Genes within 1Mb (chr12:100705169:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 2.11e-01 -0.198 0.158 0.062 B L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 9.85e-01 0.00252 0.134 0.062 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 4.42e-02 0.167 0.0826 0.062 B L1
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 2.96e-01 0.143 0.137 0.062 B L1
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.54e-02 -0.284 0.116 0.062 B L1
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 5.03e-01 0.0897 0.134 0.062 B L1
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 3.45e-01 0.112 0.118 0.062 CD4T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.99e-01 0.0582 0.111 0.062 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0763 0.165 0.062 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0449 0.127 0.062 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0701 0.124 0.062 CD4T L1
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 1.66e-01 0.131 0.0941 0.062 CD4T L1
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 4.07e-01 0.11 0.132 0.062 CD8T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00783 0.131 0.062 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 5.26e-01 -0.105 0.166 0.062 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0996 0.137 0.062 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 3.31e-01 -0.147 0.151 0.062 CD8T L1
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 2.50e-01 0.141 0.123 0.062 CD8T L1
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 8.13e-01 0.0415 0.175 0.061 DC L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 7.89e-01 0.0453 0.169 0.061 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0272 0.16 0.061 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 5.82e-01 0.104 0.188 0.061 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0128 0.195 0.061 DC L1
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 6.48e-01 0.0856 0.187 0.061 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 6.85e-01 0.0707 0.174 0.061 DC L1
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 7.59e-01 -0.047 0.153 0.062 Mono L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 1.86e-01 -0.167 0.126 0.062 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 5.39e-01 0.0754 0.122 0.062 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 2.01e-01 -0.219 0.171 0.062 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 3.72e-01 -0.141 0.157 0.062 Mono L1
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 6.26e-01 0.0642 0.131 0.062 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 4.29e-01 0.0973 0.123 0.062 Mono L1
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 2.35e-01 0.168 0.141 0.06 NK L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0541 0.117 0.06 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 6.46e-01 -0.067 0.146 0.06 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0517 0.17 0.06 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 2.28e-01 -0.188 0.156 0.06 NK L1
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 1.23e-01 0.185 0.12 0.06 NK L1
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 3.43e-01 -0.16 0.169 0.062 Other_T L1
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.32e-01 0.1 0.161 0.062 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 9.48e-01 0.0108 0.165 0.062 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 1.47e-01 0.269 0.185 0.062 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.87e-01 -0.179 0.135 0.062 Other_T L1
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 8.24e-01 -0.033 0.148 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 1.52e-01 0.293 0.204 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 1.87e-01 -0.289 0.218 0.064 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 7.38e-02 0.254 0.141 0.064 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 5.79e-01 -0.109 0.196 0.064 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.83e-01 -0.269 0.201 0.064 B_Activated L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 3.05e-01 -0.211 0.206 0.064 B_Activated L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 4.36e-03 -0.504 0.175 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 1.25e-01 0.291 0.189 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 6.69e-02 0.189 0.103 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 5.64e-01 -0.098 0.17 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 2.81e-01 -0.206 0.191 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 6.52e-01 0.0704 0.156 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0943 0.19 0.062 B_Memory L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 8.19e-01 0.0418 0.183 0.062 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 1.25e-01 0.187 0.121 0.062 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 8.43e-01 0.0365 0.183 0.062 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0406 0.182 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 7.23e-01 -0.059 0.166 0.062 B_Memory L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0466 0.168 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.44e-01 0.0978 0.161 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 4.77e-02 0.182 0.0916 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 1.18e-01 0.242 0.154 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 2.81e-01 -0.187 0.173 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 9.09e-01 0.0175 0.152 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 5.62e-01 0.111 0.192 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 9.75e-01 0.00572 0.184 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 4.98e-01 0.0651 0.096 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0314 0.173 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.38e-01 -0.281 0.189 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 7.41e-01 0.0597 0.18 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 3.24e-01 -0.185 0.187 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.12e-01 0.122 0.185 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 5.05e-01 -0.125 0.187 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 1.80e-02 -0.423 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 5.13e-01 0.125 0.19 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 2.95e-01 -0.192 0.183 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 9.59e-01 0.00706 0.136 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.74e-01 0.0723 0.128 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 6.41e-01 -0.076 0.163 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0781 0.137 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0598 0.148 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 5.69e-01 0.0649 0.114 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 7.60e-01 0.0449 0.146 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 7.65e-01 -0.046 0.154 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 9.25e-01 0.0162 0.172 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 8.33e-01 0.0351 0.166 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 4.47e-01 -0.118 0.156 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 3.82e-02 0.27 0.129 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 6.94e-02 0.312 0.171 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 9.19e-01 0.0173 0.171 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 2.44e-01 -0.2 0.171 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 5.49e-01 0.107 0.179 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.78e-01 -0.228 0.168 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 4.82e-01 0.122 0.173 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 9.94e-01 0.00112 0.153 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 1.00e+00 3.6e-05 0.157 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0809 0.167 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 5.54e-01 -0.107 0.181 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 2.14e-01 -0.222 0.178 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 6.05e-01 0.0801 0.155 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 2.82e-01 0.165 0.153 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.21e-01 -0.106 0.165 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0257 0.172 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 8.60e-02 -0.281 0.163 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 9.38e-01 0.0138 0.178 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 8.65e-01 -0.025 0.147 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 5.80e-01 0.0991 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 3.54e-01 0.177 0.191 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 4.03e-01 0.14 0.167 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 7.58e-01 0.0582 0.189 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 5.75e-01 -0.104 0.185 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 3.80e-01 0.166 0.189 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 3.26e-01 -0.18 0.183 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.90e-01 -0.106 0.197 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 2.63e-01 -0.197 0.176 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 4.94e-01 -0.139 0.202 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 3.80e-01 0.17 0.193 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 8.64e-01 0.0345 0.201 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0075 0.191 0.063 MAIT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.33e-01 0.11 0.176 0.063 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00903 0.18 0.063 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 5.93e-01 -0.102 0.191 0.063 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00384 0.195 0.063 MAIT L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0859 0.166 0.063 MAIT L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 1.96e-01 -0.238 0.184 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 3.82e-01 0.154 0.176 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00879 0.143 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 6.76e-01 0.0808 0.193 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.57e-02 -0.454 0.186 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 9.63e-01 0.00835 0.178 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 4.97e-01 0.113 0.166 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 6.00e-02 -0.266 0.141 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0895 0.169 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00869 0.177 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 4.06e-01 -0.142 0.171 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 3.84e-01 0.13 0.149 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 2.08e-01 0.241 0.191 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 9.00e-01 0.0242 0.193 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0481 0.186 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 4.27e-01 -0.156 0.195 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 3.25e-02 -0.425 0.197 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 1.50e-01 0.283 0.196 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 6.85e-01 0.0675 0.166 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.52e-01 0.0919 0.154 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0106 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0237 0.173 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.87e-01 0.23 0.173 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 2.79e-01 0.157 0.145 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 6.32e-01 -0.126 0.263 0.056 PB L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 2.93e-01 -0.267 0.252 0.056 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 4.33e-01 0.122 0.156 0.056 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 8.20e-02 0.446 0.254 0.056 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.87e-01 -0.208 0.157 0.056 PB L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 2.33e-01 0.321 0.268 0.056 PB L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 3.44e-01 -0.177 0.187 0.063 Pro_T L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 1.07e-01 -0.299 0.185 0.063 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0515 0.171 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 1.03e-01 0.294 0.179 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0992 0.136 0.063 Pro_T L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 5.26e-01 0.116 0.182 0.063 Pro_T L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 3.63e-01 0.162 0.178 0.062 Treg L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.75e-01 -0.102 0.183 0.062 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 5.99e-01 -0.101 0.191 0.062 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 7.33e-01 0.0623 0.182 0.062 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.75e-01 0.255 0.188 0.062 Treg L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 7.40e-01 0.0575 0.173 0.062 Treg L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 7.48e-01 0.0593 0.184 0.066 cDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0198 0.194 0.066 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 1.18e-01 -0.263 0.167 0.066 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 4.99e-01 0.133 0.197 0.066 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.44e-01 0.298 0.203 0.066 cDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 4.05e-01 -0.154 0.185 0.066 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0885 0.182 0.066 cDC L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0471 0.158 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 3.56e-01 -0.117 0.127 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 3.35e-01 0.12 0.125 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0105 0.186 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0654 0.167 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 7.89e-01 0.0413 0.154 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 1.70e-01 0.184 0.134 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 8.23e-01 0.0396 0.177 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.15e-01 -0.108 0.166 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 6.52e-01 0.0623 0.138 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 1.20e-01 -0.305 0.195 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 6.02e-01 0.0963 0.185 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0411 0.168 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 4.91e-01 0.115 0.167 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0213 0.212 0.073 gdT L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 3.58e-01 0.196 0.212 0.073 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0483 0.202 0.073 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 8.18e-01 0.0464 0.201 0.073 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.00e-01 -0.346 0.209 0.073 gdT L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0822 0.215 0.073 gdT L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 5.53e-01 0.117 0.197 0.056 intMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.60e-01 -0.117 0.201 0.056 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 1.36e-01 -0.259 0.173 0.056 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0686 0.191 0.056 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 3.25e-01 -0.195 0.198 0.056 intMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0812 0.2 0.056 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 3.38e-01 0.178 0.185 0.056 intMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0999 0.181 0.059 ncMono L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 4.66e-01 0.131 0.179 0.059 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 4.70e-01 -0.122 0.169 0.059 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0787 0.177 0.059 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 8.87e-01 0.0242 0.17 0.059 ncMono L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0106 0.186 0.059 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0857 0.158 0.059 ncMono L2
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 7.14e-02 -0.359 0.198 0.062 pDC L2
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 4.89e-01 0.134 0.193 0.062 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 3.29e-01 0.186 0.19 0.062 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 2.73e-01 -0.22 0.2 0.062 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 5.71e-01 -0.12 0.211 0.062 pDC L2
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 2.26e-01 0.254 0.209 0.062 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 1.34e-03 0.537 0.164 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 1.15e-01 -0.284 0.179 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 5.24e-01 0.115 0.18 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 2.61e-02 0.213 0.0951 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0338 0.156 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 4.40e-01 -0.136 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0304 0.141 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 7.16e-01 0.0611 0.168 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 9.03e-01 0.0186 0.152 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 1.01e-01 0.138 0.0839 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 1.64e-01 0.206 0.147 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 1.26e-02 -0.419 0.166 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 7.61e-01 0.0457 0.15 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0561 0.154 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 2.10e-01 -0.152 0.121 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 3.96e-01 0.105 0.123 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 2.60e-01 -0.211 0.187 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0466 0.16 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 8.24e-01 0.0305 0.137 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 1.95e-01 0.17 0.131 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 3.76e-01 -0.163 0.184 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 7.41e-01 0.0571 0.172 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 3.96e-01 -0.132 0.155 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0603 0.181 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 4.36e-01 -0.14 0.18 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0696 0.17 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0128 0.164 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075089 ACTR6 506047 sc-eQTL 2.68e-01 0.162 0.146 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111647 UHRF1BP1L 562295 sc-eQTL 2.67e-01 -0.136 0.122 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -991778 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0843 0.161 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 -574936 sc-eQTL 5.53e-01 -0.101 0.17 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 -702603 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0562 0.157 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136021 SCYL2 438029 sc-eQTL 5.91e-02 0.234 0.123 0.06 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139354 GAS2L3 131486 eQTL 0.013 0.0982 0.0394 0.00185 0.0 0.0697
ENSG00000279148 AC126474.1 677629 eQTL 0.0194 0.125 0.0535 0.0 0.0 0.0697


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000280088 \N 671095 2.77e-07 1.53e-07 6.04e-08 2.24e-07 1.01e-07 8.45e-08 1.81e-07 5.62e-08 1.5e-07 7.6e-08 1.73e-07 1.2e-07 1.79e-07 8.13e-08 5.36e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.18e-08 4.95e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.62e-07 3.49e-08 1.72e-07 1.23e-07 1.18e-07 1.04e-07 1.26e-07 1.06e-07 1.09e-07 3.78e-08 3.29e-08 9.3e-08 3.4e-08 3.24e-08 3.7e-08 8.2e-08 6.35e-08 5.56e-08 5.8e-08 1.5e-07 3.99e-08 7.61e-09 3.42e-08 1.77e-08 9.96e-08 2.02e-09 4.72e-08