Genes within 1Mb (chr1:78692972:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.63e-01 0.0284 0.0938 0.107 B L1
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 3.99e-01 0.0919 0.109 0.107 B L1
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.82e-01 0.0275 0.0994 0.107 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 2.71e-01 -0.103 0.093 0.107 B L1
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 3.00e-01 -0.129 0.124 0.107 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 1.96e-01 0.168 0.13 0.107 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0725 0.112 0.107 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0253 0.0976 0.107 B L1
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 4.82e-01 0.0526 0.0748 0.107 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 4.87e-01 0.0706 0.101 0.107 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0355 0.0969 0.107 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 4.09e-01 0.0584 0.0706 0.107 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 1.79e-01 0.115 0.085 0.107 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 3.64e-02 0.184 0.0874 0.107 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.105 0.107 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000696 0.104 0.107 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.83e-01 0.0281 0.102 0.107 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0301 0.0846 0.107 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 8.86e-01 0.0166 0.116 0.107 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 3.08e-01 0.119 0.116 0.107 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 2.26e-01 0.138 0.113 0.107 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.00e-01 0.0444 0.115 0.108 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 5.33e-01 0.0605 0.0971 0.108 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 3.80e-01 0.0837 0.0952 0.108 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.47e-01 0.00835 0.127 0.108 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 2.98e-01 0.126 0.121 0.108 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 5.00e-01 0.0891 0.132 0.108 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 6.78e-01 0.0592 0.142 0.108 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 3.08e-01 0.139 0.135 0.108 DC L1
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 9.75e-01 0.00251 0.0789 0.107 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 8.52e-01 0.0145 0.0776 0.107 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 3.77e-01 0.0707 0.0798 0.107 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 4.11e-01 0.0895 0.109 0.107 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 9.22e-02 0.149 0.0878 0.107 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 9.86e-01 0.00212 0.12 0.107 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 3.69e-01 -0.109 0.121 0.107 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 6.82e-01 0.0513 0.125 0.107 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 8.03e-01 0.0275 0.11 0.105 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 9.86e-01 0.00154 0.09 0.105 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0855 0.0943 0.105 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0102 0.0912 0.105 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.88e-01 0.108 0.125 0.105 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 1.46e-01 0.175 0.12 0.105 NK L1
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 8.68e-01 0.0177 0.106 0.107 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0338 0.114 0.107 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 4.46e-01 0.0889 0.116 0.107 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.81e-01 0.00224 0.093 0.107 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.77e-02 0.294 0.14 0.107 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 9.96e-01 0.000697 0.138 0.107 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 3.88e-01 -0.109 0.126 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0708 0.155 0.11 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 8.02e-01 0.0323 0.128 0.11 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 2.45e-01 0.15 0.129 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 8.31e-01 0.032 0.15 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0217 0.122 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 1.12e-01 0.23 0.144 0.11 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 9.72e-01 0.00553 0.157 0.11 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 1.09e-01 -0.223 0.138 0.11 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 1.44e-01 -0.185 0.126 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 8.89e-01 0.0169 0.121 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 9.02e-02 -0.207 0.121 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 6.40e-02 -0.223 0.12 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0524 0.135 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 5.82e-03 0.389 0.14 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 4.24e-01 0.107 0.134 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 5.01e-01 0.0776 0.115 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 4.53e-01 -0.102 0.136 0.106 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 4.87e-01 0.0745 0.107 0.106 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 1.16e-01 0.168 0.106 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 6.89e-01 0.0559 0.139 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 8.26e-01 0.03 0.136 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.34e-01 -0.136 0.14 0.106 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 7.84e-01 0.0386 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 9.60e-01 0.00605 0.12 0.106 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 9.04e-01 0.0138 0.115 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 2.47e-01 0.12 0.103 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00327 0.107 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 6.81e-01 0.0436 0.106 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 7.98e-01 0.0326 0.127 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.58e-01 -0.128 0.139 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0926 0.134 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 9.15e-01 0.0111 0.105 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 4.32e-01 0.101 0.129 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 4.47e-01 0.081 0.106 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.00e-01 0.045 0.116 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 2.00e-01 -0.157 0.122 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 1.89e-01 -0.165 0.125 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 5.44e-01 0.0885 0.146 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 2.79e-01 -0.156 0.144 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 1.17e-01 -0.192 0.122 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 5.69e-01 0.0801 0.141 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0188 0.11 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 1.38e-01 -0.188 0.126 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 2.50e-01 0.161 0.14 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0235 0.138 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 8.20e-01 0.0327 0.143 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 4.34e-01 0.0718 0.0917 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 7.79e-01 0.0303 0.108 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0422 0.11 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 4.92e-01 0.0539 0.0783 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 9.70e-01 0.00315 0.0837 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 3.36e-02 0.203 0.095 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 6.60e-01 0.0436 0.0988 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 1.33e-01 0.151 0.1 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 6.56e-01 0.0471 0.105 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.11e-01 0.011 0.0987 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.57e-01 0.114 0.123 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 8.74e-01 0.0206 0.13 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0624 0.131 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 9.65e-01 0.00529 0.122 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.09e-01 0.0461 0.123 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 8.14e-01 0.0279 0.119 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 1.16e-01 0.218 0.138 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 9.85e-01 0.00274 0.143 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 6.44e-01 0.0554 0.12 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 8.30e-01 0.0222 0.103 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 4.57e-01 0.0863 0.116 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 5.29e-01 -0.069 0.109 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0831 0.129 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 5.25e-01 0.0761 0.12 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 1.26e-01 0.188 0.122 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 6.58e-01 0.0541 0.122 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 2.61e-01 0.124 0.11 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 4.37e-01 0.0878 0.113 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 8.65e-01 0.0176 0.103 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00456 0.124 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00844 0.126 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 4.80e-01 0.0863 0.122 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0526 0.139 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 5.73e-01 0.0752 0.133 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.12 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.46e-01 0.00851 0.126 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0439 0.138 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 1.56e-02 0.34 0.139 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0071 0.124 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 2.68e-01 0.168 0.152 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0554 0.112 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0469 0.116 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 4.97e-01 0.0951 0.14 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 1.12e-01 0.224 0.14 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0746 0.15 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 4.23e-01 0.0979 0.122 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.54e-01 0.0387 0.123 0.106 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0741 0.113 0.106 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0209 0.126 0.106 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000567 0.134 0.106 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 9.84e-01 0.00277 0.137 0.106 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 3.66e-01 0.123 0.136 0.106 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0915 0.125 0.106 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 9.15e-01 0.0154 0.144 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 5.84e-01 0.058 0.106 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0461 0.124 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0308 0.132 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 7.74e-01 0.0395 0.138 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 2.25e-01 0.161 0.132 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0454 0.119 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0174 0.0928 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0692 0.0991 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 8.55e-02 0.186 0.108 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0497 0.139 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 3.51e-01 0.122 0.131 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0441 0.151 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 6.35e-01 0.0556 0.117 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 6.39e-01 -0.062 0.132 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 1.66e-01 -0.198 0.143 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.47e-01 -0.132 0.139 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 9.25e-02 -0.245 0.145 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 5.70e-03 0.353 0.126 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0453 0.091 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0436 0.0967 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 2.48e-01 -0.141 0.121 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 2.90e-01 -0.135 0.127 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 2.72e-01 0.153 0.139 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 1.62e-01 0.302 0.214 0.078 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0941 0.188 0.078 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 3.07e-02 -0.362 0.165 0.078 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0809 0.204 0.078 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 6.19e-01 0.0928 0.186 0.078 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.99e-01 0.171 0.202 0.078 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 5.27e-01 -0.149 0.235 0.078 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 5.92e-01 0.111 0.206 0.078 PB L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 2.90e-01 0.144 0.136 0.109 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0682 0.104 0.109 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 3.41e-01 0.108 0.113 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0458 0.125 0.109 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.65e-01 0.128 0.142 0.109 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0913 0.138 0.109 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 2.01e-01 -0.137 0.107 0.109 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 9.71e-01 0.00463 0.126 0.107 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0259 0.0986 0.107 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0392 0.102 0.107 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 8.14e-01 0.0285 0.121 0.107 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 7.16e-01 0.049 0.134 0.107 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 8.91e-01 0.0189 0.137 0.107 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 2.96e-01 0.134 0.128 0.112 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 6.69e-01 0.0415 0.0968 0.112 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 1.09e-01 0.157 0.0973 0.112 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0686 0.134 0.112 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 1.24e-01 0.167 0.108 0.112 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.80e-01 0.119 0.135 0.112 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 9.04e-01 -0.018 0.149 0.112 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 1.59e-01 0.193 0.136 0.112 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00874 0.086 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 4.15e-01 0.0686 0.0839 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 3.11e-01 0.0891 0.0878 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.126 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 4.41e-01 0.0778 0.101 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 5.26e-01 0.0814 0.128 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 9.80e-01 0.00356 0.139 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00151 0.128 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.35e-01 -0.036 0.106 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 4.83e-01 0.0612 0.087 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 4.50e-01 0.0647 0.0855 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 6.85e-01 0.0519 0.128 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 2.30e-01 0.132 0.109 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00886 0.139 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 1.16e-01 -0.223 0.141 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0778 0.138 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 2.92e-01 -0.161 0.152 0.112 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0851 0.139 0.112 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 2.43e-01 -0.165 0.141 0.112 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 4.15e-01 -0.127 0.156 0.112 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.77e-01 0.132 0.15 0.112 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0329 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 7.63e-01 0.0418 0.138 0.112 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 4.04e-01 -0.107 0.128 0.107 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00478 0.0935 0.107 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 3.21e-01 0.0906 0.091 0.107 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0109 0.141 0.107 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 4.00e-01 0.0916 0.109 0.107 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 1.77e-01 -0.177 0.13 0.107 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 9.00e-01 0.018 0.144 0.107 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 2.49e-01 0.16 0.138 0.107 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.22e-01 -0.039 0.109 0.111 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0239 0.0858 0.111 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0703 0.0903 0.111 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0136 0.135 0.111 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 7.10e-01 0.043 0.115 0.111 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 4.45e-01 -0.101 0.131 0.111 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 5.96e-01 0.0754 0.142 0.111 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 5.42e-01 0.081 0.133 0.111 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 3.07e-01 -0.144 0.14 0.119 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 7.58e-01 0.0331 0.107 0.119 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.29e-01 0.0379 0.109 0.119 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0554 0.137 0.119 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 2.48e-01 -0.154 0.133 0.119 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 9.36e-01 0.0112 0.139 0.119 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 7.79e-01 0.0435 0.155 0.119 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0726 0.137 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 1.68e-01 -0.149 0.108 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 4.59e-01 0.0843 0.114 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0644 0.119 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 1.92e-01 -0.153 0.117 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0649 0.135 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 3.24e-02 0.298 0.138 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 4.39e-01 0.0999 0.129 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 5.17e-01 0.0698 0.108 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 7.62e-01 0.0326 0.108 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 3.97e-01 0.0901 0.106 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.71e-01 0.0322 0.11 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0339 0.101 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 2.59e-01 -0.146 0.129 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0828 0.142 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 1.96e-01 -0.169 0.13 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0851 0.101 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0207 0.0836 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 5.00e-01 0.0559 0.0828 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 2.26e-01 0.103 0.085 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 8.02e-01 0.0277 0.111 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 1.32e-01 0.148 0.0977 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 4.65e-01 0.0925 0.126 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 4.15e-01 -0.106 0.13 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0183 0.127 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0486 0.0945 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 9.73e-01 -0.003 0.0887 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 7.02e-01 0.0323 0.0842 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 8.74e-01 0.0208 0.131 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 804459 sc-eQTL 6.01e-01 0.057 0.109 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 2.21e-01 -0.16 0.13 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0726 0.135 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 688418 sc-eQTL 2.91e-01 0.147 0.139 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 933120 sc-eQTL 6.61e-01 0.0488 0.111 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 73050 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0265 0.0896 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 43176 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0412 0.094 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 713862 sc-eQTL 9.93e-01 0.000871 0.0949 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 713797 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0393 0.119 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 913348 sc-eQTL 2.13e-01 0.157 0.125 0.106 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137965 IFI44 43176 eQTL 0.00928 -0.0459 0.0176 0.00217 0.0 0.138


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000137965 IFI44 43176 9.98e-06 1.26e-05 1.88e-06 7.13e-06 2.44e-06 4.8e-06 1.16e-05 2.07e-06 9.72e-06 5.42e-06 1.4e-05 6.05e-06 1.93e-05 3.99e-06 3.33e-06 6.51e-06 6.55e-06 7.78e-06 3.04e-06 2.86e-06 5.84e-06 1.04e-05 9.94e-06 3.27e-06 1.83e-05 3.9e-06 4.86e-06 4.08e-06 1.14e-05 1.22e-05 6.69e-06 9.55e-07 1.1e-06 3.37e-06 5.12e-06 2.67e-06 1.79e-06 2.06e-06 2.06e-06 9.86e-07 1.04e-06 1.6e-05 1.39e-06 1.5e-07 6.81e-07 1.75e-06 1.56e-06 7.04e-07 4.55e-07