Genes within 1Mb (chr12:100751290:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0834 0.0801 0.259 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0373 0.0681 0.259 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00631 0.0423 0.259 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 1.95e-02 0.161 0.0686 0.259 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00609 0.0597 0.259 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0593 0.0678 0.259 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 1.66e-01 -0.119 0.0858 0.259 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 8.15e-01 0.0146 0.0623 0.259 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 7.18e-01 -0.021 0.058 0.259 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0862 0.0865 0.259 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 8.97e-02 0.113 0.0661 0.259 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 5.47e-01 0.0392 0.065 0.259 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0133 0.0496 0.259 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0262 0.0685 0.259 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0466 0.0678 0.259 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 1.28e-01 -0.13 0.0853 0.259 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 3.60e-01 0.065 0.0709 0.259 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0808 0.0782 0.259 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0373 0.0635 0.259 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0298 0.0916 0.255 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 7.81e-01 0.0246 0.0884 0.255 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 1.53e-01 -0.119 0.0832 0.255 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 8.95e-01 -0.013 0.0986 0.255 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 9.59e-01 0.00529 0.102 0.255 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 1.48e-01 0.142 0.0975 0.255 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 2.63e-01 -0.102 0.0908 0.255 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 7.37e-01 0.0266 0.0792 0.259 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0223 0.0651 0.259 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 7.07e-01 0.0238 0.0633 0.259 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 6.69e-01 0.0379 0.0885 0.259 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0292 0.0814 0.259 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 1.08e-01 0.109 0.0675 0.259 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0108 0.0635 0.259 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0464 0.0723 0.258 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 9.05e-01 0.00711 0.0597 0.258 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 1.34e-01 -0.111 0.074 0.258 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 2.35e-01 0.103 0.0865 0.258 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0529 0.0797 0.258 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0149 0.0614 0.258 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0602 0.0873 0.259 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 5.03e-01 0.0556 0.0829 0.259 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 1.70e-01 -0.117 0.0848 0.259 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 3.33e-02 0.203 0.095 0.259 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0865 0.0697 0.259 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0585 0.0763 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 1.91e-01 0.138 0.105 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 1.89e-01 -0.148 0.112 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0184 0.0733 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 2.64e-01 0.112 0.1 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00153 0.104 0.26 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0938 0.106 0.26 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0713 0.0816 0.26 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 1.98e-02 -0.219 0.0932 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0489 0.101 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 9.96e-01 0.000307 0.0548 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 9.59e-02 0.149 0.0894 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0691 0.101 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 4.23e-01 0.0661 0.0824 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 7.45e-01 0.0307 0.0943 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 8.20e-01 0.0227 0.0995 0.259 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0481 0.0959 0.259 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 1.75e-01 0.0866 0.0636 0.259 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 1.71e-01 0.131 0.0957 0.259 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 5.05e-01 0.0638 0.0954 0.259 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0274 0.087 0.259 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 2.36e-01 -0.109 0.0919 0.259 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0113 0.0866 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 6.13e-01 0.0419 0.0828 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 6.75e-01 -0.02 0.0476 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 1.21e-02 0.2 0.0789 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000186 0.0893 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0189 0.0783 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0754 0.0994 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 8.53e-01 0.0185 0.0995 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0712 0.0952 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0455 0.0496 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 1.71e-01 0.122 0.089 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0366 0.0981 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 7.85e-02 -0.164 0.0925 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 2.40e-01 -0.105 0.0888 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00703 0.0993 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 1.98e-01 -0.126 0.098 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 7.22e-01 0.0354 0.0992 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00256 0.0954 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0855 0.101 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0792 0.0969 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0204 0.0713 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0143 0.0673 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0765 0.0851 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 3.77e-01 0.0632 0.0715 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 6.85e-01 0.0315 0.0776 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0372 0.0597 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 8.22e-01 0.0171 0.076 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 8.79e-02 -0.136 0.0794 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.88e-01 -0.077 0.089 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 5.42e-01 0.0527 0.0863 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 4.90e-01 0.0558 0.0807 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 1.39e-01 0.1 0.0675 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 3.02e-01 0.092 0.0889 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 3.40e-01 0.0843 0.088 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 2.50e-01 -0.102 0.0886 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 1.46e-01 0.134 0.0921 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0927 0.0872 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0862 0.0895 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 1.36e-01 -0.118 0.0787 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0414 0.0809 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 6.68e-01 -0.037 0.0862 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0022 0.0933 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 2.06e-02 -0.213 0.0911 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 1.54e-01 -0.114 0.0794 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00456 0.0791 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 9.46e-01 0.00578 0.0848 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.96e-01 -0.075 0.0882 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00646 0.0843 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0863 0.0914 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0339 0.0754 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0921 0.0938 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 1.16e-01 -0.157 0.0999 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0277 0.0878 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 2.52e-01 0.114 0.0988 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0948 0.0971 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0236 0.0997 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0617 0.0943 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0804 0.101 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0933 0.0903 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 6.84e-02 0.189 0.103 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 6.44e-01 0.046 0.0995 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 8.92e-02 -0.175 0.103 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 8.14e-01 0.0228 0.0964 0.26 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 5.59e-01 0.0523 0.0892 0.26 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0895 0.0909 0.26 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00905 0.0968 0.26 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0447 0.0987 0.26 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 2.24e-01 -0.102 0.0835 0.26 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 1.38e-01 -0.14 0.0943 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 1.86e-01 0.12 0.0905 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.22e-01 -0.073 0.0735 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 3.64e-02 0.207 0.0984 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 1.22e-01 -0.15 0.0966 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0267 0.0914 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0614 0.0848 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 5.67e-02 -0.138 0.0719 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 2.17e-01 -0.107 0.0861 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 1.74e-01 0.123 0.0903 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0213 0.0877 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0647 0.0765 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0425 0.099 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 3.24e-01 0.0984 0.0996 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 1.90e-01 -0.126 0.0959 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00311 0.101 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 1.10e-01 -0.165 0.103 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 8.88e-01 0.0144 0.102 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0229 0.0854 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 8.13e-01 0.0188 0.0795 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 1.22e-01 -0.13 0.0835 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 9.14e-01 0.0096 0.0889 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 4.97e-01 0.0608 0.0894 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 4.37e-01 0.0582 0.0747 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 5.49e-01 0.0756 0.126 0.267 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 8.62e-01 0.0211 0.121 0.267 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0485 0.0747 0.267 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 6.29e-01 0.0597 0.123 0.267 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0978 0.0753 0.267 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0705 0.129 0.267 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 9.83e-02 -0.17 0.102 0.267 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 5.80e-01 0.0539 0.0972 0.263 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 9.55e-01 0.00552 0.097 0.263 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 2.30e-02 -0.201 0.0878 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 4.66e-03 0.263 0.0921 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0548 0.0709 0.263 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 7.25e-01 0.0333 0.0947 0.263 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0755 0.0909 0.259 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0297 0.0932 0.259 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0164 0.0977 0.259 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 2.13e-01 0.116 0.0926 0.259 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 5.34e-02 0.185 0.0953 0.259 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 1.91e-01 -0.115 0.0878 0.259 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 2.55e-01 -0.11 0.096 0.261 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0255 0.101 0.261 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0685 0.0878 0.261 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 8.76e-01 -0.016 0.103 0.261 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0438 0.107 0.261 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0534 0.0965 0.261 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 7.70e-02 -0.168 0.0945 0.261 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 3.14e-01 0.0829 0.0821 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0191 0.0661 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 5.64e-01 0.0376 0.0649 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 3.14e-01 0.0977 0.0967 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 8.14e-01 0.0205 0.0869 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 2.64e-01 0.0897 0.08 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 8.89e-01 0.00979 0.0699 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0689 0.091 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00358 0.0856 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 7.59e-01 0.0218 0.0709 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0361 0.101 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 2.77e-01 0.103 0.0947 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 6.01e-02 0.162 0.0859 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 8.31e-01 0.0183 0.0857 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 6.82e-01 0.0487 0.118 0.264 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0147 0.119 0.264 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 9.91e-01 0.00129 0.113 0.264 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 3.46e-01 -0.106 0.112 0.264 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0285 0.118 0.264 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 2.54e-01 0.137 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 7.95e-02 0.173 0.098 0.251 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 4.32e-01 -0.079 0.1 0.251 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00289 0.087 0.251 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0844 0.0954 0.251 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0743 0.0988 0.251 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0797 0.1 0.251 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 3.13e-01 0.0933 0.0923 0.251 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0635 0.0922 0.251 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 2.51e-01 0.105 0.0913 0.251 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0994 0.0859 0.251 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 2.23e-01 0.11 0.0899 0.251 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0646 0.0866 0.251 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 2.55e-01 0.108 0.0945 0.251 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 8.26e-01 0.0177 0.0807 0.251 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0579 0.104 0.257 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 6.99e-01 0.039 0.101 0.257 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0107 0.0995 0.257 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 6.49e-02 -0.193 0.104 0.257 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 5.20e-01 0.071 0.11 0.257 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 5.72e-01 0.0621 0.11 0.257 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 7.96e-02 0.155 0.0879 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 4.64e-01 -0.068 0.0926 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0532 0.0924 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 5.01e-01 0.0333 0.0494 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 1.17e-02 0.2 0.0788 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 7.19e-01 0.0326 0.0904 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0175 0.0724 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0678 0.0931 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 7.91e-01 0.0228 0.0862 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00402 0.0782 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0284 0.0433 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 3.11e-02 0.163 0.0751 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0585 0.0866 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 1.81e-01 -0.103 0.0768 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -988182 sc-eQTL 1.65e-01 -0.136 0.0978 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 8.90e-01 0.011 0.0792 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 7.51e-01 -0.02 0.0628 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 5.19e-01 0.041 0.0635 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 9.93e-01 0.000862 0.0966 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 6.81e-01 0.034 0.0826 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 6.63e-02 0.129 0.07 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 7.89e-01 0.0182 0.0678 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 8.94e-01 0.0126 0.094 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00531 0.0881 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0813 0.0793 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 6.79e-01 0.0384 0.0925 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0652 0.0918 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 9.42e-01 0.00633 0.0871 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 177607 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00529 0.084 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 552168 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0509 0.075 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 608416 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0176 0.0631 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 sc-eQTL 1.21e-01 -0.128 0.0825 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -528815 sc-eQTL 8.00e-01 0.0221 0.0872 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -656482 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0537 0.0808 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 484150 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0111 0.0638 0.259 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -945657 eQTL 3.30e-02 0.0599 0.0281 0.0 0.0 0.246
ENSG00000257489 AC010203.1 551507 eQTL 0.0188 -0.0773 0.0329 0.0 0.0 0.246


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina