logo

Genes within 1Mb (chr1:78592523:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0798 0.0887 0.276 B L1
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0433 0.064 0.276 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 7.53e-01 0.0235 0.0744 0.276 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 3.72e-01 0.0607 0.0679 0.276 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 8.28e-01 0.0139 0.0638 0.276 B L1
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 8.55e-01 0.0155 0.0849 0.276 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0916 0.0887 0.276 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 7.44e-01 -0.025 0.0763 0.276 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 9.60e-01 0.00337 0.0668 0.276 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0514 0.0804 0.276 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 1.87e-01 0.0677 0.0512 0.276 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 6.19e-01 0.0346 0.0696 0.276 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 7.85e-01 0.0181 0.0665 0.276 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0768 0.0482 0.276 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0744 0.0583 0.276 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.63e-01 0.0104 0.0605 0.276 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 2.42e-01 -0.089 0.0758 0.276 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 1.46e-01 -0.105 0.0721 0.276 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0122 0.0718 0.276 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0389 0.0703 0.276 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0193 0.0584 0.276 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 1.41e-01 -0.117 0.0794 0.276 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0449 0.0804 0.276 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0668 0.0785 0.276 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0368 0.0861 0.282 DC L1
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 5.70e-01 0.0443 0.0777 0.282 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 8.04e-01 0.0163 0.0656 0.282 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 5.16e-01 0.0419 0.0643 0.282 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.17e-01 0.00894 0.0854 0.282 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 3.28e-02 0.174 0.081 0.282 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 3.61e-01 0.0813 0.0889 0.282 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 9.44e-01 0.00675 0.0961 0.282 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 2.62e-01 -0.103 0.0914 0.282 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 9.32e-02 -0.151 0.0898 0.276 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00257 0.0532 0.276 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 8.08e-01 0.0128 0.0523 0.276 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00404 0.0539 0.276 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0352 0.0734 0.276 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0739 0.0594 0.276 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 7.36e-02 -0.145 0.0806 0.276 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 4.42e-01 0.0631 0.082 0.276 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 3.31e-01 -0.082 0.0841 0.276 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00758 0.093 0.275 NK L1
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00989 0.0731 0.275 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 9.25e-01 0.00564 0.0598 0.275 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0746 0.0626 0.275 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00534 0.0606 0.275 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 3.14e-02 -0.179 0.0824 0.275 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0137 0.0802 0.275 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 8.41e-01 0.0183 0.0913 0.276 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00412 0.0727 0.276 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 9.98e-01 0.000228 0.0783 0.276 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 6.37e-01 0.0377 0.0798 0.276 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 8.15e-01 0.0149 0.0636 0.276 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 5.62e-01 0.0564 0.0971 0.276 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.36e-01 0.0196 0.0941 0.276 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0782 0.086 0.276 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 2.25e-01 0.134 0.11 0.283 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0306 0.109 0.283 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 3.91e-01 0.0776 0.0902 0.283 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0276 0.0912 0.283 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 2.79e-01 -0.114 0.105 0.283 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0328 0.0857 0.283 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 7.39e-01 0.0341 0.102 0.283 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 2.06e-01 0.14 0.11 0.283 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 8.37e-02 0.17 0.0975 0.283 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 7.56e-01 0.0299 0.0958 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 7.56e-01 0.0268 0.0864 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 6.01e-01 0.043 0.0821 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 9.54e-02 0.138 0.0826 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0539 0.082 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 3.10e-01 0.0932 0.0916 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 9.72e-01 0.00344 0.0967 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.34e-02 0.157 0.0903 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 9.44e-01 0.00554 0.0783 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0429 0.0954 0.278 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0618 0.0923 0.278 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0258 0.0729 0.278 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 2.09e-01 0.0914 0.0726 0.278 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 4.41e-01 0.073 0.0946 0.278 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0229 0.0924 0.278 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 3.50e-01 0.0895 0.0956 0.278 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.39e-02 -0.165 0.0953 0.278 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0806 0.0813 0.278 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0749 0.0921 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 8.51e-01 0.0146 0.0776 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 4.11e-01 0.0577 0.07 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0445 0.0728 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0158 0.0719 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0209 0.0863 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0414 0.0941 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0967 0.0907 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 7.49e-01 0.0227 0.0708 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0349 0.0944 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0451 0.0851 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 5.89e-01 -0.038 0.0703 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 5.29e-01 0.0486 0.077 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00136 0.0812 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00712 0.0829 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 8.41e-02 -0.166 0.0957 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 9.00e-01 -0.012 0.0955 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 5.92e-02 -0.153 0.0806 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 1.02e-01 0.169 0.103 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0775 0.0978 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 2.79e-01 0.083 0.0764 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 2.86e-01 0.0942 0.088 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0486 0.0974 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0517 0.0957 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 6.67e-01 0.043 0.0998 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0409 0.0838 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 5.51e-02 0.12 0.0621 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 5.13e-01 0.0482 0.0737 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0151 0.0748 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0595 0.0533 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0769 0.0569 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.29e-01 0.0142 0.0655 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0967 0.0887 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 9.83e-01 0.00141 0.0667 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 7.98e-01 0.0175 0.0681 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 1.48e-01 0.103 0.0709 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 1.15e-01 -0.105 0.0662 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0212 0.0832 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 2.57e-01 0.0993 0.0873 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0445 0.0864 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 5.04e-01 0.0597 0.0891 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 3.64e-01 0.0752 0.0826 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0534 0.0835 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0561 0.0805 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 1.97e-01 -0.121 0.0937 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 6.25e-01 0.0473 0.0968 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0741 0.0953 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 1.52e-01 -0.12 0.0838 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 6.53e-01 0.0326 0.0726 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 2.61e-02 0.18 0.0805 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 7.36e-01 0.0259 0.0769 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0587 0.0907 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0674 0.084 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0728 0.0862 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 3.42e-01 -0.085 0.0893 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0643 0.0836 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 8.80e-01 0.0114 0.0754 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0413 0.0774 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00547 0.071 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0812 0.0852 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.84e-01 0.0126 0.0863 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 9.34e-01 0.00698 0.0837 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 9.43e-01 0.00698 0.0967 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0813 0.0971 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 5.75e-01 0.0523 0.0932 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 6.17e-01 0.0423 0.0845 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 7.94e-01 0.0232 0.0885 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 4.31e-01 0.0765 0.0969 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 2.67e-01 0.11 0.0988 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 2.93e-01 0.0916 0.0868 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 6.26e-02 -0.188 0.1 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 7.19e-01 0.0367 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 5.50e-01 0.0449 0.0749 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00927 0.0778 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.38e-01 0.00734 0.0937 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 8.87e-01 0.0134 0.0943 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 7.30e-01 0.0346 0.1 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 1.45e-01 -0.119 0.0813 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 7.41e-01 0.032 0.0967 0.279 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 3.60e-01 0.0778 0.0848 0.279 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 9.77e-01 0.00225 0.0782 0.279 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 6.03e-01 0.0453 0.0868 0.279 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0163 0.0923 0.279 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 5.15e-01 0.0616 0.0943 0.279 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 7.42e-01 0.0309 0.0941 0.279 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 3.44e-02 -0.182 0.0854 0.279 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 1.73e-01 0.133 0.0975 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0202 0.0977 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0117 0.072 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0657 0.0845 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0247 0.0897 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 8.33e-01 0.0198 0.0935 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 3.30e-01 0.0881 0.0902 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0543 0.096 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 3.69e-01 0.0715 0.0795 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 7.86e-01 0.0169 0.0621 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0465 0.0663 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0982 0.0723 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 3.86e-02 -0.192 0.0922 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0119 0.0875 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 6.99e-01 0.0385 0.0993 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0274 0.0977 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 8.72e-01 0.0123 0.076 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0771 0.0855 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 3.46e-02 0.196 0.0919 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 1.07e-04 -0.345 0.0873 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0749 0.0944 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 6.14e-01 0.0481 0.0952 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 8.77e-01 0.0132 0.0852 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 2.93e-01 0.0634 0.0601 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00148 0.064 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 2.59e-01 0.091 0.0803 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 9.72e-01 0.00301 0.0846 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 5.62e-01 0.0536 0.0923 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 5.94e-01 0.0752 0.141 0.256 PB L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 8.19e-01 0.0284 0.124 0.256 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 5.38e-01 0.0664 0.108 0.256 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0362 0.0966 0.256 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.86e-01 0.002 0.117 0.256 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 4.28e-01 0.0847 0.106 0.256 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 4.05e-01 0.0965 0.115 0.256 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 3.14e-01 -0.135 0.134 0.256 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0131 0.118 0.256 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 9.49e-01 0.0064 0.0999 0.272 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0483 0.0924 0.272 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 5.61e-01 0.0413 0.0709 0.272 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 8.47e-02 0.133 0.0766 0.272 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 1.41e-01 -0.125 0.0843 0.272 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 9.20e-01 0.00968 0.0965 0.272 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 1.20e-01 -0.146 0.0934 0.272 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 2.67e-01 0.0811 0.0729 0.272 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 7.72e-01 0.0281 0.0966 0.276 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 4.22e-01 -0.07 0.0869 0.276 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 9.80e-01 0.00169 0.0682 0.276 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 1.26e-01 -0.108 0.0701 0.276 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 7.60e-01 0.0255 0.0835 0.276 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 4.10e-01 0.0766 0.0927 0.276 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0534 0.0949 0.276 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 7.74e-01 0.0298 0.104 0.283 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 8.26e-01 0.0195 0.0888 0.283 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 5.38e-01 0.0412 0.0668 0.283 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 5.45e-01 -0.041 0.0676 0.283 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 4.98e-01 0.0626 0.0923 0.283 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 2.60e-02 0.166 0.0741 0.283 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0544 0.0935 0.283 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0141 0.103 0.283 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 5.39e-02 -0.181 0.0935 0.283 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 1.53e-01 -0.131 0.0914 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0495 0.0576 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 2.48e-01 0.0651 0.0562 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 8.45e-01 0.0115 0.059 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0831 0.0841 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00364 0.0676 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 7.28e-01 -0.03 0.086 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 2.61e-01 0.105 0.093 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0836 0.0854 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 8.92e-01 0.0133 0.0977 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0699 0.0704 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00865 0.058 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 5.74e-01 0.0321 0.057 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.06e-01 -0.01 0.0852 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0944 0.0729 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 5.70e-02 -0.176 0.0919 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 4.32e-02 0.191 0.0937 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0898 0.0918 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 5.86e-01 0.0643 0.118 0.261 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0738 0.111 0.261 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 4.73e-01 -0.073 0.102 0.261 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 3.29e-01 -0.101 0.103 0.261 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 2.05e-01 0.144 0.113 0.261 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0284 0.109 0.261 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 9.46e-01 0.00785 0.116 0.261 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 4.74e-01 0.0723 0.101 0.261 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.103 0.278 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 1.81e-03 0.263 0.0833 0.278 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 3.92e-01 0.0534 0.0622 0.278 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 7.07e-01 0.0228 0.0607 0.278 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0467 0.0936 0.278 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 5.32e-01 0.0453 0.0724 0.278 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 3.37e-01 0.0838 0.087 0.278 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 6.32e-01 -0.046 0.0959 0.278 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0288 0.0923 0.278 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0535 0.0972 0.267 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 8.04e-01 0.0183 0.0739 0.267 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0731 0.0578 0.267 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0828 0.0609 0.267 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0591 0.0915 0.267 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0642 0.0778 0.267 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 7.91e-02 -0.156 0.0882 0.267 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0357 0.0959 0.267 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0124 0.0898 0.267 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 2.54e-01 -0.113 0.0983 0.285 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 4.06e-01 0.0839 0.101 0.285 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0136 0.0768 0.285 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0182 0.0782 0.285 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 8.33e-02 -0.169 0.0971 0.285 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 2.29e-01 0.115 0.0952 0.285 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 2.21e-01 0.121 0.0988 0.285 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 1.63e-01 -0.154 0.11 0.285 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0241 0.0984 0.285 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 8.83e-01 0.0137 0.0932 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 6.15e-01 0.0374 0.0743 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 7.85e-01 0.0213 0.0782 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 2.56e-01 0.093 0.0816 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.27e-01 0.00742 0.0808 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 3.22e-01 0.0917 0.0923 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 6.00e-01 0.0504 0.096 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 2.02e-01 0.113 0.0883 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 6.08e-01 0.038 0.0739 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 2.65e-01 -0.1 0.0899 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0311 0.0721 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 7.01e-01 0.0273 0.0712 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 8.69e-01 0.0123 0.0741 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.11e-01 0.00758 0.0679 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0338 0.0868 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 2.17e-01 -0.117 0.0947 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0786 0.0877 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 4.46e-01 -0.052 0.0681 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 2.39e-01 -0.109 0.0925 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0702 0.0564 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 4.76e-01 0.04 0.056 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 8.41e-01 0.0116 0.0577 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0906 0.0747 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0578 0.0663 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0823 0.0854 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 1.59e-01 0.124 0.0877 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 2.10e-01 -0.108 0.0858 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0745 0.0943 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 9.96e-02 0.103 0.0623 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 9.15e-01 0.00628 0.0588 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 9.69e-01 0.00219 0.0558 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00312 0.0868 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 704010 sc-eQTL 8.24e-01 0.0161 0.072 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 1.85e-01 -0.115 0.0863 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 1.10e-01 -0.143 0.0892 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 587969 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00991 0.0921 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 909104 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0348 0.0947 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 832671 sc-eQTL 8.35e-01 0.0155 0.0744 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -27399 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00461 0.06 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -57273 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0704 0.0627 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 613413 sc-eQTL 8.25e-01 0.0141 0.0635 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 613348 sc-eQTL 1.59e-02 -0.191 0.0786 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 812899 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0184 0.0841 0.276 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137960 GIPC2 612981 pQTL 0.0466 -0.0454 0.0228 0.0 0.0 0.318

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina