logo

Genes within 1Mb (chr1:78525867:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 8.11e-02 -0.18 0.102 0.209 B L1
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00012 0.0744 0.209 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 2.50e-01 0.0995 0.0862 0.209 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.57e-01 0.0728 0.0788 0.209 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 9.91e-01 0.00085 0.074 0.209 B L1
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0482 0.0985 0.209 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 2.76e-02 0.226 0.102 0.209 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 3.18e-01 0.0885 0.0884 0.209 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 3.73e-03 -0.223 0.076 0.209 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 2.00e-02 -0.217 0.0925 0.209 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 9.80e-01 0.00151 0.0598 0.209 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0295 0.081 0.209 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 8.32e-01 0.0165 0.0774 0.209 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0316 0.0564 0.209 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.31e-01 0.00594 0.0682 0.209 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0306 0.0704 0.209 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 6.13e-02 -0.163 0.0865 0.209 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 6.25e-01 0.0406 0.083 0.209 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0316 0.0823 0.209 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 8.59e-01 0.0143 0.0806 0.209 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 9.03e-01 0.00821 0.067 0.209 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0362 0.0915 0.209 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 8.61e-02 -0.158 0.0916 0.209 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0165 0.0902 0.209 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.43e-01 -0.148 0.101 0.207 DC L1
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 1.78e-01 -0.123 0.091 0.207 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 9.74e-01 0.00249 0.0771 0.207 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 6.32e-01 0.0363 0.0757 0.207 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 7.78e-01 0.0284 0.1 0.207 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 2.84e-01 -0.103 0.0961 0.207 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 3.33e-01 -0.101 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 3.50e-01 0.106 0.113 0.207 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 6.87e-01 0.0435 0.108 0.207 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 4.23e-02 -0.214 0.105 0.209 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 3.85e-01 0.0543 0.0623 0.209 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00615 0.0614 0.209 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.36e-01 0.0609 0.0631 0.209 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 7.61e-02 0.152 0.0855 0.209 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0354 0.0699 0.209 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 4.59e-01 0.0705 0.0951 0.209 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 9.55e-01 0.00543 0.0963 0.209 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0632 0.0988 0.209 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.22e-01 -0.166 0.107 0.208 NK L1
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 9.92e-01 0.000841 0.0845 0.208 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 3.22e-01 0.0684 0.0689 0.208 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 4.26e-01 0.0578 0.0725 0.208 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 6.97e-01 0.0273 0.07 0.208 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.89e-01 0.00129 0.0963 0.208 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00767 0.0926 0.208 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.29e-01 -0.161 0.106 0.209 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00398 0.0846 0.209 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0521 0.0911 0.209 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 1.47e-01 0.135 0.0924 0.209 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 9.75e-01 0.00233 0.0741 0.209 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.33e-01 0.00957 0.113 0.209 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0295 0.11 0.209 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 1.78e-01 -0.135 0.0998 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0208 0.122 0.214 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 1.31e-01 0.182 0.12 0.214 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.30e-01 0.0215 0.1 0.214 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 9.01e-01 0.0127 0.101 0.214 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0277 0.117 0.214 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 4.19e-02 0.192 0.0939 0.214 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00632 0.114 0.214 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 9.42e-01 0.00889 0.122 0.214 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0237 0.109 0.214 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 3.65e-02 -0.231 0.11 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 9.26e-01 0.00928 0.1 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.01e-01 -0.024 0.0952 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 2.67e-01 -0.107 0.096 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0781 0.0949 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0348 0.106 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 1.14e-01 0.177 0.111 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0479 0.105 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 1.87e-01 -0.12 0.0903 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0844 0.11 0.207 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0414 0.106 0.207 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 3.78e-01 0.074 0.0838 0.207 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 4.07e-01 0.0696 0.0837 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 5.09e-01 0.0721 0.109 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 5.24e-01 0.0679 0.106 0.207 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 7.33e-01 0.0377 0.11 0.207 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 2.93e-01 0.116 0.11 0.207 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0608 0.0938 0.207 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 8.64e-02 -0.183 0.106 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0233 0.0898 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 2.76e-01 0.0883 0.0809 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 4.12e-01 0.0692 0.0842 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 1.00e+00 -2.34e-05 0.0832 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0833 0.0997 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 1.80e-01 0.146 0.108 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00999 0.105 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 1.02e-02 -0.209 0.0807 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0774 0.112 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 7.08e-01 0.038 0.101 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 7.43e-01 0.0275 0.0837 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 8.68e-01 0.0152 0.0917 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0281 0.0965 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00506 0.0986 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 3.85e-01 0.0996 0.114 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 1.06e-02 0.289 0.112 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 2.67e-01 -0.107 0.0964 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.21e-01 0.188 0.12 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 4.02e-01 0.0963 0.115 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0978 0.0897 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.17e-01 -0.104 0.103 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 6.31e-02 0.212 0.113 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.14e-01 0.0122 0.112 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0137 0.117 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 4.34e-02 -0.198 0.0973 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0427 0.0732 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0332 0.0863 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 1.93e-01 0.114 0.0873 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0389 0.0626 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 3.13e-01 0.0674 0.0667 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0178 0.0767 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.95e-02 -0.243 0.103 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 3.59e-01 0.0719 0.0782 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00316 0.08 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.58e-01 -0.077 0.0835 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 6.46e-01 0.036 0.0783 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 2.51e-01 -0.112 0.0974 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 3.09e-01 -0.105 0.103 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0913 0.0992 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 8.11e-01 0.0245 0.102 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 2.13e-01 -0.118 0.0948 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 7.02e-01 0.0368 0.096 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 1.77e-02 0.218 0.0913 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 7.05e-01 0.0409 0.108 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00926 0.111 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.22e-01 -0.166 0.107 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 2.84e-03 0.281 0.093 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0521 0.0819 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 2.50e-01 -0.106 0.0916 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0354 0.0868 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0194 0.102 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0356 0.0949 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 7.91e-01 0.0258 0.0974 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0872 0.102 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 8.83e-01 0.0141 0.0952 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0139 0.0858 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0254 0.0882 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 8.67e-01 0.0135 0.0808 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00447 0.0971 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 2.81e-01 -0.106 0.0979 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0375 0.0952 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 3.51e-01 -0.104 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 1.27e-01 -0.171 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 1.73e-01 -0.146 0.107 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0957 0.0972 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 8.72e-01 0.0165 0.102 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 2.10e-02 -0.257 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 3.92e-01 0.0978 0.114 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 3.39e-01 -0.096 0.1 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 3.00e-01 -0.126 0.122 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 8.97e-02 -0.208 0.122 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 1.72e-01 -0.123 0.0898 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 8.45e-01 0.0183 0.0937 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 9.17e-01 0.0118 0.113 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 5.63e-01 0.0658 0.114 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 1.49e-01 -0.174 0.12 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0629 0.0983 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.86e-02 -0.263 0.111 0.212 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 5.16e-01 0.0641 0.0985 0.212 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.73e-02 -0.155 0.0902 0.212 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.32e-01 0.0978 0.101 0.212 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 8.37e-01 0.022 0.107 0.212 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 7.57e-01 0.0339 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 2.22e-01 -0.133 0.109 0.212 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 1.46e-01 -0.146 0.0997 0.212 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.31e-02 -0.275 0.11 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 2.35e-03 -0.335 0.109 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0498 0.0819 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0813 0.0962 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 2.95e-01 0.107 0.102 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 7.29e-01 0.037 0.107 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 8.77e-01 0.0159 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00482 0.111 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 6.20e-01 0.0456 0.0919 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 7.81e-01 0.0199 0.0716 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 1.51e-01 0.11 0.0762 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 7.12e-01 -0.031 0.0838 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.06e-01 0.0127 0.108 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0661 0.101 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 5.31e-01 -0.074 0.118 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 3.69e-02 0.241 0.115 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 1.13e-01 0.143 0.0897 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 5.53e-01 0.0604 0.102 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 1.11e-01 -0.176 0.11 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.84e-01 0.00216 0.108 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 6.72e-01 0.0476 0.112 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 8.13e-02 -0.19 0.108 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0222 0.0976 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 1.34e-01 0.103 0.0686 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 4.39e-01 0.0568 0.0732 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 7.89e-01 0.0248 0.0922 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 7.16e-01 0.0353 0.0968 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 7.21e-01 0.0378 0.106 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 4.95e-01 -0.107 0.156 0.215 PB L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 5.81e-01 0.0757 0.137 0.215 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0299 0.119 0.215 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 5.76e-01 0.0599 0.107 0.215 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0837 0.129 0.215 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0564 0.118 0.215 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 8.60e-01 0.0227 0.128 0.215 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 5.31e-02 -0.286 0.146 0.215 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 1.73e-01 -0.178 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0117 0.115 0.211 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0302 0.106 0.211 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 2.54e-01 0.0929 0.0812 0.211 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 2.51e-01 0.102 0.0883 0.211 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0454 0.0972 0.211 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 4.10e-01 0.0914 0.111 0.211 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 2.06e-01 0.136 0.107 0.211 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 1.32e-01 -0.126 0.0834 0.211 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0363 0.111 0.209 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 5.46e-01 0.0603 0.0998 0.209 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0209 0.0782 0.209 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00774 0.0809 0.209 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0394 0.0958 0.209 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0905 0.106 0.209 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0157 0.109 0.209 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0727 0.12 0.207 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 1.90e-01 -0.135 0.103 0.207 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.51e-01 0.0146 0.0777 0.207 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 7.45e-01 0.0256 0.0786 0.207 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0127 0.107 0.207 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0755 0.0871 0.207 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 2.96e-01 -0.114 0.108 0.207 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 5.49e-01 0.0718 0.12 0.207 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 3.07e-01 0.112 0.109 0.207 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.14e-01 -0.17 0.107 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 8.66e-01 0.0115 0.0679 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0234 0.0663 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 4.55e-01 0.0518 0.0693 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 5.64e-01 0.0572 0.099 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0523 0.0794 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.62e-01 0.00485 0.101 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0532 0.11 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0503 0.101 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 5.32e-02 -0.222 0.114 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 3.38e-01 0.0797 0.083 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.34e-01 0.0143 0.0683 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.47e-01 0.0632 0.0671 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 2.65e-01 0.112 0.1 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 5.62e-01 0.0501 0.0862 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0127 0.109 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0285 0.111 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0376 0.108 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0944 0.128 0.206 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 1.71e-01 -0.166 0.12 0.206 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 1.83e-01 -0.147 0.11 0.206 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 6.77e-01 -0.047 0.113 0.206 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 1.21e-01 -0.192 0.123 0.206 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 2.00e-01 -0.153 0.118 0.206 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0113 0.126 0.206 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000977 0.11 0.206 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 5.81e-02 -0.231 0.121 0.204 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0444 0.101 0.204 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0155 0.074 0.204 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 8.13e-01 0.0171 0.0722 0.204 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0531 0.111 0.204 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0394 0.0861 0.204 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0834 0.103 0.204 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0631 0.114 0.204 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0108 0.11 0.204 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 7.21e-01 0.0406 0.114 0.206 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00716 0.0863 0.206 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 2.72e-01 0.0744 0.0676 0.206 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0104 0.0715 0.206 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 3.83e-02 0.221 0.106 0.206 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 7.93e-02 0.159 0.0903 0.206 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 6.37e-01 0.049 0.104 0.206 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 9.40e-02 0.187 0.111 0.206 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0112 0.105 0.206 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 9.01e-02 -0.192 0.113 0.201 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0108 0.116 0.201 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0228 0.0886 0.201 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.28e-01 0.0882 0.0899 0.201 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 2.70e-01 0.125 0.113 0.201 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0351 0.11 0.201 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 8.09e-01 0.0277 0.114 0.201 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 5.52e-01 0.0761 0.128 0.201 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00561 0.113 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 2.32e-01 -0.128 0.107 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0207 0.0857 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.76e-01 0.0141 0.0901 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0628 0.0942 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0355 0.0931 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 5.06e-01 0.0709 0.107 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 8.64e-02 0.19 0.11 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 7.27e-01 0.0357 0.102 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 1.85e-02 -0.2 0.0842 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.02e-01 -0.171 0.104 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00822 0.0839 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 3.52e-01 0.0772 0.0827 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 4.58e-01 0.064 0.0861 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 9.25e-01 0.00747 0.0789 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0788 0.101 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 3.35e-01 0.107 0.11 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 1.68e-01 0.141 0.102 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 5.58e-03 -0.218 0.0779 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 1.47e-02 -0.262 0.107 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 4.74e-01 0.0473 0.0659 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0138 0.0654 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 3.09e-01 0.0685 0.0671 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 2.29e-01 0.105 0.087 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0483 0.0774 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 7.53e-01 0.0314 0.0998 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0789 0.103 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0718 0.1 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 2.42e-01 -0.13 0.111 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 5.48e-01 0.0444 0.0737 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 9.29e-01 0.00621 0.0692 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 9.33e-01 0.00554 0.0657 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 1.84e-01 0.136 0.102 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 637354 sc-eQTL 5.53e-01 0.0503 0.0848 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 4.46e-01 0.0779 0.102 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 2.16e-01 0.131 0.105 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 521313 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0274 0.108 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 842448 sc-eQTL 2.92e-01 -0.115 0.108 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 766015 sc-eQTL 5.40e-01 0.0524 0.0853 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94055 sc-eQTL 3.36e-01 0.0663 0.0687 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -123929 sc-eQTL 2.48e-01 0.0835 0.072 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546757 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00824 0.0729 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546692 sc-eQTL 5.95e-01 0.0487 0.0915 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 746243 sc-eQTL 8.76e-01 -0.015 0.0966 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137959 IFI44L -94055 eQTL 0.0137 -0.0407 0.0165 0.00278 0.0 0.21
ENSG00000180488 MIGA1 746243 eQTL 6.62e-02 0.0333 0.0181 0.00103 0.0 0.21
ENSG00000235927 NEXN-AS1 636328 eQTL 0.0261 -0.0609 0.0273 0.0 0.0 0.21

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000273338 \N 521313 4.37e-07 2.5e-07 8.55e-08 2.48e-07 1.07e-07 1.26e-07 3.25e-07 7.46e-08 2.26e-07 1.37e-07 2.62e-07 1.96e-07 3.6e-07 8.26e-08 1.01e-07 1.26e-07 8.53e-08 2.75e-07 9.69e-08 7.4e-08 1.48e-07 2.24e-07 2.04e-07 5.11e-08 3.41e-07 1.9e-07 1.74e-07 1.7e-07 1.76e-07 2e-07 1.59e-07 8.02e-08 4.93e-08 9.81e-08 1.22e-07 5.05e-08 6.2e-08 6.1e-08 4.99e-08 8.03e-08 2.87e-08 2.5e-07 3.31e-08 1.58e-08 7.89e-08 9.12e-09 1.03e-07 2.94e-09 5.58e-08