logo

Genes within 1Mb (chr1:78629896:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00845 0.1 0.214 B L1
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0826 0.0722 0.214 B L1
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0772 0.0839 0.214 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 2.72e-02 -0.169 0.0759 0.214 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 9.06e-01 0.00852 0.072 0.214 B L1
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00266 0.0959 0.214 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 2.93e-01 0.105 0.1 0.214 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00662 0.0862 0.214 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0719 0.0752 0.214 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 2.48e-01 0.106 0.0912 0.214 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 7.86e-01 0.0158 0.0583 0.214 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0478 0.0791 0.214 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0533 0.0754 0.214 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 6.65e-01 0.0239 0.0551 0.214 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 1.49e-01 0.096 0.0662 0.214 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 4.38e-01 0.0534 0.0687 0.214 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 3.64e-01 0.0775 0.0852 0.214 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.39e-01 -0.12 0.0808 0.214 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 6.37e-01 -0.038 0.0805 0.214 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0325 0.0789 0.214 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0291 0.0655 0.214 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0952 0.0893 0.214 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 2.29e-01 0.109 0.0899 0.214 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 2.00e-01 -0.113 0.0879 0.214 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 4.33e-01 -0.078 0.0992 0.218 DC L1
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 9.03e-02 -0.152 0.089 0.218 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 3.39e-01 0.0724 0.0755 0.218 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 2.32e-01 0.0887 0.074 0.218 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 8.71e-01 0.016 0.0985 0.218 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0645 0.0944 0.218 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0366 0.103 0.218 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 7.83e-01 0.0305 0.111 0.218 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 5.34e-02 -0.204 0.105 0.218 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 1.31e-02 0.26 0.104 0.214 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 7.15e-01 0.0227 0.0621 0.214 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00659 0.0611 0.214 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 5.46e-01 0.0381 0.0629 0.214 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0593 0.0856 0.214 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0832 0.0694 0.214 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00138 0.0948 0.214 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0346 0.0958 0.214 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0376 0.0984 0.214 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0151 0.107 0.215 NK L1
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0405 0.0844 0.215 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 1.87e-01 -0.091 0.0687 0.215 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0895 0.0723 0.215 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 8.81e-01 0.0105 0.07 0.215 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0221 0.0962 0.215 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0686 0.0925 0.215 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 7.86e-01 0.0282 0.104 0.214 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.16e-01 0.129 0.0819 0.214 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 2.85e-01 0.0949 0.0886 0.214 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 3.14e-01 0.0911 0.0903 0.214 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0842 0.0719 0.214 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0848 0.11 0.214 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0905 0.107 0.214 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 3.93e-02 -0.201 0.0967 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00538 0.123 0.217 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.29e-01 -0.184 0.121 0.217 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0445 0.101 0.217 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0862 0.101 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 5.98e-01 -0.062 0.117 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0334 0.0954 0.217 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 5.52e-02 -0.218 0.113 0.217 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0402 0.123 0.217 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0449 0.109 0.217 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0535 0.108 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0978 0.0972 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0398 0.0926 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 7.85e-02 -0.165 0.0931 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 5.81e-01 0.051 0.0924 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 4.48e-01 0.0786 0.103 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 7.54e-01 0.0342 0.109 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 1.00e-01 0.168 0.102 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 8.19e-01 0.0203 0.0883 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 9.35e-01 0.00892 0.11 0.213 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 9.75e-01 0.00333 0.106 0.213 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 4.30e-01 0.066 0.0835 0.213 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 7.82e-01 0.0231 0.0835 0.213 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 6.39e-01 0.0511 0.109 0.213 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 2.84e-01 -0.114 0.106 0.213 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0671 0.11 0.213 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 2.38e-01 0.13 0.11 0.213 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0244 0.0935 0.213 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00662 0.106 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 6.03e-01 0.0464 0.0891 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0377 0.0804 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0968 0.0834 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0521 0.0825 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 7.94e-01 0.026 0.0991 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 7.76e-01 0.0308 0.108 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 2.36e-01 -0.124 0.104 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 9.36e-01 0.0065 0.0813 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 2.31e-01 0.133 0.111 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0313 0.1 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 1.01e-01 -0.135 0.0822 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0744 0.0905 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 9.73e-01 0.00323 0.0954 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0403 0.0974 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 7.17e-01 0.0412 0.113 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 9.73e-01 0.00378 0.112 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 9.61e-02 -0.159 0.0949 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 3.12e-01 0.12 0.118 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0577 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0165 0.0878 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 1.26e-01 0.155 0.101 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 5.13e-01 0.0731 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000203 0.11 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0309 0.114 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 7.11e-01 0.0357 0.0961 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 5.41e-01 0.044 0.0717 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0955 0.0843 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 2.16e-01 -0.106 0.0855 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 4.36e-01 0.0478 0.0612 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 5.49e-01 0.0393 0.0654 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 6.31e-01 0.0361 0.0751 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 2.59e-01 0.115 0.102 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0129 0.0765 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0537 0.078 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 6.68e-01 -0.035 0.0817 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00325 0.0764 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 1.90e-02 0.223 0.0942 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 1.57e-01 0.142 0.1 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 6.92e-01 0.0386 0.0973 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 6.94e-01 0.0396 0.1 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0194 0.0931 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 1.40e-01 -0.138 0.0935 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 9.34e-01 0.00752 0.0906 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 9.12e-01 0.0117 0.106 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 5.27e-01 0.0689 0.109 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 5.40e-01 0.0651 0.106 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 2.18e-01 -0.115 0.0932 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0731 0.0805 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 5.15e-01 -0.059 0.0904 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 2.42e-01 -0.1 0.0853 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0719 0.101 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00799 0.0935 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00108 0.0959 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 5.20e-01 0.065 0.101 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 2.67e-02 -0.208 0.0933 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0495 0.085 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 6.09e-02 -0.163 0.0867 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0416 0.08 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0411 0.0962 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 1.04e-02 0.247 0.0958 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 1.71e-01 -0.129 0.094 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 7.95e-01 0.0294 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 2.37e-01 -0.134 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 8.99e-02 -0.185 0.108 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0546 0.0987 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 9.39e-01 0.00795 0.103 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0517 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0915 0.116 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0821 0.102 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 4.69e-01 -0.087 0.12 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 4.78e-01 0.0856 0.12 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 9.80e-01 0.00225 0.0887 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 7.93e-01 0.0242 0.0921 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 9.07e-01 0.0129 0.111 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 1.81e-01 -0.149 0.111 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 7.77e-01 0.0335 0.118 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 5.05e-01 0.0644 0.0965 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0639 0.109 0.212 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 4.16e-01 0.0779 0.0955 0.212 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 6.28e-01 0.0427 0.088 0.212 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 3.67e-01 0.0882 0.0976 0.212 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0999 0.104 0.212 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 4.41e-01 -0.082 0.106 0.212 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0922 0.106 0.212 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 8.05e-02 -0.169 0.0964 0.212 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0938 0.114 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 2.64e-01 0.127 0.113 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 8.77e-01 0.013 0.0836 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0554 0.0982 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 3.53e-01 0.0969 0.104 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 7.30e-01 0.0376 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 4.71e-01 0.0757 0.105 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0594 0.111 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00397 0.0917 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 1.52e-01 -0.102 0.0711 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00564 0.0764 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0209 0.0836 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0986 0.107 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0772 0.101 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 4.05e-01 0.0979 0.117 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.26e-02 -0.287 0.114 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 1.94e-01 -0.117 0.0895 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 8.21e-01 0.023 0.101 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 3.48e-01 0.103 0.11 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0832 0.107 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0586 0.112 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00471 0.11 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0448 0.0982 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0636 0.0693 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 4.94e-02 -0.145 0.0731 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0705 0.0927 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 5.55e-02 0.186 0.0966 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 9.94e-01 0.000753 0.107 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0348 0.148 0.226 PB L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.30e-01 -0.196 0.128 0.226 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 3.12e-01 -0.114 0.112 0.226 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 5.41e-01 -0.062 0.101 0.226 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 2.59e-01 0.138 0.122 0.226 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 8.51e-01 -0.021 0.112 0.226 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0222 0.121 0.226 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 2.05e-01 0.179 0.14 0.226 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 2.21e-01 -0.151 0.123 0.226 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0451 0.113 0.215 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.13e-01 0.165 0.104 0.215 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 7.37e-02 -0.143 0.0796 0.215 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0936 0.087 0.215 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 2.80e-01 0.103 0.0955 0.215 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0336 0.109 0.215 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 3.33e-01 0.103 0.106 0.215 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00378 0.0826 0.215 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 3.83e-01 0.0948 0.109 0.214 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0282 0.098 0.214 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 5.26e-01 0.0487 0.0767 0.214 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 4.49e-01 0.0601 0.0792 0.214 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 3.31e-01 0.0915 0.0939 0.214 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 7.60e-01 -0.032 0.104 0.214 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 3.34e-01 -0.103 0.107 0.214 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 2.42e-01 -0.139 0.119 0.217 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.09e-01 -0.163 0.101 0.217 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 4.94e-01 0.0527 0.0769 0.217 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 1.24e-01 0.12 0.0774 0.217 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0388 0.106 0.217 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0358 0.0864 0.217 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 3.10e-01 -0.109 0.107 0.217 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0136 0.119 0.217 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 1.55e-01 -0.154 0.108 0.217 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 1.06e-01 0.172 0.106 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00131 0.067 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 8.83e-01 0.00963 0.0655 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 3.25e-01 0.0675 0.0684 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 2.35e-01 -0.116 0.0976 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0883 0.0783 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 3.25e-01 0.0983 0.0997 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 7.48e-01 0.0348 0.108 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0131 0.0994 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 1.10e-01 0.183 0.114 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 8.26e-02 0.143 0.0822 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 7.18e-01 0.0246 0.068 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 7.81e-01 0.0187 0.0669 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000273 0.1 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 6.58e-01 0.0381 0.0858 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.109 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 2.09e-01 -0.139 0.111 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0877 0.108 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 4.65e-02 0.264 0.132 0.218 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.09e-01 0.202 0.125 0.218 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0512 0.115 0.218 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 6.24e-01 0.0577 0.117 0.218 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 1.72e-01 0.177 0.129 0.218 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 3.65e-01 -0.112 0.124 0.218 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 3.53e-02 -0.275 0.129 0.218 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 4.67e-02 -0.226 0.113 0.218 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 4.44e-01 0.0896 0.117 0.22 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0288 0.0971 0.22 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 6.88e-01 0.0286 0.0709 0.22 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 6.88e-01 0.0278 0.0691 0.22 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 3.05e-01 0.109 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 7.53e-01 -0.026 0.0825 0.22 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 3.94e-02 -0.204 0.0982 0.22 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 8.38e-01 0.0224 0.109 0.22 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 9.72e-01 0.00363 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 5.66e-01 0.0646 0.112 0.219 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0788 0.0853 0.219 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 1.77e-02 -0.158 0.0662 0.219 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 8.89e-01 0.00993 0.0708 0.219 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0204 0.106 0.219 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 3.29e-01 0.0879 0.0899 0.219 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 2.69e-01 -0.114 0.103 0.219 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 5.92e-01 0.0595 0.111 0.219 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0766 0.104 0.219 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 2.27e-02 -0.267 0.116 0.212 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 5.03e-01 -0.081 0.121 0.212 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00589 0.092 0.212 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 8.92e-01 0.0128 0.0936 0.212 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 2.13e-01 0.146 0.117 0.212 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0248 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 3.70e-01 0.107 0.119 0.212 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 8.71e-01 0.0216 0.133 0.212 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0659 0.118 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0419 0.105 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 1.31e-01 -0.127 0.0837 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0582 0.0884 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 1.61e-01 -0.13 0.0922 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 8.66e-01 0.0155 0.0914 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 8.61e-01 0.0183 0.105 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 8.68e-01 0.018 0.109 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 1.12e-01 0.159 0.0997 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0327 0.0837 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 5.85e-01 0.0571 0.105 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0156 0.0837 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0724 0.0825 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 1.84e-01 -0.114 0.0856 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0257 0.0787 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 7.36e-01 0.034 0.101 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 2.74e-01 0.121 0.11 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 2.76e-01 -0.111 0.102 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0508 0.079 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 1.85e-02 0.251 0.106 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 2.78e-01 0.071 0.0652 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 5.95e-01 0.0345 0.0648 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 3.68e-01 0.0601 0.0666 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0973 0.0864 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0608 0.0767 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 6.93e-01 0.0391 0.099 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 7.92e-01 -0.027 0.102 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0156 0.0995 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 1.32e-01 0.164 0.108 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0552 0.0721 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0828 0.0674 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 6.19e-01 0.032 0.0643 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 7.75e-01 0.0286 0.0999 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 741383 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0859 0.0828 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 2.10e-02 -0.229 0.0986 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 4.86e-01 0.072 0.103 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 625342 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0945 0.106 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 946477 sc-eQTL 8.99e-01 0.0138 0.109 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 870044 sc-eQTL 5.82e-01 -0.047 0.0854 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L 9974 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0851 0.0687 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -19900 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0757 0.0721 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 650786 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0164 0.073 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 650721 sc-eQTL 9.81e-01 0.00223 0.0916 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 850272 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0686 0.0966 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137959 IFI44L 9974 eQTL 0.0026 -0.0432 0.0143 0.0 0.0 0.274

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 \N 946477 2.6e-07 1.08e-07 3.28e-08 1.68e-07 1.02e-07 9.13e-08 1.36e-07 5.24e-08 1.32e-07 4.23e-08 1.61e-07 7.49e-08 1.21e-07 6.07e-08 4.89e-08 7.76e-08 5.15e-08 1.06e-07 5.22e-08 2.85e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.01e-08 1.33e-07 1.03e-07 1.13e-07 8.49e-08 1.05e-07 1.09e-07 9.5e-08 3.41e-08 2.75e-08 8.02e-08 9.56e-08 4.14e-08 5.1e-08 9.06e-08 8.48e-08 3.74e-08 3.07e-08 1.42e-07 4.89e-08 3.38e-08 1.09e-07 1.78e-08 1.46e-07 4.6e-09 4.72e-08