logo

Genes within 1Mb (chr1:78514480:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 5.77e-02 -0.178 0.0933 0.25 B L1
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 5.45e-01 0.0412 0.0678 0.25 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00916 0.0788 0.25 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 9.31e-01 0.0062 0.072 0.25 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0537 0.0674 0.25 B L1
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 2.88e-01 0.0955 0.0897 0.25 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 7.70e-03 0.249 0.0926 0.25 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0585 0.0807 0.25 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 1.78e-01 -0.095 0.0704 0.25 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 1.62e-01 -0.12 0.0853 0.25 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 2.81e-01 0.059 0.0546 0.25 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0378 0.0741 0.25 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 9.37e-01 0.00562 0.0708 0.25 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0358 0.0516 0.25 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 2.89e-01 0.0662 0.0622 0.25 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 3.51e-02 -0.135 0.0638 0.25 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0461 0.0803 0.25 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 2.21e-02 0.174 0.0756 0.25 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 9.68e-01 0.00309 0.0759 0.25 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 5.88e-01 0.0403 0.0743 0.25 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0323 0.0617 0.25 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 2.82e-01 0.0908 0.0841 0.25 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 5.28e-02 -0.164 0.0842 0.25 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 4.05e-01 0.0693 0.083 0.25 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 1.70e-01 -0.128 0.0929 0.248 DC L1
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0507 0.0841 0.248 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0575 0.0709 0.248 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0855 0.0695 0.248 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00464 0.0925 0.248 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 1.32e-01 -0.133 0.0882 0.248 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0422 0.0964 0.248 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 1.59e-01 -0.146 0.104 0.248 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 4.84e-01 0.0695 0.0991 0.248 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 1.77e-01 -0.136 0.1 0.25 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 6.27e-01 0.0288 0.0592 0.25 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0172 0.0583 0.25 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 9.20e-01 0.00603 0.06 0.25 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 4.34e-01 0.064 0.0816 0.25 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0901 0.0661 0.25 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 1.00e+00 -1.59e-05 0.0904 0.25 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 8.05e-01 0.0226 0.0914 0.25 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0525 0.0939 0.25 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0961 0.0994 0.251 NK L1
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.72e-01 0.0228 0.0783 0.251 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 6.68e-01 0.0275 0.064 0.251 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 7.61e-01 0.0205 0.0673 0.251 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 5.04e-01 0.0434 0.0649 0.251 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 5.11e-01 0.0587 0.0892 0.251 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 7.72e-01 0.0249 0.0859 0.251 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 4.94e-02 -0.192 0.0971 0.25 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 4.58e-01 0.0579 0.0779 0.25 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 2.06e-01 -0.106 0.0837 0.25 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0219 0.0856 0.25 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 3.90e-01 0.0588 0.0682 0.25 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 3.64e-01 0.0947 0.104 0.25 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 6.01e-01 0.0529 0.101 0.25 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0333 0.0924 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 2.05e-01 -0.158 0.124 0.227 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.97e-02 0.216 0.122 0.227 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0328 0.102 0.227 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0986 0.103 0.227 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 5.53e-01 -0.071 0.119 0.227 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 5.97e-01 0.0513 0.0969 0.227 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 1.05e-01 0.188 0.115 0.227 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 3.81e-01 0.109 0.125 0.227 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0213 0.111 0.227 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 4.11e-01 -0.085 0.103 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 3.16e-01 0.0935 0.0931 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0575 0.0886 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 9.09e-01 0.0103 0.0898 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 5.38e-01 0.0546 0.0885 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 2.74e-01 0.109 0.0989 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 4.28e-02 0.211 0.103 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 1.49e-03 -0.308 0.0958 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 2.30e-01 -0.101 0.0842 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 3.19e-01 -0.103 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 3.97e-01 0.0848 0.0998 0.248 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00273 0.0789 0.248 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 5.92e-01 0.0423 0.0788 0.248 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0439 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 6.04e-02 0.187 0.0992 0.248 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 1.16e-02 0.26 0.102 0.248 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 3.19e-02 0.222 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 6.93e-01 0.0348 0.0882 0.248 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 6.26e-02 -0.185 0.099 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 6.26e-01 -0.041 0.084 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0133 0.0758 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0577 0.0787 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0845 0.0776 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0016 0.0934 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 1.21e-02 0.254 0.1 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0186 0.0984 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 9.44e-02 -0.128 0.0762 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 2.09e-01 -0.132 0.105 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0217 0.0947 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 9.77e-01 0.0023 0.0783 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 7.15e-01 0.0313 0.0857 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0356 0.0903 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000772 0.0922 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 6.31e-01 0.0516 0.107 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 2.15e-01 0.132 0.106 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0459 0.0904 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00749 0.113 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 4.24e-02 0.216 0.106 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0842 0.0833 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 2.01e-01 -0.123 0.0959 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 8.58e-01 0.019 0.106 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 4.01e-01 0.0877 0.104 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 9.51e-01 0.00664 0.109 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 1.14e-01 -0.142 0.0895 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 3.38e-01 0.0644 0.0671 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0312 0.0792 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 3.47e-01 0.0756 0.0802 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0417 0.0573 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 7.97e-03 0.162 0.0603 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 1.26e-02 -0.174 0.0693 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0948 0.095 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.34e-01 0.0243 0.0714 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 8.11e-01 0.0175 0.0729 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0147 0.0762 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 4.01e-01 0.06 0.0712 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 4.65e-02 -0.177 0.0882 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 8.75e-02 -0.16 0.0931 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 7.42e-01 0.0303 0.0922 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0388 0.095 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 8.90e-02 -0.15 0.0876 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 3.30e-01 0.0868 0.0889 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0143 0.0859 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0882 0.1 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 9.46e-01 0.007 0.103 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 1.25e-01 -0.155 0.101 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 2.10e-02 0.205 0.0884 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 7.35e-01 0.0262 0.0772 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00361 0.0866 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 8.53e-01 0.0152 0.0818 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0165 0.0965 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 6.04e-03 -0.244 0.0878 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 8.31e-01 0.0196 0.0918 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 9.75e-01 0.00305 0.0956 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 8.25e-03 0.235 0.088 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0471 0.0806 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0148 0.0828 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0709 0.0757 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 6.59e-01 0.0403 0.0912 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0569 0.0921 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00323 0.0895 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00479 0.105 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0296 0.105 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0352 0.101 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0727 0.0914 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 1.49e-01 -0.138 0.0953 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 1.72e-01 -0.143 0.105 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 3.86e-01 -0.093 0.107 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0463 0.0942 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 4.86e-01 0.0808 0.116 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.49e-02 -0.207 0.116 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0764 0.0856 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0445 0.089 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 9.24e-01 0.0102 0.107 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 1.73e-01 0.147 0.107 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0351 0.115 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 6.98e-01 0.0363 0.0934 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 6.52e-02 -0.189 0.102 0.251 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.66e-01 0.0269 0.0901 0.251 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 1.26e-01 -0.127 0.0825 0.251 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 6.09e-01 0.0471 0.0921 0.251 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 2.68e-01 0.108 0.0977 0.251 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 3.34e-01 0.0968 0.1 0.251 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 8.61e-01 0.0175 0.0998 0.251 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0503 0.0915 0.251 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0466 0.104 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 2.07e-01 -0.131 0.103 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00154 0.0764 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 1.24e-01 -0.138 0.0893 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 3.07e-01 0.0973 0.095 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00885 0.0993 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 1.00e-01 -0.157 0.0953 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 5.46e-01 -0.062 0.103 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 2.75e-01 0.093 0.0849 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 8.69e-01 0.0109 0.0663 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00117 0.0709 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 7.21e-01 0.0277 0.0776 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 9.16e-01 0.0105 0.0996 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0133 0.0936 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 9.06e-01 0.0127 0.107 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 2.64e-01 0.117 0.105 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0413 0.0817 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0735 0.0921 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0135 0.1 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 4.45e-01 0.0747 0.0975 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 2.94e-01 -0.107 0.102 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 6.78e-01 0.0379 0.0912 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 9.34e-01 0.00534 0.0645 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 2.91e-01 0.0724 0.0684 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 8.60e-01 0.0152 0.0862 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 5.44e-01 0.055 0.0904 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 6.42e-01 0.0461 0.0989 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 1.25e-01 -0.204 0.132 0.256 PB L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.89e-01 0.0314 0.117 0.256 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0745 0.102 0.256 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 6.82e-01 0.0376 0.0914 0.256 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0892 0.11 0.256 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 7.10e-01 0.0376 0.101 0.256 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 8.26e-01 0.0241 0.11 0.256 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0982 0.127 0.256 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0154 0.112 0.256 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0457 0.107 0.25 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0931 0.0986 0.25 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0767 0.0756 0.25 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0462 0.0824 0.25 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 7.02e-01 0.0347 0.0905 0.25 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 4.99e-01 0.0698 0.103 0.25 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 1.77e-01 0.135 0.0999 0.25 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0149 0.0781 0.25 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 4.31e-01 0.0813 0.103 0.25 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.75e-01 0.0266 0.093 0.25 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 4.64e-01 0.0534 0.0727 0.25 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0518 0.0752 0.25 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0688 0.0891 0.25 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 7.45e-02 0.176 0.0984 0.25 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0632 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 8.75e-01 0.0179 0.114 0.244 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0865 0.0975 0.244 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0532 0.0735 0.244 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 2.65e-01 -0.083 0.0742 0.244 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 3.09e-01 0.103 0.101 0.244 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0313 0.0826 0.244 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0644 0.103 0.244 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0706 0.113 0.244 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 2.26e-01 0.126 0.104 0.244 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0281 0.0994 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 4.40e-01 0.0483 0.0624 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0676 0.0609 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 7.54e-01 0.0201 0.0639 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 9.11e-01 0.0103 0.0913 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0721 0.0731 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0656 0.0931 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 7.79e-01 0.0284 0.101 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00483 0.0927 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 1.79e-03 -0.332 0.105 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.72e-01 0.0225 0.0776 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 5.51e-01 0.0381 0.0638 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 4.21e-01 0.0506 0.0626 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0327 0.0937 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00163 0.0805 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 7.41e-01 0.0337 0.102 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 2.90e-01 -0.11 0.104 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 3.16e-01 -0.102 0.101 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0902 0.123 0.258 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 4.24e-01 0.093 0.116 0.258 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 4.92e-01 -0.073 0.106 0.258 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 1.09e-01 -0.173 0.107 0.258 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 1.25e-01 -0.182 0.118 0.258 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0283 0.114 0.258 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0415 0.121 0.258 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0214 0.105 0.258 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 2.69e-01 -0.124 0.112 0.244 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0815 0.0932 0.244 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0106 0.0682 0.244 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 9.64e-01 0.00299 0.0665 0.244 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 8.58e-01 0.0184 0.102 0.244 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 9.77e-01 0.00232 0.0793 0.244 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 1.10e-01 -0.152 0.0948 0.244 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 1.34e-01 0.157 0.104 0.244 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 7.88e-01 0.0272 0.101 0.244 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 2.66e-01 0.122 0.109 0.247 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 9.20e-01 0.00835 0.0834 0.247 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 4.54e-02 0.131 0.0649 0.247 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 2.58e-01 0.0781 0.0689 0.247 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 3.76e-02 0.214 0.102 0.247 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 1.18e-02 0.22 0.0866 0.247 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 4.10e-01 0.0827 0.1 0.247 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0409 0.108 0.247 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0361 0.101 0.247 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0531 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 6.38e-01 0.0533 0.113 0.243 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 8.56e-01 0.0156 0.0861 0.243 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 7.95e-01 0.0228 0.0876 0.243 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0255 0.11 0.243 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 5.51e-01 0.0641 0.107 0.243 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0527 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0254 0.124 0.243 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 5.08e-01 0.0732 0.11 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 2.85e-01 -0.108 0.101 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.57e-02 0.143 0.0803 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0355 0.0851 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0187 0.0891 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 7.69e-01 0.0259 0.0879 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 6.62e-02 0.185 0.1 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 1.65e-03 0.326 0.102 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 1.09e-01 -0.154 0.0959 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 1.33e-01 -0.121 0.0801 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 3.19e-02 -0.209 0.0967 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0171 0.0782 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0161 0.0773 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0299 0.0803 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 1.73e-01 -0.1 0.0732 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 8.89e-01 0.0132 0.0942 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 6.87e-02 0.187 0.102 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 7.31e-01 0.0328 0.0952 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 5.68e-02 -0.14 0.0733 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 3.89e-02 -0.204 0.0984 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 5.91e-01 0.0326 0.0606 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0329 0.06 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 6.37e-01 0.0292 0.0618 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0235 0.0802 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 8.69e-02 -0.122 0.0707 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0159 0.0917 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 6.64e-01 -0.041 0.0944 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0889 0.092 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 7.53e-01 0.0329 0.104 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0256 0.0693 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 1.20e-01 0.101 0.0646 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 9.35e-01 0.00505 0.0617 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 4.23e-02 0.194 0.095 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 625967 sc-eQTL 4.33e-02 0.16 0.0789 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00727 0.0959 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 4.90e-01 0.0686 0.0991 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 509926 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0267 0.102 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 831061 sc-eQTL 3.20e-01 -0.101 0.101 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 754628 sc-eQTL 5.43e-01 0.0484 0.0793 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -105442 sc-eQTL 6.81e-01 0.0263 0.064 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -135316 sc-eQTL 4.83e-01 0.0471 0.0671 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 535370 sc-eQTL 5.43e-01 0.0412 0.0677 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 535305 sc-eQTL 5.17e-01 0.0551 0.085 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 734856 sc-eQTL 6.26e-01 0.0438 0.0897 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000180488 MIGA1 734856 eQTL 5.95e-02 0.0312 0.0165 0.00106 0.0 0.263

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000077254 \N 754628 2.74e-07 1.34e-07 5.14e-08 1.9e-07 9.24e-08 9.9e-08 1.61e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9.19e-08 1.52e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.49e-08 4.17e-08 1.27e-07 6.07e-08 4.31e-08 1.22e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.93e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.16e-07 1.05e-07 9.92e-08 3.26e-08 4.02e-08 8e-08 6.34e-08 3.22e-08 5.3e-08 8.63e-08 6.58e-08 3.92e-08 5.03e-08 1.46e-07 5.21e-08 1.28e-08 3.4e-08 1.84e-08 1.22e-07 1.91e-09 4.8e-08