Genes within 1Mb (chr12:100743458:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 3.23e-01 0.0692 0.0699 0.517 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 9.00e-01 0.00749 0.0594 0.517 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 4.89e-01 0.0255 0.0368 0.517 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0772 0.0604 0.517 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0282 0.0521 0.517 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 3.80e-01 0.0519 0.0591 0.517 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 3.50e-01 0.0703 0.075 0.517 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0179 0.0544 0.517 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 9.22e-01 0.00498 0.0507 0.517 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0622 0.0757 0.517 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0436 0.058 0.517 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0507 0.0567 0.517 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00154 0.0433 0.517 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 9.00e-01 0.00752 0.0597 0.517 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0644 0.0589 0.517 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0197 0.0746 0.517 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0826 0.0616 0.517 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0407 0.0682 0.517 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0367 0.0553 0.517 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0681 0.0781 0.52 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0627 0.0754 0.52 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 5.95e-01 0.038 0.0714 0.52 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 5.46e-01 0.0509 0.0841 0.52 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 7.66e-01 -0.026 0.0871 0.52 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 5.91e-01 0.045 0.0836 0.52 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 9.67e-01 0.00321 0.0778 0.52 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00246 0.0683 0.517 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0164 0.0561 0.517 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 5.70e-01 -0.031 0.0545 0.517 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0124 0.0763 0.517 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 1.43e-01 -0.103 0.0698 0.517 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0358 0.0585 0.517 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 2.07e-01 0.0691 0.0545 0.517 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 5.49e-02 0.121 0.0628 0.515 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0464 0.0522 0.515 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.88e-01 0.0175 0.0651 0.515 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 2.27e-02 -0.172 0.075 0.515 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0149 0.0698 0.515 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 3.75e-01 0.0477 0.0537 0.515 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 2.00e-01 0.0977 0.076 0.517 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0545 0.0723 0.517 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0215 0.0743 0.517 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0885 0.0836 0.517 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0425 0.061 0.517 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00484 0.0667 0.517 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0157 0.0942 0.523 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 9.13e-01 0.0111 0.101 0.523 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 9.62e-03 0.168 0.0642 0.523 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0717 0.0898 0.523 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 5.84e-01 0.0509 0.0928 0.523 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.27e-01 0.00865 0.0946 0.523 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00115 0.073 0.523 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 3.77e-01 0.0718 0.0811 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 4.62e-01 0.0638 0.0866 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 1.25e-01 0.0722 0.0469 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0928 0.0772 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 3.85e-01 0.0758 0.087 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0982 0.0707 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 6.91e-01 0.0323 0.0812 0.517 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0699 0.0872 0.515 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 6.78e-01 0.035 0.0841 0.515 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.60e-01 0.0172 0.0561 0.515 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0983 0.084 0.515 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 4.26e-01 0.0668 0.0837 0.515 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 5.37e-01 0.0472 0.0763 0.515 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 9.95e-01 0.000525 0.0809 0.515 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 7.66e-01 0.0225 0.0757 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 7.30e-01 0.025 0.0725 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 1.94e-01 0.0541 0.0415 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 8.23e-02 -0.121 0.0695 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0516 0.078 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0122 0.0685 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 7.44e-01 0.0284 0.087 0.517 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 7.15e-01 0.0315 0.0861 0.517 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 5.18e-01 0.0534 0.0824 0.517 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 1.66e-01 0.0596 0.0428 0.517 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0843 0.0771 0.517 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 1.52e-01 -0.121 0.0845 0.517 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 1.90e-01 0.106 0.0803 0.517 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0209 0.0771 0.517 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 8.59e-01 0.0152 0.0854 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 7.52e-01 0.0267 0.0846 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0213 0.0854 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 6.77e-01 0.0342 0.082 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0575 0.0869 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 7.06e-01 0.0316 0.0835 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0322 0.0624 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 9.85e-01 0.00114 0.0589 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0706 0.0744 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0354 0.0626 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 9.56e-01 0.00377 0.0679 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.40e-01 0.00391 0.0522 0.517 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 7.33e-01 0.023 0.0671 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 1.31e-01 0.106 0.0703 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0573 0.0787 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 8.87e-01 0.0108 0.0763 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 1.24e-01 -0.11 0.071 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0571 0.0598 0.517 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0429 0.0776 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 6.45e-02 -0.142 0.0763 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0922 0.0772 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0486 0.0806 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0293 0.0762 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 8.65e-01 0.0133 0.0781 0.517 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 1.76e-01 0.0918 0.0676 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00496 0.0695 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0222 0.074 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 3.36e-01 -0.077 0.0799 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 4.23e-01 0.0634 0.079 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 6.30e-01 0.033 0.0685 0.517 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 1.07e-01 -0.111 0.0688 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 4.80e-02 -0.146 0.0736 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0979 0.077 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 7.75e-01 0.0212 0.0738 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0621 0.0801 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0234 0.0661 0.517 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 3.99e-01 0.0695 0.0821 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 6.96e-01 0.0344 0.0879 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0844 0.0766 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 7.12e-02 -0.156 0.086 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 4.22e-01 0.0684 0.085 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0911 0.087 0.528 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 5.73e-01 0.0465 0.0823 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 1.28e-01 0.134 0.0878 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 6.10e-01 0.0404 0.079 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0414 0.0908 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 8.19e-01 0.0199 0.0868 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 4.14e-01 0.0737 0.09 0.518 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0504 0.0846 0.517 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0222 0.0785 0.517 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0192 0.08 0.517 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 9.58e-01 0.00453 0.0851 0.517 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 2.17e-01 -0.107 0.0865 0.517 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 3.27e-01 0.0722 0.0735 0.517 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 7.44e-01 -0.027 0.0825 0.518 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 1.90e-01 -0.104 0.0787 0.518 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 4.92e-01 0.0441 0.064 0.518 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 1.83e-01 -0.115 0.0861 0.518 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0152 0.0845 0.518 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 6.28e-01 0.0386 0.0794 0.518 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 2.29e-02 0.17 0.0741 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 1.77e-01 0.0863 0.0638 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0253 0.0762 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 1.65e-01 -0.111 0.0797 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0462 0.0774 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0238 0.0676 0.515 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 7.73e-01 0.025 0.0865 0.502 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 6.32e-02 -0.162 0.0865 0.502 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.39e-01 0.028 0.0841 0.502 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0609 0.0883 0.502 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0519 0.0902 0.502 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.00e-03 0.231 0.0877 0.502 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 8.26e-01 0.0164 0.0744 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0791 0.0691 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.58e-01 0.0226 0.0732 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 1.03e-01 -0.126 0.077 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 2.91e-01 0.0824 0.0778 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00697 0.0652 0.515 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 3.10e-01 -0.115 0.113 0.519 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 2.10e-02 -0.249 0.106 0.519 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0129 0.0671 0.519 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 3.34e-01 0.107 0.11 0.519 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0288 0.0681 0.519 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 7.95e-01 0.0302 0.116 0.519 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 3.46e-02 0.194 0.0908 0.519 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 1.98e-01 -0.108 0.0836 0.517 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0397 0.0836 0.517 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 3.71e-01 0.0686 0.0765 0.517 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 1.04e-01 -0.131 0.0804 0.517 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 6.85e-01 0.0249 0.0612 0.517 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00508 0.0817 0.517 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00408 0.0809 0.517 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 3.42e-02 -0.175 0.0819 0.517 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.93e-02 -0.152 0.0862 0.517 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0626 0.0825 0.517 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 4.75e-03 -0.239 0.0838 0.517 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 6.71e-02 0.143 0.0777 0.517 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0276 0.0848 0.517 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0475 0.089 0.517 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 5.48e-02 -0.148 0.0766 0.517 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 8.90e-01 0.0125 0.0905 0.517 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0289 0.0938 0.517 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 7.44e-01 0.0278 0.085 0.517 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 5.75e-01 0.0471 0.0839 0.517 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0338 0.071 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0144 0.057 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0569 0.0559 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 8.88e-02 -0.142 0.083 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0545 0.0748 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.63e-01 0.00318 0.0692 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 8.65e-01 0.0103 0.0603 0.517 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 4.56e-01 0.0583 0.0781 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 6.35e-01 -0.035 0.0735 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 7.51e-01 0.0193 0.0609 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 1.76e-01 0.117 0.0864 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 6.98e-02 -0.147 0.0809 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 7.22e-02 -0.133 0.0738 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 5.98e-02 0.138 0.073 0.517 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 8.17e-01 0.0241 0.104 0.521 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 6.61e-01 -0.046 0.105 0.521 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0128 0.0994 0.521 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 3.81e-01 0.0867 0.0986 0.521 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0912 0.103 0.521 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 4.68e-02 -0.209 0.104 0.521 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 1.14e-01 -0.133 0.0841 0.52 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 4.28e-01 0.0682 0.0859 0.52 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 9.27e-01 0.00687 0.0745 0.52 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 5.73e-01 0.0462 0.0818 0.52 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 2.73e-01 -0.093 0.0845 0.52 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 5.22e-01 0.055 0.0857 0.52 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 1.30e-01 0.12 0.0788 0.52 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 5.63e-01 0.0467 0.0807 0.52 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 4.69e-01 0.0581 0.08 0.52 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 4.20e-01 0.0608 0.0753 0.52 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0526 0.0789 0.52 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00073 0.0759 0.52 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00775 0.0829 0.52 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0777 0.0704 0.52 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 6.32e-01 0.0439 0.0915 0.508 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00848 0.0884 0.508 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 3.08e-01 0.089 0.0869 0.508 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 7.39e-02 0.164 0.0909 0.508 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00296 0.0967 0.508 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 6.45e-02 0.177 0.095 0.508 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 3.29e-01 -0.076 0.0776 0.508 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00144 0.0803 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 4.68e-01 0.0582 0.08 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 4.80e-01 0.0303 0.0428 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0849 0.0691 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 1.66e-01 0.108 0.078 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0372 0.0627 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 3.01e-01 0.0836 0.0806 0.517 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 4.31e-01 0.0596 0.0756 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 7.33e-01 0.0234 0.0687 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 2.32e-01 0.0455 0.0379 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 9.93e-02 -0.11 0.0663 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 2.53e-01 -0.087 0.0759 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 2.28e-01 0.0816 0.0675 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -996014 sc-eQTL 3.98e-01 0.0729 0.0861 0.517 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 9.84e-01 0.00136 0.0687 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0234 0.0545 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0355 0.055 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 9.42e-01 0.00608 0.0838 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 1.11e-01 -0.114 0.0713 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0507 0.0611 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 5.10e-01 0.0388 0.0587 0.517 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0891 0.0812 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 1.31e-01 0.115 0.0758 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 3.34e-01 0.0665 0.0687 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 7.26e-01 0.0281 0.0801 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 9.98e-01 0.000203 0.0796 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 8.20e-01 0.0172 0.0754 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 169775 sc-eQTL 4.65e-01 0.0532 0.0727 0.513 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 544336 sc-eQTL 4.01e-02 0.134 0.065 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 600584 sc-eQTL 7.45e-01 -0.018 0.0551 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 sc-eQTL 8.21e-01 0.0164 0.0726 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -536647 sc-eQTL 1.15e-01 -0.12 0.0758 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -664314 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0142 0.0708 0.515 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 476318 sc-eQTL 4.93e-01 0.0383 0.0558 0.515 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -953489 eQTL 7.90e-06 -0.11 0.0245 0.0 0.0 0.452
ENSG00000257489 AC010203.1 543675 eQTL 0.0468 0.0575 0.0289 0.0 0.0 0.452


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina