logo

Genes within 1Mb (chr1:78778423:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 7.43e-01 0.0377 0.115 0.094 B L1
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.69e-01 0.0448 0.105 0.094 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 6.76e-01 0.0411 0.0982 0.094 B L1
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0712 0.131 0.094 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 7.84e-02 -0.241 0.136 0.094 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 1.14e-02 0.296 0.116 0.094 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0322 0.103 0.094 B L1
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0662 0.111 0.094 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0952 0.106 0.094 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 1.88e-01 0.102 0.077 0.094 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.05e-04 -0.306 0.091 0.094 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 6.14e-01 0.0488 0.0965 0.094 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0145 0.111 0.094 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 1.85e-01 -0.144 0.108 0.094 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 3.84e-03 0.259 0.0887 0.094 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 3.70e-01 -0.111 0.123 0.094 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 6.43e-01 0.0578 0.125 0.094 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 8.48e-01 0.0233 0.122 0.094 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 1.83e-01 -0.138 0.104 0.092 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0538 0.102 0.092 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 6.18e-01 0.0675 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 2.22e-01 -0.158 0.129 0.092 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0985 0.141 0.092 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0372 0.152 0.092 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0456 0.145 0.092 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 5.70e-01 0.0463 0.0814 0.094 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 9.72e-01 0.00298 0.0839 0.094 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0592 0.114 0.094 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0723 0.0927 0.094 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00843 0.126 0.094 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 4.47e-01 0.0972 0.128 0.094 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 7.07e-01 0.0493 0.131 0.094 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0933 0.0942 0.094 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0394 0.0992 0.094 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 5.52e-01 0.057 0.0957 0.094 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.25e-01 0.0125 0.132 0.094 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 9.16e-01 0.0134 0.127 0.094 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0138 0.122 0.094 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 9.10e-03 -0.323 0.123 0.094 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 1.65e-01 -0.138 0.0989 0.094 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 5.45e-01 -0.092 0.152 0.094 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 1.09e-01 -0.235 0.146 0.094 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00766 0.135 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 4.26e-01 -0.113 0.142 0.087 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 2.57e-02 -0.319 0.142 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 4.87e-01 0.116 0.166 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 4.96e-02 -0.264 0.133 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 2.95e-01 -0.169 0.161 0.087 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 3.76e-01 0.154 0.173 0.087 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 9.22e-01 0.0151 0.155 0.087 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00166 0.125 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 7.68e-01 0.0375 0.127 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00922 0.125 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 3.29e-01 -0.137 0.14 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 2.99e-02 -0.319 0.146 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 5.04e-01 0.0929 0.139 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0327 0.12 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 1.23e-01 0.17 0.11 0.095 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0496 0.11 0.095 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 7.54e-01 -0.045 0.144 0.095 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 1.90e-01 -0.183 0.14 0.095 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0385 0.145 0.095 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 5.51e-01 0.0867 0.145 0.095 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 9.45e-01 0.00859 0.123 0.095 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 5.75e-01 0.0607 0.108 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 3.06e-01 0.115 0.112 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 5.57e-01 0.0652 0.111 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 4.86e-01 0.0929 0.133 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 2.98e-01 -0.151 0.145 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 6.02e-02 0.263 0.139 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0286 0.109 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0609 0.11 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 9.14e-01 0.013 0.121 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 7.11e-01 0.0471 0.127 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 7.59e-01 0.04 0.13 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0566 0.151 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 1.69e-01 0.206 0.149 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 3.17e-01 -0.127 0.127 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 8.55e-01 -0.022 0.12 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 1.14e-01 0.219 0.138 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 3.68e-01 0.138 0.153 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 1.39e-01 -0.222 0.149 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0894 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 2.97e-01 -0.123 0.118 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.92e-02 -0.217 0.119 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 1.13e-01 0.135 0.0851 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 3.71e-02 -0.19 0.0904 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 7.67e-01 0.031 0.105 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00919 0.106 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0585 0.111 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 3.79e-01 0.0911 0.103 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.34e-02 -0.217 0.128 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 1.42e-01 0.2 0.136 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 9.24e-01 0.0122 0.127 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0189 0.128 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 3.30e-01 0.121 0.123 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.77e-01 0.00413 0.145 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 5.16e-01 0.0967 0.149 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0128 0.111 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0337 0.124 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 7.34e-03 0.312 0.115 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 2.85e-01 -0.148 0.138 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0267 0.128 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 1.59e-01 -0.185 0.131 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0665 0.116 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0274 0.119 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 7.67e-02 0.193 0.108 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0495 0.131 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 7.42e-01 0.0436 0.133 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 1.67e-01 0.178 0.128 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 1.77e-01 -0.189 0.14 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 1.15e-01 -0.2 0.126 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 4.25e-02 0.269 0.132 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 2.27e-01 0.176 0.145 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 7.89e-01 0.0399 0.149 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0792 0.131 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0102 0.126 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 9.48e-01 0.00846 0.13 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 5.11e-01 -0.103 0.157 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 2.81e-01 -0.17 0.158 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 2.70e-01 0.185 0.167 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 8.10e-01 -0.033 0.137 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 5.94e-01 0.0638 0.12 0.091 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 1.62e-01 -0.186 0.132 0.091 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 4.23e-01 -0.113 0.141 0.091 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.30e-01 0.0126 0.144 0.091 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 3.15e-01 -0.145 0.144 0.091 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0072 0.132 0.091 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 2.17e-01 -0.139 0.112 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00382 0.132 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 2.70e-01 -0.155 0.14 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00438 0.146 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 3.46e-01 -0.133 0.141 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0262 0.0966 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0434 0.103 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 7.28e-01 0.0393 0.113 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 2.29e-01 0.175 0.145 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 4.05e-01 0.114 0.136 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 1.27e-01 -0.184 0.12 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 1.43e-02 -0.331 0.134 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 3.40e-01 0.141 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.90e-01 0.00189 0.144 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 3.65e-01 0.136 0.15 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0404 0.0936 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0174 0.0995 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 5.21e-01 0.0804 0.125 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0106 0.131 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 5.17e-01 -0.093 0.143 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0502 0.162 0.093 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 3.84e-01 -0.127 0.145 0.093 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 6.72e-01 0.0747 0.176 0.093 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0398 0.16 0.093 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 3.16e-01 -0.175 0.173 0.093 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 8.09e-02 0.351 0.2 0.093 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 1.41e-01 0.261 0.176 0.093 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 6.71e-01 0.0462 0.108 0.096 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 7.00e-02 -0.213 0.117 0.096 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00908 0.13 0.096 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 4.19e-01 0.119 0.147 0.096 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0723 0.144 0.096 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 1.20e-01 -0.174 0.111 0.096 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 7.03e-01 -0.04 0.105 0.094 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0244 0.108 0.094 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 3.12e-01 -0.13 0.128 0.094 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 4.30e-02 -0.288 0.141 0.094 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0642 0.146 0.094 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 3.02e-01 -0.106 0.103 0.093 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 9.98e-01 0.000263 0.104 0.093 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00311 0.142 0.093 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 2.20e-02 -0.264 0.114 0.093 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 7.37e-01 0.0484 0.144 0.093 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 9.26e-01 0.0147 0.159 0.093 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 4.29e-01 0.115 0.145 0.093 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 4.85e-01 0.0619 0.0883 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0431 0.0925 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0227 0.132 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 2.05e-01 -0.134 0.106 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 9.01e-01 0.0167 0.135 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 9.50e-01 0.00928 0.146 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 6.62e-01 0.0587 0.134 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0337 0.0907 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 8.82e-01 0.0132 0.0892 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 2.42e-01 -0.156 0.133 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 1.30e-01 -0.173 0.114 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 6.66e-01 0.0626 0.145 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 5.01e-01 0.0996 0.148 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 3.39e-01 0.138 0.144 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 8.25e-01 0.0319 0.144 0.103 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 4.69e-02 -0.29 0.145 0.103 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 5.56e-02 -0.309 0.16 0.103 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 5.99e-01 0.0818 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0793 0.164 0.103 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 5.59e-01 0.0837 0.143 0.103 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0243 0.0967 0.093 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 7.67e-01 0.0279 0.0942 0.093 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 1.79e-01 0.195 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 2.49e-01 0.13 0.112 0.093 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 3.52e-01 0.126 0.135 0.093 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 8.22e-01 0.0336 0.149 0.093 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 2.13e-01 -0.178 0.143 0.093 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 6.91e-01 0.0361 0.0906 0.093 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 3.70e-01 0.0856 0.0953 0.093 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0431 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0261 0.122 0.093 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 1.81e-01 -0.186 0.138 0.093 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 1.60e-01 -0.21 0.149 0.093 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 4.72e-01 -0.101 0.14 0.093 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 7.17e-01 -0.041 0.113 0.105 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.50e-01 0.0523 0.115 0.105 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0191 0.144 0.105 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0344 0.141 0.105 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 3.34e-01 -0.141 0.146 0.105 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0207 0.163 0.105 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 4.25e-01 -0.116 0.145 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 7.91e-01 0.0316 0.119 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0363 0.125 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0384 0.123 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 7.22e-02 -0.254 0.14 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 1.06e-02 -0.373 0.145 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 4.52e-01 0.102 0.135 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 5.53e-01 0.0671 0.113 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0207 0.111 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 4.03e-01 0.0964 0.115 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 5.75e-01 0.0592 0.105 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 4.53e-01 0.101 0.135 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 4.01e-01 -0.124 0.148 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 3.51e-02 0.287 0.135 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0376 0.106 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 6.94e-01 0.0343 0.0869 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0358 0.0894 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0907 0.116 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 7.08e-02 -0.186 0.102 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 6.59e-01 0.0586 0.133 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 5.60e-01 0.0796 0.137 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 5.17e-01 0.0864 0.133 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 7.28e-01 0.0321 0.092 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 3.71e-01 0.0782 0.0873 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 6.41e-01 0.0634 0.136 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 889910 sc-eQTL 4.16e-01 0.0918 0.113 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0693 0.136 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0678 0.141 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 773869 sc-eQTL 3.63e-01 -0.131 0.144 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 158501 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0386 0.0937 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 128627 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0398 0.0983 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 799313 sc-eQTL 3.43e-01 0.094 0.099 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 799248 sc-eQTL 7.10e-01 0.0463 0.124 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 998799 sc-eQTL 6.98e-01 0.0512 0.131 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162613 \N 799313 3.07e-07 1.7e-07 6.45e-08 2.44e-07 9.8e-08 8.75e-08 2.1e-07 5.62e-08 1.5e-07 7.6e-08 1.61e-07 1.15e-07 2.38e-07 8e-08 6.27e-08 7.98e-08 4.45e-08 1.72e-07 7.11e-08 6.02e-08 1.25e-07 1.31e-07 1.58e-07 3.49e-08 2.28e-07 1.31e-07 1.22e-07 1.04e-07 1.34e-07 1.58e-07 1.14e-07 3.99e-08 3.43e-08 9.72e-08 6.25e-08 2.79e-08 5.54e-08 8.57e-08 5.78e-08 7.77e-08 5.54e-08 1.6e-07 5.22e-08 2.1e-08 3.41e-08 1.71e-08 1.2e-07 3.8e-09 4.8e-08