logo

Genes within 1Mb (chr1:78669556:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 1.30e-01 -0.159 0.105 0.192 B L1
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 1.22e-01 -0.117 0.0755 0.192 B L1
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 1.73e-01 -0.12 0.0878 0.192 B L1
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 2.08e-01 -0.101 0.0802 0.192 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 1.32e-01 0.114 0.0751 0.192 B L1
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 7.44e-01 0.0329 0.101 0.192 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 1.97e-01 -0.136 0.105 0.192 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 4.80e-01 -0.064 0.0903 0.192 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 9.82e-01 0.00181 0.0791 0.192 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 5.41e-01 -0.059 0.0964 0.192 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0502 0.0615 0.192 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 7.29e-02 -0.149 0.0828 0.192 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 2.51e-03 -0.239 0.078 0.192 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 9.78e-01 0.00158 0.0581 0.192 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 6.77e-02 -0.128 0.0696 0.192 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0166 0.0726 0.192 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 2.89e-01 -0.095 0.0894 0.192 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 6.89e-02 -0.155 0.0847 0.192 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 3.66e-02 -0.176 0.0837 0.192 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 5.11e-04 -0.284 0.0805 0.192 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 2.73e-01 0.0755 0.0687 0.192 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.15e-01 0.022 0.0941 0.192 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00074 0.0948 0.192 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 2.05e-01 -0.117 0.0923 0.192 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 6.70e-01 0.0439 0.103 0.191 DC L1
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 8.42e-01 0.0186 0.0929 0.191 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 1.78e-02 -0.185 0.0772 0.191 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 8.86e-01 -0.011 0.0769 0.191 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 6.15e-01 0.0514 0.102 0.191 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 9.82e-01 0.00221 0.0979 0.191 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 7.72e-01 0.0309 0.106 0.191 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 7.02e-01 0.0439 0.115 0.191 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00194 0.109 0.191 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 4.15e-01 -0.089 0.109 0.192 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 5.64e-01 0.0371 0.0642 0.192 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0317 0.0632 0.192 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0618 0.065 0.192 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 1.06e-01 -0.143 0.0881 0.192 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0765 0.0719 0.192 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 9.43e-01 0.00702 0.0981 0.192 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 4.05e-01 0.0826 0.099 0.192 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 8.26e-01 0.0225 0.102 0.192 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0415 0.112 0.193 NK L1
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0818 0.0877 0.193 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 1.44e-01 -0.105 0.0714 0.193 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 1.25e-01 -0.116 0.075 0.193 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0393 0.0728 0.193 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.20e-01 0.0228 0.1 0.193 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 8.00e-01 0.0244 0.0963 0.193 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0627 0.109 0.192 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0713 0.0865 0.192 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 2.83e-01 -0.1 0.0932 0.192 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 1.17e-02 -0.238 0.0937 0.192 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 7.56e-02 -0.135 0.0753 0.192 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0275 0.116 0.192 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 7.38e-01 0.0376 0.112 0.192 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 4.03e-01 -0.086 0.103 0.192 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 4.17e-03 -0.359 0.124 0.199 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00911 0.125 0.199 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 6.06e-02 -0.194 0.103 0.199 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 3.93e-02 -0.214 0.103 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 1.47e-01 0.175 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0674 0.0981 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 7.30e-02 -0.21 0.116 0.199 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 4.82e-01 0.0889 0.126 0.199 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0744 0.113 0.199 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 2.82e-01 -0.122 0.114 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 3.89e-01 0.0885 0.102 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0794 0.0974 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0827 0.0986 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0228 0.0974 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 8.61e-01 0.0191 0.109 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0664 0.115 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0522 0.108 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0106 0.093 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 3.28e-01 0.109 0.111 0.194 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 7.67e-01 0.032 0.108 0.194 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 2.83e-01 0.0912 0.0848 0.194 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0747 0.0849 0.194 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00374 0.111 0.194 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 6.49e-02 -0.199 0.107 0.194 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 6.38e-02 0.207 0.111 0.194 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 2.70e-01 -0.124 0.112 0.194 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0403 0.0951 0.194 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 3.46e-01 -0.104 0.11 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 3.42e-02 -0.195 0.0917 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0835 0.0834 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0642 0.0868 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 4.12e-01 0.0704 0.0857 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 7.40e-01 0.0342 0.103 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 3.26e-01 -0.11 0.112 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0446 0.108 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00638 0.0845 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 3.31e-02 -0.243 0.113 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0672 0.103 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 3.87e-03 -0.244 0.0835 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 2.10e-01 -0.117 0.093 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 5.61e-01 0.0572 0.0982 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 8.54e-01 0.0185 0.1 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 3.29e-01 -0.114 0.117 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00444 0.116 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0508 0.0984 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 7.96e-01 0.0322 0.124 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 8.86e-01 0.017 0.118 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 6.37e-01 0.0435 0.0921 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 2.86e-01 0.113 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 2.73e-01 -0.129 0.117 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 6.31e-02 -0.213 0.114 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0354 0.12 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0754 0.101 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0333 0.0754 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 1.12e-02 -0.224 0.0875 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 9.35e-04 -0.295 0.0879 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 6.94e-01 0.0254 0.0644 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0787 0.0686 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0472 0.0789 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0483 0.107 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00532 0.0805 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0933 0.0819 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 3.91e-02 -0.177 0.0851 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0118 0.0804 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 9.89e-01 0.00144 0.1 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 1.80e-01 0.142 0.105 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0462 0.102 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 6.41e-01 0.0492 0.105 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 8.19e-01 0.0224 0.0977 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 4.50e-02 -0.197 0.0977 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 9.28e-01 0.00855 0.0951 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 5.03e-01 0.0744 0.111 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0442 0.114 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 9.40e-01 0.00834 0.111 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0638 0.0979 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0979 0.0842 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 3.78e-02 -0.196 0.0938 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 6.01e-01 0.0469 0.0895 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 2.39e-01 0.124 0.105 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 7.24e-01 0.0346 0.0979 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0911 0.1 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0892 0.106 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 7.50e-02 -0.176 0.0985 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 2.42e-02 -0.201 0.0884 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 5.37e-03 -0.254 0.0902 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 5.26e-01 0.0535 0.0841 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0808 0.101 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0501 0.102 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0374 0.0992 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 2.52e-01 -0.13 0.114 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0272 0.115 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 6.38e-04 -0.37 0.107 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 2.47e-01 -0.115 0.0993 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 8.22e-01 0.0235 0.104 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 2.76e-01 0.125 0.114 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 9.56e-01 0.00652 0.117 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00214 0.103 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0229 0.125 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0346 0.126 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0135 0.0925 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0488 0.096 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 6.66e-01 0.05 0.116 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 1.00e-01 -0.191 0.116 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 2.28e-01 0.149 0.123 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0612 0.101 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0596 0.114 0.19 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 7.57e-01 -0.031 0.1 0.19 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0488 0.0923 0.19 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 1.47e-01 -0.148 0.102 0.19 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0592 0.109 0.19 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.85e-01 0.0162 0.112 0.19 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0379 0.111 0.19 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0533 0.102 0.19 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 2.49e-01 -0.137 0.118 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0449 0.118 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 7.73e-03 -0.23 0.0855 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0213 0.102 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 2.39e-01 -0.128 0.108 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 4.36e-01 0.0882 0.113 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 7.47e-02 -0.194 0.108 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 2.88e-01 0.121 0.114 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 7.72e-01 0.0276 0.0949 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0282 0.0739 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 1.08e-01 -0.127 0.0785 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 2.29e-01 -0.104 0.0862 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 2.37e-01 0.131 0.111 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 3.54e-01 0.0968 0.104 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 7.10e-02 -0.216 0.119 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0678 0.118 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 3.75e-02 -0.19 0.0909 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 2.44e-02 -0.232 0.102 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 6.79e-01 0.0466 0.112 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 7.36e-01 -0.037 0.11 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 5.82e-01 0.0631 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0638 0.114 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 5.52e-02 -0.195 0.101 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 2.61e-01 -0.081 0.0718 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0755 0.0764 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 9.69e-01 0.00369 0.0963 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0153 0.101 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 5.15e-01 0.072 0.11 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 3.39e-01 -0.161 0.167 0.181 PB L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0805 0.147 0.181 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 8.09e-01 -0.031 0.128 0.181 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0805 0.115 0.181 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 4.10e-02 0.283 0.137 0.181 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 5.13e-01 0.0831 0.127 0.181 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 5.20e-02 -0.266 0.136 0.181 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 6.19e-01 0.0798 0.16 0.181 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 1.01e-01 0.23 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 2.32e-01 -0.143 0.119 0.193 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 9.32e-01 0.00948 0.111 0.193 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 6.36e-01 0.0404 0.0852 0.193 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 2.01e-01 -0.118 0.0923 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 1.56e-02 -0.244 0.1 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0289 0.116 0.193 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 5.97e-01 0.0598 0.113 0.193 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0102 0.0877 0.193 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 9.46e-01 0.00766 0.114 0.192 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 5.46e-01 -0.062 0.102 0.192 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0767 0.0802 0.192 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 7.94e-02 -0.145 0.0824 0.192 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0277 0.0984 0.192 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 7.16e-02 -0.197 0.109 0.192 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 7.54e-01 0.0352 0.112 0.192 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0766 0.122 0.193 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 5.90e-01 0.0564 0.105 0.193 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0995 0.0785 0.193 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 8.28e-01 0.0173 0.0797 0.193 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0425 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 2.88e-01 -0.094 0.0882 0.193 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 5.22e-01 0.0706 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 3.43e-01 0.115 0.121 0.193 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 4.71e-01 0.0802 0.111 0.193 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0972 0.111 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0247 0.0699 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 5.88e-01 -0.037 0.0683 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 1.45e-01 -0.104 0.0711 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 3.47e-01 -0.096 0.102 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0655 0.0818 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 2.10e-01 0.13 0.104 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0398 0.113 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 7.20e-01 0.0372 0.104 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 9.89e-01 0.00164 0.119 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 2.23e-01 0.104 0.0854 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 8.31e-02 -0.122 0.0699 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 4.44e-01 -0.053 0.0692 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 1.61e-01 -0.145 0.103 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 9.19e-02 -0.149 0.0883 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 6.05e-01 0.0583 0.112 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 1.81e-01 0.153 0.114 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 7.36e-01 0.0377 0.112 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 9.55e-01 0.0077 0.135 0.209 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 4.09e-01 0.105 0.127 0.209 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0573 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 6.04e-02 -0.222 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0412 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 2.14e-01 0.156 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 4.01e-01 0.111 0.132 0.209 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0463 0.116 0.209 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 3.04e-01 -0.125 0.122 0.196 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 4.00e-01 0.0854 0.101 0.196 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 8.26e-01 0.0163 0.074 0.196 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 8.48e-02 -0.124 0.0716 0.196 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 4.34e-01 0.0871 0.111 0.196 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0205 0.0861 0.196 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.77e-01 0.0161 0.104 0.196 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0658 0.114 0.196 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0536 0.11 0.196 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0497 0.116 0.192 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 1.72e-01 0.12 0.0875 0.192 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0809 0.0688 0.192 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0299 0.0727 0.192 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 1.44e-01 -0.159 0.108 0.192 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 5.12e-02 -0.18 0.0918 0.192 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 2.54e-02 -0.235 0.105 0.192 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 2.19e-01 -0.14 0.114 0.192 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 3.03e-01 -0.11 0.107 0.192 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0412 0.115 0.212 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0241 0.118 0.212 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 7.14e-02 -0.161 0.0887 0.212 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 7.93e-01 0.024 0.0912 0.212 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 8.55e-01 -0.021 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 5.41e-01 0.0683 0.111 0.212 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.88e-01 0.0163 0.116 0.212 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 9.53e-01 0.00768 0.129 0.212 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0316 0.115 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 3.58e-01 -0.101 0.11 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 4.60e-01 0.0649 0.0877 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 3.14e-01 -0.093 0.0921 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 2.24e-01 -0.117 0.0963 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00488 0.0954 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0397 0.109 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0134 0.114 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0926 0.104 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 9.46e-01 0.00592 0.0873 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 9.85e-02 -0.178 0.107 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 3.25e-02 -0.184 0.0853 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 6.82e-02 -0.155 0.0845 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0888 0.0884 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 2.55e-01 0.0923 0.0809 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 6.84e-01 0.0423 0.104 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 3.48e-01 -0.107 0.113 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0441 0.105 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0151 0.0815 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 2.78e-01 -0.121 0.111 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 8.31e-01 0.0145 0.068 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0666 0.0672 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0902 0.0691 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 1.43e-01 -0.132 0.0896 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 9.15e-02 -0.134 0.0793 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 3.15e-01 0.103 0.103 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 4.44e-01 0.0811 0.106 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 5.76e-01 0.0579 0.103 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 3.14e-01 -0.116 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 1.98e-01 0.098 0.0758 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0228 0.0713 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0532 0.0677 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 5.89e-01 -0.057 0.105 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 781043 sc-eQTL 5.30e-01 -0.055 0.0874 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 1.92e-01 -0.137 0.105 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0731 0.109 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 665002 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0925 0.112 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 986137 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00728 0.113 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 909704 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0863 0.0883 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 49634 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0694 0.0713 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 19760 sc-eQTL 9.91e-02 -0.123 0.0744 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 690446 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0307 0.0756 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 690381 sc-eQTL 8.05e-01 0.0234 0.0949 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 889932 sc-eQTL 4.17e-01 0.0814 0.1 0.194 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000180488 \N 889932 2.67e-07 1.25e-07 3.71e-08 1.82e-07 9.21e-08 9.8e-08 1.53e-07 5.37e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.62e-07 8.55e-08 1.45e-07 6.56e-08 6.17e-08 7.3e-08 3.94e-08 1.26e-07 5.39e-08 4.45e-08 1.08e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.49e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.57e-08 1.09e-07 1.02e-07 9.7e-08 3.87e-08 3.56e-08 8.25e-08 8.76e-08 3.94e-08 5.08e-08 9.25e-08 6.54e-08 3.77e-08 5.14e-08 1.36e-07 5.08e-08 1.45e-08 5.15e-08 1.99e-08 1.21e-07 3.86e-09 4.94e-08