Genes within 1Mb (chr1:78619049:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 6.71e-02 0.195 0.106 0.19 B L1
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.91e-02 0.152 0.0765 0.19 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0804 0.0895 0.19 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 8.08e-01 -0.02 0.0819 0.19 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 3.73e-01 0.0685 0.0767 0.19 B L1
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 5.62e-01 0.0594 0.102 0.19 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 4.44e-01 0.0821 0.107 0.19 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.89e-01 0.00123 0.092 0.19 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 2.47e-01 -0.093 0.0802 0.19 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 1.53e-03 0.309 0.0962 0.19 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 3.56e-01 0.058 0.0627 0.19 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0216 0.0853 0.19 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 9.41e-01 0.00605 0.0814 0.19 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 6.23e-01 0.0292 0.0593 0.19 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 2.14e-01 0.0891 0.0714 0.19 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 8.57e-02 -0.127 0.0736 0.19 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 8.25e-02 0.16 0.0918 0.19 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 8.93e-01 0.0118 0.088 0.19 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0724 0.0871 0.19 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 6.16e-01 0.0429 0.0854 0.19 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 9.56e-01 0.0039 0.071 0.19 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 8.37e-02 0.167 0.0963 0.19 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 2.95e-02 -0.212 0.0967 0.19 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 1.46e-02 -0.232 0.0942 0.19 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 6.00e-02 0.199 0.105 0.189 DC L1
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0789 0.0955 0.189 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0253 0.0806 0.189 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0931 0.0789 0.189 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 8.88e-01 0.0148 0.105 0.189 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 5.49e-01 0.0605 0.101 0.189 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 2.87e-01 -0.117 0.109 0.189 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.30e-01 0.115 0.118 0.189 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0465 0.113 0.189 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.75e-01 0.118 0.108 0.19 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.15e-01 0.0519 0.0635 0.19 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0297 0.0626 0.19 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 9.81e-01 0.00158 0.0645 0.19 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 6.61e-01 0.0386 0.0878 0.19 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0432 0.0713 0.19 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 2.02e-01 0.124 0.0967 0.19 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0634 0.0981 0.19 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 6.77e-01 -0.042 0.101 0.19 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 4.91e-02 0.223 0.112 0.187 NK L1
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 9.93e-01 0.000749 0.0893 0.187 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0983 0.0727 0.187 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000242 0.0767 0.187 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 6.58e-01 0.0328 0.074 0.187 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0131 0.102 0.187 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 1.15e-01 -0.154 0.0973 0.187 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 9.46e-01 0.00753 0.11 0.19 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 7.88e-01 0.0236 0.0877 0.19 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0911 0.0944 0.19 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0751 0.0962 0.19 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0081 0.0768 0.19 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 7.98e-01 -0.03 0.117 0.19 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0323 0.114 0.19 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 7.33e-01 0.0355 0.104 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 3.26e-01 0.122 0.124 0.207 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 3.87e-01 0.106 0.123 0.207 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0161 0.102 0.207 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0808 0.103 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 3.26e-01 -0.117 0.118 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0418 0.0965 0.207 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 9.93e-02 0.19 0.114 0.207 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0372 0.124 0.207 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 1.77e-01 0.149 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 5.51e-01 0.068 0.114 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 2.20e-01 0.126 0.102 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0471 0.0977 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 6.79e-01 -0.041 0.0989 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 1.70e-01 0.134 0.0971 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 2.91e-01 0.115 0.109 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0268 0.115 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00285 0.108 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 1.21e-02 -0.232 0.0917 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 6.83e-01 0.0463 0.113 0.188 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0678 0.11 0.188 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0654 0.0865 0.188 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0621 0.0865 0.188 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 7.37e-01 0.0379 0.113 0.188 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 5.90e-01 0.0592 0.11 0.188 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0654 0.114 0.188 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 2.45e-01 -0.132 0.114 0.188 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 2.99e-02 -0.209 0.0958 0.188 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.89e-01 0.117 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 2.88e-01 0.0991 0.0931 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 2.14e-01 -0.105 0.084 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 7.11e-01 0.0325 0.0876 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 7.23e-01 0.0307 0.0864 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0334 0.104 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 1.36e-01 0.169 0.113 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0623 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 2.01e-01 -0.109 0.0849 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 4.76e-01 0.0829 0.116 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 1.22e-01 0.162 0.104 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 6.29e-01 0.0418 0.0864 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 9.85e-01 0.00176 0.0947 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 9.75e-01 0.00308 0.0998 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 1.14e-01 0.161 0.101 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0971 0.118 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.22e-01 0.116 0.117 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 4.45e-01 0.0763 0.0998 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.79e-01 0.137 0.126 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 6.09e-01 0.0613 0.12 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.74e-01 0.0149 0.0937 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 3.46e-01 0.102 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0917 0.119 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0959 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.13e-01 0.0133 0.122 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 9.02e-03 0.267 0.101 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 9.36e-01 0.00621 0.077 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.17e-01 -0.021 0.0907 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 3.80e-01 0.0808 0.0919 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00437 0.0658 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 4.59e-01 0.052 0.0701 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 2.19e-01 -0.099 0.0803 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.73e-02 0.241 0.109 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 2.43e-01 0.0962 0.0821 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0152 0.0841 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0495 0.0879 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 6.81e-01 0.0338 0.0822 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 5.20e-01 0.0661 0.103 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 2.12e-02 -0.248 0.107 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 5.08e-01 0.0695 0.105 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.09e-01 0.0893 0.108 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 9.92e-01 0.000976 0.1 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00653 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 2.88e-01 0.104 0.0974 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 8.53e-01 0.0211 0.114 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.67e-01 0.0048 0.117 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 1.11e-01 0.181 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 3.48e-01 0.0942 0.1 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0927 0.0863 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 7.04e-01 0.0369 0.097 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 3.18e-01 0.0915 0.0915 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 8.17e-02 0.188 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0879 0.1 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0672 0.103 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.30e-02 0.243 0.106 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 3.97e-01 0.0852 0.1 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 5.82e-01 -0.05 0.0906 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 5.22e-01 0.0597 0.093 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 2.30e-01 -0.102 0.085 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 2.30e-01 -0.123 0.102 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.35e-02 -0.173 0.103 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 4.76e-02 -0.199 0.0996 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 5.23e-02 0.224 0.114 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.61e-01 0.0858 0.116 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 6.70e-01 0.0476 0.111 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00116 0.101 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 3.91e-01 0.0907 0.106 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 2.56e-01 0.132 0.116 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 1.74e-01 -0.161 0.118 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 4.97e-01 0.0708 0.104 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 1.33e-02 -0.324 0.13 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0115 0.133 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 9.20e-01 0.00977 0.0976 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 6.72e-01 0.043 0.101 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 4.24e-01 0.0976 0.122 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 5.21e-01 0.0788 0.123 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00952 0.13 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 9.83e-02 -0.175 0.106 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 6.04e-01 0.0599 0.115 0.193 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 5.98e-01 0.0535 0.101 0.193 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0113 0.0934 0.193 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0247 0.104 0.193 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 7.59e-01 0.0339 0.11 0.193 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 6.42e-01 0.0525 0.113 0.193 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0173 0.112 0.193 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 7.70e-01 0.0302 0.103 0.193 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 8.37e-01 0.0244 0.119 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.63e-01 -0.087 0.118 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0486 0.0873 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 6.46e-01 0.0472 0.103 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 2.57e-01 0.123 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 8.76e-01 0.0177 0.113 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.109 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 3.49e-01 0.11 0.117 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0327 0.0976 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0863 0.0758 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 6.90e-01 0.0324 0.0813 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 4.19e-01 -0.072 0.0889 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 9.25e-01 0.0108 0.114 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0559 0.107 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0655 0.122 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 5.79e-01 0.0666 0.12 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0648 0.0932 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 8.35e-01 0.022 0.105 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 2.60e-01 -0.129 0.114 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 4.82e-01 0.0784 0.111 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 1.77e-01 0.157 0.116 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 1.45e-03 0.365 0.113 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0367 0.104 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 1.32e-01 -0.11 0.073 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0547 0.0778 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 6.32e-02 0.182 0.0972 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 7.57e-01 0.0319 0.103 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 1.78e-01 -0.151 0.112 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 4.23e-01 -0.148 0.184 0.174 PB L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0426 0.162 0.174 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00888 0.141 0.174 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0381 0.126 0.174 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 8.15e-01 0.0359 0.153 0.174 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 1.87e-01 -0.184 0.138 0.174 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 9.13e-02 -0.255 0.15 0.174 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 7.60e-02 -0.311 0.174 0.174 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 2.68e-01 -0.171 0.154 0.174 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 1.25e-02 0.298 0.118 0.187 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0392 0.111 0.187 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 9.51e-01 0.00527 0.0852 0.187 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 8.49e-01 0.0177 0.0926 0.187 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 3.49e-02 -0.214 0.101 0.187 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0572 0.116 0.187 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 1.02e-01 -0.184 0.112 0.187 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 6.92e-01 0.0347 0.0877 0.187 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.17e-01 0.145 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 3.80e-01 0.0931 0.106 0.19 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00763 0.083 0.19 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0994 0.0855 0.19 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0257 0.102 0.19 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 3.57e-01 0.104 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 7.93e-01 0.0304 0.116 0.19 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 8.44e-03 0.329 0.124 0.195 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 8.75e-01 0.0171 0.108 0.195 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00181 0.0814 0.195 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0715 0.0822 0.195 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 3.30e-01 -0.11 0.112 0.195 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 5.51e-01 0.0546 0.0913 0.195 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0619 0.114 0.195 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000442 0.125 0.195 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0534 0.115 0.195 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 3.29e-01 0.108 0.111 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.56e-01 0.052 0.0697 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0186 0.0681 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 9.51e-01 0.00436 0.0713 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 6.92e-01 0.0404 0.102 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0221 0.0817 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 4.16e-01 0.0846 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 1.64e-01 -0.157 0.112 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0436 0.103 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.31e-01 0.142 0.119 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 1.37e-01 0.128 0.0855 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0297 0.0706 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0475 0.0694 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00329 0.104 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00226 0.0891 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 5.72e-01 0.0637 0.113 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.13e-01 0.116 0.115 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 4.57e-01 0.0833 0.112 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 1.39e-01 -0.198 0.133 0.206 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 2.76e-01 -0.138 0.126 0.206 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 1.85e-01 -0.153 0.115 0.206 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 3.27e-01 -0.115 0.117 0.206 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 7.64e-01 0.0391 0.13 0.206 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 1.40e-01 -0.183 0.124 0.206 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.97e-01 0.112 0.131 0.206 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00671 0.115 0.206 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 1.36e-01 0.186 0.125 0.187 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0759 0.104 0.187 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.99e-01 0.00966 0.076 0.187 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 7.81e-01 0.0206 0.0741 0.187 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 3.39e-01 -0.109 0.114 0.187 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0672 0.0883 0.187 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 2.86e-01 -0.113 0.106 0.187 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 4.52e-01 0.0881 0.117 0.187 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 1.54e-01 -0.16 0.112 0.187 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 4.11e-01 0.097 0.118 0.19 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 8.06e-01 -0.022 0.0896 0.19 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.74e-01 0.0112 0.0704 0.19 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 5.22e-01 0.0475 0.0741 0.19 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 9.16e-01 0.0117 0.111 0.19 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00013 0.0945 0.19 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 1.68e-01 0.149 0.107 0.19 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.46e-01 0.11 0.116 0.19 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 9.49e-02 -0.181 0.108 0.19 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 4.74e-01 0.0851 0.119 0.195 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 2.55e-01 -0.138 0.121 0.195 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0286 0.0925 0.195 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 1.88e-01 -0.124 0.0936 0.195 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 9.10e-01 0.0134 0.118 0.195 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0969 0.115 0.195 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0869 0.119 0.195 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.30e-01 0.0118 0.133 0.195 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 7.74e-01 0.0341 0.118 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.03e-01 0.142 0.111 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 7.01e-01 0.0342 0.0891 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0991 0.0934 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 2.00e-01 -0.125 0.0977 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 2.72e-01 0.106 0.0965 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 5.13e-01 0.0726 0.111 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 8.72e-01 0.0186 0.115 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0989 0.106 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 9.15e-03 -0.229 0.0872 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 1.88e-01 0.143 0.108 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 4.75e-02 0.172 0.0862 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0619 0.0859 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 5.97e-01 0.0473 0.0893 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 4.60e-01 0.0606 0.0817 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 7.85e-01 0.0287 0.105 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 5.49e-01 0.0688 0.115 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 9.48e-01 0.0069 0.106 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0333 0.0822 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 6.06e-01 0.0573 0.111 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 3.74e-01 0.0601 0.0675 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0327 0.067 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0268 0.069 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 7.71e-01 0.0261 0.0896 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0494 0.0794 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 2.71e-01 0.113 0.102 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0962 0.105 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0198 0.103 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 2.28e-01 0.139 0.115 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0459 0.0767 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.82e-01 0.0107 0.0719 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 4.63e-01 0.0501 0.0683 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0263 0.106 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 730536 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00513 0.0882 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 9.05e-02 0.179 0.105 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 2.22e-01 0.134 0.11 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 sc-eQTL 1.32e-01 -0.17 0.112 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 935630 sc-eQTL 3.74e-02 0.238 0.114 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 859197 sc-eQTL 9.73e-01 0.00301 0.0903 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -873 sc-eQTL 8.23e-02 -0.126 0.0723 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -30747 sc-eQTL 9.25e-01 0.0072 0.0764 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 639939 sc-eQTL 8.11e-01 0.0184 0.0771 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 639874 sc-eQTL 6.26e-01 0.0472 0.0967 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 839425 sc-eQTL 2.78e-01 -0.111 0.102 0.188 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000077254 USP33 859197 eQTL 0.00357 -0.0405 0.0139 0.0 0.0 0.164
ENSG00000137959 IFI44L -873 eQTL 2.71e-06 0.0814 0.0173 0.0644 0.0554 0.164
ENSG00000162614 NEXN 730536 eQTL 0.0557 0.0386 0.0201 0.00121 0.0 0.164
ENSG00000273338 AC103591.3 614495 eQTL 1.87e-02 0.0623 0.0264 0.0 0.0 0.164


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000137959 IFI44L -873 0.000158 0.000141 2.84e-05 6.4e-05 3.3e-05 5.8e-05 0.000174 3.65e-05 0.000147 0.000102 0.000198 8.18e-05 0.00022 6.61e-05 3.66e-05 0.000126 7.41e-05 0.000139 4.47e-05 4.41e-05 8.96e-05 0.000174 0.00015 5.87e-05 0.00021 5.47e-05 9.85e-05 6.66e-05 0.000142 0.000105 9.99e-05 1.45e-05 2.46e-05 4.07e-05 4.64e-05 3.52e-05 2.24e-05 2.14e-05 3.06e-05 1.46e-05 1.1e-05 0.000153 1.95e-05 3.62e-06 1.98e-05 2.82e-05 2.3e-05 1.45e-05 1.26e-05