Genes within 1Mb (chr1:78730918:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0492 0.0921 0.12 B L1
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 2.68e-01 0.119 0.107 0.12 B L1
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0291 0.0977 0.12 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0679 0.0915 0.12 B L1
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 9.77e-01 0.0035 0.122 0.12 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00103 0.128 0.12 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 7.60e-02 -0.194 0.109 0.12 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0249 0.0959 0.12 B L1
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 5.42e-01 0.0455 0.0745 0.12 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 3.13e-01 0.102 0.101 0.12 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0316 0.0966 0.12 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00114 0.0705 0.12 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 2.27e-01 0.103 0.0848 0.12 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 8.92e-01 0.0119 0.088 0.12 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0173 0.104 0.12 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.99e-01 0.0262 0.103 0.12 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 8.47e-01 0.0194 0.101 0.12 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 1.70e-01 -0.115 0.0833 0.12 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 5.29e-01 0.072 0.114 0.12 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 7.47e-01 0.0373 0.115 0.12 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 2.18e-01 0.139 0.112 0.12 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 6.94e-02 0.206 0.113 0.124 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 8.74e-01 0.0152 0.0962 0.124 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 6.85e-01 0.0384 0.0944 0.124 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0855 0.125 0.124 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 7.32e-01 0.0412 0.12 0.124 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 7.13e-01 0.0482 0.131 0.124 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 6.02e-01 0.0735 0.141 0.124 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 4.13e-01 0.11 0.134 0.124 DC L1
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 4.99e-01 0.0533 0.0785 0.12 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0233 0.0774 0.12 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 8.61e-01 -0.014 0.0797 0.12 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 5.81e-01 0.0599 0.108 0.12 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 2.57e-01 0.0998 0.0879 0.12 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0411 0.12 0.12 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 7.63e-01 0.0366 0.121 0.12 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 9.72e-02 0.206 0.124 0.12 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0224 0.107 0.12 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0247 0.0877 0.12 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 2.29e-01 -0.111 0.0919 0.12 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 3.12e-01 -0.09 0.0888 0.12 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 6.70e-01 0.0521 0.122 0.12 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 3.87e-01 0.102 0.117 0.12 NK L1
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 3.13e-01 0.107 0.105 0.12 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0864 0.114 0.12 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 8.16e-01 0.0271 0.116 0.12 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 9.37e-01 0.00728 0.0926 0.12 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 9.28e-01 0.0127 0.141 0.12 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 3.33e-01 0.132 0.137 0.12 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0215 0.125 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 8.82e-02 -0.266 0.155 0.128 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 3.95e-01 0.11 0.129 0.128 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 4.96e-01 0.0889 0.13 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 7.30e-01 0.0521 0.151 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 6.98e-02 -0.222 0.122 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 8.19e-01 0.0336 0.147 0.128 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 2.12e-01 0.197 0.157 0.128 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 1.33e-02 -0.346 0.138 0.128 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 4.90e-02 -0.247 0.125 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 6.93e-01 0.0474 0.12 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 1.90e-01 -0.159 0.121 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 5.02e-02 -0.233 0.119 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 5.72e-01 0.0757 0.134 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 1.37e-01 0.21 0.14 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 6.90e-01 -0.053 0.133 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 2.80e-01 0.123 0.114 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 4.36e-01 -0.104 0.133 0.119 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 9.45e-01 0.00726 0.105 0.119 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 6.91e-01 0.0418 0.105 0.119 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0461 0.137 0.119 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0354 0.133 0.119 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 8.11e-01 0.0331 0.138 0.119 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0197 0.139 0.119 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 1.54e-01 -0.168 0.117 0.119 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 2.73e-01 -0.122 0.111 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 1.75e-01 0.137 0.1 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0135 0.105 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 1.54e-01 0.147 0.103 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 8.95e-01 0.0164 0.124 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0907 0.135 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 1.75e-01 -0.177 0.13 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 5.51e-01 0.0608 0.102 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 3.77e-01 0.112 0.126 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 9.83e-01 0.00225 0.105 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 3.58e-01 -0.105 0.114 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 1.98e-01 -0.155 0.12 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0957 0.123 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0401 0.143 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 4.81e-01 -0.1 0.142 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0781 0.121 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 4.92e-01 0.0979 0.142 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 8.87e-01 0.0159 0.112 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0892 0.128 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0205 0.142 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 3.65e-01 -0.126 0.139 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00865 0.145 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 4.07e-01 0.0754 0.0907 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.22e-01 0.0381 0.107 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00356 0.109 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0666 0.0775 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000407 0.0829 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 4.11e-01 0.0782 0.095 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 3.88e-01 0.0844 0.0976 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 9.75e-02 0.165 0.0992 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0346 0.104 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 8.04e-01 0.0243 0.0977 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00452 0.122 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 9.96e-01 0.000582 0.128 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 1.59e-01 -0.183 0.13 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 2.21e-01 0.148 0.121 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 4.08e-01 -0.101 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0325 0.118 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 3.90e-01 0.118 0.137 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 3.59e-01 -0.13 0.141 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 8.04e-01 0.0294 0.118 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 8.29e-01 -0.022 0.102 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 9.74e-01 0.00371 0.114 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 2.75e-01 -0.118 0.108 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 2.67e-01 0.141 0.127 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 9.11e-01 0.0132 0.118 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 4.05e-01 0.101 0.121 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 9.67e-01 0.00496 0.121 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 3.84e-01 0.0946 0.108 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00186 0.112 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0359 0.102 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 9.91e-01 0.00142 0.123 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0868 0.124 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 2.69e-01 0.133 0.12 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 5.49e-01 0.084 0.14 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0236 0.134 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0305 0.122 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 1.24e-01 -0.196 0.127 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 3.79e-01 -0.123 0.14 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 2.98e-01 0.149 0.142 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00305 0.125 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 6.94e-02 0.276 0.151 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0467 0.112 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 2.32e-01 -0.139 0.116 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 3.87e-01 -0.121 0.14 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 3.23e-01 0.139 0.141 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 4.96e-01 -0.102 0.15 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 4.74e-01 0.0875 0.122 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 3.00e-01 0.127 0.122 0.119 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.91e-02 -0.198 0.112 0.119 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 1.90e-01 -0.164 0.125 0.119 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 3.03e-01 0.137 0.133 0.119 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 1.34e-01 -0.204 0.135 0.119 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 1.40e-01 0.2 0.135 0.119 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 2.36e-01 -0.147 0.124 0.119 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 2.36e-01 -0.169 0.142 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0223 0.105 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 6.45e-01 0.0568 0.123 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0227 0.131 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 2.11e-01 0.17 0.136 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 4.79e-01 0.0933 0.132 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0365 0.116 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0304 0.0905 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 8.91e-02 -0.164 0.0961 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 9.10e-01 0.0119 0.106 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 8.20e-01 -0.031 0.136 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 4.02e-01 0.107 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 6.53e-01 0.0679 0.151 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0413 0.117 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0685 0.132 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 4.68e-01 -0.104 0.143 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 8.37e-02 -0.241 0.139 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0327 0.146 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 4.67e-02 0.247 0.124 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0517 0.0881 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0715 0.0935 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 3.71e-02 -0.245 0.117 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 3.09e-01 -0.126 0.123 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 7.26e-01 0.0475 0.135 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 1.49e-01 0.269 0.185 0.093 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0432 0.162 0.093 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 2.71e-01 -0.16 0.145 0.093 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 4.52e-01 0.133 0.176 0.093 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 3.60e-01 0.147 0.16 0.093 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 1.91e-01 0.228 0.173 0.093 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 2.28e-01 -0.244 0.201 0.093 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 6.46e-02 0.327 0.175 0.093 PB L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 3.46e-01 0.128 0.136 0.122 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 1.27e-01 -0.159 0.104 0.122 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 6.71e-01 0.0482 0.113 0.122 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0656 0.124 0.122 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0252 0.142 0.122 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 2.80e-01 -0.149 0.138 0.122 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0709 0.107 0.122 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0525 0.125 0.12 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0216 0.0981 0.12 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 3.21e-01 -0.101 0.101 0.12 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 7.95e-01 0.0313 0.12 0.12 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 3.21e-01 0.133 0.133 0.12 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0348 0.137 0.12 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 1.07e-02 0.321 0.124 0.129 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 2.17e-01 0.118 0.095 0.129 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 3.85e-01 0.0838 0.0963 0.129 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 8.14e-01 -0.031 0.132 0.129 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 8.37e-01 0.022 0.107 0.129 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 6.76e-01 0.0558 0.133 0.129 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 5.29e-01 0.0926 0.147 0.129 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 2.12e-01 0.168 0.134 0.129 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0244 0.0855 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.39e-01 0.0279 0.0836 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0174 0.0875 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 4.68e-01 0.0907 0.125 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 5.19e-01 0.0646 0.1 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 9.40e-01 0.00955 0.127 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 4.75e-01 0.0989 0.138 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 2.06e-01 0.16 0.126 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 3.16e-01 0.105 0.104 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 8.80e-01 0.013 0.0859 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00865 0.0845 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 6.00e-01 0.0662 0.126 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 8.63e-01 0.0188 0.108 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00144 0.137 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0694 0.14 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 5.59e-01 0.0798 0.136 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0293 0.153 0.121 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 7.21e-01 0.0501 0.14 0.121 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 4.57e-01 0.106 0.142 0.121 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000332 0.157 0.121 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 6.59e-01 0.0667 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0152 0.159 0.121 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 9.03e-01 0.017 0.139 0.121 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 4.39e-01 0.0963 0.124 0.124 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00824 0.0909 0.124 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 6.79e-01 0.0367 0.0886 0.124 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0209 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0573 0.106 0.124 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0496 0.127 0.124 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 4.99e-01 0.0946 0.14 0.124 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 4.47e-02 0.269 0.133 0.124 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 3.09e-01 -0.11 0.108 0.124 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0849 0.0845 0.124 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 1.34e-01 -0.134 0.0888 0.124 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 9.75e-01 0.00413 0.134 0.124 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 7.01e-01 0.0437 0.114 0.124 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0147 0.13 0.124 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 7.93e-01 0.0368 0.14 0.124 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 7.72e-01 -0.038 0.131 0.124 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 3.59e-01 -0.125 0.136 0.138 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0806 0.104 0.138 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 1.54e-01 0.151 0.105 0.138 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 2.49e-01 -0.153 0.132 0.138 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0507 0.129 0.138 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 5.40e-01 0.0825 0.134 0.138 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0042 0.15 0.138 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0125 0.133 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 1.08e-01 -0.172 0.107 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 2.80e-01 0.122 0.113 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0574 0.118 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 7.56e-02 -0.207 0.116 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0198 0.134 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 3.22e-01 0.138 0.138 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00316 0.128 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0226 0.107 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0341 0.105 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 2.90e-01 0.11 0.104 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00304 0.108 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 4.95e-01 0.0676 0.0989 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0485 0.127 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 3.16e-01 -0.139 0.138 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 1.22e-01 -0.198 0.127 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0124 0.0995 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 8.15e-01 0.0194 0.0832 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 9.40e-01 0.00622 0.0824 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00562 0.0849 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 4.14e-01 0.09 0.11 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 3.08e-01 0.0996 0.0974 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 7.75e-01 0.0359 0.126 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 6.93e-01 0.0512 0.13 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 2.37e-01 0.15 0.126 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 9.91e-01 0.00103 0.0927 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0462 0.0869 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0314 0.0826 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0504 0.128 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 842405 sc-eQTL 5.59e-01 0.0624 0.107 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 4.32e-01 -0.101 0.128 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00479 0.133 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 726364 sc-eQTL 1.14e-01 0.215 0.135 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 971066 sc-eQTL 8.55e-01 0.0198 0.108 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 110996 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0212 0.0872 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 81122 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0887 0.0913 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 751808 sc-eQTL 2.41e-01 -0.108 0.0921 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 751743 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0758 0.116 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 951294 sc-eQTL 3.70e-01 0.11 0.122 0.121 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162614 NEXN 842405 eQTL 0.0236 0.0455 0.0201 0.00144 0.0 0.173


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina