logo

Genes within 1Mb (chr1:78488483:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 5.98e-01 0.0903 0.171 0.06 B L1
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 9.50e-01 0.00782 0.124 0.06 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.66e-01 0.199 0.143 0.06 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 1.32e-01 0.197 0.13 0.06 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 1.10e-01 0.196 0.122 0.06 B L1
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0174 0.164 0.06 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 9.57e-01 0.00921 0.171 0.06 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 8.13e-01 0.0348 0.147 0.06 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 8.89e-02 0.218 0.128 0.06 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.05e-01 -0.25 0.153 0.06 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 3.44e-01 0.0932 0.0983 0.06 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 4.61e-01 0.0985 0.133 0.06 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 7.83e-01 0.0351 0.128 0.06 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0132 0.0931 0.06 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 9.97e-01 0.000419 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 3.40e-01 -0.111 0.116 0.06 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 3.53e-01 -0.135 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 3.68e-01 0.125 0.138 0.06 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 3.89e-01 0.118 0.137 0.06 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00511 0.135 0.06 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 5.44e-01 -0.068 0.112 0.06 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 3.52e-01 -0.142 0.153 0.06 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 4.56e-01 0.115 0.154 0.06 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00521 0.151 0.06 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 5.45e-01 -0.105 0.173 0.061 DC L1
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 8.57e-01 0.0283 0.157 0.061 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 6.02e-01 0.0689 0.132 0.061 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 8.81e-01 0.0195 0.13 0.061 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00921 0.172 0.061 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0098 0.165 0.061 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0178 0.179 0.061 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 3.24e-01 0.191 0.193 0.061 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 6.53e-01 -0.083 0.184 0.061 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0954 0.175 0.06 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 8.76e-02 0.175 0.102 0.06 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0795 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0815 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 1.99e-01 -0.182 0.141 0.06 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 5.95e-01 0.0613 0.115 0.06 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 6.00e-01 0.0825 0.157 0.06 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 2.47e-02 0.355 0.157 0.06 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 4.06e-01 -0.136 0.163 0.06 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0545 0.187 0.06 NK L1
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 5.71e-01 0.0832 0.147 0.06 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 5.01e-01 0.0808 0.12 0.06 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 4.07e-01 -0.105 0.126 0.06 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0258 0.122 0.06 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 4.43e-01 -0.128 0.167 0.06 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 3.09e-01 0.164 0.161 0.06 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 2.13e-01 0.219 0.176 0.06 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 4.88e-01 0.0975 0.14 0.06 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 3.70e-02 0.314 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 3.90e-01 0.133 0.154 0.06 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 5.00e-01 0.0829 0.123 0.06 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0718 0.188 0.06 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 7.72e-02 -0.321 0.181 0.06 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 9.92e-01 0.00173 0.166 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.59e-01 -0.29 0.205 0.056 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 9.54e-01 0.0118 0.204 0.056 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 4.09e-01 0.14 0.169 0.056 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 1.51e-01 0.244 0.169 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 5.15e-01 0.128 0.197 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 1.86e-01 -0.211 0.159 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 1.73e-01 -0.26 0.19 0.056 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 8.81e-01 -0.031 0.206 0.056 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0444 0.184 0.056 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 3.55e-01 0.17 0.183 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 2.48e-01 -0.191 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 4.47e-02 0.315 0.156 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 6.01e-02 0.299 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 1.14e-01 0.248 0.156 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 1.16e-01 0.276 0.175 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 2.69e-01 0.205 0.185 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 1.95e-01 0.226 0.174 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 2.31e-02 0.339 0.148 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.55e-02 -0.434 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 3.68e-01 0.157 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.33e-01 0.207 0.137 0.06 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 5.81e-02 0.26 0.136 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0994 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0227 0.175 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 3.05e-01 0.186 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0501 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 6.24e-01 0.0755 0.154 0.06 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.39e-01 0.267 0.18 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 4.40e-01 -0.117 0.152 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 4.14e-01 0.112 0.137 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 7.14e-02 0.257 0.142 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 5.14e-02 0.274 0.14 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 3.69e-01 -0.152 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 1.02e-01 -0.301 0.183 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0998 0.178 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 1.40e-01 0.205 0.138 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 8.00e-01 0.0486 0.191 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 1.41e-01 0.253 0.172 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.75e-01 0.193 0.142 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 2.23e-01 0.19 0.156 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 3.99e-01 -0.139 0.164 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 2.26e-02 -0.381 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 1.96e-01 -0.252 0.195 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 7.03e-01 -0.074 0.193 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 9.65e-01 0.00716 0.165 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 4.95e-02 -0.387 0.196 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 3.18e-01 0.187 0.187 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 2.87e-01 0.156 0.146 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0732 0.169 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 8.93e-01 0.0251 0.186 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0968 0.183 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0766 0.191 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 3.32e-01 -0.157 0.161 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 5.64e-01 0.0697 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 3.28e-01 0.139 0.142 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 6.71e-01 0.0613 0.144 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 6.22e-01 0.0509 0.103 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 7.87e-01 0.0298 0.11 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0368 0.126 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 4.96e-03 -0.481 0.169 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 4.44e-01 0.0992 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 4.72e-01 0.0949 0.132 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0141 0.138 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 1.45e-01 -0.188 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 9.49e-01 0.0104 0.161 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 1.88e-01 -0.224 0.169 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 5.45e-01 -0.1 0.165 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0616 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0303 0.158 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 6.33e-01 0.0765 0.16 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0325 0.154 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 3.39e-02 0.38 0.178 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 9.64e-01 0.00841 0.185 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.87e-01 -0.236 0.178 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0495 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 2.17e-01 0.168 0.136 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 1.66e-01 0.211 0.152 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 4.86e-01 -0.101 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 5.58e-01 -0.1 0.17 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 8.93e-01 0.0212 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 1.93e-01 -0.211 0.161 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 2.81e-01 -0.184 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0479 0.16 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 3.64e-01 0.131 0.144 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0984 0.148 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 2.08e-01 -0.171 0.135 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 6.77e-01 0.068 0.163 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 2.66e-01 0.184 0.165 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0718 0.16 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 2.32e-02 -0.421 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0218 0.188 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 6.01e-01 0.0943 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 4.14e-01 0.133 0.163 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 9.95e-01 0.00101 0.171 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 2.71e-01 -0.206 0.187 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 9.37e-01 -0.015 0.191 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 4.79e-01 -0.119 0.168 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0325 0.197 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 3.69e-01 0.178 0.198 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.48e-01 0.21 0.145 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0542 0.151 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00346 0.182 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0696 0.183 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 7.90e-01 0.0519 0.195 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 8.15e-01 0.0372 0.159 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 3.01e-01 0.19 0.184 0.061 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 2.15e-01 0.2 0.161 0.061 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.28e-01 0.226 0.148 0.061 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0998 0.165 0.061 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 5.48e-01 -0.106 0.176 0.061 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 6.18e-01 0.0897 0.18 0.061 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 3.89e-01 -0.154 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 4.26e-01 0.131 0.164 0.061 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 6.00e-01 -0.103 0.195 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 6.38e-02 0.36 0.193 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.41e-01 0.211 0.143 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 9.80e-01 0.00432 0.169 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 8.41e-01 0.0358 0.179 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 4.75e-01 -0.133 0.186 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 1.38e-01 0.267 0.179 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0675 0.192 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00663 0.159 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 8.10e-01 0.0298 0.124 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0157 0.133 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00567 0.145 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 3.14e-01 -0.188 0.186 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 5.21e-01 -0.113 0.175 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 5.44e-01 0.122 0.201 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0597 0.198 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.05e-01 0.249 0.153 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 6.08e-01 0.0891 0.173 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0614 0.188 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 6.94e-01 0.0722 0.183 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0286 0.191 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.53e-01 -0.273 0.191 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0936 0.171 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0602 0.129 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0288 0.162 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 1.15e-01 0.267 0.169 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 5.39e-01 0.114 0.186 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.54e-03 0.828 0.255 0.063 PB L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 8.31e-01 0.0502 0.234 0.063 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 3.77e-01 0.18 0.203 0.063 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0575 0.183 0.063 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 6.29e-01 -0.107 0.221 0.063 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 9.13e-02 -0.339 0.199 0.063 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 1.16e-02 0.547 0.213 0.063 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0453 0.254 0.063 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 4.94e-01 -0.153 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0368 0.195 0.059 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0863 0.181 0.059 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 6.68e-02 0.254 0.138 0.059 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 6.28e-02 0.28 0.15 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 7.04e-01 0.063 0.166 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 1.54e-01 -0.269 0.188 0.059 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 5.66e-01 0.106 0.184 0.059 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 1.14e-01 -0.225 0.142 0.059 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0122 0.186 0.06 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0261 0.167 0.06 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 4.89e-01 0.0908 0.131 0.06 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 1.29e-01 0.205 0.135 0.06 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00356 0.161 0.06 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 3.02e-01 -0.184 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0918 0.182 0.06 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0986 0.213 0.051 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 8.59e-01 0.0326 0.183 0.051 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 6.38e-01 0.0649 0.138 0.051 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 6.99e-01 0.0539 0.139 0.051 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 4.51e-01 -0.144 0.19 0.051 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0582 0.155 0.051 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 1.73e-01 0.262 0.192 0.051 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 2.31e-01 0.254 0.212 0.051 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 4.27e-01 -0.155 0.194 0.051 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 2.38e-01 -0.209 0.177 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 3.29e-02 0.237 0.11 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0149 0.109 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 8.64e-01 0.0195 0.114 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 5.03e-02 -0.318 0.161 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0348 0.131 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 6.22e-01 -0.082 0.166 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 1.21e-01 0.279 0.179 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 2.05e-01 -0.209 0.165 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 7.88e-01 0.0512 0.19 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 8.68e-01 0.0229 0.137 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0671 0.113 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0613 0.111 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0275 0.166 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 2.36e-01 0.169 0.142 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 4.48e-01 0.137 0.18 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 2.85e-01 0.197 0.184 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 5.48e-01 -0.108 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.52e-01 0.338 0.235 0.058 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 2.37e-01 0.264 0.222 0.058 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.08e-01 0.328 0.202 0.058 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 5.93e-01 0.111 0.208 0.058 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 1.15e-02 0.573 0.224 0.058 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 8.02e-01 0.0552 0.22 0.058 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 4.84e-02 -0.456 0.229 0.058 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0747 0.202 0.058 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0872 0.196 0.062 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0153 0.163 0.062 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 2.81e-01 -0.128 0.119 0.062 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 1.85e-01 -0.153 0.115 0.062 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0567 0.179 0.062 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 7.00e-01 0.0533 0.138 0.062 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 3.12e-01 0.168 0.166 0.062 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 1.95e-01 0.237 0.182 0.062 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 2.51e-01 0.202 0.176 0.062 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 3.73e-01 0.169 0.189 0.059 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 7.08e-01 0.0539 0.144 0.059 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0664 0.113 0.059 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 1.47e-01 -0.172 0.118 0.059 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00924 0.178 0.059 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 9.67e-02 0.252 0.151 0.059 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 3.13e-01 0.175 0.173 0.059 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0891 0.187 0.059 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0317 0.175 0.059 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0177 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 2.76e-01 0.216 0.197 0.056 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 8.47e-01 0.0292 0.151 0.056 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 8.39e-01 0.0313 0.154 0.056 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 7.14e-01 0.0706 0.193 0.056 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 3.49e-01 -0.176 0.187 0.056 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 9.97e-01 0.000815 0.195 0.056 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 4.79e-01 -0.154 0.217 0.056 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 5.46e-01 0.117 0.193 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0985 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0397 0.143 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.07e-01 0.243 0.15 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 1.13e-01 0.25 0.157 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 3.48e-01 0.146 0.155 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 5.26e-01 0.113 0.178 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 2.22e-01 0.226 0.185 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 1.37e-01 0.254 0.17 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 1.05e-02 0.362 0.14 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 1.46e-01 0.259 0.177 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 8.53e-01 0.0265 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 1.18e-01 0.22 0.14 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 5.55e-02 0.28 0.145 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 1.28e-01 0.204 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 3.19e-01 -0.171 0.171 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 4.44e-02 -0.377 0.186 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 5.19e-01 -0.112 0.174 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 2.04e-01 0.171 0.134 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0906 0.178 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 1.12e-01 0.172 0.108 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0245 0.108 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0308 0.111 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 1.21e-01 -0.223 0.143 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 3.97e-01 0.108 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0208 0.164 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 2.65e-02 0.374 0.167 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 2.85e-01 -0.177 0.165 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 5.93e-01 0.0978 0.183 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 5.85e-01 0.0664 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 3.58e-01 -0.105 0.114 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 2.03e-01 -0.138 0.108 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0728 0.168 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 599970 sc-eQTL 4.92e-01 0.096 0.139 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 2.32e-01 0.2 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 8.88e-01 0.0245 0.174 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 483929 sc-eQTL 4.57e-01 0.133 0.178 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 805064 sc-eQTL 5.81e-01 -0.104 0.189 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 728631 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0389 0.148 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -131439 sc-eQTL 7.12e-01 0.0442 0.12 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -161313 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0896 0.125 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 509373 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0542 0.127 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 509308 sc-eQTL 7.92e-01 0.0419 0.159 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 708859 sc-eQTL 7.03e-01 0.064 0.168 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137960 GIPC2 508941 pQTL 0.0212 -0.0973 0.0422 0.0 0.0 0.0636

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000219201 \N 676702 5.37e-07 2.3e-07 8.55e-08 2.41e-07 1.06e-07 1.26e-07 3.11e-07 7.52e-08 2.12e-07 1.39e-07 2.62e-07 2.04e-07 3.95e-07 8.26e-08 9.2e-08 1.33e-07 7.3e-08 2.83e-07 9.71e-08 7.26e-08 1.48e-07 2.3e-07 2.04e-07 5.11e-08 3.41e-07 1.82e-07 1.74e-07 1.61e-07 1.47e-07 2.1e-07 1.59e-07 4.78e-08 4.96e-08 9.61e-08 1.16e-07 5.04e-08 5.76e-08 5.92e-08 4.83e-08 8.09e-08 4.68e-08 2.41e-07 3.31e-08 1.43e-08 6.21e-08 8.59e-09 9.38e-08 0.0 4.68e-08