logo

Genes within 1Mb (chr1:78645457:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 7.47e-03 0.374 0.138 0.092 B L1
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 6.09e-03 0.276 0.0997 0.092 B L1
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 2.88e-01 -0.125 0.118 0.092 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0299 0.108 0.092 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 3.31e-01 0.0982 0.101 0.092 B L1
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 4.87e-01 0.0935 0.134 0.092 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 4.83e-01 0.0989 0.141 0.092 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 3.73e-01 0.108 0.121 0.092 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0869 0.106 0.092 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 2.55e-05 0.528 0.123 0.092 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 1.39e-01 0.121 0.0812 0.092 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0841 0.111 0.092 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0374 0.106 0.092 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 2.94e-01 0.0809 0.0769 0.092 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.67e-01 0.103 0.0928 0.092 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0943 0.0961 0.092 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.20e-03 0.392 0.119 0.092 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 1.11e-01 0.185 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00187 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 3.93e-01 0.0968 0.113 0.092 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0149 0.094 0.092 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.11e-01 0.161 0.128 0.092 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 9.12e-02 -0.218 0.129 0.092 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 3.61e-01 -0.116 0.126 0.092 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.71e-01 0.196 0.143 0.088 DC L1
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 4.98e-01 -0.088 0.13 0.088 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0515 0.109 0.088 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.107 0.088 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0411 0.142 0.088 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 9.38e-02 0.229 0.136 0.088 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0552 0.149 0.088 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 5.50e-01 0.096 0.16 0.088 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 7.83e-01 0.0421 0.153 0.088 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 7.92e-02 0.257 0.146 0.092 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00759 0.0863 0.092 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0178 0.085 0.092 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 8.40e-01 0.0177 0.0875 0.092 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 3.77e-01 0.105 0.119 0.092 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 8.09e-01 0.0235 0.0968 0.092 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 7.52e-03 0.35 0.13 0.092 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0843 0.133 0.092 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 4.06e-01 0.114 0.137 0.092 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.03e-02 0.392 0.151 0.088 NK L1
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 1.40e-01 0.178 0.12 0.088 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 2.36e-01 -0.117 0.0986 0.088 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 9.34e-01 0.00862 0.104 0.088 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 9.63e-01 0.00467 0.1 0.088 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0119 0.138 0.088 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 1.79e-01 -0.178 0.132 0.088 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 9.90e-01 0.0018 0.145 0.092 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 5.53e-01 0.0685 0.115 0.092 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 3.34e-01 -0.12 0.124 0.092 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 3.07e-01 -0.129 0.126 0.092 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 8.81e-01 0.0151 0.101 0.092 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 8.97e-01 0.02 0.154 0.092 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0427 0.149 0.092 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 2.70e-01 0.15 0.136 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 2.01e-01 0.215 0.167 0.094 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 2.98e-01 0.173 0.166 0.094 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 5.78e-01 0.0767 0.138 0.094 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 3.17e-01 0.139 0.139 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0863 0.161 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0182 0.131 0.094 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.08e-01 0.196 0.155 0.094 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 2.39e-01 -0.198 0.168 0.094 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 6.80e-01 0.0619 0.15 0.094 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.62e-01 0.211 0.15 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 1.01e-02 0.348 0.134 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0772 0.129 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 7.78e-01 -0.037 0.131 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 2.21e-02 0.294 0.128 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 2.35e-01 0.172 0.144 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 7.28e-01 -0.053 0.152 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0339 0.143 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 1.07e-01 -0.198 0.123 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 6.86e-01 0.0618 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 6.39e-01 0.0694 0.148 0.091 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 3.24e-01 -0.115 0.116 0.091 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 9.80e-01 0.00295 0.116 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 9.70e-01 0.00568 0.152 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 9.63e-02 0.245 0.147 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 1.27e-01 -0.233 0.152 0.091 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 4.60e-01 0.113 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0763 0.13 0.091 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 6.87e-02 0.265 0.145 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 1.76e-01 0.166 0.122 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 6.14e-02 -0.207 0.11 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 3.62e-01 0.105 0.115 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 8.36e-01 0.0236 0.114 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0956 0.136 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.39e-01 0.175 0.148 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 6.83e-01 0.0587 0.144 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 3.26e-01 -0.11 0.112 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.38e-01 0.228 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 2.19e-01 0.17 0.138 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 4.38e-01 0.0888 0.114 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0933 0.125 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00652 0.132 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 1.02e-01 0.22 0.134 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 9.19e-01 0.016 0.157 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 7.25e-02 0.279 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 3.05e-02 0.285 0.131 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 4.14e-01 0.134 0.163 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 3.29e-01 -0.152 0.155 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0624 0.121 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 1.92e-01 0.182 0.139 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 8.41e-01 0.031 0.154 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 4.77e-02 -0.299 0.15 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00634 0.158 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.45e-05 0.569 0.128 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 5.18e-01 0.0647 0.0999 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0456 0.118 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 4.34e-01 0.0935 0.119 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 3.97e-01 0.0723 0.0853 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 6.51e-01 0.0413 0.0912 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 2.68e-01 -0.116 0.104 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 3.94e-02 0.296 0.143 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 1.30e-02 0.267 0.107 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0324 0.111 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 1.90e-01 -0.151 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0212 0.108 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.91e-01 0.143 0.135 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0797 0.142 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 3.58e-01 0.126 0.137 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 3.17e-01 0.142 0.141 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 7.45e-01 0.0429 0.131 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0282 0.133 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 1.44e-01 0.187 0.127 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 4.72e-01 0.108 0.149 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00994 0.154 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.98e-02 0.355 0.151 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 2.48e-02 0.302 0.133 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 3.53e-01 -0.108 0.116 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0162 0.131 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 2.19e-01 0.152 0.123 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 3.45e-01 0.137 0.145 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 3.17e-01 -0.135 0.135 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0672 0.138 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.86e-03 0.432 0.137 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 9.42e-02 0.219 0.13 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0148 0.118 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 3.76e-01 0.108 0.121 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 6.28e-01 -0.054 0.111 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 3.20e-01 -0.133 0.133 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 1.36e-01 -0.201 0.134 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0904 0.131 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 2.44e-02 0.337 0.148 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 3.39e-01 0.145 0.151 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 4.98e-01 0.0983 0.145 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 6.29e-01 0.0637 0.131 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 3.40e-01 0.131 0.137 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.58e-01 0.171 0.15 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 2.08e-02 -0.354 0.152 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 7.68e-01 0.0399 0.135 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 4.48e-01 -0.129 0.17 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0707 0.171 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 8.05e-01 0.0311 0.126 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 6.06e-01 0.0674 0.131 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0831 0.157 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 5.90e-01 0.0854 0.158 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 5.10e-01 -0.111 0.168 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00104 0.137 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 9.65e-01 0.00666 0.151 0.093 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 8.59e-01 0.0236 0.133 0.093 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 7.19e-01 -0.044 0.122 0.093 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 8.06e-01 0.0334 0.136 0.093 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 6.77e-01 0.0602 0.144 0.093 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 6.46e-01 0.0679 0.148 0.093 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0897 0.147 0.093 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 1.32e-01 0.203 0.134 0.093 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 5.49e-01 0.096 0.16 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0338 0.16 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 1.09e-01 -0.188 0.117 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 8.50e-01 0.0261 0.138 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 6.58e-01 0.065 0.146 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 4.83e-01 -0.107 0.153 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 5.70e-01 -0.084 0.148 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 4.45e-01 0.122 0.159 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 5.22e-01 0.0845 0.132 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 1.56e-01 -0.145 0.102 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 4.00e-01 0.0925 0.11 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0157 0.12 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 9.77e-01 0.00438 0.154 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 4.02e-01 -0.121 0.145 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 2.95e-01 0.171 0.163 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 2.38e-01 0.189 0.16 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00547 0.125 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 3.39e-01 0.135 0.14 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 1.75e-01 -0.207 0.152 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 7.65e-01 0.0446 0.149 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 7.36e-01 0.0524 0.155 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.59e-03 0.487 0.152 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 3.44e-01 0.132 0.139 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 2.63e-01 -0.11 0.0983 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 7.68e-01 -0.031 0.105 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 6.54e-01 0.0591 0.132 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 6.44e-01 0.0641 0.138 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 1.85e-01 -0.2 0.151 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0274 0.229 0.081 PB L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 7.80e-01 0.0565 0.201 0.081 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 3.21e-01 0.174 0.174 0.081 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 9.26e-01 0.0146 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 6.75e-01 0.08 0.19 0.081 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0869 0.173 0.081 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.59e-01 -0.213 0.187 0.081 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 9.02e-01 0.0269 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 2.70e-01 -0.212 0.191 0.081 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 2.03e-02 0.364 0.156 0.093 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0954 0.146 0.093 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 9.51e-01 0.00697 0.112 0.093 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0473 0.122 0.093 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 3.65e-01 -0.121 0.134 0.093 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.80e-01 -0.165 0.152 0.093 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 9.50e-01 0.00936 0.149 0.093 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0339 0.115 0.093 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 8.55e-01 0.0277 0.152 0.092 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 7.11e-01 0.0507 0.137 0.092 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 5.72e-01 0.0607 0.107 0.092 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0456 0.111 0.092 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 6.65e-01 0.0569 0.131 0.092 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 1.88e-01 0.192 0.145 0.092 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 7.02e-01 0.0572 0.149 0.092 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 9.02e-02 0.289 0.169 0.09 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 7.11e-01 0.0544 0.146 0.09 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 7.63e-01 0.0334 0.11 0.09 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0995 0.111 0.09 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 3.42e-01 -0.145 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 1.16e-01 0.194 0.123 0.09 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 9.69e-01 0.006 0.154 0.09 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 1.91e-01 -0.222 0.169 0.09 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 8.70e-01 0.0255 0.156 0.09 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.92e-01 0.194 0.149 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0986 0.0936 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 8.09e-01 0.0222 0.0917 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 8.33e-01 0.0203 0.096 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 2.02e-01 0.175 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 7.16e-01 -0.04 0.11 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 4.10e-01 0.115 0.14 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 1.27e-01 -0.231 0.151 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 5.15e-01 0.0908 0.139 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.71e-01 0.217 0.158 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 1.70e-01 0.157 0.114 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 9.89e-01 0.00135 0.0943 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 7.93e-01 0.0244 0.0927 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0683 0.138 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 6.51e-01 0.0538 0.119 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 1.13e-02 0.379 0.148 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 1.81e-01 0.205 0.153 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 1.27e-01 0.228 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 3.68e-01 -0.163 0.18 0.091 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 5.19e-01 0.11 0.171 0.091 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 3.81e-01 -0.137 0.156 0.091 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 8.48e-01 0.0305 0.159 0.091 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 1.00e+00 -1.07e-05 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00794 0.168 0.091 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 2.62e-01 0.2 0.177 0.091 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 1.53e-01 0.221 0.154 0.091 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 5.77e-01 0.0971 0.174 0.087 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0634 0.144 0.087 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 6.98e-01 -0.041 0.105 0.087 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 9.55e-01 0.00581 0.103 0.087 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 1.69e-01 -0.218 0.158 0.087 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 8.06e-01 0.0301 0.123 0.087 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.43e-01 -0.172 0.147 0.087 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 7.88e-01 0.0438 0.162 0.087 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 3.58e-01 -0.144 0.156 0.087 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 3.24e-01 0.158 0.16 0.09 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0574 0.122 0.09 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 4.27e-01 0.0761 0.0956 0.09 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0749 0.101 0.09 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 4.45e-01 0.115 0.151 0.09 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 9.17e-02 0.216 0.128 0.09 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 6.47e-02 0.27 0.145 0.09 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 5.45e-02 0.303 0.157 0.09 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0684 0.148 0.09 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 3.42e-01 0.153 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 1.90e-01 -0.215 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 6.89e-01 -0.05 0.125 0.09 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 6.10e-01 -0.065 0.127 0.09 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 6.56e-01 0.0711 0.159 0.09 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0193 0.156 0.09 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 4.55e-01 -0.121 0.161 0.09 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 2.51e-01 0.207 0.18 0.09 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 4.66e-01 0.117 0.16 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 5.63e-02 0.28 0.146 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 3.92e-02 0.241 0.116 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0989 0.123 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0364 0.129 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 1.76e-01 0.173 0.127 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 1.49e-01 0.211 0.146 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 5.07e-01 -0.101 0.152 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0944 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 1.80e-01 -0.157 0.116 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 2.04e-02 0.332 0.142 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 4.91e-02 0.226 0.114 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 1.92e-01 -0.149 0.113 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 9.93e-01 0.00105 0.118 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00149 0.108 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00976 0.139 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 4.82e-01 0.107 0.152 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 2.38e-01 0.166 0.14 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 8.02e-01 0.0274 0.109 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 2.67e-01 0.166 0.149 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0372 0.0913 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0109 0.0905 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 8.83e-01 0.0137 0.0932 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 4.12e-01 0.0993 0.121 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0444 0.107 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 2.29e-02 0.313 0.137 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 2.35e-01 -0.169 0.142 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 3.74e-01 0.124 0.139 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 3.33e-01 0.153 0.158 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 8.58e-01 0.0188 0.105 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0316 0.0986 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 9.74e-01 0.00303 0.0937 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0306 0.146 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 756944 sc-eQTL 1.54e-01 0.172 0.12 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 3.78e-02 0.301 0.144 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 1.03e-01 0.245 0.15 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 640903 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0871 0.154 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 sc-eQTL 1.61e-02 0.372 0.153 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 885605 sc-eQTL 2.25e-01 0.148 0.122 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 25535 sc-eQTL 1.94e-01 -0.128 0.0981 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -4339 sc-eQTL 6.20e-01 0.0512 0.103 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 666347 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0156 0.104 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 666282 sc-eQTL 5.80e-01 0.0724 0.131 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 865833 sc-eQTL 2.31e-01 -0.165 0.138 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 eQTL 0.0251 0.046 0.0205 0.0 0.0 0.0746
ENSG00000137959 IFI44L 25535 eQTL 0.0103 0.0638 0.0248 0.0 0.0 0.0746

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 962038 2.76e-07 1.3e-07 5.14e-08 1.83e-07 9.24e-08 9.9e-08 1.53e-07 5.4e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.57e-07 9e-08 1.47e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.36e-08 3.93e-08 1.27e-07 5.75e-08 4.31e-08 1.13e-07 1.27e-07 1.44e-07 2.95e-08 1.55e-07 1.21e-07 1.1e-07 9.61e-08 1.12e-07 1.02e-07 9.7e-08 3.03e-08 3.61e-08 8.23e-08 4.84e-08 3.28e-08 5.22e-08 8.71e-08 6.37e-08 3.92e-08 5.34e-08 1.35e-07 5.2e-08 1.11e-08 3.81e-08 1.86e-08 1.22e-07 1.89e-09 4.88e-08
ENSG00000137959 IFI44L 25535 1.57e-05 1.9e-05 3.08e-06 9.98e-06 3.09e-06 7.28e-06 2.25e-05 2.96e-06 1.65e-05 8.28e-06 2.11e-05 8.18e-06 2.93e-05 7.27e-06 5.1e-06 1.01e-05 8.87e-06 1.46e-05 4.67e-06 4.26e-06 8.37e-06 1.68e-05 1.77e-05 5.19e-06 2.74e-05 5.36e-06 8.03e-06 7.57e-06 1.72e-05 1.71e-05 1.16e-05 1.26e-06 1.64e-06 4.39e-06 7.03e-06 4.06e-06 2.02e-06 2.73e-06 3.2e-06 2.38e-06 1.48e-06 2.24e-05 2.68e-06 2.64e-07 1.85e-06 2.52e-06 2.71e-06 1.26e-06 1.03e-06
ENSG00000162616 \N 666282 3.77e-07 1.76e-07 6.72e-08 2.45e-07 1.1e-07 9.31e-08 2.63e-07 6.12e-08 1.86e-07 1.05e-07 1.83e-07 1.48e-07 2.55e-07 8.55e-08 6.93e-08 9.35e-08 4.63e-08 2.15e-07 7.36e-08 6.29e-08 1.24e-07 1.81e-07 1.75e-07 4.27e-08 2.59e-07 1.56e-07 1.33e-07 1.28e-07 1.37e-07 1.33e-07 1.22e-07 4.75e-08 3.74e-08 1.03e-07 7.55e-08 4.68e-08 6.04e-08 6.78e-08 6.29e-08 7.17e-08 4.51e-08 1.6e-07 3.13e-08 1.71e-08 5.49e-08 6.98e-09 7.26e-08 0.0 4.97e-08