logo

Genes within 1Mb (chr1:78686250:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 5.03e-01 0.0591 0.088 0.124 B L1
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 1.62e-01 0.143 0.102 0.124 B L1
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 3.30e-01 0.091 0.0932 0.124 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0528 0.0875 0.124 B L1
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0365 0.117 0.124 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 6.02e-01 0.0637 0.122 0.124 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 3.30e-01 -0.102 0.105 0.124 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 9.45e-01 0.00639 0.0917 0.124 B L1
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 4.05e-01 0.0587 0.0703 0.124 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 3.15e-01 0.096 0.0953 0.124 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0376 0.0912 0.124 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 6.38e-01 0.0314 0.0665 0.124 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 3.11e-01 0.0813 0.0801 0.124 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 1.05e-01 0.134 0.0825 0.124 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 8.92e-01 0.0134 0.0986 0.124 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 8.52e-01 0.0183 0.0977 0.124 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.75e-01 0.0537 0.0957 0.124 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 9.64e-01 0.00359 0.0795 0.124 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00563 0.109 0.124 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 5.14e-01 0.0714 0.109 0.124 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 9.95e-02 0.176 0.106 0.124 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 5.93e-01 0.0582 0.109 0.126 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 5.53e-01 0.0544 0.0916 0.126 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 3.67e-01 0.0812 0.0898 0.126 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0209 0.119 0.126 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 3.67e-01 0.103 0.114 0.126 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 3.20e-01 0.124 0.124 0.126 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 9.72e-01 0.00464 0.134 0.126 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 1.69e-01 0.176 0.127 0.126 DC L1
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 5.56e-01 0.0434 0.0736 0.124 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 5.46e-01 0.0438 0.0724 0.124 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 2.65e-01 0.0831 0.0745 0.124 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 2.39e-01 0.12 0.101 0.124 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 4.18e-02 0.168 0.0818 0.124 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00171 0.112 0.124 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 7.12e-01 -0.042 0.114 0.124 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 1.96e-01 0.151 0.116 0.124 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 8.86e-01 0.0147 0.103 0.122 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 7.89e-01 0.0225 0.0839 0.122 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0947 0.0879 0.122 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0771 0.0849 0.122 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 5.62e-01 0.0678 0.117 0.122 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 2.10e-01 0.141 0.112 0.122 NK L1
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0123 0.1 0.124 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 9.25e-01 0.0102 0.108 0.124 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.42e-01 0.067 0.11 0.124 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 7.54e-01 0.0275 0.0876 0.124 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 3.79e-01 0.118 0.133 0.124 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 5.00e-01 0.0875 0.129 0.124 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0757 0.118 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0777 0.152 0.125 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 4.73e-01 0.0907 0.126 0.125 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 2.96e-01 0.133 0.127 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 6.07e-01 0.0757 0.147 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 2.66e-01 -0.133 0.119 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 3.00e-01 0.148 0.143 0.125 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0455 0.154 0.125 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 9.60e-02 -0.228 0.136 0.125 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 1.22e-01 -0.183 0.118 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 6.82e-01 0.0462 0.113 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 2.21e-01 -0.14 0.114 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 3.15e-01 -0.113 0.112 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0346 0.126 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 3.00e-02 0.286 0.131 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 8.52e-01 0.0233 0.125 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 3.05e-01 0.11 0.107 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.96e-01 0.00067 0.126 0.123 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 1.44e-01 0.145 0.0992 0.123 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 1.87e-01 0.131 0.0993 0.123 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 6.44e-01 0.0599 0.13 0.123 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 9.42e-01 0.00916 0.127 0.123 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 4.40e-01 -0.101 0.131 0.123 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0553 0.131 0.123 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00167 0.112 0.123 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.62e-01 0.00506 0.107 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 1.13e-01 0.153 0.0962 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 9.85e-01 0.00184 0.101 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 2.61e-01 0.112 0.099 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 6.05e-01 0.0617 0.119 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0951 0.13 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 3.91e-01 -0.108 0.125 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 5.22e-01 0.0627 0.0978 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 2.66e-01 0.134 0.12 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 7.25e-01 0.035 0.0994 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 3.19e-01 0.108 0.109 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 2.39e-01 -0.135 0.114 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 3.47e-01 -0.11 0.117 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0639 0.136 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 3.69e-01 -0.121 0.135 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 2.74e-01 -0.126 0.115 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 5.30e-01 0.0832 0.132 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00699 0.104 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 1.94e-01 -0.155 0.119 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 8.20e-01 0.03 0.132 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 4.82e-01 -0.091 0.129 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 9.82e-01 0.00312 0.135 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 2.25e-01 0.105 0.0859 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 5.62e-01 0.059 0.101 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0666 0.103 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 9.78e-01 0.00204 0.0736 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 9.99e-01 -5.82e-05 0.0786 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 1.34e-01 0.135 0.0897 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 3.66e-01 0.0838 0.0926 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 8.58e-02 0.162 0.094 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 4.88e-01 0.0686 0.0989 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 5.55e-01 0.0548 0.0926 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 7.68e-01 0.0341 0.116 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 7.84e-01 0.0333 0.122 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 1.97e-01 -0.16 0.123 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 4.07e-01 0.0952 0.115 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 9.79e-01 0.00304 0.116 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 9.95e-01 0.000749 0.112 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 1.36e-01 0.194 0.13 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 7.18e-01 0.0485 0.134 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 3.12e-01 0.114 0.113 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 8.78e-01 0.015 0.0973 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 3.68e-01 0.0983 0.109 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0823 0.103 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0979 0.122 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 9.29e-01 0.0101 0.113 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 2.47e-01 0.134 0.115 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 7.87e-01 0.0309 0.114 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 1.34e-01 0.154 0.102 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 2.14e-01 0.131 0.105 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 6.04e-01 0.0503 0.0968 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0201 0.116 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0128 0.118 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 1.94e-01 0.148 0.114 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.60e-01 0.00648 0.13 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 8.32e-01 0.0266 0.125 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.60e-01 -0.066 0.113 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 7.14e-01 0.0436 0.119 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 9.28e-01 0.0117 0.13 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 2.29e-02 0.3 0.131 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 8.36e-01 0.0241 0.117 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 4.24e-01 0.116 0.144 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0326 0.106 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0365 0.11 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 5.10e-01 0.0878 0.133 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 2.92e-01 0.141 0.134 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0627 0.142 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 4.91e-01 0.08 0.116 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00659 0.116 0.123 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 6.41e-01 -0.05 0.107 0.123 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0753 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0192 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 2.26e-01 -0.156 0.129 0.123 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 3.38e-01 0.123 0.128 0.123 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0458 0.118 0.123 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 6.24e-01 0.067 0.137 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 7.65e-01 0.0302 0.101 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0231 0.118 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0482 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 8.76e-01 0.0205 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 2.02e-01 0.161 0.126 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0494 0.111 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 7.87e-01 0.0235 0.0866 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0494 0.0925 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 3.88e-01 0.0875 0.101 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 9.76e-01 0.00396 0.13 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 5.38e-01 0.0752 0.122 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.60e-01 0.00718 0.141 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 8.51e-01 0.0207 0.11 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0793 0.124 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 9.94e-02 -0.221 0.134 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 3.97e-01 -0.111 0.131 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 1.57e-01 -0.194 0.136 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 3.21e-02 0.256 0.118 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 9.62e-01 0.00405 0.0847 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 4.37e-01 -0.07 0.0898 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 1.21e-01 -0.175 0.113 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 1.40e-01 -0.175 0.118 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 3.99e-01 0.11 0.13 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 1.34e-01 0.269 0.178 0.093 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 8.36e-01 0.0326 0.157 0.093 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 6.93e-02 -0.254 0.139 0.093 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 4.75e-01 -0.122 0.17 0.093 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 6.29e-01 0.075 0.155 0.093 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 1.84e-01 0.223 0.167 0.093 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 4.63e-01 -0.144 0.195 0.093 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 4.94e-01 0.118 0.172 0.093 PB L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 6.69e-01 0.055 0.129 0.126 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 7.54e-01 -0.031 0.0988 0.126 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 6.73e-01 0.0454 0.107 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 9.29e-01 0.0106 0.118 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 3.59e-01 0.123 0.134 0.126 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0783 0.131 0.126 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 1.65e-01 -0.141 0.101 0.126 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0896 0.12 0.124 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 9.79e-01 0.00242 0.0938 0.124 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0398 0.0969 0.124 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 5.46e-01 0.0694 0.115 0.124 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 9.52e-01 0.00769 0.128 0.124 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0102 0.131 0.124 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 1.60e-01 0.17 0.12 0.129 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 3.09e-01 0.0927 0.0908 0.129 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 7.96e-02 0.161 0.0914 0.129 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0928 0.126 0.129 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 1.79e-01 0.137 0.102 0.129 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 5.07e-01 0.0847 0.127 0.129 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0585 0.14 0.129 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 1.50e-01 0.185 0.128 0.129 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00586 0.0805 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 3.08e-01 0.0803 0.0785 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 2.22e-01 0.1 0.0821 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 7.36e-01 0.0397 0.118 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 2.73e-01 0.103 0.0941 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 5.95e-01 0.0639 0.12 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 7.27e-01 0.0454 0.13 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 5.91e-01 0.0643 0.119 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0138 0.0989 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 2.98e-01 0.0846 0.0811 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 4.27e-01 0.0635 0.0798 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 5.15e-01 0.0778 0.119 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 2.76e-01 0.112 0.102 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0236 0.13 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 2.42e-01 -0.155 0.132 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 5.41e-01 0.0789 0.129 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0903 0.142 0.133 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 5.70e-01 -0.074 0.13 0.133 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0346 0.132 0.133 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00753 0.146 0.133 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 4.82e-01 0.0985 0.14 0.133 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 9.78e-01 0.00418 0.148 0.133 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 7.08e-01 0.0484 0.129 0.133 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.35e-01 0.00968 0.119 0.124 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 5.44e-01 0.0529 0.0871 0.124 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 2.40e-01 0.0998 0.0847 0.124 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 9.67e-01 0.00538 0.131 0.124 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 4.62e-01 0.0747 0.101 0.124 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0264 0.122 0.124 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 8.20e-01 0.0306 0.134 0.124 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 7.90e-02 0.226 0.128 0.124 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00844 0.103 0.127 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 8.58e-01 0.0145 0.0806 0.127 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 4.88e-01 -0.059 0.0849 0.127 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 8.38e-01 0.026 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 9.53e-01 0.00639 0.108 0.127 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0953 0.123 0.127 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 8.18e-01 0.0308 0.133 0.127 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 5.28e-01 0.0787 0.125 0.127 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 2.56e-01 -0.151 0.133 0.138 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 9.60e-01 0.00514 0.102 0.138 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.54e-01 0.0611 0.103 0.138 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0435 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 2.80e-01 -0.136 0.126 0.138 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 6.12e-01 0.0666 0.131 0.138 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 8.39e-01 0.0297 0.146 0.138 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0171 0.13 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0845 0.101 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 1.93e-01 0.138 0.106 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 7.74e-01 -0.032 0.111 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0846 0.11 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0738 0.126 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 1.57e-01 0.185 0.13 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00293 0.121 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 4.96e-01 0.0686 0.1 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 6.19e-01 0.0501 0.101 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 2.71e-01 0.11 0.0993 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 4.20e-01 0.0836 0.103 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 8.19e-01 0.0217 0.0948 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0758 0.121 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 2.98e-01 -0.138 0.133 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 1.86e-01 -0.162 0.122 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0291 0.0953 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 9.05e-01 0.00931 0.0783 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 3.33e-01 0.0751 0.0774 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 1.61e-01 0.112 0.0795 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 4.82e-01 0.0729 0.104 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 6.05e-02 0.172 0.0912 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 5.36e-01 0.0734 0.118 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0348 0.122 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 4.63e-01 0.0875 0.119 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 8.79e-01 0.0135 0.0883 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 5.62e-01 0.048 0.0827 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 6.21e-01 0.0389 0.0786 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 8.53e-01 0.0227 0.122 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 797737 sc-eQTL 5.42e-01 0.0619 0.101 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0813 0.122 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0744 0.126 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 681696 sc-eQTL 1.02e-01 0.212 0.129 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 926398 sc-eQTL 7.36e-01 0.035 0.103 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 66328 sc-eQTL 8.58e-01 0.015 0.0835 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 36454 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0547 0.0875 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 707140 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0719 0.0882 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 707075 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0348 0.111 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 906626 sc-eQTL 3.45e-01 0.111 0.117 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137965 IFI44 36454 eQTL 0.0043 -0.047 0.0164 0.00312 0.00143 0.169

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000137965 IFI44 36454 1.26e-05 1.25e-05 2.45e-06 6.69e-06 2.39e-06 5.83e-06 1.38e-05 2.14e-06 1.06e-05 5.89e-06 1.45e-05 6.06e-06 1.88e-05 3.99e-06 3.67e-06 7.36e-06 6.37e-06 9.83e-06 3.29e-06 3.12e-06 6.79e-06 1.15e-05 1.08e-05 3.78e-06 1.87e-05 4.6e-06 6.74e-06 4.8e-06 1.33e-05 1.18e-05 7.35e-06 1.02e-06 1.24e-06 3.64e-06 4.96e-06 2.85e-06 1.76e-06 1.99e-06 1.96e-06 1.2e-06 1.2e-06 1.48e-05 1.63e-06 2.1e-07 1.03e-06 1.72e-06 1.91e-06 7.39e-07 4.79e-07