logo

Genes within 1Mb (chr1:78570626:GC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.53e-01 -0.01 0.171 0.06 B L1
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 9.78e-01 0.00338 0.124 0.06 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0484 0.143 0.06 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 8.39e-01 0.0267 0.131 0.06 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0597 0.123 0.06 B L1
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 5.16e-01 -0.106 0.163 0.06 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0763 0.171 0.06 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 8.06e-01 0.0361 0.147 0.06 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0267 0.129 0.06 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.66e-01 0.0067 0.157 0.06 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 1.24e-01 -0.154 0.0993 0.06 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.85e-01 0.0947 0.135 0.06 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 2.77e-01 0.141 0.129 0.06 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 4.98e-01 -0.064 0.0943 0.06 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 7.95e-01 0.0297 0.114 0.06 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 6.92e-02 0.213 0.117 0.06 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 4.76e-01 -0.102 0.144 0.06 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 1.96e-04 -0.502 0.132 0.06 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 3.08e-01 -0.138 0.135 0.06 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 9.87e-01 0.00218 0.133 0.06 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 8.88e-01 0.0156 0.11 0.06 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 1.58e-02 -0.362 0.149 0.06 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 3.17e-01 0.152 0.152 0.06 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 1.38e-01 -0.22 0.148 0.06 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 3.34e-01 -0.173 0.179 0.056 DC L1
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0758 0.162 0.056 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 8.14e-01 0.0321 0.136 0.056 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 4.27e-01 0.106 0.134 0.056 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 2.45e-01 0.207 0.177 0.056 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 8.85e-01 0.0247 0.17 0.056 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 8.62e-01 0.0323 0.185 0.056 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 5.36e-01 0.124 0.199 0.056 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 4.46e-01 0.145 0.19 0.056 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 7.69e-01 0.051 0.174 0.06 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 1.90e-01 -0.134 0.102 0.06 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 6.23e-01 0.0495 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0329 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 8.22e-01 0.0318 0.141 0.06 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 5.53e-02 -0.219 0.114 0.06 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 1.36e-01 -0.232 0.155 0.06 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 6.48e-01 0.0721 0.158 0.06 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 2.19e-02 -0.37 0.16 0.06 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 2.97e-01 0.187 0.179 0.06 NK L1
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 3.30e-01 -0.137 0.141 0.06 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 7.29e-01 -0.04 0.115 0.06 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 2.60e-01 -0.137 0.121 0.06 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00176 0.117 0.06 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 1.95e-02 -0.374 0.159 0.06 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0267 0.155 0.06 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 3.49e-01 0.162 0.173 0.06 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 6.25e-02 -0.256 0.137 0.06 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 1.00e+00 2.72e-05 0.149 0.06 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 3.58e-01 -0.139 0.151 0.06 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 3.23e-02 0.257 0.119 0.06 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 3.99e-01 0.155 0.184 0.06 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0722 0.178 0.06 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0201 0.163 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0261 0.212 0.064 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 9.67e-01 0.00876 0.21 0.064 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.62e-01 -0.128 0.174 0.064 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 2.66e-01 -0.195 0.175 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0597 0.203 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0142 0.165 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 3.85e-01 0.171 0.196 0.064 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 2.41e-01 0.249 0.211 0.064 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 1.83e-01 0.251 0.188 0.064 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 1.06e-01 -0.314 0.194 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 7.88e-01 0.0473 0.176 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0103 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 3.51e-01 0.157 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 4.27e-02 -0.337 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 3.65e-01 0.169 0.186 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0471 0.197 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 1.24e-01 0.284 0.184 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 2.47e-01 -0.184 0.159 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 1.70e-01 0.255 0.185 0.06 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00246 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0753 0.142 0.06 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0294 0.142 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 2.50e-03 0.554 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 9.78e-01 0.00498 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00768 0.187 0.06 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 4.31e-01 -0.147 0.187 0.06 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 2.68e-01 -0.176 0.159 0.06 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0764 0.177 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 8.97e-01 0.0194 0.149 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 9.96e-01 0.000708 0.135 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 1.78e-01 -0.188 0.139 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 5.24e-01 -0.088 0.138 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 7.31e-02 -0.296 0.164 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 6.80e-01 0.0746 0.181 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 1.53e-01 -0.249 0.174 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 9.11e-01 0.0152 0.136 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 1.65e-01 0.254 0.182 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 5.80e-01 0.0914 0.165 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.28e-01 -0.108 0.136 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 1.91e-01 0.195 0.149 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0724 0.157 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0359 0.161 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 7.38e-02 -0.334 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 3.28e-01 0.181 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0961 0.158 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 1.40e-01 0.284 0.192 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 4.95e-01 -0.125 0.182 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0991 0.143 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 4.50e-01 0.124 0.164 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 3.81e-01 -0.159 0.181 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 1.67e-01 -0.246 0.178 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 3.11e-01 0.189 0.186 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.91e-01 0.00192 0.163 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 2.61e-01 -0.137 0.122 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 2.05e-01 0.182 0.143 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 3.90e-01 0.125 0.145 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0573 0.104 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 6.02e-01 0.058 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 2.21e-01 0.156 0.127 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 7.81e-01 0.048 0.173 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 3.87e-02 -0.267 0.128 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 6.11e-01 0.0672 0.132 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 5.63e-02 0.263 0.137 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.32e-01 0.0442 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0378 0.161 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 1.34e-01 0.254 0.169 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 8.36e-01 0.0346 0.167 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 3.13e-01 -0.174 0.172 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0644 0.16 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0822 0.161 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 2.41e-01 0.182 0.155 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0774 0.181 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0101 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0473 0.178 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 7.57e-03 -0.416 0.154 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0514 0.135 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 1.15e-01 0.239 0.151 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.85e-01 0.0392 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 2.88e-01 -0.18 0.169 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 3.65e-01 0.142 0.157 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 9.81e-03 -0.413 0.159 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0554 0.17 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 4.53e-02 -0.317 0.157 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0984 0.143 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0659 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.34e-01 0.0459 0.135 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 3.48e-01 -0.152 0.162 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 1.66e-01 0.227 0.163 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0846 0.159 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.94e-02 -0.324 0.195 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0792 0.198 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 9.54e-01 -0.011 0.19 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 9.21e-01 0.0171 0.172 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 2.63e-01 0.202 0.18 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 8.67e-01 0.0332 0.197 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 2.93e-01 0.212 0.201 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0636 0.177 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 7.60e-01 -0.061 0.2 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 3.87e-01 -0.174 0.2 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 5.94e-01 0.0789 0.148 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0914 0.153 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 4.74e-01 0.132 0.184 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 6.73e-01 0.0786 0.186 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 3.63e-01 -0.18 0.197 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0407 0.161 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 4.49e-01 0.139 0.184 0.061 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 8.22e-02 -0.28 0.16 0.061 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.83e-01 0.104 0.149 0.061 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 5.34e-01 0.103 0.165 0.061 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 1.03e-01 0.286 0.174 0.061 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0471 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0807 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0714 0.164 0.061 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 3.14e-01 0.195 0.193 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0276 0.193 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 6.94e-01 0.0561 0.142 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 8.83e-01 0.0247 0.167 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 8.59e-02 -0.304 0.176 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 9.81e-02 -0.305 0.184 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 6.41e-01 0.0834 0.179 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0165 0.186 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0512 0.154 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 2.75e-01 -0.131 0.12 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 4.17e-01 -0.104 0.128 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 1.03e-01 -0.228 0.139 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 1.69e-01 -0.247 0.179 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0649 0.169 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 3.25e-01 0.186 0.189 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0842 0.186 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 2.54e-01 -0.165 0.144 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 2.62e-02 -0.361 0.161 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.58e-01 0.0546 0.177 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 3.12e-01 -0.175 0.172 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0326 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 4.25e-02 0.376 0.184 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0126 0.166 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 8.25e-01 0.0261 0.118 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 7.88e-01 0.0337 0.125 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 9.39e-02 0.263 0.156 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 4.26e-01 -0.131 0.165 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 4.78e-01 0.128 0.18 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 5.70e-01 -0.139 0.245 0.067 PB L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 2.41e-01 -0.252 0.214 0.067 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 8.83e-01 0.0276 0.187 0.067 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0687 0.168 0.067 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 6.90e-01 0.0812 0.203 0.067 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 7.02e-01 0.071 0.185 0.067 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0227 0.201 0.067 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 9.59e-02 -0.388 0.231 0.067 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0532 0.205 0.067 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0197 0.191 0.061 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 9.98e-01 0.000347 0.177 0.061 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 8.14e-01 0.032 0.136 0.061 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 2.93e-01 -0.156 0.148 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 8.92e-01 -0.022 0.162 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 5.01e-01 0.124 0.185 0.061 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0299 0.18 0.061 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 4.20e-01 0.113 0.14 0.061 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0119 0.187 0.06 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 4.21e-01 -0.136 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 1.89e-01 -0.173 0.131 0.06 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 3.44e-01 -0.129 0.136 0.06 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0748 0.162 0.06 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 2.78e-01 0.195 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 7.81e-01 0.0511 0.184 0.06 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 7.48e-01 0.0689 0.214 0.056 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 4.82e-01 -0.129 0.183 0.056 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 8.16e-01 0.0322 0.138 0.056 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 6.59e-01 0.0619 0.14 0.056 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.73e-01 0.0551 0.191 0.056 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 3.58e-01 0.143 0.155 0.056 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0127 0.193 0.056 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0541 0.213 0.056 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 3.43e-01 -0.185 0.195 0.056 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.95e-01 -0.0011 0.177 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 3.07e-02 -0.24 0.11 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 2.47e-01 0.126 0.109 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 7.27e-01 0.0398 0.114 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0205 0.163 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0894 0.13 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 8.62e-01 0.0289 0.166 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0347 0.18 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 2.79e-03 -0.489 0.162 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 7.57e-02 0.335 0.188 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 2.73e-01 -0.15 0.136 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 5.61e-01 0.0654 0.112 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 7.39e-01 0.0369 0.11 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 2.02e-01 -0.21 0.164 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 1.21e-01 -0.219 0.141 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 1.12e-01 -0.284 0.178 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 1.22e-01 0.283 0.182 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 1.02e-01 -0.291 0.177 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 8.79e-01 0.0341 0.225 0.061 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 5.35e-01 -0.132 0.212 0.061 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.84e-01 -0.136 0.194 0.061 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 1.13e-01 -0.312 0.196 0.061 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 6.31e-01 0.105 0.217 0.061 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0361 0.209 0.061 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0192 0.221 0.061 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 5.98e-01 -0.101 0.192 0.061 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 5.46e-01 -0.118 0.195 0.062 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 1.94e-02 0.378 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.32e-01 0.0932 0.118 0.062 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0418 0.116 0.062 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 8.07e-01 0.0436 0.178 0.062 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 4.67e-01 -0.1 0.138 0.062 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 7.44e-01 0.0544 0.166 0.062 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 7.23e-01 0.0649 0.183 0.062 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0999 0.176 0.062 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 4.05e-01 0.172 0.206 0.054 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 2.49e-01 -0.181 0.156 0.054 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0136 0.123 0.054 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 8.15e-01 0.0304 0.13 0.054 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.79e-01 0.0545 0.194 0.054 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000364 0.165 0.054 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 9.86e-02 -0.311 0.187 0.054 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 2.65e-01 -0.227 0.203 0.054 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 9.46e-01 0.0129 0.19 0.054 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 2.56e-01 -0.238 0.209 0.051 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 8.95e-01 0.0283 0.214 0.051 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 8.27e-01 0.0358 0.163 0.051 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 9.42e-01 0.0121 0.166 0.051 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 4.74e-01 0.15 0.208 0.051 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 9.52e-01 0.0124 0.203 0.051 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 8.73e-01 0.0337 0.211 0.051 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0179 0.236 0.051 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 2.84e-02 0.456 0.206 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 4.77e-01 -0.134 0.188 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 5.26e-01 0.0954 0.15 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0567 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 9.03e-01 0.0202 0.166 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.34e-01 0.0555 0.163 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 8.00e-01 0.0476 0.187 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 8.94e-01 0.0259 0.194 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 3.47e-01 0.168 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 2.98e-01 -0.156 0.149 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00503 0.173 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 9.66e-01 0.00598 0.138 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0585 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 9.87e-01 0.00223 0.142 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 3.63e-01 -0.119 0.13 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 1.00e-01 -0.273 0.166 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 4.55e-01 -0.136 0.182 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 5.03e-01 -0.113 0.168 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 9.32e-01 0.0112 0.131 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 4.89e-01 0.123 0.178 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 9.21e-02 -0.182 0.108 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 2.68e-01 0.119 0.107 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 7.29e-01 0.0384 0.111 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0821 0.144 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 1.94e-01 -0.165 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 4.23e-01 -0.131 0.164 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 4.67e-01 0.123 0.169 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 5.71e-03 -0.453 0.162 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0552 0.182 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 6.01e-01 0.0634 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 4.48e-01 0.0862 0.113 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 7.04e-01 0.041 0.108 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 2.56e-01 0.19 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 682113 sc-eQTL 3.58e-01 -0.128 0.139 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 3.40e-01 -0.16 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 2.84e-01 -0.186 0.173 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 566072 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0952 0.178 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 887207 sc-eQTL 3.22e-01 0.181 0.182 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 810774 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0972 0.143 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -49296 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0728 0.115 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -79170 sc-eQTL 2.55e-01 -0.138 0.121 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 591516 sc-eQTL 7.69e-01 0.036 0.122 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 591451 sc-eQTL 4.84e-02 -0.302 0.152 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 791002 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0815 0.162 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000235613 \N 723516 2.66e-07 1.11e-07 3.34e-08 1.7e-07 1.03e-07 9.13e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.32e-07 3.99e-08 1.55e-07 7.49e-08 1.2e-07 6.1e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.15e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.88e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.33e-07 1.09e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.05e-07 1.09e-07 9.43e-08 3.19e-08 2.74e-08 8e-08 9.56e-08 4.14e-08 5.09e-08 8.75e-08 8.48e-08 3.8e-08 3.46e-08 1.42e-07 4.51e-08 1.76e-08 1.12e-07 1.8e-08 1.5e-07 4.96e-09 4.72e-08