logo

Genes within 1Mb (chr1:78541208:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 1.36e-01 -0.253 0.169 0.06 B L1
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 7.28e-01 0.0427 0.123 0.06 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 1.36e-01 0.212 0.142 0.06 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 1.96e-01 0.168 0.13 0.06 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 4.89e-02 0.239 0.121 0.06 B L1
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0944 0.162 0.06 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0206 0.17 0.06 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 8.57e-01 0.0263 0.146 0.06 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 2.77e-01 0.139 0.127 0.06 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 3.86e-02 -0.321 0.154 0.06 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0502 0.0993 0.06 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 4.38e-01 0.105 0.135 0.06 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 3.88e-01 0.111 0.128 0.06 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0724 0.0937 0.06 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 7.36e-01 0.0383 0.113 0.06 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 4.09e-01 0.0968 0.117 0.06 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 2.79e-01 0.157 0.144 0.06 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 7.81e-01 0.0384 0.138 0.06 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 1.49e-01 0.197 0.136 0.06 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 4.05e-01 0.111 0.134 0.06 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 7.79e-01 0.0312 0.111 0.06 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0833 0.152 0.06 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 7.23e-01 0.0543 0.153 0.06 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 1.31e-01 0.225 0.149 0.06 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0366 0.173 0.056 DC L1
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 4.10e-01 0.129 0.156 0.056 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 3.41e-01 0.126 0.132 0.056 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 3.20e-01 0.129 0.129 0.056 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 8.65e-01 0.0292 0.172 0.056 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 6.11e-01 0.0841 0.165 0.056 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0859 0.179 0.056 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 7.17e-02 -0.347 0.192 0.056 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 6.26e-01 0.0901 0.184 0.056 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0653 0.173 0.06 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 2.88e-01 0.108 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 5.05e-01 0.0667 0.0999 0.06 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 7.21e-01 0.0368 0.103 0.06 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0281 0.14 0.06 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 4.26e-01 0.0908 0.114 0.06 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0265 0.155 0.06 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 1.45e-01 0.228 0.156 0.06 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 2.21e-01 0.197 0.161 0.06 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 4.92e-01 -0.123 0.179 0.06 NK L1
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 2.60e-01 -0.159 0.141 0.06 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.115 0.06 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0345 0.121 0.06 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0785 0.117 0.06 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 4.71e-01 0.116 0.161 0.06 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 5.87e-03 0.423 0.152 0.06 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 9.31e-01 0.0148 0.172 0.06 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 1.79e-01 0.184 0.136 0.06 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 3.23e-02 0.315 0.146 0.06 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 1.14e-01 0.237 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0789 0.12 0.06 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 4.85e-01 0.128 0.183 0.06 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 8.81e-01 0.0267 0.177 0.06 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0478 0.162 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 1.54e-01 -0.293 0.205 0.064 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 4.97e-01 0.138 0.203 0.064 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 7.08e-01 0.0632 0.169 0.064 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 7.29e-01 -0.059 0.17 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 2.00e-01 0.252 0.196 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 1.78e-01 -0.215 0.159 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 6.41e-02 -0.352 0.189 0.064 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 3.76e-01 -0.182 0.205 0.064 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 9.99e-01 0.000207 0.183 0.064 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 1.04e-01 -0.308 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0911 0.171 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 2.40e-02 0.366 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 7.01e-01 0.0633 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0341 0.163 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 3.36e-01 0.175 0.182 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 4.49e-01 -0.145 0.191 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 8.65e-01 0.0306 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 6.24e-03 0.421 0.152 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 1.10e-01 -0.288 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0372 0.175 0.06 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 1.52e-02 0.333 0.136 0.06 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 9.64e-02 0.229 0.137 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0981 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0899 0.175 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 1.45e-01 0.264 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0947 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 5.15e-01 0.1 0.154 0.06 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 2.21e-01 -0.218 0.178 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 4.61e-01 0.111 0.15 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 5.07e-01 0.09 0.135 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 4.96e-02 0.275 0.139 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.01e-02 0.271 0.138 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0407 0.167 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0737 0.182 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0384 0.176 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 8.37e-02 0.236 0.136 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0189 0.184 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 3.24e-01 -0.163 0.165 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 1.93e-01 0.178 0.136 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 1.60e-01 0.21 0.149 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 9.89e-01 0.0021 0.158 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 2.50e-01 -0.186 0.161 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 5.02e-01 -0.126 0.187 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00128 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0652 0.158 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 2.22e-02 -0.474 0.206 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0122 0.198 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0665 0.155 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 5.32e-01 0.111 0.178 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 3.27e-01 0.193 0.196 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 2.42e-01 0.226 0.192 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 2.40e-01 -0.237 0.201 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 7.81e-02 -0.287 0.162 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0759 0.122 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 3.85e-01 0.125 0.143 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 2.78e-01 0.158 0.145 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0219 0.104 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 7.46e-01 -0.036 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 6.91e-02 0.231 0.127 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 4.91e-01 -0.12 0.174 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 9.63e-01 0.00603 0.131 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 5.12e-01 0.0875 0.133 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 8.07e-01 0.0341 0.139 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0862 0.13 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 3.33e-01 0.158 0.163 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 1.86e-01 -0.227 0.171 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 2.19e-03 -0.53 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 2.05e-01 -0.228 0.18 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 4.17e-01 0.136 0.167 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 7.59e-01 0.052 0.169 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0335 0.163 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 2.00e-02 0.44 0.188 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 5.54e-01 0.116 0.196 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 7.85e-01 0.0482 0.177 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 1.43e-01 -0.228 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 3.67e-01 0.121 0.134 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0522 0.151 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 2.47e-02 -0.318 0.141 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 7.94e-01 0.0439 0.168 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 1.14e-01 0.246 0.155 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 5.13e-01 -0.105 0.159 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 5.73e-01 0.1 0.178 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 9.60e-01 0.00843 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 2.55e-01 0.17 0.149 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 4.91e-01 0.106 0.154 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 6.18e-01 0.0704 0.141 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 8.21e-01 0.0384 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 7.18e-01 -0.062 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 7.57e-01 0.0515 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 9.18e-01 0.0198 0.191 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 9.54e-01 0.011 0.192 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 8.15e-01 -0.043 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0023 0.167 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0999 0.174 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0118 0.191 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 9.11e-01 0.0219 0.195 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 1.14e-01 0.27 0.17 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 5.87e-01 -0.118 0.216 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 2.88e-01 0.231 0.217 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 3.69e-01 0.144 0.16 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 1.19e-01 0.259 0.165 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 7.57e-01 -0.062 0.2 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0538 0.202 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 8.34e-01 0.0448 0.214 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 1.14e-01 0.275 0.173 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 4.45e-01 0.145 0.19 0.058 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 7.46e-01 0.0542 0.167 0.058 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 2.50e-01 0.177 0.154 0.058 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 2.52e-01 -0.196 0.17 0.058 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.19e-01 -0.117 0.182 0.058 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 3.30e-01 0.181 0.185 0.058 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 9.20e-01 0.0187 0.185 0.058 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 9.67e-01 0.00704 0.17 0.058 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 5.66e-01 -0.111 0.194 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 1.19e-01 -0.3 0.192 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 4.67e-01 0.104 0.142 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 5.41e-01 0.102 0.167 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.65e-02 -0.337 0.176 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 3.59e-01 0.17 0.185 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 1.21e-02 0.446 0.176 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 8.13e-01 0.0436 0.184 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 2.73e-01 -0.168 0.153 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0247 0.119 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0513 0.127 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 6.86e-01 0.0565 0.139 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 3.03e-01 0.184 0.178 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 7.44e-02 0.299 0.167 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 7.32e-01 -0.066 0.192 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0117 0.189 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 1.88e-02 0.344 0.145 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 4.18e-01 0.134 0.166 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 3.09e-02 0.387 0.178 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 5.33e-01 0.11 0.175 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 4.17e-01 0.149 0.183 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 2.05e-01 -0.23 0.181 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0523 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 5.59e-02 0.219 0.114 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0696 0.122 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 4.25e-02 -0.311 0.152 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 4.90e-01 0.111 0.161 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 1.03e-01 0.287 0.175 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 7.07e-01 0.0841 0.223 0.078 PB L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 3.85e-01 -0.17 0.196 0.078 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 6.43e-02 0.314 0.168 0.078 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 1.27e-01 0.233 0.152 0.078 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 3.50e-01 0.173 0.185 0.078 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 3.32e-01 -0.164 0.168 0.078 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 9.97e-03 0.467 0.178 0.078 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 9.36e-01 0.0172 0.213 0.078 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 5.06e-01 -0.125 0.187 0.078 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0589 0.185 0.061 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0733 0.171 0.061 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 8.55e-03 0.343 0.129 0.061 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 8.08e-03 0.376 0.141 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0589 0.157 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 9.71e-01 0.0065 0.179 0.061 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 4.85e-01 -0.122 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 2.90e-01 -0.143 0.135 0.061 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 1.51e-02 -0.477 0.195 0.06 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 4.10e-01 0.147 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 4.49e-01 -0.106 0.139 0.06 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 8.14e-02 0.251 0.143 0.06 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 3.21e-01 -0.17 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 5.70e-01 -0.108 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0975 0.194 0.06 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0693 0.212 0.054 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 5.47e-01 0.109 0.181 0.054 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 3.46e-01 0.129 0.136 0.054 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 8.88e-01 0.0195 0.138 0.054 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0669 0.189 0.054 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0252 0.154 0.054 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 8.34e-01 0.0401 0.191 0.054 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 6.91e-01 0.0837 0.211 0.054 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 3.44e-01 0.183 0.193 0.054 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0935 0.175 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 3.24e-01 0.109 0.11 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 1.37e-01 0.16 0.107 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 3.05e-01 0.116 0.112 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0299 0.161 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 5.88e-01 0.0699 0.129 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 5.20e-01 -0.106 0.164 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 4.30e-01 0.141 0.178 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 6.68e-01 0.0702 0.163 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0856 0.187 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 6.42e-01 0.0629 0.135 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 5.85e-01 0.0607 0.111 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 5.19e-01 0.0706 0.109 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0472 0.163 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 3.06e-01 0.144 0.14 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 1.85e-01 0.235 0.177 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 1.74e-01 0.247 0.181 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 2.74e-01 0.193 0.176 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00859 0.242 0.055 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 5.93e-01 -0.122 0.228 0.055 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 8.53e-01 0.0386 0.209 0.055 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 1.40e-01 0.313 0.211 0.055 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 9.77e-01 0.00662 0.234 0.055 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0634 0.225 0.055 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 1.25e-01 0.363 0.236 0.055 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 2.51e-02 0.46 0.203 0.055 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 9.94e-01 0.00146 0.193 0.062 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 6.72e-01 -0.068 0.161 0.062 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0888 0.117 0.062 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 6.30e-01 0.0552 0.114 0.062 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 9.79e-01 0.0047 0.176 0.062 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0156 0.137 0.062 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 6.31e-01 0.0791 0.164 0.062 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 9.56e-01 0.00998 0.181 0.062 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 2.09e-02 0.399 0.172 0.062 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0725 0.19 0.061 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0164 0.144 0.061 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 9.99e-01 8.07e-05 0.113 0.061 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 6.28e-01 0.0579 0.119 0.061 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0907 0.179 0.061 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 5.86e-01 0.083 0.152 0.061 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000377 0.174 0.061 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 6.76e-01 0.0784 0.187 0.061 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 2.07e-01 0.221 0.175 0.061 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 1.39e-01 -0.285 0.192 0.062 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 1.18e-01 0.308 0.196 0.062 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0439 0.15 0.062 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 4.47e-01 0.116 0.153 0.062 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 6.75e-01 0.0805 0.192 0.062 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 2.41e-01 -0.219 0.186 0.062 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 7.96e-01 0.0503 0.194 0.062 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 3.13e-03 -0.633 0.211 0.062 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 8.91e-02 -0.326 0.191 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 2.67e-02 -0.397 0.178 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0185 0.144 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 3.37e-02 0.32 0.15 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 5.95e-01 0.0841 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0199 0.156 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 9.07e-01 -0.021 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0146 0.186 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 7.34e-01 0.0583 0.171 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 3.77e-02 0.296 0.142 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 3.53e-01 -0.162 0.174 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00524 0.139 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 2.64e-01 0.154 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 4.52e-02 0.286 0.142 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 7.65e-02 0.231 0.13 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0517 0.168 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0908 0.183 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0436 0.17 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 2.24e-01 0.16 0.131 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 4.36e-01 -0.136 0.175 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 4.75e-01 0.0763 0.107 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 1.73e-01 0.144 0.105 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 3.66e-01 0.0986 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0262 0.141 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 3.65e-01 0.114 0.125 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 9.93e-01 0.00143 0.162 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 1.88e-01 0.219 0.166 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 4.16e-01 0.132 0.162 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 8.82e-01 0.0268 0.181 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 9.09e-01 0.0138 0.12 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00284 0.112 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 9.60e-01 0.00531 0.107 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0921 0.166 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 652695 sc-eQTL 4.42e-01 0.106 0.138 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0103 0.166 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 8.36e-01 0.0355 0.172 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 536654 sc-eQTL 1.78e-02 0.416 0.174 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 857789 sc-eQTL 5.39e-01 -0.111 0.181 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 781356 sc-eQTL 3.44e-01 -0.135 0.142 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -78714 sc-eQTL 2.22e-01 0.14 0.114 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -108588 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0445 0.12 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 562098 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0502 0.122 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 562033 sc-eQTL 3.94e-01 0.13 0.152 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 761584 sc-eQTL 4.17e-02 0.327 0.16 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000235613 NSRP1P1 694098 eQTL 0.0232 0.121 0.0532 0.0 0.0 0.0481

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 \N 857789 2.77e-07 1.36e-07 5.82e-08 2.01e-07 9.94e-08 9.05e-08 1.73e-07 5.75e-08 1.44e-07 6.75e-08 1.67e-07 1.19e-07 1.79e-07 7.95e-08 5.43e-08 7.98e-08 4.24e-08 1.56e-07 6.92e-08 5.2e-08 1.25e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.83e-08 1.72e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.1e-07 1.26e-07 9.88e-08 1.07e-07 3.55e-08 3.68e-08 8.7e-08 3.4e-08 3.07e-08 5.65e-08 8.76e-08 6.67e-08 5.13e-08 4.36e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.07e-08 3.2e-08 1.65e-08 1.2e-07 1.89e-09 4.81e-08