logo

Genes within 1Mb (chr1:78564192:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.16e-02 -0.292 0.167 0.062 B L1
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 7.97e-01 0.0311 0.121 0.062 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 7.51e-02 0.25 0.14 0.062 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 1.09e-01 0.205 0.128 0.062 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 6.82e-02 0.219 0.119 0.062 B L1
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0952 0.16 0.062 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 8.49e-01 -0.032 0.168 0.062 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 8.02e-01 0.0363 0.144 0.062 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 2.22e-01 0.154 0.126 0.062 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 3.56e-02 -0.322 0.152 0.062 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0676 0.0979 0.062 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 2.43e-01 0.155 0.133 0.062 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 1.85e-01 0.168 0.126 0.062 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0581 0.0925 0.062 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 7.82e-01 0.0309 0.112 0.062 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 3.31e-01 0.112 0.115 0.062 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 2.77e-01 0.155 0.142 0.062 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.07e-01 0.0159 0.136 0.062 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 8.58e-02 0.231 0.134 0.062 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 2.10e-01 0.165 0.132 0.062 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 7.26e-01 0.0385 0.11 0.062 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.01e-01 -0.101 0.15 0.062 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 7.14e-01 0.0554 0.151 0.062 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 1.01e-01 0.242 0.147 0.062 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 5.25e-01 -0.108 0.17 0.059 DC L1
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 4.98e-01 0.104 0.153 0.059 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.64e-01 0.18 0.129 0.059 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 1.34e-01 0.19 0.126 0.059 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 9.39e-01 0.0128 0.169 0.059 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 3.72e-01 0.144 0.161 0.059 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.37e-01 -0.108 0.176 0.059 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 1.50e-01 -0.273 0.189 0.059 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 7.43e-01 0.0595 0.181 0.059 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0626 0.17 0.062 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 3.55e-01 0.0928 0.1 0.062 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 3.79e-01 0.0868 0.0985 0.062 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 5.23e-01 0.0649 0.102 0.062 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0249 0.138 0.062 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 4.46e-01 0.0857 0.112 0.062 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0196 0.153 0.062 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 1.21e-01 0.239 0.154 0.062 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 1.58e-01 0.224 0.158 0.062 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 5.20e-01 -0.114 0.177 0.062 NK L1
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 2.64e-01 -0.155 0.139 0.062 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 9.37e-02 0.19 0.113 0.062 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 9.66e-01 0.00517 0.119 0.062 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0936 0.115 0.062 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 6.85e-01 0.0644 0.158 0.062 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 6.39e-03 0.413 0.15 0.062 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 9.81e-01 0.00409 0.169 0.062 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 1.53e-01 0.192 0.134 0.062 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.25e-02 0.361 0.143 0.062 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 6.04e-02 0.277 0.147 0.062 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0681 0.118 0.062 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.76e-01 0.101 0.18 0.062 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 9.54e-01 0.01 0.175 0.062 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0105 0.16 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 1.53e-01 -0.291 0.203 0.066 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 4.41e-01 0.155 0.201 0.066 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 4.50e-01 0.126 0.167 0.066 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0995 0.168 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 1.08e-01 0.312 0.193 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 1.82e-01 -0.211 0.157 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 6.92e-02 -0.342 0.187 0.066 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 5.09e-01 -0.135 0.203 0.066 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0234 0.181 0.066 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 7.12e-02 -0.337 0.186 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0704 0.169 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 9.23e-03 0.415 0.158 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 4.48e-01 0.123 0.162 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0489 0.16 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 4.27e-01 0.142 0.179 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 4.77e-01 -0.135 0.189 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 8.21e-01 0.0402 0.178 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 2.92e-03 0.451 0.15 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 1.21e-01 -0.276 0.178 0.062 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0463 0.173 0.062 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 5.12e-03 0.378 0.134 0.062 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 4.30e-02 0.275 0.135 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0623 0.177 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0828 0.173 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 1.93e-01 0.233 0.178 0.062 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0649 0.179 0.062 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 3.24e-01 0.15 0.152 0.062 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 1.70e-01 -0.24 0.175 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 5.69e-01 0.0841 0.148 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 2.92e-01 0.14 0.133 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 2.24e-02 0.315 0.137 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 8.47e-02 0.235 0.136 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0346 0.164 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0888 0.179 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0334 0.173 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 6.56e-02 0.247 0.134 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0425 0.181 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 3.94e-01 -0.139 0.163 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 9.59e-02 0.224 0.134 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 8.30e-02 0.255 0.147 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 8.19e-01 0.0357 0.156 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 2.39e-01 -0.187 0.158 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0981 0.185 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 9.90e-01 0.00226 0.183 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0855 0.156 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 4.19e-02 -0.417 0.204 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0357 0.195 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0315 0.153 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 6.38e-01 0.083 0.176 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 1.41e-01 0.286 0.193 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 3.43e-01 0.181 0.19 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 4.25e-01 -0.159 0.199 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.83e-02 -0.274 0.16 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0946 0.12 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 2.09e-01 0.178 0.141 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 1.32e-01 0.216 0.143 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0178 0.103 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0569 0.11 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 6.96e-02 0.228 0.125 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 3.45e-01 -0.162 0.171 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0146 0.129 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 2.80e-01 0.142 0.131 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 5.30e-01 0.0863 0.137 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0781 0.128 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 1.90e-01 0.21 0.16 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 3.23e-01 -0.167 0.168 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.47e-04 -0.568 0.168 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 8.50e-02 -0.305 0.176 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 2.17e-01 0.203 0.164 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 4.81e-01 0.117 0.166 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 7.89e-01 -0.043 0.16 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 2.04e-02 0.433 0.185 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 6.14e-01 0.0974 0.193 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 6.22e-01 0.0859 0.174 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 2.49e-01 -0.177 0.153 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.93e-01 0.172 0.132 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 9.47e-01 0.00989 0.148 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 5.48e-02 -0.269 0.139 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.27e-01 0.105 0.165 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 6.62e-02 0.281 0.152 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 3.56e-01 -0.145 0.157 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 5.54e-01 0.104 0.175 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.32e-01 -0.014 0.164 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.33e-01 0.221 0.147 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 2.93e-01 0.159 0.151 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 6.08e-01 0.0713 0.139 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00088 0.167 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0857 0.169 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 5.87e-01 0.0891 0.164 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 9.26e-01 0.0175 0.187 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.62e-01 -0.009 0.188 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 8.53e-01 0.0335 0.181 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 7.84e-01 0.0448 0.164 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 6.62e-01 -0.075 0.171 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0743 0.188 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 8.95e-01 0.0253 0.192 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 7.79e-02 0.296 0.167 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0462 0.214 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 2.12e-01 0.268 0.214 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 2.60e-01 0.178 0.158 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 8.17e-02 0.285 0.163 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0747 0.198 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 9.24e-01 -0.019 0.199 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 5.34e-01 0.131 0.211 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 2.09e-01 0.216 0.172 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 4.88e-01 0.13 0.187 0.061 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 7.55e-01 0.0515 0.165 0.061 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.26e-01 0.232 0.151 0.061 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 3.97e-01 -0.143 0.168 0.061 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 6.56e-01 -0.08 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 3.82e-01 0.16 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00415 0.183 0.061 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 8.45e-01 0.0327 0.167 0.061 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0981 0.19 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 1.39e-01 -0.28 0.189 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 2.89e-01 0.148 0.139 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 4.49e-01 0.124 0.164 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 3.15e-02 -0.373 0.172 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 4.45e-01 0.139 0.181 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 1.29e-02 0.434 0.173 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 7.58e-01 0.0562 0.182 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 1.52e-01 -0.216 0.15 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 8.53e-01 0.0218 0.118 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0133 0.126 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 7.45e-01 0.0449 0.138 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.37e-01 0.109 0.177 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 4.84e-02 0.327 0.165 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0336 0.189 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.20e-01 0.0188 0.186 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 7.88e-03 0.381 0.142 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 3.67e-01 0.147 0.163 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 1.43e-02 0.43 0.174 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.18e-01 0.112 0.172 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 6.31e-01 0.0865 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 1.52e-01 -0.257 0.178 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000689 0.16 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 2.00e-02 0.262 0.112 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0277 0.12 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 4.63e-02 -0.301 0.15 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 6.50e-01 0.0722 0.159 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 1.63e-01 0.242 0.173 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.17e-01 0.0509 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 3.77e-01 -0.17 0.192 0.081 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 3.70e-02 0.347 0.164 0.081 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 6.66e-02 0.274 0.148 0.081 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 1.33e-01 0.272 0.18 0.081 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0418 0.166 0.081 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 1.31e-02 0.442 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0364 0.209 0.081 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0546 0.184 0.081 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0714 0.183 0.063 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 8.18e-01 -0.039 0.169 0.063 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 3.21e-03 0.379 0.127 0.063 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 8.76e-03 0.367 0.139 0.063 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 5.58e-01 -0.091 0.155 0.063 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0341 0.176 0.063 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 3.82e-01 -0.15 0.172 0.063 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0929 0.133 0.063 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.80e-03 -0.505 0.191 0.062 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 2.96e-01 0.183 0.174 0.062 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0533 0.137 0.062 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 5.02e-02 0.276 0.14 0.062 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 5.09e-01 -0.111 0.168 0.062 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 4.15e-01 -0.152 0.186 0.062 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 5.11e-01 -0.125 0.19 0.062 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 4.81e-01 -0.146 0.207 0.056 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 5.07e-01 0.118 0.178 0.056 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.94e-01 0.174 0.134 0.056 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 5.72e-01 0.0769 0.136 0.056 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0294 0.185 0.056 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 9.20e-01 0.0151 0.151 0.056 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00928 0.188 0.056 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 5.01e-01 0.139 0.206 0.056 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 5.15e-01 0.123 0.189 0.056 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 7.33e-01 -0.059 0.173 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 3.59e-01 0.0996 0.108 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 7.29e-02 0.19 0.105 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.111 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0175 0.159 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 5.06e-01 0.0847 0.127 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.19e-01 -0.105 0.162 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 3.40e-01 0.168 0.175 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 4.72e-01 0.116 0.161 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0661 0.185 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 6.23e-01 0.0657 0.134 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 3.95e-01 0.0935 0.11 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 3.36e-01 0.104 0.108 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0537 0.161 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 2.39e-01 0.163 0.138 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 1.60e-01 0.246 0.175 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 1.37e-01 0.266 0.178 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 2.60e-01 0.196 0.174 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.81e-01 0.0355 0.236 0.058 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 7.61e-01 -0.068 0.223 0.058 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 4.99e-01 0.138 0.204 0.058 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 6.13e-02 0.387 0.205 0.058 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0785 0.229 0.058 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0676 0.219 0.058 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 9.23e-02 0.389 0.23 0.058 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 1.07e-02 0.511 0.198 0.058 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 6.84e-01 -0.078 0.191 0.064 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0691 0.159 0.064 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0523 0.116 0.064 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 4.92e-01 0.0778 0.113 0.064 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 9.25e-01 0.0165 0.174 0.064 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0781 0.135 0.064 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 4.38e-01 0.126 0.162 0.064 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 8.73e-01 0.0285 0.179 0.064 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 2.14e-02 0.394 0.17 0.064 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 5.31e-01 -0.117 0.187 0.063 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0412 0.142 0.063 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 7.70e-01 0.0327 0.112 0.063 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 4.53e-01 0.0885 0.118 0.063 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0781 0.176 0.063 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 4.76e-01 0.107 0.15 0.063 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0577 0.171 0.063 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 6.17e-01 0.0925 0.185 0.063 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 3.69e-01 0.155 0.173 0.063 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 1.04e-01 -0.306 0.187 0.065 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 1.84e-01 0.256 0.192 0.065 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 8.43e-01 0.0291 0.147 0.065 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 2.38e-01 0.176 0.149 0.065 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 9.29e-01 0.0168 0.188 0.065 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 5.01e-01 -0.123 0.183 0.065 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 8.87e-01 0.027 0.19 0.065 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 1.84e-02 -0.496 0.208 0.065 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 1.01e-01 -0.308 0.187 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 2.07e-02 -0.411 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0158 0.143 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.13e-02 0.377 0.148 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 3.45e-01 0.148 0.157 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 9.94e-01 0.00118 0.155 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0462 0.177 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0344 0.184 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 6.22e-01 0.0839 0.17 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 1.67e-02 0.338 0.14 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 2.68e-01 -0.19 0.171 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0173 0.137 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.39e-01 0.2 0.135 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 2.03e-02 0.325 0.139 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 1.17e-01 0.202 0.128 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 7.81e-01 -0.046 0.165 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0915 0.181 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 8.11e-01 -0.04 0.167 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 2.13e-01 0.161 0.129 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 5.60e-01 -0.101 0.173 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 5.55e-01 0.0621 0.105 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.08e-01 0.168 0.104 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 2.25e-01 0.13 0.107 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0278 0.139 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 3.47e-01 0.116 0.123 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 9.37e-01 0.0125 0.159 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 1.54e-01 0.234 0.163 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 3.07e-01 0.164 0.16 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0446 0.178 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00488 0.118 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 8.18e-01 0.0255 0.111 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 7.62e-01 0.032 0.105 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0723 0.164 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 675679 sc-eQTL 4.81e-01 0.0958 0.136 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0213 0.164 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 7.81e-01 0.0471 0.169 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 559638 sc-eQTL 2.57e-02 0.386 0.172 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 880773 sc-eQTL 5.40e-01 -0.11 0.179 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 804340 sc-eQTL 3.62e-01 -0.128 0.14 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -55730 sc-eQTL 1.12e-01 0.18 0.113 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -85604 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00594 0.119 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 585082 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0472 0.12 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 585017 sc-eQTL 5.67e-01 0.0862 0.15 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 784568 sc-eQTL 4.27e-02 0.321 0.157 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000235613 NSRP1P1 717082 eQTL 0.0241 0.117 0.0517 0.0 0.0 0.0525

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 \N 880773 2.76e-07 1.27e-07 5.49e-08 1.82e-07 1.01e-07 9.91e-08 1.67e-07 5.66e-08 1.5e-07 6.08e-08 1.63e-07 1.08e-07 1.69e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.74e-08 4.12e-08 1.44e-07 6.32e-08 4.78e-08 1.26e-07 1.25e-07 1.44e-07 2.91e-08 1.63e-07 1.23e-07 1.13e-07 9.92e-08 1.22e-07 1e-07 1.06e-07 3.06e-08 4.02e-08 8.72e-08 5.99e-08 2.99e-08 5.29e-08 8.63e-08 6.71e-08 4.19e-08 5.24e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.57e-08 3.84e-08 1.87e-08 1.21e-07 3.78e-09 5.02e-08
ENSG00000219201 \N 752411 3.02e-07 1.5e-07 6.26e-08 2.05e-07 9.82e-08 8.45e-08 1.99e-07 5.78e-08 1.71e-07 9.35e-08 1.61e-07 1.23e-07 2.13e-07 8.13e-08 5.43e-08 9.01e-08 4.31e-08 1.77e-07 7.09e-08 5.46e-08 1.22e-07 1.56e-07 1.58e-07 3.49e-08 1.98e-07 1.43e-07 1.19e-07 1.1e-07 1.32e-07 1.06e-07 1.14e-07 3.99e-08 3.21e-08 9.81e-08 3.07e-08 2.68e-08 4.62e-08 8.89e-08 6.28e-08 4.41e-08 5.94e-08 1.52e-07 5.12e-08 1.88e-08 2.64e-08 1.68e-08 8.81e-08 1.92e-09 4.82e-08