0662 0.11 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 8.72e-01 0.0172 0.106 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 3.35e-01 0.0896 0.0927 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 7.62e-01 0.0349 0.115 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 6.84e-01 0.0472 0.116 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0694 0.112 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 8.07e-02 0.205 0.117 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 2.78e-01 0.13 0.12 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 8.01e-01 0.0299 0.119 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 1.59e-01 0.144 0.102 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 1.72e-01 0.13 0.0947 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0413 0.101 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 1.95e-01 0.138 0.106 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 2.72e-01 0.118 0.107 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 6.11e-01 0.0456 0.0895 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0557 0.165 0.144 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 6.84e-01 0.0649 0.159 0.144 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 3.02e-01 0.101 0.0977 0.144 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 4.71e-01 0.117 0.162 0.144 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0163 0.0996 0.144 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 6.03e-01 0.0882 0.169 0.144 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 7.35e-01 0.0459 0.135 0.144 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0481 0.117 0.161 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 8.04e-01 -0.029 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.35e-01 0.0507 0.107 0.161 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 9.08e-01 -0.013 0.113 0.161 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 2.71e-01 0.0938 0.0849 0.161 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 6.08e-01 0.0584 0.114 0.161 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 5.27e-01 0.0688 0.109 0.162 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 8.33e-01 0.0234 0.111 0.162 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0792 0.117 0.162 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 8.69e-01 0.0184 0.111 0.162 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 6.45e-01 0.0529 0.115 0.162 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 2.34e-01 -0.125 0.105 0.162 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 1.09e-01 0.185 0.115 0.156 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 5.27e-01 0.0768 0.121 0.156 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0626 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0514 0.123 0.156 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00599 0.128 0.156 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 9.26e-03 -0.299 0.114 0.156 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 6.41e-01 0.0534 0.114 0.156 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0481 0.0978 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 3.33e-01 0.0761 0.0784 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0877 0.077 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 9.80e-01 0.00291 0.115 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 3.12e-02 -0.221 0.102 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 8.13e-01 0.0226 0.0953 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0416 0.083 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0962 0.11 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0105 0.104 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 3.15e-01 0.0864 0.0858 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 1.34e-01 -0.183 0.122 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00829 0.115 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 5.17e-01 0.0681 0.105 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0906 0.104 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0191 0.136 0.173 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 5.60e-01 0.0796 0.136 0.173 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 9.46e-01 0.00881 0.13 0.173 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 1.73e-01 -0.176 0.128 0.173 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000523 0.135 0.173 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 2.63e-01 -0.154 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 2.13e-01 0.143 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 3.08e-01 0.119 0.116 0.156 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00119 0.101 0.156 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0473 0.111 0.156 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 1.85e-01 -0.152 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 2.93e-01 -0.122 0.116 0.156 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 3.34e-01 -0.104 0.107 0.156 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.112 0.156 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 1.39e-01 -0.164 0.11 0.156 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0484 0.104 0.156 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 8.83e-01 0.0161 0.109 0.156 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 6.84e-02 0.191 0.104 0.156 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 1.08e-01 0.184 0.114 0.156 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0524 0.0977 0.156 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 7.31e-02 -0.216 0.12 0.161 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 5.53e-01 0.0693 0.116 0.161 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 9.18e-01 0.0119 0.115 0.161 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 2.40e-02 -0.272 0.119 0.161 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 9.15e-02 -0.215 0.126 0.161 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 7.11e-02 -0.228 0.125 0.161 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 5.64e-01 0.0594 0.103 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0622 0.112 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0443 0.112 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00519 0.06 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 7.30e-01 0.0336 0.0971 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0864 0.11 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 8.77e-01 0.0136 0.0879 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 5.39e-01 0.0637 0.103 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00782 0.094 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0131 0.0521 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 6.20e-01 0.0453 0.0912 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0311 0.104 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 9.29e-01 0.00832 0.0927 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -982266 sc-eQTL 3.47e-01 -0.111 0.118 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0797 0.0948 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 6.10e-01 0.0385 0.0752 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 7.13e-01 -0.028 0.0761 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 3.66e-01 -0.105 0.116 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 1.27e-01 -0.151 0.0985 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 5.76e-01 0.0474 0.0846 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0808 0.0811 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 1.92e-01 0.146 0.112 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0431 0.105 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0123 0.0949 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 9.07e-01 0.0129 0.111 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 5.51e-01 0.0656 0.11 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 4.96e-01 0.0709 0.104 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 183523 sc-eQTL 1.84e-01 -0.133 0.0999 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 558084 sc-eQTL 3.23e-01 0.0891 0.09 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 614332 sc-eQTL 2.62e-01 0.0849 0.0755 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -939741 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0794 0.0995 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -522899 sc-eQTL 1.05e-01 0.17 0.104 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -650566 sc-eQTL 2.57e-01 0.11 0.0968 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 490066 sc-eQTL 5.22e-01 0.0491 0.0766 0.162 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000238105 GOLGA2P5 583547 eQTL 0.0306 -0.0369 0.0171 0.0 0.0 0.153


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina