logo

Genes within 1Mb (chr1:78525236:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 6.48e-01 -0.047 0.103 0.197 B L1
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0459 0.0741 0.197 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 6.52e-01 0.0389 0.0861 0.197 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 5.13e-01 0.0515 0.0786 0.197 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.20e-01 0.114 0.0734 0.197 B L1
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 2.86e-01 0.105 0.098 0.197 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00618 0.103 0.197 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 4.16e-01 0.0718 0.0882 0.197 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 8.07e-02 -0.135 0.0767 0.197 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 8.87e-01 0.0133 0.0934 0.197 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 3.19e-01 0.0593 0.0594 0.197 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 7.22e-01 0.0288 0.0808 0.197 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 6.11e-01 0.0392 0.0771 0.197 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0741 0.056 0.197 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0417 0.0679 0.197 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 9.76e-01 0.00208 0.0702 0.197 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0278 0.0872 0.197 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0915 0.0828 0.197 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 4.84e-01 0.0577 0.0823 0.197 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 6.54e-01 0.0362 0.0806 0.197 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0724 0.0668 0.197 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0727 0.0914 0.197 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0403 0.0922 0.197 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 8.23e-02 -0.156 0.0896 0.197 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0389 0.101 0.2 DC L1
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 2.12e-01 0.114 0.0907 0.2 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0143 0.0768 0.2 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0507 0.0753 0.2 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0699 0.0999 0.2 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 1.32e-01 0.144 0.0954 0.2 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 2.51e-02 0.232 0.103 0.2 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0718 0.112 0.2 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 7.53e-02 -0.19 0.106 0.2 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0176 0.107 0.197 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0393 0.0627 0.197 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 8.63e-01 0.0107 0.0618 0.197 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 9.45e-01 0.0044 0.0636 0.197 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.24e-01 -0.133 0.0862 0.197 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 8.92e-02 -0.119 0.0699 0.197 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 6.70e-02 -0.175 0.095 0.197 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 6.47e-01 0.0444 0.0969 0.197 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0776 0.0994 0.197 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 7.98e-01 0.0276 0.108 0.197 NK L1
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 2.25e-01 -0.103 0.0843 0.197 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 8.56e-01 0.0126 0.0692 0.197 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0399 0.0726 0.197 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0377 0.0701 0.197 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 2.48e-01 -0.111 0.0961 0.197 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0405 0.0927 0.197 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 9.62e-01 0.00514 0.107 0.197 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 9.25e-01 0.00802 0.0855 0.197 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 2.60e-01 0.104 0.0919 0.197 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00549 0.0939 0.197 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 9.21e-01 0.00746 0.0749 0.197 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 7.07e-01 0.043 0.114 0.197 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0258 0.111 0.197 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0556 0.101 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0934 0.128 0.196 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0932 0.127 0.196 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00354 0.105 0.196 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00119 0.106 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.09e-01 -0.196 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 1.63e-01 0.139 0.099 0.196 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 2.79e-01 0.129 0.119 0.196 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 8.02e-02 0.224 0.127 0.196 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 1.20e-01 0.177 0.113 0.196 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 6.37e-01 0.054 0.114 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0236 0.103 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 4.47e-01 0.0746 0.0979 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 6.59e-01 0.0438 0.0992 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 6.01e-01 0.0512 0.0978 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 2.12e-01 0.137 0.109 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 3.78e-01 0.102 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 8.02e-01 0.0273 0.108 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 1.21e-01 -0.144 0.0929 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 2.82e-01 -0.121 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0387 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 8.06e-01 0.0211 0.0857 0.198 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 4.58e-01 0.0637 0.0856 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.17e-01 0.174 0.111 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 9.51e-01 0.0067 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 5.32e-01 0.0704 0.113 0.198 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 7.61e-02 -0.2 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0732 0.0957 0.198 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0386 0.108 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 2.08e-01 0.115 0.0908 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 4.99e-01 0.0557 0.0822 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0168 0.0855 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 3.79e-01 0.0742 0.0843 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 4.99e-01 0.0685 0.101 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 9.86e-01 0.00194 0.111 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 4.53e-01 0.0802 0.107 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 1.91e-01 -0.109 0.0829 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 1.98e-01 0.145 0.112 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0992 0.101 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00606 0.0837 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 3.60e-01 0.084 0.0915 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 2.46e-01 0.112 0.0963 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 6.00e-01 0.0518 0.0986 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0889 0.115 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00762 0.114 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 7.93e-02 -0.169 0.096 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 3.03e-01 0.125 0.121 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 8.83e-01 0.0169 0.115 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 1.83e-01 0.12 0.0896 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 1.33e-02 0.255 0.102 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 2.06e-01 -0.145 0.114 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0611 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 4.40e-01 0.0907 0.117 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0106 0.0977 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 4.16e-01 0.0593 0.0728 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 7.40e-01 0.0286 0.0859 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0549 0.0871 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0354 0.0623 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0253 0.0665 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 9.50e-01 0.00474 0.0763 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0166 0.104 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 8.37e-01 0.016 0.0777 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 6.75e-01 0.0333 0.0793 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 4.43e-01 0.0637 0.0829 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.24e-01 -0.119 0.0772 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 8.73e-01 0.0155 0.0969 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 7.79e-01 0.0286 0.102 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 9.31e-01 0.00886 0.102 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 9.93e-02 0.174 0.105 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 9.24e-01 0.00933 0.098 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 3.10e-01 0.1 0.0987 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0544 0.0953 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 2.40e-01 -0.131 0.111 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.96e-01 0.0608 0.115 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0789 0.109 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0158 0.0961 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 1.82e-01 0.11 0.0825 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 1.41e-01 0.137 0.0925 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 6.57e-01 -0.039 0.0878 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0507 0.104 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 4.41e-01 -0.074 0.0959 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 4.84e-02 -0.194 0.0976 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 1.57e-01 -0.146 0.103 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 1.89e-01 -0.127 0.0962 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0302 0.0871 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0351 0.0894 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0384 0.0819 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 2.95e-01 -0.103 0.0983 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.90e-01 0.0537 0.0995 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0514 0.0966 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 1.17e-01 0.183 0.116 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 2.75e-01 -0.129 0.117 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 6.90e-01 0.0452 0.113 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 1.61e-01 0.143 0.102 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00575 0.107 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 4.90e-01 0.0811 0.117 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 7.27e-01 0.0419 0.12 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0405 0.105 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 6.02e-01 0.062 0.119 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 6.51e-01 -0.054 0.119 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 8.02e-02 0.153 0.0872 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 4.92e-01 0.0628 0.0911 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0466 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 6.49e-01 0.0504 0.111 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 4.77e-01 0.0835 0.117 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 2.46e-01 -0.111 0.0955 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 1.31e-01 0.172 0.113 0.199 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0273 0.1 0.199 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 2.41e-01 0.108 0.092 0.199 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 8.46e-02 0.176 0.102 0.199 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 2.51e-01 0.125 0.109 0.199 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 5.68e-01 0.0636 0.111 0.199 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0641 0.111 0.199 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 1.63e-01 -0.142 0.101 0.199 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 6.44e-01 0.0533 0.115 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00918 0.115 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00963 0.0845 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0429 0.0993 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 7.87e-01 0.0285 0.105 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 3.45e-01 -0.104 0.11 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 1.56e-01 0.15 0.106 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0587 0.111 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0447 0.0919 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 5.34e-01 0.0447 0.0716 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0332 0.0766 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0779 0.0837 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.107 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0595 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 6.60e-01 0.0511 0.116 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 1.77e-01 -0.154 0.114 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 3.09e-01 0.0902 0.0884 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 6.43e-01 0.0463 0.0999 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.82e-01 0.145 0.108 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 2.27e-01 -0.128 0.105 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 1.60e-01 -0.155 0.11 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 3.05e-01 0.113 0.11 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 9.23e-01 0.00961 0.0988 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 8.67e-01 0.0117 0.0699 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 9.91e-01 0.000839 0.0742 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 8.90e-01 0.0129 0.0934 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 7.00e-01 0.0378 0.098 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 8.42e-01 0.0214 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0486 0.156 0.204 PB L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000683 0.137 0.204 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.204 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 5.94e-01 0.0569 0.107 0.204 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 4.05e-01 0.108 0.129 0.204 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 4.54e-01 0.0882 0.117 0.204 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 5.31e-01 0.0803 0.128 0.204 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 4.95e-01 0.101 0.148 0.204 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 7.25e-01 0.046 0.13 0.204 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 2.05e-01 -0.146 0.115 0.196 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 2.78e-01 0.116 0.106 0.196 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 1.31e-01 0.124 0.0815 0.196 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 3.11e-01 0.0902 0.0888 0.196 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.09e-01 -0.156 0.0972 0.196 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 4.71e-01 0.0803 0.111 0.196 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0413 0.108 0.196 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 6.35e-02 0.156 0.0836 0.196 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0216 0.112 0.197 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0209 0.101 0.197 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 3.75e-01 0.0702 0.079 0.197 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 9.62e-01 0.0039 0.0818 0.197 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0369 0.0969 0.197 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0709 0.108 0.197 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 3.53e-01 -0.102 0.11 0.197 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0551 0.12 0.2 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 4.06e-01 0.0855 0.103 0.2 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 8.77e-01 -0.012 0.0774 0.2 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0831 0.0781 0.2 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 9.25e-01 0.0101 0.107 0.2 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 4.34e-02 0.175 0.086 0.2 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 3.25e-02 0.231 0.107 0.2 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 3.63e-01 -0.109 0.119 0.2 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 3.95e-02 -0.224 0.108 0.2 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0806 0.108 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0553 0.0678 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 3.34e-01 0.0641 0.0662 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 4.28e-01 0.055 0.0693 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.91e-01 -0.129 0.0987 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0601 0.0794 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 3.48e-01 -0.095 0.101 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.61e-01 0.0639 0.11 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 2.89e-01 -0.107 0.1 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 7.96e-01 0.03 0.116 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 5.04e-01 -0.056 0.0837 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0639 0.0687 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0118 0.0677 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 2.94e-01 -0.106 0.101 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0408 0.0868 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 4.93e-02 -0.215 0.109 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 1.68e-01 0.154 0.112 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 3.21e-01 -0.108 0.109 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 6.05e-01 0.0739 0.143 0.179 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 1.20e-01 -0.21 0.134 0.179 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 4.58e-01 0.0917 0.123 0.179 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 1.43e-01 -0.184 0.125 0.179 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 3.90e-01 0.119 0.138 0.179 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0353 0.133 0.179 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0765 0.14 0.179 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 2.96e-01 -0.128 0.122 0.179 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 2.86e-01 0.128 0.119 0.198 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 4.38e-01 0.0771 0.0992 0.198 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 7.43e-01 0.0238 0.0725 0.198 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0245 0.0707 0.198 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 5.95e-01 -0.058 0.109 0.198 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0564 0.0843 0.198 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0317 0.101 0.198 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 6.60e-01 0.0493 0.112 0.198 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 6.08e-01 0.0551 0.107 0.198 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 4.31e-01 0.0906 0.115 0.188 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 5.13e-01 0.0573 0.0873 0.188 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0544 0.0686 0.188 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0252 0.0724 0.188 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.78e-01 -0.146 0.108 0.188 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 1.41e-01 -0.135 0.0917 0.188 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 8.42e-01 -0.021 0.105 0.188 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 3.33e-01 -0.11 0.113 0.188 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0155 0.106 0.188 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 4.08e-01 -0.101 0.122 0.186 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 2.13e-01 0.155 0.124 0.186 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 4.97e-01 0.0645 0.0948 0.186 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0713 0.0964 0.186 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.26e-01 -0.185 0.12 0.186 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 6.61e-01 0.0519 0.118 0.186 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 9.81e-01 0.00297 0.123 0.186 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.21e-01 -0.088 0.137 0.186 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0916 0.121 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0972 0.109 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0133 0.0873 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 6.75e-01 0.0385 0.0918 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 5.90e-01 0.0518 0.096 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 2.93e-01 0.0997 0.0946 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 8.76e-02 0.185 0.108 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 1.36e-01 0.168 0.112 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 9.51e-01 0.00637 0.104 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0273 0.0869 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 9.02e-01 0.013 0.106 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 8.11e-01 0.0203 0.0849 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 7.78e-01 0.0236 0.0839 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 7.72e-01 0.0253 0.0872 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 1.43e-01 0.117 0.0794 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 4.06e-01 0.0849 0.102 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0359 0.112 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 6.08e-01 0.0531 0.103 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 7.13e-02 -0.144 0.0796 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0382 0.109 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0722 0.0663 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 6.01e-01 0.0345 0.0659 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 5.36e-01 0.042 0.0678 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 7.67e-02 -0.156 0.0874 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0951 0.0778 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 1.21e-01 -0.156 0.1 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 5.10e-01 0.0684 0.104 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 2.05e-01 -0.128 0.101 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 3.26e-01 0.11 0.111 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 6.04e-01 0.0385 0.0741 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 6.98e-01 -0.027 0.0695 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 9.01e-01 0.00822 0.066 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 2.43e-01 -0.12 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 636723 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0496 0.0851 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0489 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0934 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 520682 sc-eQTL 7.06e-01 0.0411 0.109 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 841817 sc-eQTL 7.54e-01 0.0341 0.109 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 765384 sc-eQTL 3.67e-01 -0.077 0.0853 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -94686 sc-eQTL 5.38e-01 0.0425 0.0688 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -124560 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0452 0.0722 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 546126 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00849 0.073 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 546061 sc-eQTL 2.18e-01 -0.113 0.0912 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 745612 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0672 0.0966 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137960 GIPC2 545694 pQTL 0.0191 -0.0566 0.0241 0.0 0.0 0.242

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina