Genes within 1Mb (chr12:100740950:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0467 0.0867 0.216 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 5.24e-01 -0.047 0.0735 0.216 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.94e-01 -0.048 0.0455 0.216 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 5.14e-02 0.146 0.0744 0.216 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 2.11e-01 0.0807 0.0643 0.216 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 1.99e-01 -0.094 0.073 0.216 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 2.42e-01 -0.109 0.0928 0.216 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 8.28e-01 0.0146 0.0668 0.216 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.57e-01 0.00336 0.0623 0.216 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0426 0.093 0.216 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 1.75e-01 0.0966 0.071 0.216 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 7.92e-01 0.0184 0.0697 0.216 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0353 0.0532 0.216 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0611 0.0736 0.216 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0556 0.0728 0.216 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0854 0.092 0.216 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.92e-01 0.0805 0.0762 0.216 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0571 0.0842 0.216 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0273 0.0683 0.216 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0105 0.0987 0.216 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 4.97e-01 0.0648 0.0952 0.216 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 1.57e-01 -0.127 0.0896 0.216 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0365 0.106 0.216 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.86e-01 0.0766 0.11 0.216 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 8.35e-02 0.182 0.105 0.216 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0842 0.098 0.216 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 4.95e-01 0.0583 0.0854 0.216 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00625 0.0703 0.216 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00803 0.0683 0.216 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 3.09e-01 0.0972 0.0953 0.216 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 7.98e-01 0.0225 0.0879 0.216 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 2.16e-01 0.0907 0.073 0.216 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 8.27e-01 -0.015 0.0686 0.216 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 1.90e-01 -0.102 0.0778 0.217 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.96e-01 0.000293 0.0644 0.217 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0992 0.08 0.217 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 3.44e-01 0.0886 0.0935 0.217 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 5.70e-01 -0.049 0.086 0.217 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0738 0.0661 0.217 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0429 0.0948 0.216 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 3.86e-01 0.0781 0.0899 0.216 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 1.78e-01 -0.124 0.0921 0.216 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 5.11e-02 0.203 0.103 0.216 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0537 0.0759 0.216 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0132 0.083 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 4.88e-01 0.0788 0.114 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0888 0.121 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 7.31e-02 -0.141 0.0783 0.219 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.33e-01 0.129 0.108 0.219 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 3.68e-01 0.101 0.112 0.219 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0651 0.114 0.219 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 5.03e-01 -0.059 0.088 0.219 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0798 0.102 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 2.79e-01 -0.117 0.108 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0515 0.059 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 1.29e-01 0.147 0.0965 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0429 0.109 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 2.91e-01 0.094 0.0888 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 8.31e-01 0.0218 0.102 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 7.35e-01 0.0365 0.108 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0277 0.104 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 5.55e-01 0.0408 0.0691 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 1.12e-01 0.165 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 7.82e-01 0.0286 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0525 0.0941 0.216 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0482 0.0998 0.216 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0147 0.0939 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.80e-01 0.00228 0.09 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0661 0.0515 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.18e-02 0.198 0.0858 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 7.83e-01 0.0267 0.0969 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00908 0.085 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0818 0.108 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 7.17e-01 0.039 0.107 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 2.40e-01 -0.121 0.103 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 8.68e-02 -0.0917 0.0533 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.59e-01 0.109 0.0961 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 5.49e-01 0.0635 0.106 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 1.14e-02 -0.253 0.099 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 2.58e-01 -0.109 0.0958 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 7.06e-01 0.0411 0.109 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 2.58e-01 -0.122 0.107 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 6.80e-01 0.0449 0.109 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 6.07e-01 0.0538 0.104 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 3.27e-01 -0.109 0.11 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0583 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 9.01e-01 0.00954 0.0764 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0114 0.0721 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0313 0.0913 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 8.87e-01 0.0109 0.0767 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0035 0.0831 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0442 0.0639 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00441 0.0821 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 2.22e-01 -0.105 0.0861 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0641 0.0962 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 3.69e-01 0.0839 0.0931 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.05e-01 0.0728 0.0872 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 5.36e-01 0.0454 0.0732 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 5.51e-01 0.0577 0.0967 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 4.82e-01 0.0674 0.0957 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0413 0.0964 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.30e-01 0.121 0.1 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0614 0.0949 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0916 0.0972 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 2.18e-01 -0.105 0.0848 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0627 0.0871 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00983 0.0928 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 8.74e-01 0.016 0.1 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 2.40e-02 -0.223 0.0981 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0874 0.0857 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0365 0.0853 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0269 0.0915 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0252 0.0953 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 6.15e-01 0.0459 0.091 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 2.91e-01 -0.104 0.0986 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 9.46e-01 0.00556 0.0814 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 1.45e-01 -0.151 0.103 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 1.30e-01 -0.167 0.11 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0259 0.0968 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 4.76e-02 0.216 0.108 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 2.40e-01 -0.126 0.107 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0533 0.11 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0115 0.102 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0342 0.109 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0613 0.0977 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 3.70e-02 0.233 0.111 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.99e-01 0.0727 0.107 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 3.70e-02 -0.232 0.11 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 6.11e-01 0.0533 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 6.06e-01 0.0501 0.097 0.216 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.68e-01 -0.11 0.0987 0.216 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 8.44e-01 0.0207 0.105 0.216 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 9.48e-01 0.00707 0.107 0.216 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0686 0.091 0.216 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0939 0.102 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 2.92e-01 0.103 0.0975 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0348 0.0793 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.92e-02 0.232 0.106 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 3.29e-01 -0.102 0.104 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 8.23e-01 -0.022 0.0983 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 2.30e-01 -0.11 0.0914 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 4.27e-02 -0.158 0.0775 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0908 0.093 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 1.31e-01 0.147 0.0974 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 8.86e-01 0.0135 0.0947 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 2.31e-01 -0.099 0.0824 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0733 0.106 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 2.64e-01 0.119 0.107 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.83e-01 -0.111 0.103 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0386 0.108 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 2.89e-01 -0.117 0.111 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0501 0.109 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0631 0.0923 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 8.43e-01 0.0171 0.086 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 1.52e-01 -0.13 0.0904 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0159 0.0962 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 9.43e-01 0.00695 0.0968 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00707 0.081 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 2.48e-01 0.155 0.133 0.23 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 1.88e-01 0.17 0.128 0.23 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0958 0.0791 0.23 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 9.79e-01 0.0034 0.131 0.23 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0703 0.0805 0.23 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0903 0.137 0.23 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 7.62e-02 -0.194 0.108 0.23 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 2.71e-01 0.116 0.105 0.22 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 4.72e-01 0.0755 0.105 0.22 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.38e-02 -0.216 0.095 0.22 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 4.92e-03 0.283 0.0997 0.22 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0576 0.0767 0.22 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0102 0.103 0.22 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 1.77e-01 -0.133 0.0981 0.216 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 5.03e-01 0.0676 0.101 0.216 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 8.84e-01 0.0155 0.106 0.216 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.43e-01 0.117 0.1 0.216 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.21e-02 0.211 0.103 0.216 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 1.38e-01 -0.141 0.0949 0.216 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0667 0.104 0.222 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.67e-01 0.0045 0.109 0.222 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0264 0.095 0.222 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 9.56e-01 0.00614 0.111 0.222 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0515 0.115 0.222 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 7.61e-01 0.0318 0.104 0.222 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 1.45e-01 -0.15 0.102 0.222 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 2.32e-01 0.107 0.0889 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00476 0.0717 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 6.41e-01 0.0328 0.0704 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.105 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.00e-01 0.0792 0.094 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 2.31e-01 0.104 0.0867 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00193 0.0758 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0535 0.0982 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00919 0.0923 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0503 0.0764 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 9.04e-01 0.0132 0.109 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 2.35e-01 0.122 0.102 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 1.02e-01 0.153 0.0928 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0494 0.0924 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 6.23e-01 0.0666 0.135 0.215 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.19e-01 0.0138 0.136 0.215 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 8.81e-01 0.0194 0.13 0.215 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0903 0.129 0.215 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 5.50e-01 0.0809 0.135 0.215 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 2.28e-02 0.311 0.135 0.215 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 6.13e-02 0.198 0.105 0.213 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 2.26e-01 -0.13 0.107 0.213 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00118 0.0933 0.213 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0438 0.103 0.213 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0179 0.106 0.213 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 6.42e-01 -0.05 0.107 0.213 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 6.21e-01 0.0491 0.0992 0.213 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0393 0.0993 0.215 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 2.59e-01 0.111 0.0982 0.215 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.17e-01 -0.115 0.0924 0.215 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.44e-01 0.113 0.0967 0.215 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 1.98e-01 -0.12 0.0929 0.215 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 7.79e-01 0.0286 0.102 0.215 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 3.11e-01 0.0879 0.0866 0.215 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 6.41e-01 0.054 0.116 0.22 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 6.23e-01 0.0549 0.111 0.22 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0714 0.11 0.22 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 2.86e-01 -0.124 0.116 0.22 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 1.07e-01 0.196 0.121 0.22 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 6.49e-01 0.0552 0.121 0.22 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 1.90e-01 0.129 0.0977 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0105 0.1 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0825 0.0996 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0137 0.0533 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 8.95e-03 0.224 0.0849 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 7.24e-01 0.0345 0.0975 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0226 0.0781 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0479 0.1 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 7.54e-01 0.0293 0.0936 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0363 0.0849 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0741 0.0468 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 7.22e-02 0.148 0.0819 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 7.33e-01 0.0322 0.0941 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 9.58e-02 -0.139 0.0833 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -998522 sc-eQTL 1.90e-01 -0.14 0.106 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 6.13e-01 0.0433 0.0855 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00555 0.0678 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 8.72e-01 0.011 0.0686 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 5.87e-01 0.0568 0.104 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 3.03e-01 0.092 0.089 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 9.14e-02 0.128 0.0757 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 8.59e-01 -0.013 0.0732 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 5.42e-01 0.0621 0.102 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0402 0.0955 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 2.12e-01 -0.108 0.0859 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 6.96e-01 0.0393 0.1 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0986 0.0995 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0302 0.0945 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 167267 sc-eQTL 6.56e-01 0.0407 0.0911 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 541828 sc-eQTL 1.61e-01 -0.113 0.0805 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 598076 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0208 0.0679 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 sc-eQTL 1.82e-01 -0.119 0.089 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -539155 sc-eQTL 9.44e-01 0.00657 0.0939 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -666822 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0592 0.0871 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 473810 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0756 0.0686 0.218 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -955997 eQTL 2.15e-02 0.0713 0.031 0.0 0.0 0.198
ENSG00000257489 AC010203.1 541167 eQTL 0.0041 -0.104 0.0362 0.0 0.0 0.198


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina